Testy funkcjonalne w celu rozwiązania nierozwiązanych rzadkich chorób. Rzadkie. (RID)
Rozwiązywanie nierozwiązanych rzadkich chorób: testy funkcjonalne i nowa strategia diagnostyczna do badania wariantów genetycznych z sekwencjonowania o dużej przepustowości (RID)
Choroby rzadkie to heterogenna grupa schorzeń, które wymagają ważnych narzędzi diagnostycznych.
Zastosowanie wysokowydajnego sekwencjonowania jest w stanie zdiagnozować połowę pacjentów. W przypadku drugiej części nie można stwierdzić ze względu na obecność wariantów o nieznanym znaczeniu (VOUS). Potrzebna jest analiza funkcjonalna, aby dostarczyć mocnych argumentów za przeklasyfikowaniem wariantów jako patogenne lub łagodne. Głównym celem jest ocena wydajności diagnostycznej tej strategii.
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Faza
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Vincent MICHAUD
- Numer telefonu: +335 57 82 01 93
- E-mail: vincent.michaud@chu-bordeaux.fr
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Ndeye-Fatou NGOM
- E-mail: ndeye-fatou.ngom@chu-bordeaux.fr
Lokalizacje studiów
-
-
-
Bordeaux, Francja, 33000
- Rekrutacyjny
- Hôpital Pellegrin
-
Kontakt:
- Vincent MICHAUD, Dr
- E-mail: vincent.michaud@chu-bordeaux.fr
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjent niepełnoletni i dorosły.
- Zarejestrowany w systemie ubezpieczeń społecznych.
- Świadoma zgoda podpisana przez pacjenta lub rodzica małoletniego pacjenta.
- Pacjent dotknięty jedną z badanych rzadkich chorób (albinizm, wrodzona wada serca, mukowiscydoza, choroba neurorozwojowa)
- Warianty łożysk pacjenta o nieznanym znaczeniu (VOUS)
Kryteria wyłączenia:
- Odmowa udziału w protokole badania.
- Pacjent pod nadzorem administracyjnym
- Kobiety w ciąży lub karmiące
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Diagnostyczny
- Przydział: Nie dotyczy
- Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Liczba ramion
Broń i interwencje
Grupa uczestników / ArmGrupa uczestników / Arm |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Inny: Podejście ex vivo i in vitro
Podejście ex vivo dotyczące 25 pacjentów z próbką krwi w probówkach PAXgene lub biopsją skóry i analizą RNA-Seq. Podejście in vitro dotyczące 25 pacjentów bez konkretnych próbek potrzebnych do analizy w teście minigenu lub lucyferazy |
Podejście ex vivo dotyczące 25 pacjentów z próbką krwi w probówkach PAXgene lub biopsją skóry i analizą RNA-Seq
Podejście in vitro dotyczące 25 pacjentów bez konkretnych próbek potrzebnych do analizy w teście minigenu lub lucyferazy
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Odsetek VOUS przeklasyfikowany jako patogenny (klasa 5) lub łagodny (klasa 1)
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Jest to odsetek VOUS, który można definitywnie przeklasyfikować jako patogenny (klasa 5) lub łagodny (klasa 1) zgodnie z klasyfikacją ACMG (Richards i in., 2015 i załącznik 1).
Rzeczywiście, obecnie tylko warianty uznane za patogenne lub prawdopodobnie patogenne umożliwiają potwierdzenie diagnozy i zaproponowanie genetycznej oferty poradnictwa genetycznego dla rodzin i wykonania diagnostyki prenatalnej.
Jest to ocena, która zostanie przeprowadzona na koniec przeprowadzonych analiz
|
Wizyta integracyjna
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Proces analizy wstępnej : Czas transportu próbki do laboratorium
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Czas transportu do laboratorium.
Aby obliczyć ten czas, rejestrowany będzie czas pobrania i czas odbioru przez technika genetyki molekularnej oraz czas odbioru przez technika genetyki molekularnej
|
Wizyta integracyjna
|
|
Proces analizy wstępnej: Jakość ekstrakcji RNA (liczba integralności RNA, RIN)
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Pomiar jakości RNA metodą RIN (liczba integralności RNA): bardzo dobra >7, dobra >/=5, słaba <5.
Tylko RNA z RIN >5 zostanie zachowane.
|
Wizyta integracyjna
|
|
Praktyczność: Charakterystyka i liczba procesorów (Central Processing Unit)
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Ocena zasobów bioinformatycznych poprzez pomiar liczby potrzebnych procesorów i czasu przetwarzania danych
|
Wizyta integracyjna
|
|
Praktyczność: Czas szkolenia biologów do interpretacji
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Ocena czasu szkolenia potrzebnego do interpretacji danych
|
Wizyta integracyjna
|
|
Koszt globalny
Ramy czasowe: Wizyta integracyjna
|
Ocena kosztów analizy globalnej i każdego testu
|
Wizyta integracyjna
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Vincent MICHAUD, University Hospital, Bordeaux
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Zaburzenia psychiczne
- Choroby Układu Pokarmowego
- Procesy patologiczne
- Choroby serca
- Choroby układu krążenia
- Choroby metaboliczne
- Choroby mózgu
- Choroby ośrodkowego układu nerwowego
- Choroby Układu Nerwowego
- Choroby skórne
- Choroby Układu Oddechowego
- Choroby płuc
- Choroby oczu
- Objawy neurologiczne
- Manifestacje neurobehawioralne
- Atrybuty choroby
- Wady wrodzone
- Niemowlę, noworodek, choroby
- Choroby genetyczne, wrodzone
- Choroby układu mięśniowo-szkieletowego
- Choroby jąder podstawy
- Zaburzenia ruchowe
- Choroby neurodegeneracyjne
- Choroby skóry, genetyczne
- Choroby oczu, dziedziczne
- Choroby kości
- Metabolizm, Wrodzone Błędy
- Choroby zwyrodnieniowe układu nerwowego
- Zaburzenia neurorozwojowe
- Choroby trzustki
- Metabolizm aminokwasów, błędy wrodzone
- Nieprawidłowości sercowo-naczyniowe
- Nieprawidłowości twarzoczaszki
- Nieprawidłowości mięśniowo-szkieletowe
- Wady rozwojowe kory mózgowej
- Wady rozwojowe układu nerwowego
- Nieprawidłowości, mnogość
- Zaburzenia chromosomowe
- Zaburzenia pigmentacji
- Choroby kości, rozwojowe
- Hipopigmentacja
- Dystrofie neuroaksonalne
- Dysostozy
- Wady rozwojowe kory mózgowej, grupa II
- Mukowiscydoza
- Wady serca, wrodzone
- Upośledzenie intelektualne
- Neurodegeneracja związana z kinazą pantotenianową
- Degeneracja nerwów
- Rzadkie choroby
- Bielactwo
- Zespół Rubinsteina-Taybiego
- Heterotopia guzkowa okołokomorowa
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- CHU BX 2021/40
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .