Profil omiczny w zaburzeniach ze spektrum autyzmu: od poziomu komórkowego w kierunku przyszłych terapii (Aut_Omic)
Profil Omik w Zaburzeniach ze Spektrum Autyzmu: Od Poziomu Komórkowego w Kierunku Przyszłych Terapii
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
ASD to zaburzenie neurorozwojowe dotykające około 1 na 36 dzieci, a jego częstotliwość wzrasta z czasem, co wyznacza znaczący problem społeczny i zdrowia publicznego, z którym należy się zmierzyć, a także ważną dziedzinę badań i studiów.
Projekt ten wychodzi z założenia, że złożone choroby, takie jak ASD, muszą być podejmowane z wykorzystaniem podejścia multidyscyplinarnego.
Badacze gromadzą dużą liczbę komórek somatycznych od pacjentów z ASD, którzy zostali szczegółowo scharakteryzowani i podzieleni na podgrupy pod względem klinicznym, genetycznym, neurologicznym i neuropsychologicznym, oraz przeprogramowują te komórki w indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste, z których pochodzą komórki trzech zarodkowych listków zarodkowych.
Łącząc doświadczenia dwóch jednostek, projekt przyniesie dwa krótkoterminowe rezultaty:
- dużą kolekcję modeli komórkowych od szczegółowo scharakteryzowanych pacjentów z ASD, które mogą być udostępnione społeczności naukowej, aby przyspieszyć zrozumienie przyczyn choroby,
- wiedza o patologicznych szlakach komórek należących do dobrze scharakteryzowanych pacjentów: analizy omiczne będą skorelowane z danymi klinicznymi/genetycznymi, aby zrozumieć, czy określona podgrupa ma specyficzny profil omiczny, czy ten sam profil jest wspólny dla wszystkich podgrup ASD, czy określona cecha kliniczna lub polimorfizm genetyczny jest skorelowany z danymi omicznymi.
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Faza
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Stefano D'Arrigo, M.D.
- Numer telefonu: 02.2394.2210
- E-mail: stefano.darrigo@istituto-besta.it
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Sara Bulgheroni
- E-mail: sara.bulgheroni@istituto-besta.it
Lokalizacje studiów
-
-
-
Milan, Włochy, 20133
- Rekrutacyjny
- Foundation IRCCS Carlo Besta Neurological Institute
-
Kontakt:
- Stefano D'arrigo, MD
- Numer telefonu: 2210 02.2394.
- E-mail: stefano.darrigo@istituto-besta.it
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
Akceptuje zdrowych ochotników
Opis
Kryteria włączenia:
- Zdiagnozowane ASD zgodnie z kryteriami DSM-5
- Wiek 3-15 lat
- Podpisana świadoma zgoda przez opiekunów/prawnych przedstawicieli.
Kryteria wykluczenia:
- Kryteriami wykluczenia dla Grupy 1 będą: posiadanie ustalonej diagnozy genetycznej lub ogólnego obrazu klinicznego silnie sugerującego stan syndromiczny. Dla tej definicji zastosujemy kryteria ASD powiązane z co najmniej jednym z następujących: >=3 anomalie twarzy, >=1 poważna/>=2 mniejsze malformacje (zgodnie z klasyfikacją EUROCAT), problem kliniczny dotyczący >=2 układów. Dzieci wykazujące takie fenotypy, ale bez aktualnej diagnozy genetycznej, nie mogłyby zostać włączone do badania. Pacjenci z prezentacją syndromiczną i potwierdzoną diagnozą genetyczną zostaną włączeni do Syndromicznej Grupy 2.
- Brak standaryzowanego testu do ustalenia diagnozy
- Rodzice odmawiający wypełnienia formularza zgody
- Niemożliwe pobranie próbki krwi.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Podstawowa nauka
- Przydział: Nie dotyczy
- Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Liczba ramion
Broń i interwencje
Grupa uczestników / ArmGrupa uczestników / Arm |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Eksperymentalny: Badanie z jedną grupą
ramię składa się ze 100 pacjentów pediatrycznych (w wieku -15) z diagnozą ASD
|
Pobieranie próbek krwi w badaniu ma wyłącznie cel badawczy i nie jest wykonywane w celach klinicznych.
Kohorta pacjentów jest szczegółowo badana i dobrze stratyfikowana, więc produkcja modeli komórkowych oraz późniejsze analizy omiczne mogą być skorelowane ze szczegółowymi danymi fenotypowymi.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Pomiar nasilenia podstawowych objawów ASD przy użyciu ADOS2
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka wyniku: Kalibrowane Wyniki Nasilenia - Zakres pomiaru: 1-10
|
1 rok
|
|
Pomiar nasilenia podstawowych objawów ASD za pomocą SRS 2
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka wyniku: wynik T - Zakres pomiaru: 30-90
|
1 rok
|
|
Pomiar zdolności rozwojowych za pomocą skali Griffiths III
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: GQ - Zakres pomiaru: <20-150
|
1 rok
|
|
Pomiar zdolności poznawczych za pomocą skal Wechslera
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka wyniku: IQ - Zakres pomiaru: <20-160
|
1 rok
|
|
Pomiar zdolności poznawczych za pomocą skal Leiter 3
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka wyniku: IQ - Zakres pomiaru: 40-160
|
1 rok
|
|
Kwantifikacja problemów emocjonalnych i behawioralnych za pomocą CBCL
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: Wynik surowy - Zakres pomiaru: 0-200 dla dzieci <6 lat / i 0-226 dla dzieci w wieku 6-18 lat
|
1 rok
|
|
Weryfikacja na iPS obecności/braku ekspresji genów komórek macierzystych oraz genów z trzech listków zarodkowych
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: Ekspresja genu - Zakres pomiaru: tak/nie
|
1 rok
|
|
Procent hiNSCs różnicujących się w astrocyty, oligodendrocyty i neurony
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: % zróżnicowanych komórek/liczba całkowita komórek - Zakres pomiaru: 0-100%
|
1 rok
|
|
Pomiar długości wzrostu neurytów w hiNSCs
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: µm - Zakres pomiaru 0-500 µm
|
1 rok
|
|
Pomiar stężenia poszczególnych gatunków molekularnych lipidów w komórkach pochodzących od osób z ASD oraz w komórkach kontrolnych w celu oceny różnic w profilach lipidomicznych
Ramy czasowe: 1 rok
|
Jednostka miary wyniku: μmol/L - Zakres pomiaru: 0,001 μmol/L - >10 000 μmol/L
|
1 rok
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Maenner MJ, Warren Z, Williams AR, Amoakohene E, Bakian AV, Bilder DA, Durkin MS, Fitzgerald RT, Furnier SM, Hughes MM, Ladd-Acosta CM, McArthur D, Pas ET, Salinas A, Vehorn A, Williams S, Esler A, Grzybowski A, Hall-Lande J, Nguyen RHN, Pierce K, Zahorodny W, Hudson A, Hallas L, Mancilla KC, Patrick M, Shenouda J, Sidwell K, DiRienzo M, Gutierrez J, Spivey MH, Lopez M, Pettygrove S, Schwenk YD, Washington A, Shaw KA. Prevalence and Characteristics of Autism Spectrum Disorder Among Children Aged 8 Years - Autism and Developmental Disabilities Monitoring Network, 11 Sites, United States, 2020. MMWR Surveill Summ. 2023 Mar 24;72(2):1-14. doi: 10.15585/mmwr.ss7202a1.
- Willsey AJ, Sanders SJ, Li M, Dong S, Tebbenkamp AT, Muhle RA, Reilly SK, Lin L, Fertuzinhos S, Miller JA, Murtha MT, Bichsel C, Niu W, Cotney J, Ercan-Sencicek AG, Gockley J, Gupta AR, Han W, He X, Hoffman EJ, Klei L, Lei J, Liu W, Liu L, Lu C, Xu X, Zhu Y, Mane SM, Lein ES, Wei L, Noonan JP, Roeder K, Devlin B, Sestan N, State MW. Coexpression networks implicate human midfetal deep cortical projection neurons in the pathogenesis of autism. Cell. 2013 Nov 21;155(5):997-1007. doi: 10.1016/j.cell.2013.10.020.
- Wen Z, Nguyen HN, Guo Z, Lalli MA, Wang X, Su Y, Kim NS, Yoon KJ, Shin J, Zhang C, Makri G, Nauen D, Yu H, Guzman E, Chiang CH, Yoritomo N, Kaibuchi K, Zou J, Christian KM, Cheng L, Ross CA, Margolis RL, Chen G, Kosik KS, Song H, Ming GL. Synaptic dysregulation in a human iPS cell model of mental disorders. Nature. 2014 Nov 20;515(7527):414-8. doi: 10.1038/nature13716. Epub 2014 Aug 17.
- Waizbard-Bartov E, Fein D, Lord C, Amaral DG. Autism severity and its relationship to disability. Autism Res. 2023 Apr;16(4):685-696. doi: 10.1002/aur.2898. Epub 2023 Feb 14.
- Vargas DL, Nascimbene C, Krishnan C, Zimmerman AW, Pardo CA. Neuroglial activation and neuroinflammation in the brain of patients with autism. Ann Neurol. 2005 Jan;57(1):67-81. doi: 10.1002/ana.20315.
- Turco EM, Giovenale AMG, Sireno L, Mazzoni M, Cammareri A, Marchioretti C, Goracci L, Di Veroli A, Marchesan E, D'Andrea D, Falconieri A, Torres B, Bernardini L, Magnifico MC, Paone A, Rinaldo S, Della Monica M, D'Arrigo S, Postorivo D, Nardone AM, Zampino G, Onesimo R, Leoni C, Caicci F, Raimondo D, Binda E, Trobiani L, De Jaco A, Tata AM, Ferrari D, Cutruzzola F, Mazzoccoli G, Ziviani E, Pennuto M, Vescovi AL, Rosati J. Retinoic acid-induced 1 gene haploinsufficiency alters lipid metabolism and causes autophagy defects in Smith-Magenis syndrome. Cell Death Dis. 2022 Nov 21;13(11):981. doi: 10.1038/s41419-022-05410-7.
- Sellgren CM, Sheridan SD, Gracias J, Xuan D, Fu T, Perlis RH. Patient-specific models of microglia-mediated engulfment of synapses and neural progenitors. Mol Psychiatry. 2017 Feb;22(2):170-177. doi: 10.1038/mp.2016.220. Epub 2016 Dec 13.
- Ryan KJ, White CC, Patel K, Xu J, Olah M, Replogle JM, Frangieh M, Cimpean M, Winn P, McHenry A, Kaskow BJ, Chan G, Cuerdon N, Bennett DA, Boyd JD, Imitola J, Elyaman W, De Jager PL, Bradshaw EM. A human microglia-like cellular model for assessing the effects of neurodegenerative disease gene variants. Sci Transl Med. 2017 Dec 20;9(421):eaai7635. doi: 10.1126/scitranslmed.aai7635.
- Rosati J, Ferrari D, Altieri F, Tardivo S, Ricciolini C, Fusilli C, Zalfa C, Profico DC, Pinos F, Bernardini L, Torres B, Manni I, Piaggio G, Binda E, Copetti M, Lamorte G, Mazza T, Carella M, Gelati M, Valente EM, Simeone A, Vescovi AL. Establishment of stable iPS-derived human neural stem cell lines suitable for cell therapies. Cell Death Dis. 2018 Sep 17;9(10):937. doi: 10.1038/s41419-018-0990-2.
- Prince N, Chu SH, Chen Y, Mendez KM, Hanson E, Green-Snyder L, Brooks E, Korrick S, Lasky-Su JA, Kelly RS. Phenotypically driven subgroups of ASD display distinct metabolomic profiles. Brain Behav Immun. 2023 Jul;111:21-29. doi: 10.1016/j.bbi.2023.03.026. Epub 2023 Mar 31.
- Rolland T, Cliquet F, Anney RJL, Moreau C, Traut N, Mathieu A, Huguet G, Duan J, Warrier V, Portalier S, Dry L, Leblond CS, Douard E, Amsellem F, Malesys S, Maruani A, Toro R, Borglum AD, Grove J, Baron-Cohen S, Packer A, Chung WK, Jacquemont S, Delorme R, Bourgeron T. Phenotypic effects of genetic variants associated with autism. Nat Med. 2023 Jul;29(7):1671-1680. doi: 10.1038/s41591-023-02408-2. Epub 2023 Jun 26.
- Ormel PR, Bottcher C, Gigase FAJ, Missall RD, van Zuiden W, Fernandez Zapata MC, Ilhan D, de Goeij M, Udine E, Sommer IEC, Priller J, Raj T, Kahn RS, Hol EM, de Witte LD. A characterization of the molecular phenotype and inflammatory response of schizophrenia patient-derived microglia-like cells. Brain Behav Immun. 2020 Nov;90:196-207. doi: 10.1016/j.bbi.2020.08.012. Epub 2020 Aug 13.
- Nimmerjahn A, Kirchhoff F, Helmchen F. Resting microglial cells are highly dynamic surveillants of brain parenchyma in vivo. Science. 2005 May 27;308(5726):1314-8. doi: 10.1126/science.1110647. Epub 2005 Apr 14.
- Liu X, Campanac E, Cheung HH, Ziats MN, Canterel-Thouennon L, Raygada M, Baxendale V, Pang AL, Yang L, Swedo S, Thurm A, Lee TL, Fung KP, Chan WY, Hoffman DA, Rennert OM. Idiopathic Autism: Cellular and Molecular Phenotypes in Pluripotent Stem Cell-Derived Neurons. Mol Neurobiol. 2017 Aug;54(6):4507-4523. doi: 10.1007/s12035-016-9961-8. Epub 2016 Jun 29.
- Lim M, Carollo A, Dimitriou D, Esposito G. Recent Developments in Autism Genetic Research: A Scientometric Review from 2018 to 2022. Genes (Basel). 2022 Sep 14;13(9):1646. doi: 10.3390/genes13091646.
- Kinsner-Ovaskainen A, Lanzoni M, Garne E, Loane M, Morris J, Neville A, Nicholl C, Rankin J, Rissmann A, Tucker D, Martin S. A sustainable solution for the activities of the European network for surveillance of congenital anomalies: EUROCAT as part of the EU Platform on Rare Diseases Registration. Eur J Med Genet. 2018 Sep;61(9):513-517. doi: 10.1016/j.ejmg.2018.03.008. Epub 2018 Mar 27.
- Genovese A, Butler MG. The Autism Spectrum: Behavioral, Psychiatric and Genetic Associations. Genes (Basel). 2023 Mar 9;14(3):677. doi: 10.3390/genes14030677.
- Di Lullo E, Kriegstein AR. The use of brain organoids to investigate neural development and disease. Nat Rev Neurosci. 2017 Oct;18(10):573-584. doi: 10.1038/nrn.2017.107. Epub 2017 Sep 7.
- Chiarotti F, Venerosi A. Epidemiology of Autism Spectrum Disorders: A Review of Worldwide Prevalence Estimates Since 2014. Brain Sci. 2020 May 1;10(5):274. doi: 10.3390/brainsci10050274.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- PNRR-MCNT1-2023-12377520
- PNNR Funding (Inny numer grantu/finansowania: Ministry of Health)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Dane kliniczne i neuropsychologiczne są zbierane na papierze, a następnie wprowadzane do REDCap przez personel UO1. Dane komórkowe i molekularne są zbierane i wprowadzane do REDCap przez personel UO2.
Tylko personel kliniczny zaangażowany w badanie będzie miał dostęp do danych, które mogą być dostępne w dowolnym momencie, ale tylko z instytucji uczestniczących w badaniu.
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- SOK ROŚLINNY
- ICF
- CSR
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .