Społeczność — powiązane beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum (ESBL)

Uwzględnione zostaną następujące zmienne: wiek, płeć, zawód, lokalizacja szpitala w czasie dodatniego posiewu (SOR, oddział medyczny, OIOM itp.), wcześniejsza hospitalizacja lub przyjęcie do domu opieki, otrzymanie ambulatoryjnej dializy, opieka domowa lub inne regularne opieka medyczna (np. chemioterapia ambulatoryjna), obecność urządzeń inwazyjnych, otrzymywanie antybiotyków, w tym ich rodzaj i to, czy były one odpowiednie do profilu oporności organizmu, oraz wcześniejsze dodatnie posiewy mikrobiologiczne. Wszystkie witryny zbierają następujące informacje, które zostały zebrane w ramach leczenia klinicznego pacjenta. Następujące zmienne będą gromadzone we wszystkich ośrodkach: czas i lokalizacja dodatnich posiewów, choroby podstawowe i ciężkość choroby, obecność urządzeń moczowych lub wewnątrznaczyniowych, ostatnie terapie immunomodulacyjne lub radioterapia, wyniki badań fizykalnych, dane laboratoryjne i radiograficzne, stosowanie środków przeciwdrobnoustrojowych w 30 dni od początku zakażenia, dane mikrobiologiczne i wzorce oporności, wybór antybiotyków po zidentyfikowaniu organizmu, wyniki bakteriologiczne, wyniki laboratoryjne, informacje demograficzne, leki, wyniki kliniczne, płeć, wzrost, waga, pochodzenie etniczne i historia medyczna w przeszłości. Będziemy gromadzić informacje prospektywnie przez rok. Bakterie w kulturach pacjenta zostaną poddane podhodowli (po uzyskaniu diagnozy, ponieważ w przeciwnym razie laboratorium mikrobiologiczne zniszczyłoby hodowlę) i przekazane uczciwemu pośrednikowi, który zdeidentyfikuje próbkę i powiąże ją z zebranymi informacjami medycznymi (co będzie być również anonimizowane przez uczciwego brokera). Na tych próbkach zostanie przeprowadzona następująca ocena. Minimalne stężenie hamujące zastosowanego w leczeniu antybiotyku zostanie określone metodą E-Test (AB Biodisk, Solna, Szwecja). Zbadane zostaną specyficzne mechanizmy oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe, z naciskiem na obecność beta-laktamaz wytwarzanych przez bakterie. Ocena ta zostanie przeprowadzona za pomocą technik analitycznego ogniskowania izoelektrycznego, a także analizy PCR i sekwencjonowania genów w celu określenia genów kodujących beta-laktamazy. Próbki biologiczne będą pod kontrolą kierownika projektu badawczego. Wszystkie próbki dostarczone śledczym są pozbawiane elementów umożliwiających identyfikację przez uczciwego pośrednika i zostaną zakodowane numerami. Informacje łączące te numery kodów z tożsamościami odpowiednich podmiotów będą przechowywane w oddzielnym, bezpiecznym miejscu, do którego dostęp ma tylko uczciwy pośrednik. Badacze biorący udział w tym badaniu będą przechowywać próbki przez czas nieokreślony. Próbki będą przechowywane w laboratorium badacza znajdującym się w Scaife Hall, pokój 812, 3500 Terrace Street. W żadnym momencie badacze nie będą mieli dostępu do żadnych identyfikatorów pacjentów. Informacje z dokumentacji medycznej i próbki bakterii z placówek poza UPMC zostaną dostarczone do PI bez możliwości identyfikacji. W żadnym momencie nikt z zespołu badawczego nie będzie miał dostępu do identyfikatorów pacjentów. Wszystkie informacje i bakterie są zbierane w ramach leczenia klinicznego pacjenta.