Community – Associated Extended-spectrum Beta-laktamases (ESBL)

Budou sledovány následující proměnné: věk, pohlaví, povolání, umístění nemocnice v době pozitivní kultivace (pohotovost, lékařské oddělení, JIP atd.), předchozí hospitalizace nebo přijetí do pečovatelského domu, příjem ambulantní dialýzy, domácí péče nebo jiné pravidelné lékařská péče (např. ambulantní chemoterapie), přítomnost invazivních přístrojů, příjem antibiotik, včetně jejich typu a zda jsou adekvátní profilu odolnosti organismu, a předchozí pozitivní mikrobiologické kultivace. Všechny stránky shromažďují následující informace, které byly shromážděny v rámci klinické léčby pacienta. Na všech místech budou shromažďovány následující proměnné: čas a umístění pozitivních kultur, základní onemocnění a závažnost onemocnění, přítomnost močových nebo intravaskulárních zařízení, nedávné imunomodulační terapie nebo radiační terapie, nálezy fyzikálních vyšetření, laboratorní a radiografické údaje, použití antimikrobiálních látek v rámci 30 dní od začátku infekce, mikrobiologická data a vzorce rezistence, výběr antibiotik, jakmile je organismus identifikován, bakteriologické výsledky, laboratorní výsledky, demografické informace, léky, klinický výsledek, pohlaví, výška, váha, etnická příslušnost a anamnéza. Informace budeme shromažďovat výhledově po dobu jednoho roku. Bakterie v kulturách pacienta budou subkultivovány (po získání diagnózy, protože mikrobiologická laboratoř by kulturu jinak zničila) a poskytnuty poctivému zprostředkovateli, který vzorek zbaví identifikace a spojí jej se shromážděnými lékařskými informacemi (což bude být také zbaven identifikace poctivým makléřem). Na těchto vzorcích bude provedeno následující hodnocení. Minimální inhibiční koncentrace antibiotika použitého v léčbě bude provedena metodou E-Test (AB Biodisk, Solna, Švédsko). Budou studovány specifické mechanismy antimikrobiální rezistence s důrazem na přítomnost beta-laktamáz produkovaných bakteriemi. Toto vyhodnocení bude provedeno analytickými izoelektrickými fokusačními technikami, stejně jako PCR a analýzou genového sekvenování pro určení genů kódujících beta-laktamázy. Biologické vzorky budou pod kontrolou hlavního řešitele tohoto výzkumného projektu. Všechny vzorky poskytnuté vyšetřovatelům jsou deidentifikovány poctivým makléřem a budou kódovány čísly. Informace spojující tato kódová čísla s odpovídajícími identitami subjektů budou uchovávány na samostatném, bezpečném místě, ke kterému má přístup pouze poctivý makléř. Vyšetřovatelé této studie si vzorky ponechají neomezeně dlouho. Vzorky budou uloženy v laboratoři vyšetřovatele ve Scaife Hall, místnost 812, 3500 Terrace Street. Výzkumní pracovníci nebudou mít v žádném okamžiku přístup k žádným identifikátorům pacientů. Informace o zdravotních záznamech a vzorky bakterií ze zařízení mimo UPMC budou poskytnuty PI deidentifikovaným. Nikdo z výzkumného týmu nebude mít nikdy přístup k identifikátorům pacientů. Všechny informace a bakterie jsou shromažďovány v rámci klinické léčby pacienta.