BRCA1 Haploinsufficiency i ekspresja genów

Konkretnym celem tego projektu jest przetestowanie hipotezy, że haploinsufficiency BRCA1 reguluje ekspresję genów na chromosomie X. Hipoteza ta zostanie zbadana poprzez określenie, czy profile ekspresji genów chromosomu X, pochodzące z RNA limfocytów, nosicielek mutacji BRCA1 (przypadki) można odróżnić od dopasowanej wiekowo grupy kobiet, które nie mają mutacji BRCA1 (kontrole). Ani przypadki, ani kontrole nie będą miały historii raka. To badanie dostarczy cennych informacji na temat biologicznych funkcji BRCA1 i jego roli w nowotworzeniu piersi i/lub jajników. Próbki krwi z przypadków będą pobierane od pacjentów, którzy wcześniej przeszli poradnictwo genetyczne za pośrednictwem Clinical Genetics Service w MSKCC i uzyskali pozytywny wynik testu na obecność mutacji germinalnej w BRCA1. Próbki krwi z kontroli będą pobierane z dwóch źródeł.

Najpierw z próbek pobranych już w ramach Protokołu IRB nr 99-030, zatytułowanego „Zbieranie tkanek, krwi i komórek do wykorzystania w badaniu przyczyn, profilaktyce, diagnostyce i leczeniu raka piersi (T. Król, PI). Kontrole zostaną również zebrane od pacjentów, którzy wcześniej przeszli poradnictwo genetyczne za pośrednictwem Clinical Genetics Service w MSKCC i uzyskali negatywny wynik testu na obecność mutacji germinalnych w BRCA1. Izolacja całkowitego RNA z krwi zostanie przeprowadzona przy użyciu systemu PAXgene™ Blood RNA. W tym badaniu zostaną wykorzystane próbki RNA limfocytów od 50 osób z mutacjami BRCA1 i 50 osób kontrolnych dobranych pod względem wieku. Profilowanie ekspresji genów zostanie przeprowadzone w Centralnym Laboratorium Genomiki MSKCC pod kierunkiem dr Agnes Viale. Analiza porównawcza klas zostanie przeprowadzona na danych dotyczących ekspresji genów w Zakładzie Biostatystyki pod kierunkiem dr Adama Olshena. Przewiduje się, że badanie to zostanie zakończone za około 1 rok.