BRCA1 Haploinsufficientia és génexpresszió

A projekt konkrét célja annak a hipotézisnek a tesztelése, hogy a BRCA1 haploinsufficiencia szabályozza a génexpressziót az X kromoszómán. Ezt a hipotézist megvizsgáljuk annak meghatározásával, hogy a BRCA1 mutációhordozók (esetek) limfocita RNS-ből származó X-kromoszóma génexpressziós profilja (esetek) megkülönböztethető-e a BRCA1 mutációval nem rendelkező nők korosztályos csoportjától (kontroll). Sem az esetek, sem a kontrollok nem tartalmaznak rákbetegséget. Ez a vizsgálat értékes betekintést nyújt a BRCA1 biológiai funkciójába és az emlő- és/vagy petefészek-daganatképződésben betöltött szerepébe. Az esetekből vérmintákat gyűjtenek azoktól a betegektől, akik korábban genetikai tanácsadáson estek át az MSKCC Klinikai Genetikai Szolgálatán keresztül, és pozitívnak bizonyultak a BRCA1 csíravonal-mutációjára. A kontrollokból származó vérmintákat két forrásból veszik.

Először a 99-030 számú IRB-protokoll alapján már gyűjtött mintákból, amelyek címe "Szövet-, vér- és sejtek összegyűjtése a mellrák okainak tanulmányozására, megelőzésére, diagnosztizálására és kezelésére (T. King, PI). A kontrollokat azoktól a betegektől is begyűjtik, akik korábban genetikai tanácsadáson estek át az MSKCC Klinikai Genetikai Szolgálatán keresztül, és a BRCA1 csíravonal-mutációira negatívnak bizonyultak. A teljes RNS izolálása a vérből a PAXgene™ Blood RNA System segítségével történik. Ez a vizsgálat 50 BRCA1 mutációval rendelkező egyén limfocita RNS mintáit és 50 korosztályos kontrollt használ. A génexpressziós profilalkotást az MSKCC Genomics Core Laboratory-ban végezzük Agnes Viale, PhD felügyelete mellett. A génexpressziós adatokon osztály-összehasonlító elemzést végeznek a Biostatisztikai Osztályon Adam Olshen, PhD felügyelete mellett. Ez a tanulmány várhatóan körülbelül 1 éven belül befejeződik.