BRCA1 Haploinsufficiency ja geenin ilmentyminen

Tämän projektin erityistavoitteena on testata hypoteesia, jonka mukaan BRCA1-haploinsufektiivisuus säätelee geenien ilmentymistä X-kromosomissa. Tätä hypoteesia tutkitaan määrittämällä, voidaanko BRCA1-mutaation kantajien (tapausten) X-kromosomin geeniekspressioprofiilit, jotka ovat peräisin lymfosyyttien RNA:sta, erottaa iästä vastaavasta naisten ryhmästä, jolla ei ole BRCA1-mutaatioita (kontrollit). Kummallakaan tapauksella tai kontrolleilla ei ole aiemmin ollut syöpää. Tämä tutkimus antaa arvokasta tietoa BRCA1:n biologisesta toiminnasta ja sen roolista rintojen ja/tai munasarjojen kasvainten muodostumisessa. Tapauksista kerätään verinäytteitä potilailta, jotka ovat aiemmin käyneet geneettisessä neuvonnassa MSKCC:n kliinisen geneettisen palvelun kautta ja joiden testi on positiivinen BRCA1:n ituradan mutaatiolle. Verinäytteet kontrolleista otetaan kahdesta lähteestä.

Ensin näytteistä, jotka on jo kerätty IRB-protokollan nro 99-030 mukaisesti, jonka otsikkona on "Rintasyövän syiden, ehkäisyn, diagnoosin ja hoidon tutkimiseen tarkoitettujen kudosten, veren ja solujen kerääminen (T. King, PI). Kontrollit kerätään myös potilailta, jotka ovat aiemmin käyneet geneettistä neuvontaa MSKCC:n kliinisen genetiikkapalvelun kautta ja joiden sukusolumutaatiot ovat olleet negatiivisia BRCA1:ssä. Kokonais-RNA:n eristäminen verestä suoritetaan käyttämällä PAXgene™ Blood RNA System -järjestelmää. Tässä tutkimuksessa käytetään lymfosyyttien RNA-näytteitä 50 yksilöstä, joilla on BRCA1-mutaatioita, ja 50 ikää vastaavalta kontrollilta. Geeniekspression profilointi suoritetaan MSKCC:n Genomics Core Laboratoryssa PhD Agnes Vialen valvonnassa. Luokkavertailuanalyysi suoritetaan biostatistiikkaosaston geeniekspressiotiedoille Adam Olshen, PhD valvonnassa. Tämän tutkimuksen odotetaan valmistuvan noin 1 vuoden kuluttua.