- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT03206099
Scentralizowany protokół sekwencjonowania NIAID
Tło:
Testy genetyczne zwane „sekwencjonowaniem” pomagają naukowcom spojrzeć na DNA. Geny są zbudowane z DNA i są instrukcjami dla naszego organizmu do funkcjonowania. Wszyscy mamy tysiące genów. Warianty DNA to różnice w genach między dwiema osobami. Wszyscy mamy wiele wariantów. Większość z nich jest nieszkodliwa, a niektóre powodują różnice, takie jak niebieskie lub brązowe oczy. Kilka wariantów może powodować problemy zdrowotne.
Cel:
Zrozumienie genetyki zaburzeń immunologicznych, różnych schorzeń, a także wyników genomiki klinicznej i poradnictwa genetycznego wykonywanych w ramach niniejszego protokołu.
Kwalifikowalność:
Uczestnicy innych protokołów badawczych NIH na ludziach – w Centrum Klinicznym NIH (CC) lub w Narodowym Systemie Zdrowia Dzieci (CNHS) – (w wieku 0-99 lat) oraz, w wybranych przypadkach, ich biologiczni krewni
Projekt:
Naukowcy będą badać DNA uczestnika wyekstrahowane z krwi, śliny lub innej próbki tkanki, w tym wcześniej pobrane próbki, które mogły być przechowywane w NIH. Badacze przyjrzą się DNA uczestnika bardzo szczegółowo. Szukamy różnic w sekwencji lub strukturze DNA między uczestnikami a innymi osobami.
Uczestnicy otrzymają wyniki, które:
- Są ważne dla ich zdrowia
- Zostały potwierdzone w laboratorium klinicznym
- Zasugeruj, że mogą być narażeni na poważną chorobę, która może wpłynąć na twoje obecne lub przyszłe leczenie.
Niektóre informacje genetyczne, które zwracamy uczestnikom, mogą mieć niepewne znaczenie.
Jeśli wyniki testów genetycznych nie są powiązane z ocenami NIH uczestnika, zazwyczaj nie będziemy zgłaszać:
- Normalne warianty
- Informacje o postępujących, śmiertelnych stanach, które nie mają skutecznego leczenia
- Status przewoźnika (warunki, których nie masz, ale możesz przekazać)
Próbki i dane zostaną zapisane do przyszłych badań.
Dane osobowe będą przechowywane tak prywatnie, jak to tylko możliwe.
Jeśli przyszłe badania będą wymagały nowych informacji, można skontaktować się z uczestnikami.
Przegląd badań
Status
Szczegółowy opis
Projekt badania: To badanie służy jako scentralizowany protokół sekwencjonowania dla badań naukowych prowadzonych przez NIH na ludziach w celu ułatwienia standaryzacji i konsolidacji gromadzenia danych dotyczących genotypu i fenotypu dla uczestniczących programów. Uczestnicy innych badań NIH zarówno w NIH CC, jak i CNHS, które obejmują badania genetyczne, mogą zapisać się do tego protokołu, a badania genetyczne będą przeprowadzane zgodnie z tym protokołem
badanie.
Cel: Podstawowy: generowanie i analizowanie dowodów dotyczących wkładu genetycznego w różne choroby immunologiczne i inne stany zdrowia
warunki badane przez program badań stacjonarnych NIH (IRP).
Drugorzędne: generowanie i analizowanie dowodów dotyczących procesów i wyników genomiki klinicznej i genetycznej
usługi doradcze wykonywane w ramach niniejszego protokołu.
Punkt końcowy: Pierwszorzędowy: Odrębny wkład genetyczny w choroby immunologiczne i inne schorzenia, w tym wyraźnie:
Ustalone zaburzenia genetyczne.
Nowe wady genetyczne.
Nowe fenotypy związane z ustaloną genetyką
zaburzenia.
Drugorzędne: baza dowodów na to, jak ulepszyć kliniczne usługi genomiczne w tym protokole i powiązanych programach.
STRESZCZAĆ
Badacze z Narodowego Instytutu Alergii i Chorób Zakaźnych (NIAID) wykorzystują technologie sekwencjonowania nowej generacji, aby pomóc określić wkład genetyczny w choroby immunologiczne. Wysiłki te zwiększyły wskaźniki diagnozy molekularnej dla podzbioru NIAID
uczestników, a także odkrył podstawowe informacje na temat szlaków komórkowych i sygnalizacyjnych w obronie gospodarza i regulacji immunologicznej.
Pomimo tych sukcesów analiza i interpretacja danych genomowych pozostaje poważnym wyzwaniem. Po prostu naukowcy nie rozumieją funkcjonalnych i klinicznych konsekwencji większości ludzkich zmienności genetycznych. Dotyczy to NIAID i całego programu badań stacjonarnych. Czynienie postępów w tej dziedzinie wymaga skoordynowanego, systematycznego i przejrzystego podejścia
badania genomiki klinicznej.
Ten protokół jest specyficzny dla testów genetycznych i wyraźnie ma na celu zarówno wzmocnienie opieki klinicznej, jak i usprawnienie badań w ramach programów uczestniczących w NIH. Probandy dostarczą próbki biologiczne do testów genetycznych i będą musieli zostać zapisani do podstawowego protokołu, który przeprowadzi podstawowe oceny kliniczne i badawcze. Protokół ten służy jako nośnik dla
programowy wysiłek, który obejmuje standaryzowane fenotypowanie, zamawianie testów za pośrednictwem Systemu Informacji o Badaniach Klinicznych (CRIS), pobieranie i izolację próbek, analizę kwasów nukleinowych, bioinformatykę, interpretację kliniczną, raportowanie w CRIS, poradnictwo genetyczne i wspieranie efektywnego wykorzystania genomiki jako narzędzia badawczego w całym programie stacjonarnym. Wyniki i dane badań genetycznych (na żądanie) zostaną udostępnione zespołom badawczym dla protokołów, na które dany uczestnik jest współzarejestrowany. Ogólnie rzecz biorąc, zwiększona standaryzacja procesów będzie wspierać integralność i wydajność danych, jednocześnie zaspokajając potrzebę elastyczności badaczy.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Morgan N Similuk
- Numer telefonu: (301) 435-6691
- E-mail: morgan.similuk@nih.gov
Lokalizacje studiów
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Stany Zjednoczone, 20010
- Rekrutacyjny
- Children's National Health System
-
Kontakt:
- Michael Keller, MD
- Numer telefonu: 202-476-5843
- E-mail: mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Stany Zjednoczone, 20892
- Rekrutacyjny
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Kontakt:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Numer telefonu: TTY dial 711 800-411-1222
- E-mail: ccopr@nih.gov
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
- KRYTERIA WŁĄCZENIA UCZESTNIKÓW:
Musi spełniać jedno z poniższych kryteriów:
- Uczestnicy probandu: muszą mieć chorobę badaną przez inny protokół NIH, w którym są współzarejestrowani.
- Biologiczni krewni: biologicznie spokrewnieni z uczestnikiem probanda i nie mają choroby badanej w innym protokole NIH.
- Zdrowi ochotnicy: nie spokrewnieni z uczestnikiem probanda i nie mają choroby badanej w innym protokole NIH.
- Wiek 0-99 lat.
- Uczestnicy muszą wyrazić chęć poddania się badaniom genetycznym.
- Uczestnicy muszą wyrazić zgodę na przechowywanie próbek do przyszłych badań.
- Uczestnicy muszą wyrazić zgodę na udostępnianie ich danych genomowych, których dane identyfikacyjne zostały pozbawione elementów umożliwiających identyfikację, na przykład w bazach danych o kontrolowanym dostępie, takich jak baza danych genotypów i fenotypów (dbGaP).
- Dorośli zdrowi ochotnicy muszą być w stanie wyrazić świadomą zgodę.
KRYTERIA WYKLUCZENIA UCZESTNIKÓW:
Każdy stan, który w opinii badacza stanowi przeciwwskazanie do udziału w tym badaniu, jest powodem wykluczenia.
Wytyczne dotyczące wspólnej rejestracji:
Probandy muszą być zarejestrowane w innym protokole NIH – albo w CC NIH, albo w CNHS – jako ich podstawowy protokół do przeprowadzania ocen klinicznych i badawczych. Krewni probantów mogą zostać objęci tym protokołem, niezależnie od tego, czy krewni są zapisani w innym protokole NIH. Możemy jednak nadać priorytet rejestrowaniu krewnych, którzy są na innych protokołach NIH i przeszli staranne fenotypowanie na tych protokołach. Ostrożne fenotypowanie jest ważne, nawet dla uczestników, którzy wydają się być zdrowi. Ponieważ główny zespół badawczy najlepiej nadaje się do scharakteryzowania fenotypów swoich uczestników, fenotypowanie współzarejestrowanych krewnych zostanie przeprowadzone na podstawie podstawowych protokołów.
KRYTERIA WŁĄCZENIA DO BADANIA PODBADANIA:
- Wiek 14-99 lat.
- Biegłość w języku angielskim.
- Możliwość wyrażenia świadomej zgody.
KRYTERIA WYKLUCZENIA BADAŃ PODBADANIA:
- Otrzymali pozytywne wyniki genetyczne z tego protokołu w przeszłości.
- Każdy stan, który w opinii badacza stanowi przeciwwskazanie do udziału w tym badaniu cząstkowym.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Oparte na rodzinie
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Krewni biologiczni
Biologiczni krewni probantów, którzy mogą, ale nie muszą, być również wpisani do protokołu odsyłającego probanta.
|
|
Zdrowi ochotnicy
Wybierz kontrole wewnętrzne
|
|
Probandy
Uczestnicy z chorobą badaną przez inny protokół NIAID, do którego są zapisani, w NIH lub CNHS.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Identyfikacja nowych defektów genetycznych związanych z zaburzeniami odporności
Ramy czasowe: Po analizie danych genomowych
|
Identyfikacja nowych defektów genetycznych związanych z zaburzeniami odporności
|
Po analizie danych genomowych
|
|
Identyfikacja nowych fenotypów klinicznych związanych z ustalonymi defektami genetycznymi
Ramy czasowe: Po analizie danych genomowych
|
Identyfikacja nowych fenotypów klinicznych związanych z ustalonymi defektami genetycznymi
|
Po analizie danych genomowych
|
|
Identyfikacja stwierdzonych zaburzeń genetycznych układu odpornościowego
Ramy czasowe: Po analizie danych genomowych
|
Identyfikacja ustalonych zaburzeń genetycznych układu odpornościowego, a także w niektórych przypadkach znanych zaburzeń genetycznych poza układem odpornościowym
|
Po analizie danych genomowych
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Baza dowodów na to, jak ulepszyć kliniczne usługi genomiczne w tym protokole i powiązanych programach.
Ramy czasowe: 5.1.1. Ankieta dotycząca zrozumienia raportu rejestracyjnego/poziomu bazowego i częściowo ustrukturyzowane wywiady telefoniczne
|
Badania procesów i wyników genomiki klinicznej i poradnictwa genetycznego wykonywanych w ramach niniejszego protokołu.
Badania te będą wykorzystywać ankiety, wywiady i inne metody badań społecznych i behawioralnych w celu zebrania danych od uczestników badania na temat ich postrzegania, doświadczeń i postaw związanych z ich stanem i uczestnictwem w tym protokole.
Celem tych dodatkowych badań będzie poprawa usług świadczonych w ramach protokołu 17-I-0122 oraz stworzenie bazy dowodowej dla innych badaczy prowadzących podobne badania.
|
5.1.1. Ankieta dotycząca zrozumienia raportu rejestracyjnego/poziomu bazowego i częściowo ustrukturyzowane wywiady telefoniczne
|
Współpracownicy i badacze
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Przydatne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 170122
- 17-I-0122
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Pierwotny niedobór odporności
-
Cairo UniversityJeszcze nie rekrutacjaCarious Primary | Carious przedniEgipt