- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT03206099
NIAID Centralized Sequencing Protocol
Bakgrund:
Genetisk testning som kallas "sekvensering" hjälper forskare att titta på DNA. Gener är gjorda av DNA och är instruktionerna för våra kroppar att fungera. Vi har alla tusentals gener. DNA-varianter är skillnader i gener mellan två personer. Vi har alla massor av varianter. De flesta är ofarliga och vissa orsakar skillnader som blå eller bruna ögon. Ett fåtal varianter kan orsaka hälsoproblem.
Mål:
För att förstå genetiken av immunsjukdomar olika hälsotillstånd, såväl som resultat av klinisk genomik och genetiska rådgivningstjänster som utförs under detta protokoll.
Behörighet:
Deltagare i andra NIH-forskningsprotokoll för mänskliga försökspersoner - antingen vid NIH Clinical Center (CC) eller på Children's National Health System (CNHS) - (i åldern 0-99 år), och, i vissa fall, deras biologiska släktingar
Design:
Forskare kommer att studera deltagarens DNA extraherat från blod, saliv eller annat vävnadsprov, inklusive tidigare insamlade prover som vi kan ha lagrat på NIH. Forskare kommer att titta på deltagarens DNA i detalj. Vi letar efter skillnader i DNA-sekvensen eller strukturen mellan deltagare och andra personer.
Deltagarna kommer att få resultat som:
- Är viktiga för deras hälsa
- Har bekräftats i ett kliniskt labb
- Föreslå att de kan vara i riskzonen för allvarlig sjukdom som kan påverka din nuvarande eller framtida medicinska behandling.
Viss genetisk information som vi lämnar tillbaka till deltagarna kan vara av osäker betydelse.
Om genetiska testresultat inte är relaterade till deltagarens NIH-utvärderingar kommer vi vanligtvis inte att rapportera:
- Normala varianter
- Information om progressiva, dödliga tillstånd som inte har någon effektiv behandling
- Operatörsstatus (villkor som du inte har men kan föra vidare)
Proverna och data kommer att sparas för framtida forskning.
Personuppgifter kommer att hållas så privata som möjligt.
Om framtida studier behöver ny information kan deltagarna kontaktas.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Detaljerad beskrivning
Studiedesign: Denna studie fungerar som ett centraliserat sekvenseringsprotokoll för NIH-studier av mänskliga försökspersoner för att underlätta standardisering och konsolidera insamling av genotyp- och fenotypdata för deltagande program. Deltagare i andra NIH-studier både vid NIH CC och CNHS som inkluderar genetisk testning kan registrera sig i detta protokoll och genetisk testning kommer att utföras under detta
studie.
Mål: Primärt: Att generera och analysera bevis avseende det genetiska bidraget till olika immunsjukdomar och annan hälsa
förhållanden som studerats av NIHs intramurala forskningsprogram (IRP).
Sekundärt: Att generera och analysera bevis avseende processer och resultat av klinisk genomik och genetisk
rådgivningstjänster som utförs enligt detta protokoll.
Endpoint: Primär: Diskreta genetiska bidrag till immunsjukdomar och andra hälsotillstånd, uttryckligen inklusive:
Etablerade genetiska störningar.
Nya genetiska defekter.
Nya fenotyper associerade med etablerad genetisk
störningar.
Sekundärt: Evidensbas för hur man kan förbättra kliniska genomiska tjänster på detta protokoll och relaterade program.
PRECIS
Utredare vid National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) använder nästa generations sekvenseringsteknik för att hjälpa till att fastställa genetiska bidrag till immunsjukdomar. Dessa ansträngningar har ökat frekvensen av molekylär diagnos för en undergrupp av NIAID
deltagare samt avslöjade grundläggande insikter i cellulära och signalvägar i värdförsvar och immunreglering.
Trots dessa framgångar är analys och tolkning av genomiska data fortfarande en stor utmaning. Helt enkelt förstår forskarna inte de funktionella och kliniska konsekvenserna av de flesta mänskliga genetiska variationer. Detta gäller vid NIAID och över det intramurala forskningsprogrammet. För att göra framsteg på detta område krävs ett samordnat, systematiskt och öppet förhållningssätt till
klinisk genomikforskning.
Detta protokoll är specifikt för genetisk testning och syftar uttryckligen till att både stärka den kliniska vården och förbättra forskningen genom deltagande program vid NIH. Probands kommer att tillhandahålla biologiska prover för genetisk testning och kommer att behöva registreras på ett primärt protokoll, som kommer att utföra de primära kliniska och forskningsutvärderingar. Detta protokoll fungerar som ett fordon för en
programmatisk insats som inkluderar standardiserad fenotypning, testbeställning genom Clinical Research Information System (CRIS), provinsamling och isolering, nukleinsyraanalys, bioinformatik, klinisk tolkning, rapportering i CRIS, genetisk rådgivning och stödja effektiv användning av genomik som forskningsverktyg under hela det intramurala programmet. Genetiska testresultat och data (på begäran) kommer att delas med forskarteamen för protokoll där en given deltagare är medregistrerad. Sammantaget kommer ökad processstandardisering att stödja dataintegritet och effektivitet samtidigt som det tillgodoser behovet av utredares flexibilitet.
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Morgan N Similuk
- Telefonnummer: (301) 435-6691
- E-post: morgan.similuk@nih.gov
Studieorter
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Förenta staterna, 20010
- Rekrytering
- Children's National Health System
-
Kontakt:
- Michael Keller, MD
- Telefonnummer: 202-476-5843
- E-post: mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Förenta staterna, 20892
- Rekrytering
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Kontakt:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Telefonnummer: TTY dial 711 800-411-1222
- E-post: ccopr@nih.gov
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
- KRITERIER FÖR DELTAGARE:
Måste uppfylla något av följande kriterier:
- Probanddeltagare: måste ha en sjukdom som undersöks enligt ett annat NIH-protokoll som de är medregistrerade på.
- Biologiska släktingar: biologiskt släkt med en proband deltagare och har inte en sjukdom som undersöks i ett annat NIH-protokoll.
- Friska frivilliga: inte släkt med en proband deltagare och har inte en sjukdom som undersöks i ett annat NIH-protokoll.
- Åldern 0-99 år.
- Deltagarna måste vara villiga att genomgå genetiska tester.
- Deltagarna måste vara villiga att tillåta att prover lagras för framtida forskning.
- Deltagarna måste vara villiga att få sina avidentifierade genomiska data delade, till exempel i databaser med kontrollerad åtkomst som Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP).
- Vuxna friska frivilliga måste kunna ge informerat samtycke.
EXKLUSIONSKRITERIER FÖR DELTAGARE:
Varje tillstånd som, enligt utredarens uppfattning, kontraindicerar deltagande i denna studie är ett skäl för uteslutning.
Riktlinjer för samregistrering:
Probands måste vara registrerade på ett annat NIH - antingen vid NIH CC eller CNHS - protokoll som deras primära protokoll för att utföra kliniska och forskningsutvärderingar. Släktingar till probands kan registreras i detta protokoll oavsett om släktingarna är inskrivna på ett annat NIH-protokoll eller inte. Däremot kan vi prioritera att registrera släktingar som har andra NIH-protokoll och som har genomgått noggrann fenotypning av dessa protokoll. Noggrann fenotypning är viktigt, även för deltagare som till synes är friska. Eftersom den primära forskargruppen är bäst lämpad för att karakterisera deltagarnas fenotyper, kommer fenotypning av medenrollerade släktingar att utföras på de primära protokollen.
INKLUSIONSKRITERIER FÖR UNDERVISNING:
- I åldern 14-99 år.
- Engelska språkkunskaper.
- Förmåga att ge informerat samtycke.
UNDANTAGSKRITERIER FÖR SUBSTUDIE:
- Har fått positiva genetiska resultat från detta protokoll tidigare.
- Varje tillstånd som, enligt utredarens uppfattning, kontraindikerar deltagande i denna delstudie.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Familjebaserat
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
|---|
|
Biologiska släktingar
Biologiska släktingar till probander, som eventuellt eller inte också är medregistrerade på probandens hänvisningsprotokoll.
|
|
Friska volontärer
Välj interna kontroller
|
|
Probands
Deltagare med en sjukdom som undersöks av ett annat NIAID-protokoll som de är inskrivna på, antingen vid NIH eller CNHS.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Identifiera nya genetiska defekter associerade med immunsjukdomar
Tidsram: Vid analys av genomiska data
|
Identifiera nya genetiska defekter associerade med immunsjukdomar
|
Vid analys av genomiska data
|
|
Identifiera nya kliniska fenotyper associerade med etablerade genetiska defekter
Tidsram: Vid analys av genomiska data
|
Identifiera nya kliniska fenotyper associerade med etablerade genetiska defekter
|
Vid analys av genomiska data
|
|
Identifiera etablerade genetiska störningar i immunsystemet
Tidsram: Vid analys av genomiska data
|
Identifiera etablerade genetiska störningar i immunsystemet, såväl som kända genetiska störningar utanför immunsystemet i vissa fall
|
Vid analys av genomiska data
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Evidensbas för hur man kan förbättra kliniska genomiska tjänster på detta protokoll och relaterade program.
Tidsram: 5.1.1. Inskrivnings-/grundrapportens förståelseundersökning och semistrukturerade telefonintervjuer
|
Studier av processerna och resultaten av klinisk genomik och genetisk rådgivning som utförs enligt detta protokoll.
Dessa studier kommer att använda undersökningar, intervjuer och andra sociala och beteendemässiga forskningsmetoder för att samla in data från studiedeltagare om deras uppfattningar, erfarenheter och attityder relaterade till deras tillstånd och deltagande i detta protokoll.
Målet med dessa ytterligare studier kommer att vara att förbättra de tjänster som tillhandahålls enligt protokoll 17-I-0122 och att skapa en evidensbas för andra utredare som genomför liknande studier.
|
5.1.1. Inskrivnings-/grundrapportens förståelseundersökning och semistrukturerade telefonintervjuer
|
Samarbetspartners och utredare
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 170122
- 17-I-0122
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
IPD-planbeskrivning
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Primär immunbrist
-
Cairo UniversityHar inte rekryterat ännuCarious Primary | Karrious anteriorsEgypten
-
St. Louis Joint Replacement InstituteOkändOmvänd eller Primary Total Shoulder | Rotator Manschett- Full Tjocklek- ReparationFörenta staterna
-
Janssen-Cilag International NVAvslutadInfektioner av humant immunbristvirus (HIV). | Aids-virus (Acquired Immunodeficiency Syndrome).Frankrike, Storbritannien, Belgien, Tyskland, Spanien, Schweiz, Danmark, Israel, Österrike, Polen, Ungern, Sverige, Irland
-
Shanghai General Hospital, Shanghai Jiao Tong University...4B Technologies LimitedHar inte rekryterat ännuGlaukom, vinkelstängning | Optisk neuropati | NAION - Icke-arteritisk ischemisk optikusneuropati | APAC - Acute Primary Angle ClosureKina