Protocolo de Sequenciamento Centralizado NIAID
Fundo:
Testes genéticos chamados de "sequenciamento" ajudam os pesquisadores a analisar o DNA. Os genes são feitos de DNA e são as instruções para o funcionamento de nossos corpos. Todos nós temos milhares de genes. Variantes de DNA são diferenças em genes entre duas pessoas. Todos nós temos muitas variantes. A maioria é inofensiva e algumas causam diferenças como olhos azuis ou castanhos. Algumas variantes podem causar problemas de saúde.
Objetivo:
Compreender a genética dos distúrbios imunológicos em várias condições de saúde, bem como os resultados dos serviços de genômica clínica e aconselhamento genético realizados sob este protocolo.
Elegibilidade:
Participantes de outros protocolos de pesquisa com seres humanos do NIH - seja no NIH Clinical Center (CC) ou no Children s National Health System (CNHS) - (idade de 0 a 99 anos) e, em casos selecionados, seus parentes biológicos
Projeto:
Os pesquisadores estudarão o DNA do participante extraído do sangue, saliva ou outra amostra de tecido, incluindo amostras coletadas anteriormente que podemos ter armazenado no NIH. Os pesquisadores examinarão detalhadamente o DNA dos participantes. Estamos procurando diferenças na sequência ou estrutura do DNA entre os participantes e outras pessoas.
Os participantes receberão resultados que:
- São importantes para sua saúde
- Foram confirmados em um laboratório clínico
- Sugira que eles podem estar em risco de doença grave que pode afetar seu tratamento médico atual ou futuro.
Algumas informações genéticas que devolvemos aos participantes podem ser de importância incerta.
Se os resultados do teste genético não estiverem relacionados às avaliações do NIH do participante, normalmente não relataremos:
- variantes normais
- Informações sobre condições progressivas e fatais que não têm tratamento eficaz
- Status de portador (condições que você não tem, mas pode transmitir)
As amostras e os dados serão salvos para pesquisas futuras.
Os dados pessoais serão mantidos o mais privados possível.
Se estudos futuros precisarem de novas informações, os participantes podem ser contatados.
Visão geral do estudo
Status
Descrição detalhada
Projeto do estudo: Este estudo serve como um protocolo de sequenciamento centralizado para estudos de pesquisa em seres humanos do NIH para facilitar a padronização e consolidar o acúmulo de dados de genótipo e fenótipo para os programas participantes. Os participantes de outros estudos do NIH no NIH CC e no CNHS que incluam testes genéticos podem se inscrever neste protocolo e os testes genéticos serão conduzidos sob este
estudar.
Objetivo: Primário: Gerar e analisar evidências sobre a contribuição genética para diversas doenças imunológicas e outras doenças
condições estudadas pelo programa de pesquisa intramural do NIH (IRP).
Secundário: Gerar e analisar evidências sobre os processos e resultados da genômica clínica e genética
serviços de aconselhamento prestados ao abrigo deste protocolo.
Ponto final: Primário: Contribuições genéticas discretas para doenças imunológicas e outras condições de saúde, incluindo explicitamente:
Distúrbios genéticos estabelecidos.
Novos defeitos genéticos.
Novos fenótipos associados com genética estabelecida
transtornos.
Secundário: Base de evidências de como melhorar os serviços de genômica clínica neste protocolo e programas relacionados.
PRECIS
Os investigadores do Instituto Nacional de Alergia e Doenças Infecciosas (NIAID) usam tecnologias de sequenciamento de última geração para ajudar a determinar as contribuições genéticas para doenças imunológicas. Esses esforços aumentaram as taxas de diagnóstico molecular para um subconjunto de NIAID
participantes, bem como revelaram percepções fundamentais sobre as vias celulares e de sinalização na defesa do hospedeiro e na regulação imunológica.
Apesar desses sucessos, a análise e a interpretação dos dados genômicos continuam sendo um desafio substancial. Simplesmente, os pesquisadores não entendem as consequências funcionais e clínicas da maioria das variações genéticas humanas. Isso é verdade no NIAID e em todo o programa de pesquisa intramural. Avançar nessa área requer uma abordagem coordenada, sistemática e transparente para
pesquisa em genômica clínica.
Este protocolo é específico para testes genéticos e visa explicitamente fortalecer o atendimento clínico e aprimorar a pesquisa em todos os programas participantes do NIH. Os probandos fornecerão espécimes biológicos para testes genéticos e deverão ser inscritos em um protocolo primário, que executará as avaliações clínicas e de pesquisa primárias. Este protocolo serve como um veículo para um
esforço programático que inclui fenotipagem padronizada, solicitação de testes por meio do Sistema de Informação de Pesquisa Clínica (CRIS), coleta e isolamento de amostras, análise de ácidos nucleicos, bioinformática, interpretação clínica, relatórios em CRIS, aconselhamento genético e apoio ao uso eficaz da genômica como ferramenta de pesquisa ao longo do programa interno. Os resultados e dados dos testes genéticos (mediante solicitação) serão compartilhados com as equipes de pesquisa para os protocolos nos quais um determinado participante é co-inscrito. No geral, o aumento da padronização do processo dará suporte à integridade e eficiência dos dados, ao mesmo tempo em que acomoda a necessidade de flexibilidade do investigador.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Morgan N Similuk
- Número de telefone: (301) 435-6691
- E-mail: morgan.similuk@nih.gov
Locais de estudo
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District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Estados Unidos, 20010
- Recrutamento
- Children's National Health System
-
Contato:
- Michael Keller, MD
- Número de telefone: 202-476-5843
- E-mail: mkeller@childrensnational.org
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Maryland
-
Bethesda, Maryland, Estados Unidos, 20892
- Recrutamento
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Contato:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Número de telefone: TTY dial 711 800-411-1222
- E-mail: ccopr@nih.gov
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
- CRITÉRIOS DE INCLUSÃO DO PARTICIPANTE:
Deve preencher um dos seguintes critérios:
- Participantes do probando: devem ter uma doença sob investigação por outro protocolo do NIH no qual estão co-inscritos.
- Parentes biológicos: aparentados biologicamente com um participante do probando, e não possuem doença sob investigação em outro protocolo do NIH.
- Voluntários saudáveis: sem parentesco com participante do probando e sem doença sob investigação em outro protocolo do NIH.
- Idade 0-99 anos.
- Os participantes devem estar dispostos a passar por testes genéticos.
- Os participantes devem estar dispostos a permitir que as amostras sejam armazenadas para pesquisas futuras.
- Os participantes devem estar dispostos a compartilhar seus dados genômicos não identificados, por exemplo, em bancos de dados de acesso controlado, como o Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos (dbGaP).
- Voluntários adultos saudáveis devem ser capazes de fornecer consentimento informado.
CRITÉRIOS DE EXCLUSÃO DO PARTICIPANTE:
Qualquer condição que, na opinião do investigador, contraindique a participação neste estudo é motivo de exclusão.
Orientações para co-inscrição:
Os probandos devem estar inscritos em outro protocolo do NIH - seja no NIH CC ou CNHS - como seu protocolo principal para a realização de avaliações clínicas e de pesquisa. Parentes de probandos podem ser inscritos neste protocolo estando ou não os parentes inscritos em outro protocolo do NIH. No entanto, podemos priorizar a inscrição de parentes que estão em outros protocolos do NIH e foram submetidos a fenotipagem cuidadosa nesses protocolos. A fenotipagem cuidadosa é importante, mesmo para participantes aparentemente saudáveis. Como a equipe de pesquisa primária é mais adequada para caracterizar os fenótipos de seus participantes, a fenotipagem de parentes co-inscritos será realizada nos protocolos primários.
CRITÉRIOS DE INCLUSÃO DE SUBESTUDO:
- Idade 14-99 anos.
- Proficiência na língua Inglesa.
- Capacidade de fornecer consentimento informado.
CRITÉRIOS DE EXCLUSÃO DE SUBESTUDO:
- Recebeu resultados genéticos positivos deste protocolo no passado.
- Qualquer condição que, na opinião do investigador, contraindique a participação neste subestudo.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Familiar
- Perspectivas de Tempo: Prospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Parentes biológicos
Parentes biológicos de probandos, que podem ou não ser co-inscritos no protocolo de referência do probando.
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Voluntários saudáveis
Selecione os controles internos
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Probands
Participantes com doença sob investigação por outro protocolo do NIAID no qual estejam inscritos, seja no NIH ou CNHS.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Identificação de novos defeitos genéticos associados a distúrbios imunológicos
Prazo: Após análise de dados genômicos
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Identificação de novos defeitos genéticos associados a distúrbios imunológicos
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Após análise de dados genômicos
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Identificação de novos fenótipos clínicos associados a defeitos genéticos estabelecidos
Prazo: Após análise de dados genômicos
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Identificação de novos fenótipos clínicos associados a defeitos genéticos estabelecidos
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Após análise de dados genômicos
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Identificar distúrbios genéticos estabelecidos do sistema imunológico
Prazo: Após análise de dados genômicos
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Identificar distúrbios genéticos estabelecidos do sistema imunológico, bem como distúrbios genéticos conhecidos fora do sistema imunológico em alguns casos
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Após análise de dados genômicos
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Base de evidências de como melhorar os serviços de genômica clínica neste protocolo e programas relacionados.
Prazo: 5.1.1. Inscrição/Pesquisa de Compreensão de Relatório de Linha de Base e Entrevistas Semi-Estruturadas por Telefone
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Estudos dos processos e resultados dos serviços de genômica clínica e aconselhamento genético realizados no âmbito deste protocolo.
Esses estudos usarão pesquisas, entrevistas e outros métodos de pesquisa social e comportamental para coletar dados dos participantes do estudo sobre suas percepções, experiências e atitudes relacionadas à sua condição e participação neste protocolo.
O objetivo desses estudos adicionais será melhorar os serviços prestados sob o protocolo 17-I-0122 e gerar uma base de evidências para outros investigadores conduzindo estudos semelhantes.
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5.1.1. Inscrição/Pesquisa de Compreensão de Relatório de Linha de Base e Entrevistas Semi-Estruturadas por Telefone
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Colaboradores e Investigadores
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Links úteis
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 170122
- 17-I-0122
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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