- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT03206099
NIAID Centralised Sequencing Protocol
Tausta:
Geneettinen testaus, jota kutsutaan "sekvensoinniksi", auttaa tutkijoita tarkastelemaan DNA:ta. Geenit koostuvat DNA:sta ja ovat kehomme toimintaohjeita. Meillä kaikilla on tuhansia geenejä. DNA-muunnokset ovat kahden ihmisen välisiä eroja geeneissä. Meillä kaikilla on monia muunnelmia. Useimmat ovat vaarattomia ja jotkut aiheuttavat eroja, kuten siniset tai ruskeat silmät. Muutama versio voi aiheuttaa terveysongelmia.
Tavoite:
Ymmärtää immuunihäiriöiden genetiikkaa ja erilaisia terveystiloja sekä kliinisen genomiikan ja tämän protokollan mukaisten geneettisten neuvontapalveluiden tuloksia.
Kelpoisuus:
Osallistujat muihin NIH-ihmisaiheisten tutkimuskäytäntöihin - joko NIH Clinical Centerissä (CC) tai Children's National Health Systemissä (CNHS) - (0-99-vuotiaat) ja tietyissä tapauksissa heidän biologiset sukulaisensa
Design:
Tutkijat tutkivat osallistujien DNA:ta, joka on uutettu verestä, syljestä tai muusta kudosnäytteestä, mukaan lukien aiemmin kerätyt näytteet, jotka olemme saaneet säilyttää NIH:ssa. Tutkijat tarkastelevat osallistujan DNA:ta hyvin yksityiskohtaisesti. Etsimme eroja DNA-sekvenssissä tai rakenteessa osallistujien ja muiden ihmisten välillä.
Osallistujat saavat tuloksia, jotka:
- Ovat tärkeitä heidän terveydelleen
- Ne on varmistettu kliinisessä laboratoriossa
- Ehdota, että he voivat olla vaarassa saada vakava sairaus, joka voi vaikuttaa nykyiseen tai tulevaan hoitoon.
Jotkut osallistujille palauttamamme geneettiset tiedot voivat olla epävarmoja.
Jos geneettisten testien tulokset eivät liity osallistujan NIH-arviointiin, emme yleensä raportoi:
- Normaalit variantit
- Tietoja progressiivisista, kuolemaan johtavista tiloista, joilla ei ole tehokasta hoitoa
- Operaattorin tila (olosuhteet, joita sinulla ei ole, mutta voit siirtyä eteenpäin)
Näytteet ja tiedot tallennetaan tulevaa tutkimusta varten.
Henkilötiedot säilytetään mahdollisimman yksityisinä.
Jos tulevat tutkimukset tarvitsevat uutta tietoa, osallistujiin voidaan ottaa yhteyttä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tutkimuksen suunnittelu: Tämä tutkimus toimii keskitettynä sekvensointiprotokollana NIH-ihmisaiheisten tutkimusten tutkimuksille, jotka helpottavat standardointia ja vahvistavat genotyyppi- ja fenotyyppitietojen keräämistä osallistuvia ohjelmia varten. Muihin NIH:n tutkimuksiin sekä NIH CC:ssä että CNHS:ssä, jotka sisältävät geneettistä testausta, osallistujat voivat ilmoittautua tähän protokollaan ja geneettinen testaus suoritetaan tämän mukaisesti.
opiskella.
Tavoite: Ensisijainen: tuottaa ja analysoida todisteita geneettisestä vaikutuksesta erilaisiin immuunisairauksiin ja muihin terveyteen
NIH:n intramuraalisen tutkimusohjelman (IRP) tutkimat olosuhteet.
Toissijainen: Luoda ja analysoida todisteita kliinisen genomiikan ja genetiikan prosesseista ja tuloksista
tämän protokollan mukaiset neuvontapalvelut.
Päätepiste: Ensisijainen: Erillinen geneettinen vaikutus immuunisairauksiin ja muihin terveystiloihin, mukaan lukien:
Todetut geneettiset häiriöt.
Uusia geneettisiä vikoja.
Uudet fenotyypit, jotka liittyvät vakiintuneeseen geneettiseen
häiriöt.
Toissijainen: Todistepohja kliinisen genomipalvelun parantamiseksi tässä protokollassa ja siihen liittyvissä ohjelmissa.
TARKKAA
National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) -tutkijat käyttävät seuraavan sukupolven sekvensointitekniikoita auttaakseen määrittämään immuunisairauksien geneettisen vaikutuksen. Nämä ponnistelut ovat lisänneet molekyylidiagnoosien määrää NIAID:n osajoukossa
osallistujat sekä paljastivat perustavanlaatuisia näkemyksiä solu- ja signalointireiteistä isäntäpuolustuksessa ja immuunisäätelyssä.
Näistä onnistumisista huolimatta genomitietojen analysointi ja tulkinta on edelleen suuri haaste. Tutkijat eivät yksinkertaisesti ymmärrä useimpien ihmisen geneettisten variaatioiden toiminnallisia ja kliinisiä seurauksia. Tämä pätee NIAID:ssä ja koko sisäisessä tutkimusohjelmassa. Edistyminen tällä alalla edellyttää koordinoitua, järjestelmällistä ja avointa lähestymistapaa
kliininen genomitutkimus.
Tämä protokolla on spesifinen geneettiselle testaukselle ja sen nimenomaisena tavoitteena on sekä vahvistaa kliinistä hoitoa että tehostaa tutkimusta NIH:n osallistuvissa ohjelmissa. Probands toimittaa biologisia näytteitä geneettistä testausta varten, ja ne on rekisteröitävä ensisijaiseen protokollaan, joka suorittaa ensisijaiset kliiniset ja tutkimusarvioinnit. Tämä protokolla toimii kulkuvälineenä a
ohjelmallinen panostus, joka sisältää standardoidun fenotyypityksen, testien tilaamisen kliinisen tutkimuksen tietojärjestelmän (CRIS) kautta, näytteiden keräämisen ja eristämisen, nukleiinihappoanalyysin, bioinformatiikan, kliinisen tulkinnan, raportoinnin CRISissä, geneettistä neuvontaa ja genomiikan tehokkaan käytön tukemisen tutkimustyökaluna. koko intramuraalisen ohjelman ajan. Geenitestien tulokset ja tiedot (pyynnöstä) jaetaan tutkimusryhmien kanssa protokollista, joihin tietty osallistuja on rekisteröitynyt. Kaiken kaikkiaan lisääntynyt prosessien standardointi tukee tietojen eheyttä ja tehokkuutta samalla, kun otetaan huomioon tutkijoiden joustavuuden tarve.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Morgan N Similuk
- Puhelinnumero: (301) 435-6691
- Sähköposti: morgan.similuk@nih.gov
Opiskelupaikat
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Yhdysvallat, 20010
- Rekrytointi
- Children's National Health System
-
Ottaa yhteyttä:
- Michael Keller, MD
- Puhelinnumero: 202-476-5843
- Sähköposti: mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Yhdysvallat, 20892
- Rekrytointi
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Ottaa yhteyttä:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Puhelinnumero: TTY dial 711 800-411-1222
- Sähköposti: ccopr@nih.gov
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
- OSALLISTUJAN SISÄLTÖPERUSTEET:
On täytettävä jokin seuraavista kriteereistä:
- Proband-osallistujat: hänellä on oltava sairaus, jota tutkitaan toisella NIH-protokollalla, johon he ovat mukana.
- Biologiset sukulaiset: biologisesti sukua proband-osallistujalle, eikä hänellä ole toisessa NIH-protokollassa tutkittavaa sairautta.
- Terveet vapaaehtoiset: eivät liity tutkittavaan osallistujaan, eikä heillä ole toisessa NIH-protokollassa tutkittavaa sairautta.
- Ikäraja 0-99 vuotta.
- Osallistujien on oltava valmiita geneettiseen testaukseen.
- Osallistujien on oltava valmiita sallimaan näytteiden säilyttäminen tulevaa tutkimusta varten.
- Osallistujien on oltava halukkaita jakamaan de-identifioidut genomitietonsa esimerkiksi valvotun pääsyn tietokantoihin, kuten genotyyppien ja fenotyyppien tietokanta (dbGaP).
- Terveiden aikuisten vapaaehtoisten on kyettävä antamaan tietoinen suostumus.
OSALLISTUJIEN POISULKOMISKRITEERIT:
Kaikki olosuhteet, jotka tutkijan mielestä estävät osallistumisen tähän tutkimukseen, ovat poissulkemisen syy.
Yhteisilmoittautumisohjeet:
Probands on rekisteröitävä toiseen NIH - joko NIH CC tai CNHS - protokollaan ensisijaisena protokollana kliinisten ja tutkimusten arviointien suorittamiseksi. Koettimien sukulaiset voidaan rekisteröidä tähän protokollaan riippumatta siitä, ovatko sukulaiset mukana toisessa NIH-protokollassa vai eivät. Voimme kuitenkin asettaa etusijalle sellaisten sukulaisten rekisteröinnin, jotka noudattavat muita NIH-protokollia ja jotka ovat läpikäyneet huolellisen fenotyypin määrityksen näissä protokollissa. Huolellinen fenotyyppien määrittäminen on tärkeää myös osallistujille, jotka ovat ilmeisen terveitä. Koska ensisijainen tutkimusryhmä soveltuu parhaiten karakterisoimaan osallistujiensa fenotyyppejä, mukana olevien sukulaisten fenotyypitys suoritetaan ensisijaisilla protokollilla.
OHJAUSOPINNAN SISÄLTÖPERUSTEET:
- Ikäraja 14-99 vuotta.
- Englannin kielen taito.
- Kyky antaa tietoinen suostumus.
ALATUTKIMUKSEN POISKIELTÄMISKRITEERIT:
- ovat saaneet positiivisia geneettisiä tuloksia tästä protokollasta aiemmin.
- Kaikki olosuhteet, jotka tutkijan mielestä estävät osallistumisen tähän osatutkimukseen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Perhepohjainen
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Biologiset sukulaiset
Probandien biologiset sukulaiset, jotka voivat myös olla mukana koettimen viiteprotokollassa.
|
|
Terveet vapaaehtoiset
Valitse sisäiset ohjaimet
|
|
Probands
Osallistujat, joilla on sairaus, jota tutkitaan toisella NIAID-protokollalla, johon he ovat ilmoittautuneet joko NIH:ssa tai CNHS:ssä.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Immuunihäiriöihin liittyvien uusien geneettisten vikojen tunnistaminen
Aikaikkuna: Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
Immuunihäiriöihin liittyvien uusien geneettisten vikojen tunnistaminen
|
Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
|
Tunnistamme uusia kliinisiä fenotyyppejä, jotka liittyvät vakiintuneisiin geneettisiin vaurioihin
Aikaikkuna: Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
Tunnistamme uusia kliinisiä fenotyyppejä, jotka liittyvät vakiintuneisiin geneettisiin vaurioihin
|
Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
|
Immuunijärjestelmän vakiintuneiden geneettisten häiriöiden tunnistaminen
Aikaikkuna: Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
Immuunijärjestelmän vakiintuneiden geneettisten häiriöiden sekä immuunijärjestelmän ulkopuolisten tunnettujen geneettisten häiriöiden tunnistaminen joissakin tapauksissa
|
Genomitietojen analysoinnin jälkeen
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Todistepohja kliinisten genomipalveluiden parantamiseksi tässä protokollassa ja siihen liittyvissä ohjelmissa.
Aikaikkuna: 5.1.1. Ilmoittautumis-/perusraportin ymmärtämiskysely ja puolistrukturoidut puhelinhaastattelut
|
Tutkimukset kliinisen genomiikan ja geneettisen neuvonnan prosesseista ja tuloksista tämän protokollan mukaisesti.
Näissä tutkimuksissa käytetään kyselyitä, haastatteluja ja muita sosiaalisia ja käyttäytymiseen liittyviä tutkimusmenetelmiä kerätäkseen tutkimukseen osallistuneilta tietoja heidän käsityksistään, kokemuksistaan ja asenteistaan, jotka liittyvät heidän tilaansa ja tähän pöytäkirjaan osallistumiseen.
Näiden lisätutkimusten tavoitteena on parantaa protokollan 17-I-0122 mukaisia palveluita ja luoda todisteita muille vastaavia tutkimuksia tekeville tutkijoille.
|
5.1.1. Ilmoittautumis-/perusraportin ymmärtämiskysely ja puolistrukturoidut puhelinhaastattelut
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 170122
- 17-I-0122
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Primaarinen immuunipuutos
-
Tehran University of Medical SciencesTuntematonPrimary Acquired NasolacrimalIran, islamilainen tasavalta
-
University Hospital, MontpellierLopetettuPrimary Disease Facioscapulohumeral Dystrophy (FSHD)Ranska
-
Sohag UniversityRekrytointiHyperhidroosi Primary Focal kämmenetEgypti
-
Cairo UniversityLopetettuHyperhidroosi Primary Focal kämmenetEgypti
-
Zealand University HospitalTuntematonHyperhidroosi Primary Focal AxillaTanska
-
Oslo University HospitalValmis
-
InMode MD Ltd.RekrytointiHyperhidroosi Primary Focal AxillaIsrael, Yhdysvallat
-
University of Sao PauloRekrytointiHyperhidroosi Primary Focal kämmenetBrasilia
-
Merete HaedersdalValmisHyperhidroosi Primary Focal AxillaTanska
-
Medy-ToxValmisHyperhidroosi Primary Focal AxillaKorean tasavalta