Протокол централизованного секвенирования NIAID
Задний план:
Генетическое тестирование, называемое «секвенированием», помогает исследователям изучить ДНК. Гены состоят из ДНК и являются инструкциями для функционирования нашего тела. У всех нас есть тысячи генов. Варианты ДНК — это различия в генах между двумя людьми. У всех нас есть множество вариантов. Большинство из них безвредны, а некоторые вызывают различия, такие как голубые или карие глаза. Несколько вариантов могут вызвать проблемы со здоровьем.
Задача:
Чтобы понять генетику иммунных нарушений, различные состояния здоровья, а также результаты услуг клинической геномики и генетического консультирования, проводимых в соответствии с этим протоколом.
Право на участие:
Участники других протоколов исследований NIH на людях - либо в Клиническом центре NIH (CC), либо в Детской национальной системе здравоохранения (CNHS) - (в возрасте 0–99 лет) и, в отдельных случаях, их биологические родственники.
Дизайн:
Исследователи изучат ДНК участников, извлеченную из крови, слюны или другого образца ткани, включая ранее собранные образцы, которые мы могли хранить в Национальном институте здоровья. Исследователи изучат ДНК участников в мельчайших деталях. Мы ищем различия в последовательности или структуре ДНК между участниками и другими людьми.
Участники получат результаты, которые:
- Важны для их здоровья
- Подтверждено в клинической лаборатории
- Предположите, что они могут подвергаться риску серьезного заболевания, которое может повлиять на ваше текущее или будущее медицинское лечение.
Некоторая генетическая информация, которую мы возвращаем участникам, может иметь неопределенное значение.
Если результаты генетического теста не связаны с оценками участника NIH, мы обычно не сообщаем:
- Нормальные варианты
- Информация о прогрессирующих смертельных состояниях, не поддающихся эффективному лечению
- Статус перевозчика (условия, которых у вас нет, но вы можете передать)
Образцы и данные будут сохранены для будущих исследований.
Персональные данные будут храниться как можно более конфиденциально.
Если будущим исследованиям потребуется новая информация, с участниками можно будет связаться.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Дизайн исследования: это исследование служит централизованным протоколом секвенирования для исследований NIH на людях, чтобы облегчить стандартизацию и консолидацию данных о генотипе и фенотипе для участвующих программ. Участники других исследований NIH как в NIH CC, так и в CNHS, которые включают генетическое тестирование, могут зарегистрироваться в этом протоколе, и генетическое тестирование будет проводиться в соответствии с этим протоколом.
изучение.
Цель: первичная: собрать и проанализировать данные о генетическом вкладе в различные иммунные заболевания и другие состояния здоровья.
условия, изученные программой внутренних исследований NIH (IRP).
Вторичный: для получения и анализа данных о процессах и результатах клинической геномики и генетики.
консультационные услуги, выполненные в соответствии с этим протоколом.
Конечная точка: первичная: дискретный генетический вклад в иммунные заболевания и другие состояния здоровья, включая:
Установленные генетические нарушения.
Новые генетические дефекты.
Новые фенотипы, связанные с установленными генетическими
расстройства.
Вторичный: доказательная база того, как улучшить клинические геномные услуги в рамках этого протокола и связанных с ним программ.
ТОЧНОСТЬ
Исследователи из Национального института аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID) используют технологии секвенирования нового поколения, чтобы помочь определить генетический вклад в иммунные заболевания. Эти усилия увеличили показатели молекулярной диагностики подмножества NIAID.
участники, а также раскрыли фундаментальное понимание клеточных и сигнальных путей в защите хозяина и иммунной регуляции.
Несмотря на эти успехи, анализ и интерпретация геномных данных остаются серьезной проблемой. Просто исследователи не понимают функциональных и клинических последствий большинства генетических вариаций человека. Это верно для NIAID и для всей программы внутренних исследований. Для достижения прогресса в этой области требуется скоординированный, систематический и прозрачный подход к
клинические геномные исследования.
Этот протокол специфичен для генетического тестирования и явно направлен как на усиление клинической помощи, так и на расширение исследований в рамках участвующих программ в NIH. Пробанды будут предоставлять биологические образцы для генетического тестирования и должны быть включены в первичный протокол, который будет выполнять первичные клинические и исследовательские оценки. Этот протокол служит средством
программные усилия, которые включают стандартизированное фенотипирование, заказ тестов через Информационную систему клинических исследований (CRIS), сбор и выделение образцов, анализ нуклеиновых кислот, биоинформатику, клиническую интерпретацию, отчетность в CRIS, генетическое консультирование и поддержку эффективного использования геномики в качестве исследовательского инструмента. на протяжении всей очной программы. Результаты генетического тестирования и данные (по запросу) будут переданы исследовательским группам для протоколов, в которых участвует данный участник. В целом, повышенная стандартизация процессов будет поддерживать целостность и эффективность данных, при этом удовлетворяя потребность в гибкости следователя.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Morgan N Similuk
- Номер телефона: (301) 435-6691
- Электронная почта: morgan.similuk@nih.gov
Места учебы
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Соединенные Штаты, 20010
- Рекрутинг
- Children's National Health System
-
Контакт:
- Michael Keller, MD
- Номер телефона: 202-476-5843
- Электронная почта: mkeller@childrensnational.org
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Соединенные Штаты, 20892
- Рекрутинг
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Контакт:
- For more information at the NIH Clinical Center contact Office of Patient Recruitment (OPR)
- Номер телефона: TTY dial 711 800-411-1222
- Электронная почта: ccopr@nih.gov
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
- КРИТЕРИИ ВКЛЮЧЕНИЯ УЧАСТНИКОВ:
Должен соответствовать одному из следующих критериев:
- Пробандные участники: должны иметь заболевание, расследуемое другим протоколом NIH, в котором они участвуют.
- Биологические родственники: биологически связаны с участником-пробандом и не имеют заболевания, расследуемого в другом протоколе NIH.
- Здоровые добровольцы: не связанные с участником-пробандом и не имеющие заболевания, расследуемого в другом протоколе NIH.
- Возраст 0-99 лет.
- Участники должны быть готовы пройти генетическое тестирование.
- Участники должны быть готовы разрешить хранение образцов для будущих исследований.
- Участники должны быть готовы к совместному использованию своих деидентифицированных геномных данных, например, в базах данных с контролируемым доступом, таких как База данных генотипов и фенотипов (dbGaP).
- Взрослые здоровые добровольцы должны быть в состоянии дать информированное согласие.
КРИТЕРИИ ИСКЛЮЧЕНИЯ УЧАСТНИКОВ:
Любое состояние, которое, по мнению исследователя, противопоказывает участие в этом исследовании, является причиной для исключения.
Правила совместной регистрации:
Пробанды должны быть зарегистрированы в другом протоколе NIH — либо в NIH CC, либо в CNHS — в качестве основного протокола для проведения клинических и исследовательских оценок. Родственники пробандов могут быть зарегистрированы в этом протоколе независимо от того, зарегистрированы ли родственники в другом протоколе NIH. Тем не менее, мы можем отдать приоритет регистрации родственников, которые участвуют в других протоколах NIH и прошли тщательное фенотипирование по этим протоколам. Тщательное фенотипирование важно даже для внешне здоровых участников. Поскольку первичная исследовательская группа лучше всего подходит для характеристики фенотипов своих участников, фенотипирование совместно зарегистрированных родственников будет выполняться по первичным протоколам.
КРИТЕРИИ ВКЛЮЧЕНИЯ ЗАМЕНЫ ИССЛЕДОВАНИЯ:
- Возраст 14-99 лет.
- Владение английским языком.
- Возможность дать информированное согласие.
КРИТЕРИИ ИСКЛЮЧЕНИЯ ЗАМЕНЫ ИССЛЕДОВАНИЯ:
- Получили положительные генетические результаты от этого протокола в прошлом.
- Любое состояние, которое, по мнению исследователя, противопоказывает участие в данном субисследовании.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Семейный
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Биологические родственники
Биологические родственники пробандов, которые могут быть включены или не включены в протокол направления пробанда.
|
|
Здоровые добровольцы
Выберите внутренний контроль
|
|
Пробанды
Участники с заболеванием, расследуемым по другому протоколу NIAID, по которому они зарегистрированы, либо в NIH, либо в CNHS.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Выявление новых генетических дефектов, связанных с иммунными нарушениями
Временное ограничение: При анализе геномных данных
|
Выявление новых генетических дефектов, связанных с иммунными нарушениями
|
При анализе геномных данных
|
|
Выявление новых клинических фенотипов, связанных с установленными генетическими дефектами
Временное ограничение: При анализе геномных данных
|
Выявление новых клинических фенотипов, связанных с установленными генетическими дефектами
|
При анализе геномных данных
|
|
Выявление установленных генетических нарушений иммунной системы
Временное ограничение: При анализе геномных данных
|
Выявление установленных генетических нарушений иммунной системы, а также известных генетических нарушений вне иммунной системы в некоторых случаях
|
При анализе геномных данных
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Доказательная база того, как улучшить клинические геномные услуги по этому протоколу и связанным с ним программам.
Временное ограничение: 5.1.1. Опрос о зачислении / базовом отчете и полуструктурированные телефонные интервью
|
Исследования процессов и результатов услуг клинической геномики и генетического консультирования, проводимых в соответствии с этим протоколом.
В этих исследованиях будут использоваться опросы, интервью и другие методы социальных и поведенческих исследований для сбора данных от участников исследования об их восприятии, опыте и отношении, связанном с их состоянием и участием в этом протоколе.
Целью этих дополнительных исследований будет улучшение услуг, предоставляемых в соответствии с протоколом 17-I-0122, и создание доказательной базы для других исследователей, проводящих аналогичные исследования.
|
5.1.1. Опрос о зачислении / базовом отчете и полуструктурированные телефонные интервью
|
Соавторы и исследователи
Следователи
- Главный следователь: Morgan N Similuk, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Similuk MN, Yan J, Ghosh R, Oler AJ, Franco LM, Setzer MR, Kamen M, Jodarski C, DiMaggio T, Davis J, Gore R, Jamal L, Borges A, Gentile N, Niemela J, Lowe C, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Hsu AP, Hong C, Littel P, Seifert BA, Milner J, Johnston JJ, Cheng X, Li Z, Veltri D, Huang K, Kaladi K, Barnett J, Zhang L, Vlasenko N, Fan Y, Karlins E, Ganakammal SR, Gilmore R, Tran E, Yun A, Mackey J, Yazhuk S, Lack J, Kuram V, Cao W, Huse S, Frank K, Fahle G, Rosenzweig S, Su Y, Hwang S, Bi W, Bennett J, Myles IA, De Ravin SS, Fuss I, Strober W, Bielekova B, Almeida de Jesus A, Goldbach-Mansky R, Williamson P, Kumar K, Dempsy C, Frischmeyer-Guerrerio P, Fisch R, Bolan H, Metcalfe DD, Komarow H, Carter M, Druey KM, Sereti I, Dropulic L, Klion AD, Khoury P, O' Connell EM, Holland-Thomas NC, Brown T, McDermott DH, Murphy PM, Bundy V, Keller MD, Peng C, Kim H, Norman S, Delmonte OM, Kang E, Su HC, Malech H, Freeman A, Zerbe C, Uzel G, Bergerson JRE, Rao VK, Olivier KN, Lyons JJ, Lisco A, Cohen JI, Lionakis MS, Biesecker LG, Xirasagar S, Notarangelo LD, Holland SM, Walkiewicz MA. Clinical exome sequencing of 1000 families with complex immune phenotypes: Toward comprehensive genomic evaluations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Oct;150(4):947-954. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.009. Epub 2022 Jun 24.
- Zainab R, Kaur S, Lack J, Similuk M, Tandon M, Ghosh R, Seifert BA, Tokita M, Flippo C, Yan J, Walkiewicz M, Chittiboina P, Tatsi C. Genetic evaluation of pediatric pituitary adenomas and USP8-related genotype-phenotype correlations in Cushing's disease. Pituitary. 2025 Aug 14;28(5):92. doi: 10.1007/s11102-025-01557-6.
- Beers BJ, Similuk MN, Ghosh R, Seifert BA, Jamal L, Kamen M, Setzer MR, Jodarski C, Duncan R, Hunt D, Mixer M, Cao W, Bi W, Veltri D, Karlins E, Zhang L, Li Z, Oler AJ, Jevtich K, Yu Y, Hullfish H, Bielekova B, Frischmeyer-Guerrerio P, Dang Do A, Huryn LA, Olivier KN, Su HC, Lyons JJ, Zerbe CS, Rao VK, Keller MD, Freeman AF, Holland SM, Franco LM, Walkiewicz MA, Yan J. Chromosomal microarray analysis supplements exome sequencing to diagnose children with suspected inborn errors of immunity. Front Immunol. 2023 May 5;14:1172004. doi: 10.3389/fimmu.2023.1172004. eCollection 2023.
- Ferre EMN, Yu Y, Oikonomou V, Hilfanova A, Lee CR, Rosen LB, Burbelo PD, Vazquez SE, Anderson MS, Barocha A, Heller T, Soldatos A, Holland SM, Walkiewicz MA, Lionakis MS. Case report: Discovery of a de novo FAM111B pathogenic variant in a patient with an APECED-like clinical phenotype. Front Immunol. 2023 Feb 17;14:1133387. doi: 10.3389/fimmu.2023.1133387. eCollection 2023.
Полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 170122
- 17-I-0122
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .