Pesquisa diagnóstica em pacientes com doenças raras - Resolvendo as doenças raras não resolvidas (AnDDI-Solve-RD)

A maioria das doenças raras sem solução diagnóstica tem uma causa genética. Essas causas não foram encontradas aplicando as metodologias atuais devido a limitações técnicas (por exemplo, expansões repetidas, alterações em regiões não codificantes (intrônicas)) ou, embora registradas metodicamente, seu significado fisiopatológico, mas não classificado como clinicamente relevante. Uma re e meta-análise de conjuntos de dados existentes com novos algoritmos e modelos estatísticos, bem como a complementação com outras tecnologias ômicas, seguidas de estudos funcionais de acompanhamento em modelos de doenças apropriados (por exemplo, linhas celulares de pacientes) permite elucidar causas adicionais de doenças e melhorar o diagnóstico de doenças hereditárias. Além do exame direto das pessoas afetadas, a análise de familiares saudáveis, por exemplo, dos pais, desempenha um papel importante na chamada análise trio, especialmente na filtragem eficiente dos extensos conjuntos de dados para alterações recém-criadas, de modo -chamado de novo- Variantes (novas mutações). No contexto das análises delineadas, novos genes de doenças podem ser encontrados e validados. O ganho de conhecimento científico devido a uma melhor compreensão dos mecanismos biológicos celulares básicos pode contribuir para o desenvolvimento de abordagens terapêuticas direcionadas.

Neste contexto, o projeto Solve-RD foi construído e financiado pela União Europeia com a ambição de resolver um grande número de doenças raras, para as quais uma causa molecular ainda não é conhecida por sofisticadas abordagens ômicas combinadas, e melhorar o diagnóstico de doenças raras pacientes com doenças. O Solve-RD integra-se totalmente com as recém-formadas Redes Europeias de Referência (ERNs) para doenças raras e, em particular, ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA e -GENTURIS. A rede AndDI-Rares está totalmente afiliada à rede ERN ITHACA e contribuirá ativamente para o projeto, pela ambição de compartilhar conhecimento sobre genes, variantes genômicas e fenótipos.

O projeto irá primeiro reanalisar 18.000 exomas negativos de diferentes ERNs realizados em um contexto de diagnóstico ou pesquisa (a coleta de biomaterial, dados clínicos/fenotípicos e sequenciamento de próxima geração já foi realizada, e o paciente/família concordou previamente por escrito que seus amostra poderia ser usada para pesquisas relacionadas à sua doença, sem necessidade de presença relacionada ao estudo. O projeto também proporá novas análises multiômicas com novas amostras necessárias em 500 pacientes e seus pais no total, justificando o projeto AnDDI-Solve-RD.