- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT03829176
Investigando a Viabilidade e Implementação do Sequenciamento do Genoma Total em Pacientes com Suspeita de Doença Genética
O estudo "Investigando a Viabilidade e Implementação do Sequenciamento do Genoma Inteiro em Pacientes com Desordem Genética Suspeita" é um estudo de pesquisa que visa explorar o uso do sequenciamento do genoma completo como um potencial teste genético de primeira linha para pacientes com suspeita de diagnóstico genético. Este é um estudo de pesquisa financiado internamente.
Os investigadores vão inscrever 500 participantes que estão sendo vistos em uma das várias clínicas de genética dentro do sistema Partners HealthCare para uma suspeita de doença genética para a qual o teste genético padrão de atendimento é solicitado. No momento do teste genético padrão de atendimento, uma amostra extra de sangue será coletada e o sequenciamento do genoma poderá ser realizado. Dentro de 3-4 meses, os pacientes aprendem se receberam sequenciamento do genoma ou não, e quaisquer resultados são devolvidos e explicados. Os investigadores também estão estudando as experiências dos participantes e de seus provedores para entender melhor como implementar o sequenciamento do genoma nos cuidados clínicos.
Visão geral do estudo
Status
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
O objetivo deste protocolo de pesquisa é conduzir um ensaio clínico randomizado para avaliar os benefícios e riscos de incorporar o sequenciamento do genoma completo (WGS) como um teste de diagnóstico de primeira linha em várias clínicas de genética e subespecialidades em um grande centro médico terciário.
Os investigadores inscreverão 500 participantes no sistema Partners HealthCare (por exemplo, Massachusetts General Hospital, Massachusetts Eye and Ear, etc.). O estudo incluirá genética múltipla e clínicas de subespecialidades, incluindo, mas não se limitando a: cardiologia, genética de câncer GI, genética médica, ataxia, genética endócrina. Os participantes são elegíveis se seu provedor solicitar testes genéticos para diagnóstico de sintomas suspeitos de um distúrbio genético. Os participantes não devem ter passado por exames genéticos anteriores.
No momento da inscrição, uma pequena amostra de sangue será obtida no momento da coleta de sangue do participante para o teste padrão de atendimento. Todos os participantes estarão sujeitos à randomização 1:1, na qual 250 receberão um relatório WGS e 250 serão randomizados para o braço que recebe apenas o teste padrão de atendimento. Qualquer relatório WGS gerado será incorporado ao prontuário eletrônico do paciente.
Para pacientes pediátricos, a equipe do estudo tentará coletar amostras de sangue de ambos os pais biológicos quando possível para análise trio (WGS realizada no probando e em ambos os pais biológicos). O propósito da análise trio é principalmente para o propósito de interpretar os resultados do probando/criança. Para pacientes não pediátricos, amostras de saliva podem ser solicitadas aos pais vivos para fins de confirmação. Nenhum relatório de teste genético será gerado para os pais. A exceção é se um dos pais de um paciente pediátrico (parte do trio) optar por receber os resultados da lista ACMG 59.
Os participantes são cegos para o braço em que foram designados até 3-4 meses a partir do momento do consentimento. Nesse momento, um conselheiro genético do estudo ligará para o participante para divulgar a atribuição de randomização. Se o participante foi randomizado para receber um relatório WGS, será feito um plano para revisar o WGS por telefone, videoconferência ou pessoalmente. Depois de revisar os resultados, a equipe de pesquisa escreverá uma carta ao participante resumindo os resultados e quaisquer recomendações relevantes de tratamento médico. Esta carta também incluirá uma cópia do relatório do WGS.
Todos os participantes (ou seus pais) serão entrevistados em três pontos durante a inscrição: linha de base (no momento do consentimento), imediatamente após a divulgação e 6 meses após a divulgação. Os provedores médicos que ofereceram o padrão de teste de atendimento também serão pesquisados.
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Locais de estudo
-
-
Massachusetts
-
Boston, Massachusetts, Estados Unidos, 02114
- Massachusetts General Hospital
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Participantes de qualquer sexo com idade superior a 3 meses.
- Os participantes (maiores de 7 anos) devem ser proficientes em inglês. Se o participante tiver menos de 7 anos ou mais de 7 anos e não for verbal, esses critérios se aplicam aos pais que estão fornecendo consentimento.
- O participante está sendo avaliado clinicamente em uma clínica de genética Partners HealthCare e não teve um trabalho genético prévio para sua indicação de encaminhamento.
- Tem um distúrbio genético suspeito em que a causa genética é desconhecida, conforme confirmado pela revisão dos registros médicos do indivíduo.
- O teste genético foi solicitado para o participante por seu provedor de genética clínica como parte de uma avaliação diagnóstica.
- Disposto e capaz de fornecer uma amostra de sangue. A quantidade de sangue coletada de um paciente será de 2 colheres de chá ou menos.
- Capacidade de fornecer consentimento informado ou consentimento para participar deste protocolo. As crianças que não tenham atingido a maioridade legal devem dar o seu consentimento (os que não têm capacidade para dar o seu consentimento não devem opor-se à participação), juntamente com a autorização do(s) pai(s) ou tutor(es) da criança. Os adultos impossibilitados de consentir devem poder dar o seu consentimento ou não devem opor-se à participação, juntamente com a autorização do seu representante legal autorizado (LAR).
Critério de exclusão:
- Participantes que moram fora dos Estados Unidos.
- Participantes que não falam inglês.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: Randomizado
- Modelo Intervencional: Atribuição Paralela
- Mascaramento: Dobro
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
---|---|
Sem intervenção: Padrão de atendimento
Participantes que são randomizados para não ter o sequenciamento do genoma completo realizado em sua amostra.
Esses participantes terão apenas testes genéticos padrão de atendimento (solicitados por seu provedor clínico) e não receberão resultados genéticos como parte deste estudo.
|
|
Experimental: Sequenciamento completo do genoma
Os participantes que são randomizados para ter seu genoma sequenciado e recebem um relatório completo de sequenciamento do genoma.
As sessões de divulgação de resultados incluirão uma discussão de todo o relatório de sequenciamento do genoma, como os resultados se comparam ao relatório de teste genético padrão de atendimento e quaisquer possíveis recomendações relevantes.
Os participantes neste braço receberão uma cópia de todo o relatório de sequenciamento do genoma acompanhado de uma carta resumida escrita por um conselheiro genético do estudo.
|
Os participantes neste braço terão sua amostra analisada por sequenciamento do genoma completo (WGS), e um relatório será incluído em seu prontuário médico.
A análise será orientada pelo fenótipo (a lista de genes será selecionada com base na indicação primária para teste e outras informações de histórico médico disponíveis) e pode incluir genes na lista ACMG 59 se o participante optar por esses resultados.
Este relatório incluirá resultados de VUS patogênicos, provavelmente patogênicos e suspeitos identificados nos genes analisados.
|
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
---|---|---|
Capacidades de diagnóstico: padrão de atendimento versus rendimento diagnóstico de sequenciamento do genoma inteiro
Prazo: Da data de consentimento até a data do primeiro relatório documentado, avaliado até 12 meses
|
Avalie e compare os rendimentos gerais para achados primários e secundários/incidentais
|
Da data de consentimento até a data do primeiro relatório documentado, avaliado até 12 meses
|
Recursos de diagnóstico: atendimento padrão versus tempo de sequenciamento do genoma inteiro para chegar ao diagnóstico
Prazo: Da data de consentimento até a data do primeiro relatório positivo, avaliado até 12 meses
|
Avalie e compare o tempo necessário para chegar a um diagnóstico por meio de testes genéticos padrão de atendimento e sequenciamento completo do genoma
|
Da data de consentimento até a data do primeiro relatório positivo, avaliado até 12 meses
|
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
---|---|---|
Recursos necessários para implementar o WGS em um Centro Médico Acadêmico
Prazo: Linha de base até o final do estudo, até 2 anos
|
Avalie registrando os recursos necessários para implementar o WGS em um Centro Médico Acadêmico, documentando os recursos necessários para engajamento, execução, relatórios e avaliação.
|
Linha de base até o final do estudo, até 2 anos
|
Características do participante
Prazo: Linha de base
|
Idade, dados sociodemográficos, antecedentes pessoais e familiares
|
Linha de base
|
Mudança na utilidade percebida dos resultados genômicos
Prazo: Linha de base, pós-divulgação (aproximadamente 3-4 meses após a inscrição), 6 meses após a divulgação
|
Avaliado em pesquisas com participantes (ou pais) por meio de perguntas que avaliam: motivos para recusa, motivações para inscrição, mudança nas expectativas, confiança, preocupações, preferências para compartilhamento de informações
|
Linha de base, pós-divulgação (aproximadamente 3-4 meses após a inscrição), 6 meses após a divulgação
|
Confiança e atitudes do médico sobre o sequenciamento genômico
Prazo: Linha de base
|
Avaliado em pesquisas médicas
|
Linha de base
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Sekar Kathiresan, MD, Massachusetts General Hospital
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire AL, Nussbaum RL, O'Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73. Epub 2013 Jun 20. Erratum In: Genet Med. 2017 May;19(5):606.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Yang Y, Muzny DM, Reid JG, Bainbridge MN, Willis A, Ward PA, Braxton A, Beuten J, Xia F, Niu Z, Hardison M, Person R, Bekheirnia MR, Leduc MS, Kirby A, Pham P, Scull J, Wang M, Ding Y, Plon SE, Lupski JR, Beaudet AL, Gibbs RA, Eng CM. Clinical whole-exome sequencing for the diagnosis of mendelian disorders. N Engl J Med. 2013 Oct 17;369(16):1502-11. doi: 10.1056/NEJMoa1306555. Epub 2013 Oct 2.
- Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J, Grody WW, Hegde M, Lyon E, Spector E, Voelkerding K, Rehm HL; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24. doi: 10.1038/gim.2015.30. Epub 2015 Mar 5.
- Vassy JL, Christensen KD, Schonman EF, Blout CL, Robinson JO, Krier JB, Diamond PM, Lebo M, Machini K, Azzariti DR, Dukhovny D, Bates DW, MacRae CA, Murray MF, Rehm HL, McGuire AL, Green RC; MedSeq Project. The Impact of Whole-Genome Sequencing on the Primary Care and Outcomes of Healthy Adult Patients: A Pilot Randomized Trial. Ann Intern Med. 2017 Jun 27;167(3):159-169. doi: 10.7326/M17-0188. Print 2017 Aug 1.
- Sherman S, Pletcher BA, Driscoll DA. Fragile X syndrome: diagnostic and carrier testing. Genet Med. 2005 Oct;7(8):584-7. doi: 10.1097/01.gim.0000182468.22666.dd.
- Ross LF, Saal HM, David KL, Anderson RR; American Academy of Pediatrics; American College of Medical Genetics and Genomics. Technical report: Ethical and policy issues in genetic testing and screening of children. Genet Med. 2013 Mar;15(3):234-45. doi: 10.1038/gim.2012.176. Epub 2013 Feb 21. Erratum In: Genet Med. 2013 Apr;15(4):321. Ross, Laine Friedman [corrected to Ross, Lainie Friedman].
- Manning M, Hudgins L; Professional Practice and Guidelines Committee. Array-based technology and recommendations for utilization in medical genetics practice for detection of chromosomal abnormalities. Genet Med. 2010 Nov;12(11):742-5. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181f8baad. Erratum In: Genet Med. 2020 Dec;22(12):2126.
- Xue Y, Ankala A, Wilcox WR, Hegde MR. Solving the molecular diagnostic testing conundrum for Mendelian disorders in the era of next-generation sequencing: single-gene, gene panel, or exome/genome sequencing. Genet Med. 2015 Jun;17(6):444-51. doi: 10.1038/gim.2014.122. Epub 2014 Sep 18.
- Lee H, Deignan JL, Dorrani N, Strom SP, Kantarci S, Quintero-Rivera F, Das K, Toy T, Harry B, Yourshaw M, Fox M, Fogel BL, Martinez-Agosto JA, Wong DA, Chang VY, Shieh PB, Palmer CG, Dipple KM, Grody WW, Vilain E, Nelson SF. Clinical exome sequencing for genetic identification of rare Mendelian disorders. JAMA. 2014 Nov 12;312(18):1880-7. doi: 10.1001/jama.2014.14604.
- Vissers LELM, van Nimwegen KJM, Schieving JH, Kamsteeg EJ, Kleefstra T, Yntema HG, Pfundt R, van der Wilt GJ, Krabbenborg L, Brunner HG, van der Burg S, Grutters J, Veltman JA, Willemsen MAAP. A clinical utility study of exome sequencing versus conventional genetic testing in pediatric neurology. Genet Med. 2017 Sep;19(9):1055-1063. doi: 10.1038/gim.2017.1. Epub 2017 Mar 23.
- Yang Y, Muzny DM, Xia F, Niu Z, Person R, Ding Y, Ward P, Braxton A, Wang M, Buhay C, Veeraraghavan N, Hawes A, Chiang T, Leduc M, Beuten J, Zhang J, He W, Scull J, Willis A, Landsverk M, Craigen WJ, Bekheirnia MR, Stray-Pedersen A, Liu P, Wen S, Alcaraz W, Cui H, Walkiewicz M, Reid J, Bainbridge M, Patel A, Boerwinkle E, Beaudet AL, Lupski JR, Plon SE, Gibbs RA, Eng CM. Molecular findings among patients referred for clinical whole-exome sequencing. JAMA. 2014 Nov 12;312(18):1870-9. doi: 10.1001/jama.2014.14601.
- Gonorazky H, Liang M, Cummings B, Lek M, Micallef J, Hawkins C, Basran R, Cohn R, Wilson MD, MacArthur D, Marshall CR, Ray PN, Dowling JJ. RNAseq analysis for the diagnosis of muscular dystrophy. Ann Clin Transl Neurol. 2015 Dec 8;3(1):55-60. doi: 10.1002/acn3.267. eCollection 2016 Jan.
- Meienberg J, Bruggmann R, Oexle K, Matyas G. Clinical sequencing: is WGS the better WES? Hum Genet. 2016 Mar;135(3):359-62. doi: 10.1007/s00439-015-1631-9. Epub 2016 Jan 7.
- Gilissen C, Hehir-Kwa JY, Thung DT, van de Vorst M, van Bon BW, Willemsen MH, Kwint M, Janssen IM, Hoischen A, Schenck A, Leach R, Klein R, Tearle R, Bo T, Pfundt R, Yntema HG, de Vries BB, Kleefstra T, Brunner HG, Vissers LE, Veltman JA. Genome sequencing identifies major causes of severe intellectual disability. Nature. 2014 Jul 17;511(7509):344-7. doi: 10.1038/nature13394. Epub 2014 Jun 4.
- Stavropoulos DJ, Merico D, Jobling R, Bowdin S, Monfared N, Thiruvahindrapuram B, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Yuen RKC, Szego MJ, Hayeems RZ, Shaul RZ, Brudno M, Girdea M, Frey B, Alipanahi B, Ahmed S, Babul-Hirji R, Porras RB, Carter MT, Chad L, Chaudhry A, Chitayat D, Doust SJ, Cytrynbaum C, Dupuis L, Ejaz R, Fishman L, Guerin A, Hashemi B, Helal M, Hewson S, Inbar-Feigenberg M, Kannu P, Karp N, Kim R, Kronick J, Liston E, MacDonald H, Mercimek-Mahmutoglu S, Mendoza-Londono R, Nasr E, Nimmo G, Parkinson N, Quercia N, Raiman J, Roifman M, Schulze A, Shugar A, Shuman C, Sinajon P, Siriwardena K, Weksberg R, Yoon G, Carew C, Erickson R, Leach RA, Klein R, Ray PN, Meyn MS, Scherer SW, Cohn RD, Marshall CR. Whole Genome Sequencing Expands Diagnostic Utility and Improves Clinical Management in Pediatric Medicine. NPJ Genom Med. 2016 Jan 13;1:15012-. doi: 10.1038/npjgenmed.2015.12.
- RARE Diseases: Facts and Statistics. (2017, March 29). Retrieved July 19, 2017, from https://globalgenes.org/rare-diseases-facts-statistics/
- Fullerton SM, Wolf WA, Brothers KB, Clayton EW, Crawford DC, Denny JC, Greenland P, Koenig BA, Leppig KA, Lindor NM, McCarty CA, McGuire AL, McPeek Hinz ER, Mirel DB, Ramos EM, Ritchie MD, Smith ME, Waudby CJ, Burke W, Jarvik GP. Return of individual research results from genome-wide association studies: experience of the Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE) Network. Genet Med. 2012 Apr;14(4):424-31. doi: 10.1038/gim.2012.15. Epub 2012 Feb 23.
- Kalia SS, Adelman K, Bale SJ, Chung WK, Eng C, Evans JP, Herman GE, Hufnagel SB, Klein TE, Korf BR, McKelvey KD, Ormond KE, Richards CS, Vlangos CN, Watson M, Martin CL, Miller DT. Recommendations for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing, 2016 update (ACMG SF v2.0): a policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2017 Feb;19(2):249-255. doi: 10.1038/gim.2016.190. Epub 2016 Nov 17. Erratum In: Genet Med. 2017 Apr;19(4):484.
- MacArthur DG, Manolio TA, Dimmock DP, Rehm HL, Shendure J, Abecasis GR, Adams DR, Altman RB, Antonarakis SE, Ashley EA, Barrett JC, Biesecker LG, Conrad DF, Cooper GM, Cox NJ, Daly MJ, Gerstein MB, Goldstein DB, Hirschhorn JN, Leal SM, Pennacchio LA, Stamatoyannopoulos JA, Sunyaev SR, Valle D, Voight BF, Winckler W, Gunter C. Guidelines for investigating causality of sequence variants in human disease. Nature. 2014 Apr 24;508(7497):469-76. doi: 10.1038/nature13127.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Real)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 2017P001832
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
produto fabricado e exportado dos EUA
Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .
Ensaios clínicos em Sequenciamento completo do genoma
-
Imperial College London Diabetes CentreDesconhecidoDistúrbios Mendelianos | Desordem genética | Nova mutação | Distúrbio hereditário | Mutação De Novo | Doença hereditária | Defeitos de Gene ÚnicoEmirados Árabes Unidos