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开发微生物组无创诊断工具 (ERA-niMIC)

2020年10月8日 更新者:Igenomix

开发用于分析微生物群以改善不育患者生殖结果的非侵入性诊断工具。

尽管传统上认为子宫内膜组织不含细菌,但最近的研究表明存在子宫内膜微生物组。 在我们的研究团队进行的一项初步研究中,使用下一代测序 (NGS) 对子宫内膜液 (EF) 样本中存在的子宫内膜微生物进行了分析。与之前发表的研究一致,在正常情况下,子宫内膜主要由不同的组成乳杆菌属的种类。 进一步指出,链球菌和/或加德纳菌​​等其他致病菌的存在可能会改变子宫内膜微生物组,并可能破坏子宫环境,从而影响着床率和妊娠成功率。

该项目旨在验证在育龄妇女子宫内膜中发现的微生物组,并试图证实子宫内膜微生物组与接受辅助生殖治疗 (ART) 的患者的生殖结果之间的关系。 子宫内膜容受性分析 (ERA) 工具的使用,以及胚胎移植前子宫内膜菌群的分析,将允许评估子宫内膜病原体的存在对接受患者植入的影响。

因此,该项目的重点是开发和临床验证用于分析微生物群的非侵入性诊断工具,将微生物组研究添加到 ERA 分析中。

研究概览

详细说明

胚胎植入是物种生存的关键过程,效率相对较低,尤其是在人类中。 关键要素是胚胎、母体子宫内膜,以及它们之间使用不同科学观点的交叉交流。 子宫内膜容受性描述允许胚胎粘附和胎盘形成的表型。 由于需要对子宫内膜容受性状态进行准确客观的分子诊断测试,因此开发了子宫内膜容受性分析(ERA)。 ERA 测试是一种定制的表达微阵列,可识别个性化植入窗口 (WOI) 的转录组表达谱特征。 它的临床实用性已在植入失败的患者中得到证实,其中 25% 的 WOI 移位,一旦胚胎移植以 ERA 预测的正确 WOI 进行,他们就会怀孕。 然而,该程序需要进行子宫内膜活检(EB),这是该诊断测试的主要缺点,因为胚胎移植必须延迟到下一个周期,并且还可能给患者带来不适。 出于这个原因,之前进行了一项试点研究,以确认是否可以通过子宫内膜液 (EF) 样本中的非侵入性方法预测子宫内膜容受性。 ERA 测试的基因面板在单细胞水平上对来自子宫内膜活检的上皮细胞和基质细胞以及从 EF 分离的细胞进行了询问,证明 EF 上的主要细胞与上皮细胞群一起分类。

另一方面,为了更好地理解将子宫内膜容受性和/或胚胎植入与改变的子宫内膜微生物组联系起来的机制,进行了另一项初步研究,以确定在分析细菌 16S 核糖体后子宫内膜微生物组的组成RNA 通过 NGS。 有趣的是,在由子宫内膜容受性阵列 (ERA) 诊断为子宫内膜微生物组带有病原体或不受乳杆菌属 (NLD) 细菌支配的容受性子宫内膜患者中,着床率显着降低(23.1% 对 60.7% p = 0.02),妊娠率(33.3% vs 70.6%,p = 0.03)、每次胚胎移植的持续妊娠率(13.3% vs 58.8%,p = 0.03)和活产率(6.7% vs 58.8%,p = 0.002)以乳酸杆菌 (LD) 为主的子宫内膜微生物组。 此外,当发现的致病菌属于加德纳菌属和链球菌属时,这种关系更为重要。 这与其他已发表的分析子宫内膜病原体对 IVF 治疗影响的研究一致,强调了细菌群落研究对生殖健康的重要性。

鉴于这些初步结果,本研究旨在在更大的样本集中验证子宫内膜微生物组失衡与接受 ART 的患者生殖成功率下降之间的关系。 为此,将在以下方面改进实验设计:(i) 将分析更大的样本量以验证先前在子宫内膜微生物组试验研究中获得的先前结果,(ii) 来自子宫内膜液和子宫内膜的配对样本将分析活检的微生物概况,以研究是否存在与样本类型相关的细菌变异性,(iii) 子宫内膜微生物群将与 ERA 同时评估,作为该工具的补充诊断,以及 (iv) 子宫内膜分析微生物群将使用最先进的细菌宏基因组测序技术进行,以扩大每个样本中鉴定的微生物的信息。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

452

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • British Columbia
      • Burnaby、British Columbia、加拿大、V5G 4X7
        • Pacific Center for Reproductive Medicine
      • Mexico City、墨西哥、11000
        • New Hope Fertility Center
    • Osaka Prefecture
      • Osaka、Osaka Prefecture、日本、557-0045
        • Oak Clinic Sumiyoshi
      • Istanbul、火鸡
        • Bahceci Fulya IVF Center
    • Connecticut
      • Norwalk、Connecticut、美国、06861
        • RMA Connecticut
    • Florida
      • Margate、Florida、美国、33063
        • IVF Florida
    • Missouri
      • Chesterfield、Missouri、美国、63005
        • Missouri Center for Reproductive Medicine (MCRM Fertility)
    • Washington
      • Arlington、Washington、美国、22203
        • Dominion Fertility
      • Madrid、西班牙、28036
        • ProcreaTec
    • Malaga
      • Fuengirola、Malaga、西班牙、29640
        • Clinica Fertia
      • Buenos Aires、阿根廷、C1425DGQ
        • Pregna Medicina Reproductiva
    • Santa Fe
      • Rosario、Santa Fe、阿根廷
        • Gestanza Medicina Reproductiva
    • Selangor
      • Petaling Jaya、Selangor、马来西亚、47810
        • Alpha Fertility Center

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 50年 (成人)

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

女性

取样方法

非概率样本

研究人群

ART 患者,有 ERA 诊断子宫内膜容受性的指征,将接受冷冻囊胚期胚胎的胚胎移植(第 5 天/第 6 天)。

描述

纳入标准:

  • 接受体外受精 (IVF) / 胞浆内单精子注射 (ICSI) 或 OVODON 且具有 ERA 适应症的患者,无论是否具有植入前遗传筛查 (PGS) 适应症,其接受冷冻囊胚期胚胎移植(第 5 天/第 6 天)激素替代疗法 (HRT) 周期。
  • 产妇年龄:≤40岁(IVF/ICSI患者)
  • 产妇年龄:≤50岁(OVODONATION患者)
  • 身体质量指数 (BMI):18.5 - 30 公斤/平方米(含)
  • 人类免疫缺陷病毒(HIV)、乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、梅毒快速血浆反应素(RPR)血清学检测阴性
  • 月经规律的女性(3-4 / 26-35 天)
  • 精子浓度:>200万个精子/ml

排除标准:

  • 在过去 3 个月内是宫内节育器 (IUD) 携带者的患者
  • 在样本采集前的最后 3 个月内服用处方抗生素的患者。 (根据中心的标准临床实践,可以接受那些患者在刺激周期中接受过预防性抗生素以进行卵巢穿刺的病例。 这种抗生素的施用应至少在样本采集前 1 个月)。
  • 附件或子宫病变,如子宫畸形,可能会影响着床率(例如:息肉、壁间肌瘤 ≥ 4cm 或粘膜下、隔膜、输卵管积水等)。 患有任何先前描述的病症(在纳入之前或之后)的患者将被允许参加本研究,只要他们在任何研究程序之前接受过手术治疗。
  • 存在严重或不受控制的细菌、真菌或病毒感染,根据主要研究者的意见,可能会干扰患者参与研究或研究结果的评估。
  • 任何不稳定或可能危及患者安全和研究依从性的疾病或医疗状况。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:队列
  • 时间观点:预期

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
接受 ERA 测试的 LD 微生物组
通过 ERA 测试接受患者的子宫内膜微生物群主要由不同种类的乳杆菌属组成,由 NGS 测序确定。
在指示用于 ERA 的 EB 的同一天,在使用 5 天黄体酮的 HRT 周期的第 5 天,根据常见的临床实践,将在用于 ERA 的 EB 之前立即抽吸 EF 样本。 该 EF 样本将用于微生物组的非侵入性诊断,同时通过 ERA 进行子宫内膜容受性诊断而获得的一小部分子宫内膜组织将用作子宫内膜微生物组研究的对照。 那些具有接受性子宫内膜的患者将根据标准临床方案继续他们的 ART。 那些具有非接受性子宫内膜的患者将遵循 ERA 测试得出的建议,选择当天的第二个 EB 样本,其中将重复收集 EF 样本。 最后,EF 的接受性和微生物组结果将与子宫内膜组织相关,并与这些患者在胚胎移植后的生殖结果相关。
NLD 微生物组接受 ERA 测试
ERA 接受患者的子宫内膜微生物群由链球菌和加德纳菌等不同致病菌组成,或不以乳杆菌属细菌为主,由 NGS 测序确定。
在指示用于 ERA 的 EB 的同一天,在使用 5 天黄体酮的 HRT 周期的第 5 天,根据常见的临床实践,将在用于 ERA 的 EB 之前立即抽吸 EF 样本。 该 EF 样本将用于微生物组的非侵入性诊断,同时通过 ERA 进行子宫内膜容受性诊断而获得的一小部分子宫内膜组织将用作子宫内膜微生物组研究的对照。 那些具有接受性子宫内膜的患者将根据标准临床方案继续他们的 ART。 那些具有非接受性子宫内膜的患者将遵循 ERA 测试得出的建议,选择当天的第二个 EB 样本,其中将重复收集 EF 样本。 最后,EF 的接受性和微生物组结果将与子宫内膜组织相关,并与这些患者在胚胎移植后的生殖结果相关。

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
不孕症患者子宫内膜微生物组 (EM) 新的非侵入性诊断测试的开发
大体时间:24个月
使用子宫内膜液通过下一代测序 (NGS) 进行细菌 DNA 分析以进行 EM 诊断。 这将通过 EF 样本中每种细菌 DNA 的百分比来衡量
24个月

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
活产率
大体时间:40周
每次胚胎移植出生的婴儿数量
40周
着床率
大体时间:12周
每移植胚胎总数的植入胚胎数
12周
临床流产
大体时间:20周
临床流产次数/妊娠总数
20周
宫外孕
大体时间:20周
占妊娠总数的异位妊娠数
20周
受孕率
大体时间:20周
每次胚胎移植的怀孕次数
20周
生化妊娠
大体时间:20周
生化妊娠次数/妊娠总数
20周
持续妊娠率
大体时间:40周
每次胚胎移植的持续妊娠数
40周

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

调查人员

  • 学习椅:Carlos Simón, MD PhD、Igenomix

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2017年8月4日

初级完成 (实际的)

2019年5月17日

研究完成 (实际的)

2020年6月25日

研究注册日期

首次提交

2017年10月24日

首先提交符合 QC 标准的

2017年10月30日

首次发布 (实际的)

2017年11月6日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2020年10月9日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2020年10月8日

最后验证

2020年10月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • IGX1-MIC-CS-17-05

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

不

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

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