Opracowanie narzędzia do nieinwazyjnej diagnostyki mikrobiomu (ERA-niMIC)
Opracowanie nieinwazyjnego narzędzia diagnostycznego do analizy mikroflory w celu poprawy wyników reprodukcyjnych u niepłodnych pacjentów.
Chociaż tkanka endometrium była tradycyjnie uważana za wolną od bakterii, ostatnie badania udokumentowały obecność mikrobiomu endometrium. W badaniu pilotażowym przeprowadzonym przez nasz zespół badawczy mikroorganizmy obecne w endometrium zostały przeanalizowane w próbkach płynu endometrium (EF) przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Zgodnie z wcześniej opublikowanymi badaniami, w normalnych warunkach endometrium składa się głównie z różnych gatunki z rodzaju Lactobacillus. Ponadto zauważono, że obecność innych bakterii chorobotwórczych, takich jak Streptococcus i/lub Gardnerella, może zmienić mikrobiom endometrium i zakłócić środowisko macicy, wpływając na wskaźniki implantacji i powodzenie ciąży.
Celem tego projektu jest walidacja mikrobiomu występującego w endometrium kobiet w wieku rozrodczym i próba potwierdzenia związku między mikrobiomem endometrium a wynikami reprodukcyjnymi u pacjentek poddawanych leczeniu wspomaganego rozrodu (ART). Wykorzystanie narzędzia Endometrial Receptivity Analysis (ERA) wraz z analizą flory endometrium przed transferem zarodków pozwoli na ocenę wpływu obecności patogenów endometrium na implantację u pacjentek receptywnych.
Dlatego celem tego projektu jest opracowanie i kliniczna walidacja nieinwazyjnego narzędzia diagnostycznego do analizy mikroflory, dodając badanie mikrobiomu do analizy ERA.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Implantacja zarodka jest procesem krytycznym dla przetrwania gatunku, który jest stosunkowo nieefektywny, zwłaszcza u ludzi. Kluczowymi elementami są zarodek, endometrium matki i komunikacja między nimi z wykorzystaniem różnych perspektyw naukowych. Receptywność endometrium opisuje fenotyp, który pozwala na adhezję zarodka i umieszczenie łożyska. W związku z potrzebą dokładnego i obiektywnego molekularnego testu diagnostycznego określającego stan receptywności endometrium opracowano analizę receptywności endometrium (ERA). Test ERA to dostosowana mikromacierz ekspresyjna, która identyfikuje sygnaturę profilu ekspresji transkryptomicznej spersonalizowanego okna implantacji (WOI). Jego przydatność kliniczną wykazano u pacjentek z niepowodzeniem implantacji, u których 25% z nich ma przemieszczone WOI, które zaszły w ciążę po wykonaniu transferu zarodka w odpowiednim WOI przewidzianym przez ERA. Procedura ta wymaga jednak wykonania biopsji endometrium (EB), co jest główną wadą tego testu diagnostycznego, ponieważ transfer zarodka musi zostać przesunięty do następnego cyklu, a także możliwy dyskomfort pacjentki. Z tego powodu przeprowadzono poprzednie badanie pilotażowe w celu potwierdzenia, czy receptywność endometrium można przewidzieć metodami nieinwazyjnymi w próbkach płynu endometrialnego (EF). Panel genów testu ERA został zbadany na komórkach nabłonkowych i zrębowych z biopsji endometrium i komórkach wyizolowanych z EF na poziomie pojedynczej komórki, wykazując, że główne komórki na EF klasyfikują się razem z populacją nabłonkową.
Z drugiej strony, aby spróbować lepiej zrozumieć mechanizmy łączące receptywność endometrium i/lub implantację zarodka ze zmienionym mikrobiomem endometrium, przeprowadzono kolejne badanie pilotażowe w celu określenia składu mikrobiomu endometrium po analizie bakteryjnego rybosomu 16S RNA przez NGS. Co ciekawe, u pacjentek z receptywnym endometrium rozpoznanym metodą Endometrial Receptivity Array (ERA), które miały mikrobiom endometrium z patogenami lub nie były zdominowane przez bakterie z rodzaju Lactobacillus (NLD) wykazywały istotnie niższą implantację (23,1% vs 60,7% p = 0,02), ciąż (33,3% vs 70,6%, p = 0,03), trwającej ciąży na transfer zarodka (13,3% vs 58,8%, p = 0,03) i urodzeń żywych (6,7% vs 58,8%, p = 0,002) niż u zdrowych mikrobiom endometrium zdominowany przez Lactobacillus (LD). Co więcej, związek ten był znacznie bardziej znaczący, gdy znalezione gatunki patogenne należały do rodzaju Gardnerella i Streptococcus. Jest to zgodne z innymi opublikowanymi badaniami, które analizują wpływ patogenów endometrium na leczenie IVF, podkreślając znaczenie badania społeczności bakteryjnych dla zdrowia reprodukcyjnego.
Biorąc pod uwagę te wstępne wyniki, niniejsze badanie ma na celu potwierdzenie w większym zestawie próbek związku między brakiem równowagi mikrobiomu endometrium a spadkiem sukcesu reprodukcyjnego u pacjentów poddawanych ART. W tym celu projekt eksperymentu zostanie udoskonalony w następujących obszarach: (i) przeanalizowana zostanie próbka o większej liczebności w celu potwierdzenia poprzednich wyników uzyskanych w poprzednim badaniu pilotażowym dotyczącym mikrobiomu endometrium, (ii) sparowane próbki płynu endometrialnego i endometrium biopsja zostanie przeanalizowana pod kątem profilu mikrobiologicznego w celu zbadania, czy występuje zmienność bakteryjna związana z typem próbki, (iii) mikroflora endometrium zostanie jednocześnie oceniona za pomocą ERA jako dodatkowa diagnoza dla tego narzędzia oraz (iv) analiza endometrium mikrobiomu zostanie przeprowadzona przy użyciu najbardziej zaawansowanej technologii sekwencjonowania metagenomu bakterii w celu poszerzenia informacji o mikroorganizmach zidentyfikowanych w każdej próbce.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Buenos Aires, Argentyna, C1425DGQ
- Pregna Medicina Reproductiva
-
-
Santa Fe
-
Rosario, Santa Fe, Argentyna
- Gestanza Medicina Reproductiva
-
-
-
-
-
Madrid, Hiszpania, 28036
- ProcreaTec
-
-
Malaga
-
Fuengirola, Malaga, Hiszpania, 29640
- Clinica Fertia
-
-
-
-
-
Istanbul, Indyk
- Bahceci Fulya IVF Center
-
-
-
-
Osaka Prefecture
-
Osaka, Osaka Prefecture, Japonia, 557-0045
- Oak Clinic Sumiyoshi
-
-
-
-
British Columbia
-
Burnaby, British Columbia, Kanada, V5G 4X7
- Pacific Center for Reproductive Medicine
-
-
-
-
Selangor
-
Petaling Jaya, Selangor, Malezja, 47810
- Alpha Fertility Center
-
-
-
-
-
Mexico City, Meksyk, 11000
- New Hope Fertility Center
-
-
-
-
Connecticut
-
Norwalk, Connecticut, Stany Zjednoczone, 06861
- RMA Connecticut
-
-
Florida
-
Margate, Florida, Stany Zjednoczone, 33063
- IVF Florida
-
-
Missouri
-
Chesterfield, Missouri, Stany Zjednoczone, 63005
- Missouri Center for Reproductive Medicine (MCRM Fertility)
-
-
Washington
-
Arlington, Washington, Stany Zjednoczone, 22203
- Dominion Fertility
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci poddawani zapłodnieniu in vitro (IVF) / docytoplazmatycznemu wstrzyknięciu plemnika (ICSI) lub OVODON ze wskazaniem ERA, ze wskazaniem do preimplantacyjnego genetycznego badania przesiewowego (PGS) lub bez niego, którzy otrzymują transfer zarodków z zamrożonymi zarodkami w stadium blastocysty (dzień 5/dzień 6) w cyklu hormonalnej terapii zastępczej (HTZ).
- Wiek matki: ≤40 lat (pacjenci IVF/ICSI)
- Wiek matki: ≤50 lat (pacjenci OVODONATION)
- Wskaźnik masy ciała (BMI): 18,5 - 30 kg/m2 (oba włącznie)
- Negatywne testy serologiczne w kierunku ludzkiego wirusa niedoboru odporności (HIV), wirusa zapalenia wątroby typu B (HBV), wirusa zapalenia wątroby typu C (HCV), szybkiej reaginy osocza (RPR) w kierunku kiły
- Kobiety z regularną formułą menstruacyjną (3-4 / 26-35 dni)
- Stężenie plemników: > 2 miliony plemników/ml
Kryteria wyłączenia:
- Pacjentki, które były nosicielkami wkładek wewnątrzmacicznych (IUD) w ciągu ostatnich 3 miesięcy
- Pacjenci, którzy przyjmowali przepisane antybiotyki w ciągu ostatnich 3 miesięcy przed pobraniem próbki. (Mogą być przyjęte przypadki, w których pacjentka otrzymywała wcześniej profilaktycznie antybiotyki do punkcji jajników w cyklu stymulacji, zgodnie ze standardową praktyką kliniczną ośrodka. Podanie tego antybiotyku powinno nastąpić co najmniej 1 miesiąc przed pobraniem próbki).
- Patologie przydatków lub macicy, takie jak wady rozwojowe macicy, które mogą wpływać na szybkość implantacji (np. Polipy, mięśniak śródścienny ≥ 4 cm lub podśluzówkowy, przegroda, wodniak jajowodu itp.). Pacjenci dotknięci (przed lub po ich włączeniu) jakąkolwiek z wcześniej opisanych patologii będą mogli uczestniczyć w tym badaniu, o ile zostaną poddani leczeniu chirurgicznemu przed jakąkolwiek procedurą badawczą.
- Występowanie ciężkich lub niekontrolowanych infekcji bakteryjnych, grzybiczych lub wirusowych, które w opinii głównego badacza mogłyby zakłócić udział pacjenta w badaniu lub ocenę wyników badania.
- Jakakolwiek choroba lub stan medyczny, który jest niestabilny lub może zagrażać bezpieczeństwu pacjenta i przestrzeganiu zaleceń w badaniu.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Mikrobiom LD podatny na test ERA
Pacjenci receptywni w teście ERA z mikrobiomem endometrium składającym się głównie z różnych gatunków z rodzaju Lactobacillus, określonymi przez sekwencjonowanie NGS.
|
W tym samym dniu, w którym wskazana jest EB dla ERA, w 5. dniu cyklu HTZ z 5-dniowym przyjmowaniem progesteronu, zgodnie z powszechną praktyką kliniczną, próbka EF zostanie pobrana bezpośrednio przed EB dla ERA.
Ta próbka EF zostanie wykorzystana do nieinwazyjnej diagnostyki mikrobiomu, a także niewielka część tkanki endometrium uzyskana do diagnozy receptywności endometrium metodą ERA zostanie wykorzystana jako kontrola do badania mikrobiomu endometrium.
Pacjentki z receptywnym endometrium będą kontynuować ART zgodnie ze standardowym protokołem klinicznym.
Pacjentki z endometrium niereceptorowym zastosują się do zaleceń wynikających z testu ERA w celu wybrania dnia na drugą próbkę EB, w której zostanie powtórzone pobranie próbki EF.
Wreszcie, receptywność i wyniki mikrobiomu w EF będą skorelowane z wynikami w tkance endometrium oraz z wynikami reprodukcyjnymi tych pacjentek po transferze zarodka.
|
|
Mikrobiom NLD podatny na test ERA
Pacjentki receptywne w teście ERA z mikrobiomem endometrium składającym się z różnych bakterii chorobotwórczych, takich jak Streptococcus i Gardnerella, lub niezdominowanymi przez bakterie z rodzaju Lactobacillus, określone przez sekwencjonowanie NGS.
|
W tym samym dniu, w którym wskazana jest EB dla ERA, w 5. dniu cyklu HTZ z 5-dniowym przyjmowaniem progesteronu, zgodnie z powszechną praktyką kliniczną, próbka EF zostanie pobrana bezpośrednio przed EB dla ERA.
Ta próbka EF zostanie wykorzystana do nieinwazyjnej diagnostyki mikrobiomu, a także niewielka część tkanki endometrium uzyskana do diagnozy receptywności endometrium metodą ERA zostanie wykorzystana jako kontrola do badania mikrobiomu endometrium.
Pacjentki z receptywnym endometrium będą kontynuować ART zgodnie ze standardowym protokołem klinicznym.
Pacjentki z endometrium niereceptorowym zastosują się do zaleceń wynikających z testu ERA w celu wybrania dnia na drugą próbkę EB, w której zostanie powtórzone pobranie próbki EF.
Wreszcie, receptywność i wyniki mikrobiomu w EF będą skorelowane z wynikami w tkance endometrium oraz z wynikami reprodukcyjnymi tych pacjentek po transferze zarodka.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Opracowanie nowego nieinwazyjnego testu diagnostycznego mikrobiomu endometrium (EM) u pacjentek niepłodnych
Ramy czasowe: 24 miesiące
|
Analiza bakteryjnego DNA metodą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) z użyciem płynu endometrialnego do diagnostyki EM.
Będzie to mierzone procentem DNA każdej bakterii w próbkach EF
|
24 miesiące
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Żywy wskaźnik urodzeń
Ramy czasowe: 40 tygodni
|
Liczba dzieci urodzonych na transfer zarodka
|
40 tygodni
|
|
Wskaźnik implantacji
Ramy czasowe: 12 tygodni
|
Liczba wszczepionych zarodków na całkowitą liczbę przeniesionych zarodków
|
12 tygodni
|
|
Poronienia kliniczne
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba poronień klinicznych na całkowitą liczbę ciąż
|
20 tygodni
|
|
Ciąże pozamaciczne
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba ciąż pozamacicznych na całkowitą liczbę ciąż
|
20 tygodni
|
|
Wskaźnik ciąż
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba ciąż na transfer zarodka
|
20 tygodni
|
|
Ciąża biochemiczna
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba ciąż biochemicznych na całkowitą liczbę ciąż
|
20 tygodni
|
|
Bieżący wskaźnik ciąż
Ramy czasowe: 40 tygodni
|
Liczba trwających ciąż na transfer zarodka
|
40 tygodni
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Krzesło do nauki: Carlos Simón, MD PhD, Igenomix
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- IGX1-MIC-CS-17-05
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .