Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Разработка инструмента неинвазивной диагностики микробиома (ERA-niMIC)

8 октября 2020 г. обновлено: Igenomix

Разработка неинвазивного диагностического инструмента для анализа микробиоты для улучшения репродуктивных результатов у пациентов с бесплодием.

Хотя ткань эндометрия традиционно считалась свободной от бактерий, недавние исследования подтвердили наличие микробиома эндометрия. В пилотном исследовании, проведенном нашей исследовательской группой, микроорганизмы, присутствующие в эндометрии, были проанализированы в образцах эндометриальной жидкости (EF) с использованием секвенирования следующего поколения (NGS). В соответствии с ранее опубликованными исследованиями, в нормальных условиях эндометрий в основном состоит из различных виды рода Lactobacillus. Кроме того, было отмечено, что присутствие других патогенных бактерий, таких как Streptococcus и/или Gardnerella, может изменить микробиом эндометрия и нарушить среду матки, влияя на частоту имплантации и успешность беременности.

Этот проект направлен на проверку микробиома, обнаруженного в эндометрии женщин репродуктивного возраста, и попытку подтвердить взаимосвязь между микробиомом эндометрия и репродуктивными результатами у пациенток, проходящих лечение с помощью вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ). Использование инструмента «Анализ рецептивности эндометрия» (ERA) вместе с анализом эндометриальной флоры перед переносом эмбриона позволит оценить влияние присутствия эндометриальных патогенов на имплантацию у восприимчивых пациенток.

Таким образом, в центре внимания этого проекта находится разработка и клиническая проверка неинвазивного диагностического инструмента для анализа микробиоты, добавляющий исследование микробиома к анализу ERA.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Эмбриональная имплантация является критически важным процессом для выживания вида, который относительно неэффективен, особенно у людей. Ключевыми элементами являются эмбрион, материнский эндометрий и перекрестная связь между ними с использованием различных научных точек зрения. Рецептивность эндометрия описывает фенотип, который позволяет происходить адгезии эмбриона и плацентации. В связи с необходимостью точного и объективного молекулярного диагностического теста для определения статуса рецептивности эндометрия был разработан Анализ восприимчивости эндометрия (ERA). Тест ERA представляет собой настраиваемый микрочип экспрессии, который идентифицирует подпись профиля транскриптомной экспрессии персонализированного окна имплантации (WOI). Его клиническая полезность была продемонстрирована у пациентов с неудачей имплантации, у 25% из которых имеется смещенный ВОИ, и они забеременели после проведения переноса эмбрионов при надлежащем ВОИ, прогнозируемом ERA. Однако эта процедура требует биопсии эндометрия (ЭБ), что является основным недостатком этого диагностического теста, поскольку перенос эмбриона приходится откладывать до следующего цикла, а также возможный дискомфорт, причиняемый пациенткам. По этой причине было проведено предварительное пилотное исследование, чтобы подтвердить, можно ли предсказать рецептивность эндометрия с помощью неинвазивных методов в образцах эндометриальной жидкости (EF). Генная панель теста ERA исследовалась на эпителиальных и стромальных клетках из биоптатов эндометрия и клетках, выделенных из EF на уровне отдельных клеток, демонстрируя, что основные клетки в EF классифицируются вместе с эпителиальной популяцией.

С другой стороны, чтобы попытаться лучше понять механизмы, связывающие рецептивность эндометрия и/или имплантацию эмбриона с измененным микробиомом эндометрия, было проведено еще одно пилотное исследование по определению состава микробиома эндометрия после анализа бактериального 16S рибосомального РНК методом NGS. Интересно, что у пациенток с рецептивным эндометрием, диагностированных с помощью массива эндометриальной рецептивности (ERA), у которых микробиом эндометрия был с патогенами или не преобладали бактерии рода Lactobacillus (NLD), наблюдалась значительно более низкая имплантация (23,1% против 60,7%, р = 0,02). беременность (33,3% против 70,6%, p = 0,03), продолжающаяся беременность после переноса эмбриона (13,3% против 58,8%, p = 0,03) и живорождение (6,7% против 58,8%, p = 0,002) выше, чем у здоровых женщин. в микробиоме эндометрия преобладают Lactobacillus (LD). Причем эта связь была гораздо более значимой, когда обнаруженные патогенные виды принадлежали к родам Gardnerella и Streptococcus. Это согласуется с другими опубликованными исследованиями, в которых анализируется влияние эндометриальных патогенов на процедуры ЭКО, подчеркивая важность изучения бактериальных сообществ для репродуктивного здоровья.

Учитывая эти предварительные результаты, настоящее исследование направлено на проверку на большей выборке взаимосвязи между дисбалансом микробиома эндометрия и снижением репродуктивного успеха у пациенток, проходящих ВРТ. Для этого план эксперимента будет улучшен в следующих областях: (i) будет проанализирован больший размер выборки для подтверждения предыдущих результатов, полученных в предыдущем пилотном исследовании микробиома эндометрия, (ii) парные образцы эндометриальной жидкости и эндометрия. биопсия будет проанализирована на микробный профиль, чтобы изучить, существует ли бактериальная изменчивость, связанная с типом образца, (iii) микробиота эндометрия будет одновременно оценена с помощью ERA в качестве дополнительного диагноза для этого инструмента, и (iv) анализ эндометрия микробиота будет проводиться с использованием самых передовых технологий секвенирования бактериального метагенома, чтобы расширить информацию о микроорганизмах, идентифицированных в каждом образце.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

452

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

  • Аргентина
      • Buenos Aires, Аргентина, C1425DGQ
        • Pregna Medicina Reproductiva
    • Santa Fe
      • Rosario, Santa Fe, Аргентина
        • Gestanza Medicina Reproductiva
  • Испания
      • Madrid, Испания, 28036
        • ProcreaTec
    • Malaga
      • Fuengirola, Malaga, Испания, 29640
        • Clinica Fertia
  • Канада
    • British Columbia
      • Burnaby, British Columbia, Канада, V5G 4X7
        • Pacific Center for Reproductive Medicine
  • Малайзия
    • Selangor
      • Petaling Jaya, Selangor, Малайзия, 47810
        • Alpha Fertility Center
  • Мексика
      • Mexico City, Мексика, 11000
        • New Hope Fertility Center
  • Соединенные Штаты
    • Connecticut
      • Norwalk, Connecticut, Соединенные Штаты, 06861
        • RMA Connecticut
    • Florida
      • Margate, Florida, Соединенные Штаты, 33063
        • IVF Florida
    • Missouri
      • Chesterfield, Missouri, Соединенные Штаты, 63005
        • Missouri Center for Reproductive Medicine (MCRM Fertility)
    • Washington
      • Arlington, Washington, Соединенные Штаты, 22203
        • Dominion Fertility
  • Турция
      • Istanbul, Турция
        • Bahceci Fulya IVF Center
  • Япония
    • Osaka Prefecture
      • Osaka, Osaka Prefecture, Япония, 557-0045
        • Oak Clinic Sumiyoshi

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 50 лет (Взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Женский

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты с ВРТ с указанием диагноза рецептивности эндометрия с помощью ERA, которые получат перенос эмбрионов с замороженными эмбрионами на стадии бластоцисты (день 5/день 6).

Описание

Критерии включения:

  • Пациенты, проходящие экстракорпоральное оплодотворение (ЭКО) / интрацитоплазматическую инъекцию сперматозоидов (ИКСИ) или ОВОДОН с указанием ERA, с указанием или без указания преимплантационного генетического скрининга (ПГС), которые получают перенос эмбрионов с замороженными эмбрионами на стадии бластоцисты (день 5/день 6) на цикл заместительной гормональной терапии (ЗГТ).
  • Возраст матери: ≤40 лет (пациенты ЭКО/ИКСИ)
  • Возраст матери: ≤50 лет (пациенты с ОВОДОНАЦИЕЙ)
  • Индекс массы тела (ИМТ): 18,5 - 30 кг/м2 (оба включительно)
  • Отрицательные серологические тесты на вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), вирус гепатита В (ВГВ), вирус гепатита С (ВГС), экспресс-реагин плазмы (РПР) на сифилис
  • Женщины с регулярной менструальной смесью (3-4/26-35 дней)
  • Концентрация сперматозоидов: > 2 миллионов сперматозоидов/мл

Критерий исключения:

  • Пациентки, являющиеся носителями внутриматочной спирали (ВМС) в течение последних 3 мес.
  • Пациенты, принимавшие назначенные антибиотики в течение последних 3 месяцев до взятия образца. (Могут быть приняты те случаи, когда пациентка ранее получала профилактические антибиотики до пункции яичников в цикле стимуляции, согласно стандартной клинической практике центра. Введение этого антибиотика должно быть по крайней мере за 1 месяц до забора образца).
  • Патологии придатков или матки как пороки развития матки, которые могут повлиять на скорость имплантации (например, полипы, интрамуральная миома ≥ 4 см или подслизистая, перегородка, гидросальпинкс и т. д.). Пациенты, пораженные (до или после их включения) какой-либо из ранее описанных патологий, будут допущены к участию в этом исследовании, если они будут подвергнуты хирургическому лечению перед какой-либо процедурой исследования.
  • Наличие тяжелых или неконтролируемых бактериальных, грибковых или вирусных инфекций, которые, по мнению главного исследователя, могут помешать участию пациента в исследовании или оценке результатов исследования.
  • Любое заболевание или состояние здоровья, которое является нестабильным или может поставить под угрозу безопасность пациента и его соблюдение в исследовании.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Когорта
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Микробиом LD восприимчив к тесту ERA
Восприимчивые пациентки с помощью теста ERA с микробиотой эндометрия, в основном состоящей из различных видов рода Lactobacillus, определенной с помощью NGS-секвенирования.
Процедура: Биопсия эндометрия и забор эндометриальной жидкости
В тот же день, когда показана ЭБ для ЭРА, на 5-й день цикла ЗГТ с 5-дневным курсом прогестерона, в соответствии с общепринятой клинической практикой, образец ФВ будет аспирирован непосредственно перед ЭБ для ЭРА. Этот образец EF будет использоваться для неинвазивной диагностики микробиома, также небольшая часть ткани эндометрия, полученная для диагностики рецептивности эндометрия с помощью ERA, будет использоваться в качестве контроля для исследования микробиома эндометрия. Пациентки с восприимчивым эндометрием будут продолжать АРТ в соответствии со стандартным клиническим протоколом. Те пациенты с невосприимчивым эндометрием будут следовать рекомендациям, полученным в результате теста ERA, для выбора дня для второго образца EB, в котором сбор образца EF будет повторен. Наконец, результаты восприимчивости и микробиома при ЭФ будут коррелировать с таковыми в ткани эндометрия и с репродуктивными исходами этих пациентов после переноса эмбрионов.
Микробиом NLD восприимчив к тесту ERA
Восприимчивые пациентки с помощью теста ERA с микробиотой эндометрия, состоящей из различных патогенных бактерий, таких как Streptococcus и Gardnerella, или без преобладания бактерий рода Lactobacillus, определяемой секвенированием NGS.
Процедура: Биопсия эндометрия и забор эндометриальной жидкости
В тот же день, когда показана ЭБ для ЭРА, на 5-й день цикла ЗГТ с 5-дневным курсом прогестерона, в соответствии с общепринятой клинической практикой, образец ФВ будет аспирирован непосредственно перед ЭБ для ЭРА. Этот образец EF будет использоваться для неинвазивной диагностики микробиома, также небольшая часть ткани эндометрия, полученная для диагностики рецептивности эндометрия с помощью ERA, будет использоваться в качестве контроля для исследования микробиома эндометрия. Пациентки с восприимчивым эндометрием будут продолжать АРТ в соответствии со стандартным клиническим протоколом. Те пациенты с невосприимчивым эндометрием будут следовать рекомендациям, полученным в результате теста ERA, для выбора дня для второго образца EB, в котором сбор образца EF будет повторен. Наконец, результаты восприимчивости и микробиома при ЭФ будут коррелировать с таковыми в ткани эндометрия и с репродуктивными исходами этих пациентов после переноса эмбрионов.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Разработка нового неинвазивного диагностического теста эндометриального микробиома (ЭМ) у пациентов с бесплодием
Временное ограничение: 24 месяца
Бактериальный анализ ДНК с помощью секвенирования нового поколения (NGS) с использованием эндометриальной жидкости для диагностики ЭМ. Это будет измеряться процентным содержанием каждой бактериальной ДНК в образцах EF.
24 месяца

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Живая рождаемость
Временное ограничение: 40 недель
Количество детей, рожденных за один перенос эмбрионов
40 недель
Скорость имплантации
Временное ограничение: 12 недель
Количество имплантированных эмбрионов на общее количество перенесенных эмбрионов
12 недель
Клинические выкидыши
Временное ограничение: 20 недель
Количество клинических выкидышей на общее число беременностей
20 недель
Внематочная беременность
Временное ограничение: 20 недель
Количество внематочных беременностей на общее число беременностей
20 недель
Уровень беременности
Временное ограничение: 20 недель
Количество беременностей на перенос эмбриона
20 недель
Биохимическая беременность
Временное ограничение: 20 недель
Количество биохимических беременностей на общее количество беременностей
20 недель
Уровень продолжающейся беременности
Временное ограничение: 40 недель
Количество продолжающихся беременностей на перенос эмбриона
40 недель

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Igenomix

Следователи

  • Учебный стул: Carlos Simón, MD PhD, Igenomix

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

4 августа 2017 г.

Первичное завершение (Действительный)

17 мая 2019 г.

Завершение исследования (Действительный)

25 июня 2020 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

24 октября 2017 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

30 октября 2017 г.

Первый опубликованный (Действительный)

6 ноября 2017 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

9 октября 2020 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

8 октября 2020 г.

Последняя проверка

1 октября 2020 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • IGX1-MIC-CS-17-05

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться