Biomarkery DNA ve vzorcích tkání od pacientů s osteosarkomem
Terapeuticky použitelný výzkum k vytvoření účinné léčby (TARGET) pro osteosarkom
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
CÍLE:
I. Komplexně detekovat genomové, epigenomické a transkriptomické aberace ve vzorcích tkání od pacientů s osteosarkomem, které mohou hrát roli v chemorezistenci a metastázách, pomocí technologií s vysokým rozlišením v celém genomu.
II. Identifikovat recidivující genetické mutace podílející se na patogenezi osteosarkomu, zejména pro vznik chemorezistence a metastatických nádorů.
III. Identifikovat a validovat tyto biomarkery pro nové terapeutické cíle u pacientů s osteosarkomem, zejména u pacientů s metastatickým onemocněním a jejichž nádory jsou rezistentní na standardní chemoterapii.
PŘEHLED: Toto je multicentrická studie. Archivovaná nádorová tkáň a vzorky DNA z periferní krve jsou analyzovány pro profilování počtu kopií DNA, profilování genové exprese, profilování metylace DNA, profilování mikroRNA a genomové resekvenování. Klinická data včetně demografických údajů; datum diagnózy, operace, chemoterapie, recidivy, progrese a úmrtí; zobrazování; toxicita; a jsou také shromažďovány a analyzovány prvky patologických dat související se vzorky.
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Spojené státy, 19104
- Childrens Oncology Group
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Diagnóza osteosarkomu
Čerstvě zmrazené vzorky odebrané v době diagnózy se shodnou krevní DNA (preferováno) od pacientů zařazených do následujících biologických protokolů osteosarkomu:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Dostupné údaje o klinických výsledcích
- Nespecifikováno
- Nespecifikováno
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Pouze případ
- Časové perspektivy: Retrospektivní
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Pomocně-korelativní (vzorkování a analýza biomarkerů)
Archivovaná nádorová tkáň a vzorky DNA z periferní krve jsou analyzovány pro profilování počtu kopií DNA, profilování genové exprese, profilování metylace DNA, profilování mikroRNA a genomové resekvenování.
Klinická data včetně demografických údajů; datum diagnózy, operace, chemoterapie, recidivy, progrese a úmrtí; zobrazování; toxicita; a jsou také shromažďovány a analyzovány prvky patologických dat související se vzorky.
|
Korelační studie
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Exprese genů
Časové okno: Základní linie
|
Pro analýzu diferenciální exprese bude použit algoritmus Significance Analysis of Microarrays (SAM).
Analýza dráhy a integrace dat bude provedena na odlišně exprimovaných genech pomocí analýzy dráhy Ingenuity.
Diferenciálně exprimované geny a miRNA cíle, stejně jako geny ve významných aberacích DNA budou mapovány a integrovány za účelem identifikace obohacených drah a sítí.
|
Základní linie
|
|
Výskyt aberací počtu kopií
Časové okno: Základní linie
|
Data pole budou importována do analyzátoru počtu kopií (CNAG) pro mapovací pole GeneChip, aby se identifikovaly aberace počtu kopií ve vzorcích nádoru.
K identifikaci oblastí s častou CNA mezi různými skupinami vzorků pacientů použijeme nástroj Genomic Identification of Significant Targets in Cancer (GISTIC).
|
Základní linie
|
|
Výskyt mutací, které se vyskytují s klinicky významnou frekvencí
Časové okno: Základní linie
|
Základní linie
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- AOST10B5 (Jiný identifikátor: CTEP)
- U10CA098543 (Grant/smlouva NIH USA)
- NCI-2011-02840 (Identifikátor registru: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .