Biomarkery DNA w próbkach tkanek od pacjentów z kostniakomięsakiem
Terapeutycznie stosowane badania w celu wygenerowania skutecznych metod leczenia (TARGET) dla kostniakomięsaka
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
CELE:
I. Kompleksowe wykrywanie aberracji genomowych, epigenomicznych i transkryptomicznych w próbkach tkanek od pacjentów z kostniakomięsakiem, które mogą odgrywać rolę w chemooporności i przerzutach, przy użyciu technologii obejmujących cały genom o wysokiej rozdzielczości.
II. Identyfikacja nawracających mutacji genetycznych zaangażowanych w patogenezę kostniakomięsaka, zwłaszcza w rozwój chemooporności i guzów przerzutowych.
III. Identyfikacja i walidacja tych biomarkerów pod kątem nowych celów terapeutycznych dla pacjentów z kostniakomięsakiem, zwłaszcza tych z chorobą przerzutową, których guzy są oporne na standardową chemioterapię.
ZARYS: Jest to badanie wieloośrodkowe. Zarchiwizowane próbki DNA tkanki nowotworowej i krwi obwodowej są analizowane pod kątem profilowania liczby kopii DNA, profilowania ekspresji genów, profilowania metylacji DNA, profilowania mikroRNA i ponownego sekwencjonowania genomu. Dane kliniczne, w tym dane demograficzne; data diagnozy, operacji, chemioterapii, nawrotu, progresji i śmierci; obrazowanie; toksyczność; oraz elementy danych patologicznych związane z próbkami są również gromadzone i analizowane.
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Stany Zjednoczone, 19104
- Childrens Oncology Group
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Rozpoznanie kostniakomięsaka
Świeżo zamrożone próbki pobrane w momencie diagnozy z dopasowanym DNA krwi (preferowane) od pacjentów włączonych do następujących protokołów biologii kostniakomięsaka:
- COG-P9851
- COG-AOST06B1
- Dostępne dane dotyczące wyników klinicznych
- Nieokreślony
- Nieokreślony
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Tylko przypadek
- Perspektywy czasowe: Z mocą wsteczną
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pomocnicze-korelowane (pobieranie próbek i analiza biomarkerów)
Zarchiwizowane próbki DNA tkanki nowotworowej i krwi obwodowej są analizowane pod kątem profilowania liczby kopii DNA, profilowania ekspresji genów, profilowania metylacji DNA, profilowania mikroRNA i ponownego sekwencjonowania genomu.
Dane kliniczne, w tym dane demograficzne; data diagnozy, operacji, chemioterapii, nawrotu, progresji i śmierci; obrazowanie; toksyczność; oraz elementy danych patologicznych związane z próbkami są również gromadzone i analizowane.
|
Badania korelacyjne
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Ekspresja genów
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Algorytm analizy istotności mikromacierzy (SAM) zostanie wykorzystany do analizy ekspresji różnicowej.
Analiza ścieżki i integracja danych zostaną przeprowadzone na genach o zróżnicowanej ekspresji przy użyciu analizy Ingenuity Pathway.
Geny o zróżnicowanej ekspresji i cele miRNA, a także geny w znaczących aberracjach DNA zostaną zmapowane i zintegrowane w celu zidentyfikowania wzbogaconych szlaków i sieci.
|
Linia bazowa
|
|
Występowanie abberacji liczby kopii
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Dane z macierzy zostaną zaimportowane do analizatora liczby kopii (CNAG) w celu wykonania tablic mapowania GeneChip w celu zidentyfikowania aberracji liczby kopii w próbkach guza.
Aby zidentyfikować regiony z częstymi CNA wśród różnych grup próbek pacjentów, użyjemy narzędzia Genomic Identification of Significant Targets in Cancer (GISTIC).
|
Linia bazowa
|
|
Występowanie mutacji, które występują z klinicznie istotną częstotliwością
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Ching C Lau, Children's Oncology Group
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Oszacować)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- AOST10B5 (Inny identyfikator: CTEP)
- U10CA098543 (Grant/umowa NIH USA)
- NCI-2011-02840 (Identyfikator rejestru: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- CDR0000683276
- COG-AOST10B5
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .