Genetické analýzy nesyndromické a syndromové hluchoty v Pákistánu

Cíl: Jedním z cílů této studie je geneticky zmapovat a identifikovat mutované geny pro lidskou dědičnou ztrátu sluchu. Druhým cílem je studium funkce těchto genů ve sluchovém systému pomocí myších modelů. Lidské dědičné poškození sluchu je výsledkem abnormálního vývoje ucha, abnormální funkce ucha nebo obojího. Ačkoli geny pro četné lokusy hluchoty byly zmapovány a identifikovány, stále existuje mnoho rodin, které oddělují hluchotu jako monogenní znak, ale mutantní alela nemůže být připsána jednomu z aktuálně uváděných genů hluchoty. Abychom zmapovali a identifikovali nové mutované geny spojené se ztrátou sluchu u lidí, budeme pokračovat ve zjišťování velkých rodin segregujících syndromickou a nesyndromickou hluchotu jako monogenní rys.

Studijní populace: Tato studie bude zjišťovat subjekty z příbuzných pákistánských rodin se segregující ztrátu sluchu sestávající z nesyndromických i syndromických forem hluchoty genetické etiologie. Vzhledem k tomu, že většina pákistánských manželství je mezi prvními bratranci a sestřenicemi, má to tendenci spojovat stejné recesivní mutace pro ztrátu sluchu s více postiženými jedinci v rámci jedné rodinné linie, což je pro tuto genetickou studii výhoda. Před několika lety jsme přestali zjišťovat rodiny v Indii. Pokračujeme ve zjišťování postižených i nepostižených pákistánských rodinných příslušníků ve věku od 2 let výše. Dospělí poskytují informovaný souhlas jak pro sebe, tak pro své děti, které souhlasí s účastí v této studii. Zjistíme obě pohlaví a všechny pákistánské rasy a etnika.

Design: Subjekty budou prověřeny a schváleny naším spolupracujícím přidruženým vyšetřovatelem v Pákistánu. Po souhlasu budou subjekty podrobeny anamnéze a fyzickému, audiologickému posouzení a testování, vestibulárnímu posouzení a testování a testům analýzy krve a moči spolu se vzorkem krve nebo vzorkem bukálního výtěru, který bude použit pro extrakci genomové DNA. U probandů se v době zjišťování zpočátku předpokládá, že mají formu nesyndromické hluchoty. Další testy mohou být provedeny v závislosti na anamnéze nebo fyzickém stavu jednotlivce nebo poté, co je identifikován gen hluchoty. Údaje z funkčních studií na zvířecích modelech mohou spolu se ztrátou sluchu také poukazovat na další průvodní klinické příznaky. Tyto dodatečné testy mohou zahrnovat: fotografie nebo videokazety těla a obličeje subjektu; vyšetření zraku a zraku pro osoby s podezřelými nebo známými zrakovými problémy souvisejícími s jejich genetickou mutací ztráty sluchu a EKG a/nebo echokardiogramy pro osoby s podezřením nebo známými srdečními problémy souvisejícími s jejich mutacemi genetické ztráty sluchu. U jedinců s genetickými nefritickými problémy nebo neplodností mohou být požadovány analýzy moči a krve. Například, když se u neslyšící ženy v rodině následně zjistí, že má Perraultův syndrom, recesivní poruchu charakterizovanou ztrátou sluchu (obvykle počátečním projevem) a ovariální dysgenezí/primární amenoreou, byla by poté provedena další vyšetření pro definitivní diagnózu Perraultův syndrom. Takové hodnocení by zahrnovalo ultrazvukové vyšetření pánve a měření sérového estrogenu a gonadotropinů. Podobně se v některých z těchto rodin mohou sluchově postižení muži ptát na jejich plodnost, protože možnost mužské neplodnosti v rodinách segregujících Perraultův syndrom zůstává otevřenou otázkou. Pro genetické analýzy bude genomová DNA extrahovaná ze vzorku krve nebo bukálního výtěru od postižených a nepostižených členů rodin segregujících dědičnou ztrátu sluchu geneticky vyšetřena pomocí polymorfních markerů (STR nebo SNP) na spojení se známými lokusy hluchoty. Sluchový fenotyp dětí (>2 roky), dospívajících a dospělých jedinců bude určen na základě výkonu z audiologických vyšetření. Genomová DNA z rodin, kde bylo zjištěno, že hluchota není spojena se známými lokusy hluchoty, bude poté použita v genomových širokých screeningech s přibližně 950 000 SNP markery distribuovanými v celém lidském genomu k identifikaci nových lokusů hluchoty. Alternativně budou vzorky DNA od postižených a nepostižených jedinců podstoupit sekvenování celého exomu (WES) nebo sekvenování celého genomu (WGS) se zaměřením na potenciálně patogenní varianty lokalizované pouze v chromozomálních oblastech markerů geneticky spojených s hluchotou. Následně budou pozičně identifikovány nové geny hluchoty a studovány jejich funkce.

Výsledky: Budou identifikovány nové lokusy hluchoty a geny spojené se ztrátou sluchu a poskytnou nový pohled na mechanismy potřebné pro přenos zvuku u lidí. Údaje z této studie budou pravděpodobně základem komerčně dostupných testů pro včasnou diagnostiku a včasné genetické poradenství pro rizikové páry a také pro vývoj strategií pro zachování sluchu a prevenci ztráty sluchu....