Analisi genetiche della sordità non sindromica e sindromica in Pakistan

Obiettivo: Uno degli obiettivi di questo studio è quello di mappare geneticamente e identificare i geni mutati per la perdita dell'udito ereditaria umana. Un secondo obiettivo è studiare la funzione di questi geni nel sistema uditivo utilizzando modelli murini. L'ipoacusia ereditaria umana è il risultato di uno sviluppo anormale dell'orecchio, di una funzione anormale dell'orecchio o di entrambi. Sebbene i geni per numerosi loci della sordità siano stati mappati e identificati, ci sono ancora molte famiglie che segregano la sordità come tratto monogenico, ma un allele mutante non può essere attribuito a uno dei geni della sordità attualmente riportati. Al fine di mappare e identificare nuovi geni mutati associati alla perdita dell'udito negli esseri umani, continueremo ad accertare famiglie numerose che segregano la sordità sindromica e non sindromica come tratto monogenico.

Popolazione in studio: questo studio accerterà soggetti provenienti da famiglie pakistane consanguinee che segregano la perdita dell'udito costituita da forme di sordità sia non sindromiche che sindromiche di eziologia genetica. Poiché la maggior parte dei matrimoni pakistani sono tra cugini di primo grado, questo tende a riunire le stesse mutazioni recessive per la perdita dell'udito con più individui affetti all'interno di singole linee familiari, il che è un vantaggio per questo studio genetico. Qualche anno fa abbiamo smesso di accertare le famiglie in India. Continuiamo ad accertare membri della famiglia pakistana affetti e non affetti dall'età di 2 anni in su. Gli adulti forniscono il consenso informato sia per se stessi che per i propri figli che accettano di partecipare a questo studio. Accerteremo entrambi i sessi e tutte le razze ed etnie pakistane.

Design: I soggetti saranno selezionati e acconsentiti dal nostro ricercatore associato collaboratore in Pakistan. Dopo il consenso, i soggetti saranno sottoposti ad anamnesi e valutazione e test fisici, audiologici, valutazione e test vestibolari e test di analisi del sangue e delle urine, insieme a un campione di sangue o tampone buccale che verrà utilizzato per l'estrazione del DNA genomico. Inizialmente si presume che i probandi al momento dell'accertamento abbiano una forma di sordità non sindromica. Ulteriori test possono essere eseguiti a seconda della storia o del fisico dell'individuo o dopo che il gene della sordità è stato identificato. I dati provenienti da studi funzionali su modelli animali possono anche indicare altre caratteristiche cliniche concomitanti con la perdita dell'udito. Questi test aggiuntivi possono includere: fotografie o videocassette del corpo e del viso di un soggetto; esami oculistici e della vista per coloro con problemi di vista sospetti o noti correlati alle loro mutazioni genetiche di perdita dell'udito, ed ECG e/o ecocardiogrammi per coloro con problemi cardiaci sospetti o noti correlati alle loro mutazioni genetiche di perdita dell'udito. Le analisi delle urine e del sangue possono essere richieste per quegli individui con problemi genetici di nefrite o infertilità. Ad esempio, quando successivamente si scopre che una persona sorda in una famiglia ha la sindrome di Perrault, un disturbo recessivo caratterizzato da perdita dell'udito (di solito la manifestazione iniziale) e disgenesia ovarica/amenorrea primaria, sarebbero quindi condotte ulteriori valutazioni per una diagnosi definitiva di Sindrome di Perrault. Tale valutazione includerebbe un'ecografia pelvica e misurazioni di estrogeni sierici e gonadotropine. Allo stesso modo, in alcune di queste famiglie, ai maschi con problemi di udito può essere chiesto della loro fertilità poiché la possibilità di infertilità maschile nelle famiglie che segregano la sindrome di Perrault rimane una questione aperta. Per le analisi genetiche, il DNA genomico estratto da un campione di sangue o da un tampone buccale di membri affetti e non affetti di famiglie che segregano l'ipoacusia ereditaria sarà sottoposto a screening genetico con marcatori polimorfici (STR o SNP) per il collegamento ai loci di sordità noti. Il fenotipo uditivo di bambini (>2 anni), adolescenti e soggetti adulti sarà assegnato sulla base delle prestazioni degli esami audiologici. Il DNA genomico proveniente da famiglie in cui la sordità risulta non essere collegata ai loci di sordità noti verrà quindi utilizzato in genome wide screen con circa 950.000 marcatori SNP distribuiti nell'intero genoma umano per identificare nuovi loci di sordità. In alternativa, i campioni di DNA di individui affetti e non affetti saranno sottoposti a sequenziamento dell'intero esoma (WES) o sequenziamento dell'intero genoma (WGS) con particolare attenzione alle varianti potenzialmente patogene situate solo nelle regioni cromosomiche dei marcatori geneticamente collegati alla sordità. Successivamente, verranno individuati posizionalmente nuovi geni della sordità e studiate le loro funzioni.

Misure dei risultati: saranno identificati nuovi loci e geni della sordità associati alla perdita dell'udito e forniranno nuove informazioni sui meccanismi necessari per la trasduzione del suono negli esseri umani. È probabile che i dati di questo studio costituiscano la base dei test disponibili in commercio per la diagnosi precoce e la consulenza genetica tempestiva per le coppie a rischio, nonché lo sviluppo di strategie per preservare l'udito e prevenire la perdita dell'udito....