Análises genéticas de surdez não sindrômica e sindrômica no Paquistão

Objetivo: Um dos objetivos deste estudo é mapear geneticamente e identificar genes mutantes para perda auditiva hereditária humana. Um segundo objetivo é estudar a função desses genes no sistema auditivo usando modelos de camundongos. A deficiência auditiva hereditária humana é o resultado do desenvolvimento anormal do ouvido, função anormal do ouvido ou ambos. Embora os genes para numerosos loci de surdez tenham sido mapeados e identificados, ainda existem muitas famílias que segregam a surdez como uma característica monogênica, mas um alelo mutante não pode ser atribuído a um dos genes de surdez atualmente relatados. A fim de mapear e identificar novos genes mutantes associados à perda auditiva em humanos, continuaremos a verificar grandes famílias segregando surdez sindrômica e não sindrômica como um traço monogênico.

População do estudo: Este estudo avaliará indivíduos de famílias paquistanesas consanguíneas segregando perda auditiva consistindo em formas não sindrômicas e sindrômicas de surdez de etiologia genética. Como a maioria dos casamentos paquistaneses é entre primos de primeiro grau, isso tende a reunir as mesmas mutações recessivas para perda auditiva com múltiplos indivíduos afetados dentro de linhas familiares únicas, o que é uma vantagem para este estudo genético. Há alguns anos, paramos de averiguar famílias na Índia. Continuamos a verificar membros da família paquistaneses afetados e não afetados a partir dos 2 anos de idade. Os adultos fornecem consentimento informado para si mesmos e para seus filhos que concordam em participar deste estudo. Verificaremos ambos os sexos e todas as raças e etnias paquistanesas.

Projeto: Os indivíduos serão selecionados e consentidos por nosso investigador associado colaborador no Paquistão. Após o consentimento, os sujeitos passarão por uma história e avaliação física e audiológica e testes, avaliação e testes vestibulares e exames de sangue e urina, juntamente com uma amostra de sangue ou amostra de swab bucal que será usada para extração de DNA genômico. Presume-se inicialmente que os probandos no momento da averiguação tenham uma forma de surdez não sindrômica. Testes adicionais podem ser realizados dependendo do histórico ou físico do indivíduo ou após a identificação do gene da surdez. Dados de estudos funcionais em modelos animais também podem apontar para outras características clínicas concomitantes com perda auditiva. Esses testes adicionais podem incluir: fotografias ou vídeos do corpo e rosto de uma pessoa; exames oftalmológicos e de visão para pessoas com problemas de visão suspeitos ou conhecidos relacionados às mutações genéticas de perda auditiva e EKGs e/ou ecocardiogramas para pessoas com problemas cardíacos suspeitos ou conhecidos relacionados às mutações genéticas de perda auditiva. Análises de urina e sangue podem ser solicitadas para indivíduos com problemas nefríticos genéticos ou infertilidade. Por exemplo, quando uma mulher surda em uma família é posteriormente descoberta como portadora da síndrome de Perrault, um distúrbio recessivo caracterizado por perda auditiva (geralmente a manifestação inicial) e disgenesia ovariana/amenorreia primária, avaliações adicionais seriam realizadas para um diagnóstico definitivo de Síndrome de Perrault. Essa avaliação incluiria uma ultrassonografia pélvica e medições de estrogênio e gonadotrofinas séricas. Da mesma forma, em algumas dessas famílias, homens com deficiência auditiva podem ser questionados sobre sua fertilidade, uma vez que a possibilidade de infertilidade masculina em famílias que segregam a síndrome de Perrault permanece uma questão em aberto. Para análises genéticas, o DNA genômico extraído de uma amostra de sangue ou um swab bucal de membros afetados e não afetados de famílias que segregam perda auditiva hereditária serão geneticamente selecionados com marcadores polimórficos (STRs ou SNPs) para ligação aos loci de surdez conhecidos. O fenótipo auditivo de crianças (>2 anos), adolescentes e adultos será atribuído com base no desempenho dos exames audiológicos. O DNA genômico de famílias onde a surdez não está ligada aos loci de surdez conhecidos será então usado em telas amplas do genoma com aproximadamente 950.000 marcadores SNP distribuídos por todo o genoma humano para identificar novos loci de surdez. Alternativamente, amostras de DNA de indivíduos afetados e não afetados serão submetidas a sequenciamento de exoma total (WES) ou sequenciamento de genoma completo (WGS) com foco em variantes potencialmente patogênicas localizadas apenas em regiões cromossômicas de marcadores geneticamente ligados à surdez. Posteriormente, novos genes de surdez serão identificados posicionalmente e suas funções estudadas.

Medidas de resultado: Novos loci de surdez e genes associados à perda auditiva serão identificados e fornecerão uma nova visão sobre os mecanismos necessários para a transdução do som em humanos. Os dados deste estudo provavelmente serão a base de testes comercialmente disponíveis para diagnóstico precoce e aconselhamento genético oportuno para casais em risco, bem como o desenvolvimento de estratégias para preservar a audição e prevenir a perda auditiva....