Ei-syndromisen ja syndromisen kuurouden geneettiset analyysit Pakistanissa

Tavoite: Yksi tämän tutkimuksen tavoitteista on geneettisesti kartoittaa ja tunnistaa mutatoituneita geenejä ihmisen perinnölliselle kuulonalenemalle. Toinen tavoite on tutkia näiden geenien toimintaa kuulojärjestelmässä käyttämällä hiirimalleja. Ihmisen perinnöllinen kuulovaurio johtuu epänormaalista korvan kehityksestä, epänormaalista korvan toiminnasta tai molemmista. Vaikka useiden kuurouslokusten geenit on kartoitettu ja tunnistettu, on edelleen monia perheitä, jotka erottelevat kuurouden monogeenisenä ominaisuutena, mutta mutanttialleelia ei voida liittää yhteen tällä hetkellä raportoiduista kuurousgeeneistä. Ihmisten kuulon heikkenemiseen liittyvien uusien mutatoituneiden geenien kartoittamiseksi ja tunnistamiseksi jatkamme suurten perheiden selvittämistä, jotka erottavat syndromisen ja ei-syndromisen kuurouden monogeenisenä ominaisuutena.

Tutkimuspopulaatio: Tässä tutkimuksessa selvitetään pakistanilaisten sukulaisperheiden koehenkilöt, jotka erottelevat kuulon heikkenemistä, joka koostuu sekä geneettisen etiologian ei-syndromista että syndromista kuurouden muodoista. Koska suurin osa pakistanilaisista avioliitoista on serkkujen välisiä, tämä pyrkii tuomaan yhteen samat resessiiviset mutaatiot kuulon heikkenemiseen useiden sairastuneiden yksilöiden kanssa yhden sukulinjan sisällä, mikä on etu tässä geneettisessä tutkimuksessa. Muutama vuosi sitten lopetimme perheiden selvittämisen Intiassa. Jatkamme 2-vuotiaiden ja sitä vanhempien pakistanilaisten perheenjäsenten selvittämistä. Aikuiset antavat tietoisen suostumuksen sekä itselleen että lapsilleen, jotka suostuvat osallistumaan tähän tutkimukseen. Selvitämme molemmat sukupuolet ja kaikki pakistanilaiset rodut ja etniset ryhmät.

Suunnittelu: Pakistanissa yhteistyössä toimiva apulaistutkijamme seuloa ja hyväksyy koehenkilöt. Suostumuksen saatuaan koehenkilöille tehdään historiallinen ja fyysinen, audiologinen arviointi ja testaus, vestibulaarinen arviointi ja testaus sekä veri- ja virtsan analyysitestit sekä verinäyte tai bukkaalista vanupuikkonäyte, jota käytetään genomisen DNA:n erottamiseen. Varmistushetkellä probandeilla oletetaan alun perin olevan ei-syndrominen kuurous. Lisätestejä voidaan tehdä riippuen henkilön historiasta tai fyysisestä taustasta tai sen jälkeen, kun kuurousgeeni on tunnistettu. Eläinmalleilla tehdyistä toiminnallisista tutkimuksista saadut tiedot voivat viitata myös muihin samanaikaisiin kliinisiin piirteisiin sekä kuulon heikkenemiseen. Nämä lisätestit voivat sisältää: valokuvat tai videonauhat kohteen kehosta ja kasvoista; silmä- ja näkötutkimukset niille, joilla epäillään tai tunnetaan näköongelmia, jotka liittyvät heidän geneettiseen kuulonalenemaansa tapahtuvaan mutaatioon, sekä EKG:t ja/tai EKG:t ja/tai EKG:t ja/tai EKG-tutkimukset niille, joilla epäillään tai tunnetaan sydänongelmia, jotka liittyvät heidän geneettisiin kuulonmenetysmutaatioihinsa. Virtsa- ja verianalyysit voidaan pyytää henkilöiltä, ​​joilla on geneettisiä munuaisongelmia tai hedelmättömyyttä. Esimerkiksi kun perheessä olevalla kuurolla naishenkilöllä myöhemmin todetaan Perraultin oireyhtymä, resessiivinen häiriö, jolle on tunnusomaista kuulon heikkeneminen (yleensä ensimmäinen ilmentymä) ja munasarjojen dysgeneesi/primaarinen kuukautiset, tämän jälkeen tehdään lisäarvioinnit lopullisen diagnoosin saamiseksi. Perraultin oireyhtymä. Tällainen arviointi sisältää lantion ultraäänitutkimuksen ja seerumin estrogeenin ja gonadotropiinien mittaukset. Vastaavasti joissakin näistä perheistä kuulovammaisia ​​miehiä voidaan kysyä heidän hedelmällisyydestään, koska miesten hedelmättömyyden mahdollisuus Perraultin oireyhtymää erottavissa perheissä on edelleen avoin kysymys. Geneettisiä analyyseja varten genominen DNA, joka on eristetty verinäytteestä tai poskipuikkonäytteestä sairailta ja sairastumattomilta perheenjäseniltä, ​​jotka erottelevat perinnöllistä kuulonalenemaa, seulotaan geneettisesti polymorfisilla markkereilla (STR:t tai SNP:t) sen kytkennän varalta tunnettuihin kuurouslokuksiin. Lasten (>2-vuotiaiden), nuorten ja aikuisten kuulofenotyyppi määritetään audiologisten tutkimusten suoritusten perusteella. Perheiden genomista DNA:ta, joissa kuurouden havaitaan olevan liittämätön tunnettuihin kuurouslokuksiin, käytetään sitten genomin laajakuvanäytöissä, joissa on noin 950 000 SNP-markkeria jakautuneena koko ihmisen genomiin uusien kuurouden lokusten tunnistamiseksi. Vaihtoehtoisesti sairastuneiden ja sairastumattomien yksilöiden DNA-näytteille suoritetaan koko eksomin sekvensointi (WES) tai koko genomisekvenssi (WGS) keskittyen mahdollisesti patogeenisiin variantteihin, jotka sijaitsevat vain kuurouteen geneettisesti liittyvien markkerien kromosomaalisilla alueilla. Myöhemmin uudet kuurousgeenit tunnistetaan ja niiden toimintoja tutkitaan.

Tulostoimenpiteet: Uusia kuurouden lokuksia ja geenejä, jotka liittyvät kuulon heikkenemiseen, tunnistetaan, ja ne antavat uutta tietoa ihmisen äänen välittämiseen tarvittavista mekanismeista. Tämän tutkimuksen tiedot ovat todennäköisesti perustana kaupallisesti saatavilla oleville testeille varhaista diagnoosia ja oikea-aikaista geneettistä neuvontaa varten riskipareille sekä strategioiden kehittämistä kuulon säilyttämiseksi ja kuulon heikkenemisen ehkäisemiseksi.