Zánět kosterního svalstva, oxidační stres a oprava DNA u věkem podmíněné sarkopenie

Pro tento projekt budeme pokračovat v získávání mechanického náhledu na ztrátu svalové hmoty související s věkem a maximalizovat užitečnost tkáně, kterou jsme dříve shromáždili (Claude D. Pepper Older Americans Independence Center (OAIC); apoptóza kosterních svalů a fyzický výkon; oxidativní RNA /Poškození a opravy DNA ve starém lidském svalu (Vývojová studie), IRB # 429-2005) a odebereme svalovou tkáň od dalších mladých subjektů. Tento projekt bude konkrétně testovat, zda jsou zánětlivé dráhy a mechanismy opravy DNA změněny a/nebo zapojeny do rozvoje sarkopenie a souvisejícího poklesu fyzických funkcí pozorovaných u starších osob.

Cíl 1. Dále určíme asociaci hmoty a funkce kosterního svalstva s intramuskulárními mediátory zánětu. Důraz bude kladen na zánětlivé proteiny (např. TNF, TNFR1, pIkBα, pIKKb, CCL2, ZIP14, ZnT2) a geny (např. IL-6, TNFa, IL11β, IL-8, CCL2, CCR2, NFkB p50, NFkB ZIP14) a kovy (např. měď, zinek a železo). Předpokládáme, že většina těchto markerů bude upregulována ve svalech starších jedinců ve srovnání s mladými.

Cíl 2. Poprvé určíme vliv poškození DNA související s věkem na vzor a dynamiku translace mRNA v lidské svalové tkáni pomocí analýzy celého genomu pomocí „profilování ribozomů“. Nedávno vyvinuté techniky hlubokého sekvenování RNA-seq a „profilování ribozomů“ budou implementovány na lidský sval. To nám umožní prozkoumat v genomickém měřítku a při rozlišení jednoho nukleotidu účinek poškození DNA souvisejícího s věkem na transkripční věrnost a translační kinetiku. Důležité je, že poprvé budou tyto změny fenotypu porovnány s mapováním genomu poškození DNA, což je hlavní faktor, který řídí stárnutí savců. Předpokládáme, že starší sval má větší modifikaci translačních vzorů ve srovnání s mladým svalem.

Vzorky svalové tkáně, které zůstanou po dokončení tohoto výzkumu, budou uloženy a v budoucnu použity k prozkoumání nových cest výzkumu souvisejícího se stárnutím.