Kolorektální neoplazie a mikrobiota: Je levice rovná se pravá?

1. Mnoho studií, včetně naší, prokázalo, že kolorektální karcinom (CRC) souvisí se změnami v mikrobiomu tlustého střeva.

   1. Některé bakteriální kmeny jsou častěji přítomny v CRC
   2. Bakteriální diverzita je u CRC snížena
   3. U CRC je identifikován současný výskyt bakteriální fyly a exkluze
   4. Kromě bakteriomu byly nalezeny viromy spojené s CRC
   5. Tyto změny ve vzoru mohou být ve skutečnosti použity pro účely diagnózy a prognózy.

2. Ve většině studií však existují omezení a otázky zůstaly nezodpovězeny

   1. Většina studií používala vzorek stolice a údaje o tkáni (nádor a přilehlé normální tkáně) nemusí být k dispozici
   2. Většina studií bere adenom a CRC jako jeden stav, bez rozlišení nálezů podle lokalizace nádoru
   3. Většina studií má samostatné bakterie, viry a houby. O jejich vzájemném působení chybí data
   4. Většina studií identifikovala oba mikrobiomy, aniž by je korelovala s genomem hostitele

3. Víme, že ne všechny CRC jsou stejné. Je známo, že rakovina konečníku a tlustého střeva nejsou totéž. Navíc proximální (pravý) CRC a distální (levý) CRC nemusí být stejné.

   1. Studie ukázaly, že ve srovnání s L-CRC jsou pacienti s R-CRC starší, více žen (Iaocopetta B et al. Int J Cancer 2002)
   2. Studie také ukázaly, že genomové složení L-CRC a R-CRC se liší. U R-CRC je pravděpodobnější, že mají rodinný rakovinový syndrom (HNPCC), většinou diploidní, méně často mají ztrátovou heterozygotnost, méně mutací TP53 a více MSI a CIMP a genová exprese je odlišná (Glebov et al. Cancer Epi, Biomarker and Prevention 2003)
   3. Odpověď na terapii může být také odlišná u L-CRC ve srovnání s R-CRC
   4. Nedávné studie ukazují, že klinicko-patologické a molekulární rysy časného nástupu (<50 let) CRC se liší podle lokalizace nádoru. (Peres J a kol. Am J Cancer Res 2015). U R-CRC v této skupině je častější zárodečná mutace (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 a EPCAM). Adenomy bývají větší, plošší a pravděpodobněji mají dysplazii vysokého stupně a histologii klků
   5. Nedávné studie také ukázaly, že klinicko-patologické a molekulární rysy CRC s pozdním nástupem (70-80 let) se liší podle lokalizace nádoru (Brandariz et al. Oncotarget 2018). Existuje více sporadických MSI, více BRAF mutací a adenom/CRC bude pravděpodobně mucinózní.
4. Studií srovnávajících mikrobiom L-CRC vs R-CRC nebylo mnoho. Některé dřívější údaje ukazují, že mikrobiom v levém a pravém tlustém střevě jsou odlišné.

Cílem této studie je prozkoumat mikrobiom (včetně bakteriomu, viromu a fungomu) adenomu/CRC porovnáním levé (distální flexury ke slezině) a pravé strany (proximální flexe sleziny) tlustého střeva.