Kolorektaalinen neoplasia ja mikrobiota: Onko vasen yhtä oikea?

1. Monet tutkimukset, mukaan lukien omamme, ovat osoittaneet, että paksusuolensyöpä (CRC) liittyy muutoksiin paksusuolen mikrobiomissa

   1. Tietyt bakteeribakteerit esiintyvät useammin CRC:ssä
   2. Bakteerien monimuotoisuus on vähentynyt CRC:ssä
   3. CRC:ssä tunnistetaan bakteerifylan ja poissulkemisen samanaikainen esiintyminen
   4. Bakteriomin lisäksi CRC:hen on havaittu liittyvän viromeja
   5. Näitä muutoksia kuviossa voidaan itse asiassa käyttää diagnoosi- ja ennustetarkoituksiin.

2. Useimmissa tutkimuksissa on kuitenkin rajoituksia, ja kysymykset jäivät vastaamatta

   1. Useimmissa tutkimuksissa käytettiin ulostenäytteitä, eikä tietoja kudoksesta (kasvain ja viereiset normaalit kudokset) ehkä ole saatavilla
   2. Useimmat tutkimukset pitävät adenoomaa ja CRC:tä yhtenä sairautena erottelematta löydöksiä kasvaimen sijainnin mukaan
   3. Useimmissa tutkimuksissa on erilliset bakteerit, virukset ja sienet. Niiden vuorovaikutuksesta ei ole tietoa
   4. Useimmat tutkimukset ovat tunnistaneet jommankumman mikrobiomin korreloimatta niitä isännän genomiin

3. Tiedämme, että kaikki CRC:t eivät ole samanlaisia. On tiedetty, että peräsuolen ja paksusuolen syöpä eivät ole sama asia. Lisäksi proksimaalinen (oikea) CRC ja distaalinen (vasen) CRC eivät välttämättä ole samat.

   1. Tutkimukset ovat osoittaneet verrattuna L-CRC:hen, että R-CRC:tä sairastavat potilaat ovat vanhempia, enemmän naisia ​​(Iaocopetta B et al. Int J Cancer 2002)
   2. Tutkimukset ovat myös osoittaneet, että L-CRC:n ja R-CRC:n genominen koostumus on erilainen. R-CRC:llä on todennäköisemmin perhesyöpäoireyhtymä (HNPCC), enimmäkseen diploidinen, harvemmin heterotsygoottinen, vähemmän TP53-mutaatioita ja enemmän MSI:tä ja CIMP:tä, ja geenin ilmentyminen on erilaista (Glebov et al. Cancer Epi, Biomarker and Prevention 2003)
   3. Hoitovaste voi myös olla erilainen L-CRC:ssä verrattuna R-CRC:hen
   4. Viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että varhain alkaneen (<50 vuotta) CRC:n kliinis-patologiset ja molekyyliset ominaisuudet vaihtelevat kasvaimen sijainnin mukaan. (Peres J et ai. Am J Cancer Res 2015). Tämän ryhmän R-CRC:ssä ituradan mutaatiot ovat yleisempiä (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 ja EPCAM). Adenoomit ovat yleensä suurempia, litteämpiä ja niillä on todennäköisemmin korkealaatuista dysplasiaa ja villous histologiaa
   5. Viimeaikaiset tutkimukset ovat myös osoittaneet, että myöhään alkavan CRC:n (70-80 vuotta) kliinis-patologinen ja molekulaarinen piirre vaihtelee kasvaimen sijainnin mukaan (Brandariz et al. Oncotarget 2018). On enemmän satunnaista MSI:tä, enemmän BRAF-mutaatioita ja adenooma/CRC on todennäköisesti limamainen.
4. L-CRC:n ja R-CRC:n mikrobiomia vertailevia tutkimuksia ei ole tehty paljon. On olemassa joitain varhaisia ​​tietoja, jotka osoittavat, että vasemman ja oikean paksusuolen mikrobiomi ovat erilaisia.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on tutkia adenooman/CRC:n mikrobiomia (mukaan lukien bakteriomi, viromi ja sieni) vertaamalla paksusuolen vasenta (distaalista pernan taipumaan) ja oikeaa puolta (proksimaalinen pernan taipumaan).