Колоректальная неоплазия и микробиота: равно ли лево право?

1. Многие исследования, в том числе наши собственные, показали, что колоректальный рак (КРР) связан с изменениями в микробиоме толстой кишки.

   1. Определенные типы бактерий чаще представлены при КРР.
   2. Бактериальное разнообразие снижено при CRC
   3. Одновременное появление бактериальных типов и исключения выявлено в CRC
   4. Помимо бактериома, были обнаружены виромы, связанные с CRC.
   5. Эти изменения в паттерне могут фактически использоваться для диагностики и прогнозирования.

2. Однако в большинстве исследований есть ограничения, и вопросы остались без ответа.

   1. В большинстве исследований использовались образцы стула, и данные о ткани (опухоли и прилегающих нормальных тканях) могут быть недоступны.
   2. В большинстве исследований аденома и колоректальный рак рассматриваются как одно состояние без дифференциации результатов в зависимости от локализации опухоли.
   3. В большинстве исследований есть отдельные бактерии, вирусы и грибы. Отсутствуют данные об их взаимодействии.
   4. Большинство исследований идентифицировали любой микробиом без корреляции их с геномом хозяина.

3. Мы знаем, что не все CRC одинаковы. Известно, что рак прямой кишки и рак толстой кишки не одно и то же. Более того, проксимальный (правый) КРР и дистальный (левый) КРР могут не совпадать.

   1. Исследования показали, что по сравнению с L-CRC, пациенты с R-CRC старше, чаще женского пола (Iaocopetta B et al. Международный Рак J 2002)
   2. Исследования также показали, что геномный состав L-CRC и R-CRC различен. R-CRC чаще имеют синдром семейного рака (HNPCC), в основном диплоидный, реже имеют потерю гетерозиготности, меньше мутаций TP53 и больше MSI и CIMP, а экспрессия генов различна (Glebov et al. Cancer Epi, Biomarker and Prevention 2003)
   3. Ответ на терапию также может отличаться при L-CRC по сравнению с R-CRC.
   4. Недавние исследования показывают, что клинико-патологические и молекулярные особенности КРР с ранним началом (<50 лет) различаются в зависимости от локализации опухоли. (Перес Дж. и др. Am J Cancer Res 2015). В R-CRC в этой группе чаще встречаются герминальные мутации (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 и EPCAM). Аденомы, как правило, больше, плоские и с большей вероятностью имеют дисплазию высокой степени и ворсинчатую гистологию.
   5. Недавние исследования также показали, что клинико-патологические и молекулярные особенности КРР с поздним началом (70-80 лет) варьируют в зависимости от локализации опухоли (Brandariz et al. Онкотаргет 2018). Есть более спорадические MSI, больше мутаций BRAF, и аденома / CRC, вероятно, будут муцинозными.
4. Исследований, сравнивающих микробиом L-CRC и R-CRC, было немного. Есть некоторые ранние данные, показывающие, что микробиом в левой и правой части толстой кишки различается.

Целью данного исследования является изучение микробиома (включая бактериом, виром и грибок) аденомы/КРР путем сравнения левой (дистальной к селезеночному изгибу) и правой стороны (проксимальной к селезеночному изгибу) толстой кишки.