Kolorektal neoplasi og mikrobiota: Er venstre lige højre?

1. Mange undersøgelser, inklusive vores egen, har vist, at kolorektal cancer (CRC) er relateret til ændringer i tyktarmens mikrobiom

   1. Visse bakterielle phyla er hyppigere præsenteret i CRC
   2. Bakteriel diversitet er reduceret i CRC
   3. Samtidig forekomst af bakteriel phyla og udelukkelse er identificeret i CRC
   4. Udover bakteriom er viromer blevet fundet forbundet med CRC
   5. Disse ændringer i mønsteret kan faktisk bruges til diagnosticering og prognoseformål.

2. Der er dog begrænsninger i de fleste undersøgelser, og spørgsmålene forblev ubesvarede

   1. De fleste undersøgelser brugte afføringsprøver og data fra væv (tumor og tilstødende normalt væv) er muligvis ikke tilgængelige
   2. De fleste undersøgelser tager adenom og CRC som én tilstand uden at differentiere resultaterne i henhold til tumorplacering
   3. De fleste undersøgelser har separate bakterier, virus og svampe. Der mangler data om deres interaktion
   4. De fleste undersøgelser har identificeret begge mikrobiom uden at korrelere dem med værtens genom

3. Vi ved, at ikke alle CRC er ens. Det har været kendt, at endetarms- og tyktarmskræft ikke er det samme. Desuden er proksimal (højre) CRC og distal (venstre) CRC muligvis ikke den samme.

   1. Undersøgelser har vist sammenlignet med L-CRC, at patienter med R-CRC er ældre, mere kvindelige (Iaocopetta B et al. Int J Cancer 2002)
   2. Undersøgelser har også vist, at den genomiske sammensætning af L-CRC og R-CRC er forskellig. R-CRC er mere tilbøjelige til at have familiekræftsyndrom (HNPCC), for det meste diploid, mindre hyppigt med tab af heterozygositet, færre TP53-mutationer og flere MSI og CIMP, og genekspressionen er anderledes (Glebov et al. Cancer Epi, Biomarker and Prevention 2003)
   3. Responsen på terapi kan også være anderledes i L-CRC sammenlignet med R-CRC
   4. Nylige undersøgelser viser, at de klinisk-patologiske og molekylære træk ved tidligt opstået (<50 år) CRC varierer afhængigt af tumorens placering. (Peres J et al. Am J Cancer Res 2015). I R-CRC i denne gruppe er kimlinjemutation mere almindelig (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 og EPCAM). Adenomer har tendens til at være større, fladere og mere tilbøjelige til at have højgradig dysplasi og villøs histologi
   5. Nylige undersøgelser har også vist, at det klinik-patologiske og molekylære træk ved det sene CRC (70-80 år) varierer med tumorens placering (Brandariz et al. Oncotarget 2018). Der er mere sporadisk MSI, mere BRAF-mutation og adenom/CRC er sandsynligvis mucinøst.
4. Undersøgelser, der sammenligner mikrobiomet af L-CRC vs. R-CRC, har ikke været mange. Der er nogle tidlige data, der viser, at mikrobiomet i venstre vs højre kolon er anderledes.

Formålet med denne undersøgelse er at undersøge mikrobiomet (inklusive bakteriom, virom og svamp) af adenom/CRC ved at sammenligne venstre (distal til miltbøjning) og højre side (proksimal til miltbøjning) af tyktarmen.