Nowotwory jelita grubego i mikrobiota: czy lewa strona jest równa prawej?

1. Wiele badań, w tym nasze własne, wykazało, że rak jelita grubego (CRC) jest związany ze zmianami mikrobiomu okrężnicy

   1. Niektóre rodzaje bakterii są częściej prezentowane w CRC
   2. Różnorodność bakterii jest zmniejszona w CRC
   3. Współwystępowanie gromad bakteryjnych i wykluczenie są identyfikowane w CRC
   4. Oprócz bakteriomu stwierdzono, że wiromy są związane z CRC
   5. Te zmiany we wzorcu mogą być w rzeczywistości wykorzystane do celów diagnostycznych i prognostycznych.

2. W większości badań istnieją jednak ograniczenia, a pytania pozostały bez odpowiedzi

   1. W większości badań wykorzystano próbkę kału, a dane dotyczące tkanki (guza i sąsiadujących zdrowych tkanek) mogą nie być dostępne
   2. Większość badań traktuje gruczolaka i CRC jako jeden stan, bez różnicowania wyników w zależności od lokalizacji guza
   3. Większość badań dotyczy oddzielnych bakterii, wirusów i grzybów. Brakuje danych na temat ich interakcji
   4. Większość badań zidentyfikowała mikrobiom bez korelacji ich z genomem gospodarza

3. Wiemy, że nie wszystkie CRC są takie same. Wiadomo, że rak odbytnicy i okrężnicy to nie to samo. Ponadto proksymalny (prawy) CRC i dystalny (lewy) CRC mogą nie być takie same.

   1. Badania wykazały, że w porównaniu z L-CRC pacjenci z R-CRC są starsi, częściej płci żeńskiej (Iaocopetta B i in. Int J Rak 2002)
   2. Badania wykazały również, że skład genomowy L-CRC i R-CRC jest inny. R-CRC częściej mają rodzinny zespół raka (HNPCC), głównie diploidalny, rzadziej mają heterozygotyczność utraty, mniej mutacji TP53 i więcej MSI i CIMP, a ekspresja genów jest inna (Glebov i in. Rak Epi, Biomarker i Profilaktyka 2003)
   3. Odpowiedź na terapię może być również inna w przypadku L-CRC w porównaniu z R-CRC
   4. Ostatnie badania pokazują, że kliniczno-patologiczne i molekularne cechy CRC o wczesnym początku (<50 lat) różnią się w zależności od lokalizacji guza. (Peres J i in. Am J Cancer Res 2015). W R-CRC w tej grupie częściej występują mutacje germinalne (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 i EPCAM). Gruczolaki są zwykle większe, bardziej płaskie i częściej mają dysplazję wysokiego stopnia i histologię kosmków
   5. Ostatnie badania wykazały również, że cecha kliniczno-patologiczna i molekularna CRC o późnym początku (70-80 lat) różni się w zależności od lokalizacji guza (Brandariz i wsp. Oncotarget 2018). Jest więcej sporadycznych MSI, więcej mutacji BRAF, a gruczolak/CRC prawdopodobnie jest śluzowy.
4. Niewiele było badań porównujących mikrobiom L-CRC z R-CRC. Istnieją pewne wczesne dane pokazujące, że mikrobiom w lewej i prawej okrężnicy jest inny.

Celem tego badania jest zbadanie mikrobiomu (w tym bakteriomu, wiromu i grzyba) gruczolaka / CRC, porównując lewą (dystalną do zgięcia śledziony) vs prawą stronę (bliższą do zgięcia śledziony) okrężnicy.