Spektroskopie a umělá inteligence k narušení status quo při screeningu rakoviny děložního čípku

Po získání informovaného souhlasu budou od všech přihlášených účastníků odebrány vzorky děložního čípku a moči. Biopsie děložního čípku u skupiny s onemocněním budou prováděny podle uvážení poskytovatelů podle rutinních protokolů kolposkopie. Vzorky z děložního čípku budou odebírány ošetřujícími gynekology a vzorky moči budou odebírány účastnicemi. Alikvoty moči a cervikálních vzorků budou testovány na HPV DNA testem cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics), který slouží jako zlatý standard v Newfoundland Public Health Laboratory, St. John's, Newfoundland. Cobas test však specificky identifikuje pouze dva (typy 16 a 18) ze 14 vysoce rizikových genotypů HPV. Proto bude druhá sada alikvotů testována v laboratoři Seegene v Kitchener, Ontario, aby se získal kompletní genotypový profil všech 14 vysoce rizikových genotypů a také kvantitativní výsledky HPV pomocí testu Anyplex HPV DNA (Seegene Inc), testu nové generace HPV. . Vzorky moči budou také nezávisle testovány pomocí infračervené (IR) spektroskopie a signály analyzovány laboratoří prof. Rehmana, Ústav inženýrství, Lancaster University, Lancaster Spojené království (UK) za účelem detekce HPV. Výsledky spektroskopie budou porovnány s výsledky HPV testů s genotypy, aby se určila shoda mezi typy vzorků a mezi testovacími technologiemi, se zvláštním ohledem na testování moči. Biopsií potvrzený CIN2+ bude sloužit jako klinický cíl ke stanovení senzitivity a specificity spektroskopického testování moči ve srovnání s testováním HPV v moči; cervikální HPV výsledky budou sloužit jako referenční metoda. Jsme partnerem společnosti NSV-Tech, biotechnologické společnosti se sídlem v USA a Indii, která má zkušenosti s umělou inteligencí a screeningem rakoviny pomocí technologie založené na tabletech. Spektroskopické signály budou sdíleny s NSV-Tech za účelem vývoje umělých neuronových sítí (ANN). Výstupy spektroskopie spojené se základní pravdou (biopsií potvrzené abnormální cervikální buňky (CIN2)+ histologie) budou použity k vývoji ANN ke zlepšení diagnostické přesnosti tohoto klinicky relevantního koncového bodu a odstranění subjektivity. Studie se opírá o schopnost spektroskopie detekovat HPV. Výzkumný tým je přesvědčen, že to bude možné. Jak bylo uvedeno, členové výzkumného týmu přezkoumávají referenční vzorky moči, které byly dříve analyzovány pomocí standardních metod detekce HPV, aby potvrdili, že spektroskopie je životaschopnou možností. Při odběru a analýze kontrolních vzorků se používají standardní metody. Sběr dat bude probíhat na akademické kolposkopické klinice s odpovídajícím objemem pacientů a prokázanými výsledky při získávání pacientů pro takové studie. Analýza spektroskopie ve Spojeném království spektroskopie probíhá v laboratořích, které mají značné zkušenosti s hodnocením biologických vzorků. Mezinárodní spolupráce projektu je významná a spojuje přední světové špičky v prevenci rakoviny děložního čípku, kteří mají zkušenosti s novými technologiemi a screeningovými studiemi.