Spektroskopi og kunstig intelligens for å forstyrre status quo i livmorhalskreftscreening

Etter å ha innhentet informert samtykke, vil livmorhals- og urinprøver bli innhentet fra alle påmeldte deltakere. Livmorhalsbiopsier i sykdomsgruppen vil bli utført etter leverandørens skjønn i henhold til rutinemessige kolposkopiprotokoller. Livmorhalsprøver vil bli tatt av de behandlende gynekologene og urinprøver vil bli tatt av deltakerne. Alikvoter av urin- og livmorhalsprøver vil bli testet for HPV-DNA med cobas 4800 HPV-test (Roche Diagnostics) som fungerer som gullstandarden ved Newfoundland Public Health Laboratory, St. John's, Newfoundland. Cobas-testen identifiserer imidlertid kun to (type 16 og 18) av 14 høyrisiko HPV-genotyper spesifikt. Derfor vil et andre sett med alikvoter bli testet ved Seegene-laboratoriet i Kitchener, Ontario for å oppnå fullstendig genotypeprofil av alle 14 høyrisiko-genotyper samt kvantitative HPV-resultater ved bruk av Anyplex HPV DNA-test (Seegene Inc), en neste generasjons HPV-test . Urinprøver vil også bli testet uavhengig av infrarød (IR) spektroskopi og signaler analysert av Prof. Rehmans laboratorium, Department of Engineering, Lancaster University, Lancaster Storbritannia (UK) for å oppdage HPV. Spektroskopiresultater vil bli sammenlignet med HPV-testresultater med genotyper for å bestemme samsvar mellom prøvetyper og mellom testteknologiene, med en spesiell referanse til urintesting. Biopsi bekreftet CIN2+ vil tjene som det kliniske endepunktet for å bestemme sensitiviteten og spesifisiteten til urinspektroskopitesting sammenlignet med urin HPV-testing; cervikale HPV-resultater vil tjene som referansemetode. Vi samarbeider med NSV-Tech, et bioteknologiselskap basert i USA og India som har erfaring med kunstig intelligens og kreftscreening ved bruk av nettbrettbasert teknologi. Spektroskopisignaler vil bli delt med NSV-Tech for å utvikle kunstige nevrale nettverk (ANN). Spektroskopi-utgangene knyttet til grunnsannheten (biopsi bekreftet unormale livmorhalsceller (CIN2)+ histologi) vil bli brukt til å utvikle ANN for å forbedre diagnostisk nøyaktighet av dette klinisk relevante endepunktet og fjerne subjektivitet. Studien er avhengig av evnen til spektroskopi for å oppdage HPV. Forskerteamet er overbevist om at dette vil være gjennomførbart. Som nevnt gjennomgår medlemmer av forskerteamet referanseurinprøver som tidligere er analysert ved bruk av standard HPV-deteksjonsmetoder for å bekrefte at spektroskopi er en levedyktig alternativmetode. Innsamling og analyse av kontrollprøver bruker standardmetoder. Datainnsamlingen vil foregå i en akademisk kolposkopiklinikk med tilstrekkelig pasientvolum og dokumentert erfaring med å rekruttere pasienter til slike studier. Analysen av spektroskopi i Storbritannia av spektroskopi, er i laboratorier som har betydelig erfaring med å vurdere biologiske prøver. Prosjektets internasjonale samarbeid er betydelig og samler ledere i verdensklasse innen forebygging av livmorhalskreft som alle har erfaring med ny teknologi og screeningforsøk.