Espectroscopia e inteligencia artificial para alterar el statu quo en la detección del cáncer de cuello uterino

Después de obtener el consentimiento informado, se obtendrán muestras de cuello uterino y de orina de todos los participantes inscritos. Las biopsias de cuello uterino en el grupo de enfermedades se realizarán a discreción de los proveedores según los protocolos de colposcopia de rutina. Los ginecólogos asistentes recolectarán muestras cervicales y las participantes recolectarán muestras de orina. Se analizarán alícuotas de muestras de orina y cuello uterino para detectar el ADN del VPH con la prueba cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics) que servirá como estándar de oro en el Laboratorio de Salud Pública de Newfoundland, St. John's, Newfoundland. La prueba de cobas, sin embargo, identifica específicamente solo dos (tipos 16 y 18) de 14 genotipos de VPH de alto riesgo. Por lo tanto, se analizará un segundo conjunto de alícuotas en el laboratorio de Seegene en Kitchener, Ontario, para obtener un perfil genotípico completo de los 14 genotipos de alto riesgo, así como resultados cuantitativos de VPH mediante la prueba de ADN de VPH Anyplex (Seegene Inc), una prueba de VPH de próxima generación. . Las muestras de orina también se analizarán de forma independiente mediante espectroscopia infrarroja (IR) y las señales serán analizadas por el laboratorio del Prof. Rehman, Departamento de Ingeniería, Universidad de Lancaster, Lancaster, Reino Unido (RU) para detectar el VPH. Los resultados de la espectroscopia se compararán con los resultados de la prueba de VPH con genotipos para determinar la concordancia entre los tipos de muestras y entre las tecnologías de prueba, con especial referencia a las pruebas de orina. La CIN2+ confirmada por biopsia servirá como criterio de valoración clínico para determinar la sensibilidad y la especificidad de las pruebas de espectroscopia de orina en comparación con las pruebas de VPH en orina; Los resultados del VPH cervical servirán como método de referencia. Nos asociamos con NSV-Tech, una empresa de biotecnología con sede en los EE. UU. y la India que tiene experiencia en inteligencia artificial y detección del cáncer mediante tecnología basada en tabletas. Las señales de espectroscopia se compartirán con NSV-Tech para desarrollar redes neuronales artificiales (ANN). Los resultados de la espectroscopia vinculados a la verdad del terreno (células cervicales anormales confirmadas por biopsia (CIN2) + histología) se utilizarán para desarrollar ANN para mejorar la precisión diagnóstica de este criterio de valoración clínicamente relevante y eliminar la subjetividad. El estudio se basa en la capacidad de la espectroscopia para detectar el VPH. El equipo de investigación confía en que esto será factible. Como se señaló, los miembros del equipo de investigación están revisando muestras de orina de referencia analizadas previamente con métodos estándar de detección de VPH para confirmar que la espectroscopia es un método de opción viable. La recolección y el análisis de muestras de control utilizan métodos estándar. La recopilación de datos se llevará a cabo en una clínica académica de colposcopia con un volumen adecuado de pacientes y un historial probado en el reclutamiento de pacientes para tales ensayos. El análisis de la espectroscopia en el Reino Unido de la espectroscopia, es en laboratorios que tienen una experiencia significativa en la evaluación de muestras biológicas. La colaboración internacional del proyecto es significativa y reúne a líderes mundiales en la prevención del cáncer de cuello uterino que tienen experiencia con nuevas tecnologías y pruebas de detección.