Spectroscopie et intelligence artificielle pour perturber le statu quo dans le dépistage du cancer du col de l'utérus

Après avoir obtenu le consentement éclairé, des échantillons cervicaux et d'urine seront obtenus de tous les participants inscrits. Les biopsies cervicales dans le groupe de la maladie seront effectuées à la discrétion des prestataires selon les protocoles de colposcopie de routine. Des échantillons cervicaux seront prélevés par les gynécologues présents et des échantillons d'urine seront prélevés par les participants. Des aliquotes d'urine et d'échantillons cervicaux seront testés pour l'ADN du VPH avec le test cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics) servant d'étalon-or au Laboratoire de santé publique de Terre-Neuve, St. John's, Terre-Neuve. Le test cobas, cependant, n'identifie spécifiquement que deux (types 16 et 18) des 14 génotypes de VPH à haut risque. Par conséquent, un deuxième ensemble d'aliquotes sera testé au laboratoire Seegene à Kitchener, en Ontario, afin d'obtenir le profil génotypique complet des 14 génotypes à haut risque ainsi que les résultats quantitatifs du VPH à l'aide du test ADN Anyplex HPV (Seegene Inc), un test VPH de nouvelle génération. . Des échantillons d'urine seront également testés indépendamment par spectroscopie infrarouge (IR) et les signaux seront analysés par le laboratoire du professeur Rehman, Département d'ingénierie, Université de Lancaster, Lancaster Royaume-Uni (Royaume-Uni) pour détecter le VPH. Les résultats de la spectroscopie seront comparés aux résultats des tests HPV avec des génotypes pour déterminer la concordance entre les types d'échantillons et entre les technologies de test, avec une référence particulière aux tests d'urine. La CIN2+ confirmée par biopsie servira de critère d'évaluation clinique pour déterminer la sensibilité et la spécificité des tests de spectroscopie urinaire par rapport aux tests urinaires HPV ; les résultats HPV cervicaux serviront de méthode de référence. Nous travaillons en partenariat avec NSV-Tech, une société de biotechnologie basée aux États-Unis et en Inde, qui a de l'expérience dans l'intelligence artificielle et le dépistage du cancer à l'aide de la technologie basée sur les tablettes. Les signaux de spectroscopie seront partagés avec NSV-Tech pour développer des réseaux de neurones artificiels (ANN). Les résultats de la spectroscopie liés à la vérité terrain (cellules cervicales anormales confirmées par biopsie (CIN2) + histologie) seront utilisés pour développer l'ANN afin d'améliorer la précision diagnostique de ce critère cliniquement pertinent et d'éliminer la subjectivité. L'étude repose sur la capacité de la spectroscopie à détecter le VPH. L'équipe de recherche est convaincue que cela sera faisable. Comme indiqué, les membres de l'équipe de recherche examinent des échantillons d'urine de référence précédemment analysés à l'aide de méthodes de détection standard du VPH pour confirmer que la spectroscopie est une méthode optionnelle viable. La collecte et l'analyse des échantillons de contrôle utilisent des méthodes standard. La collecte de données aura lieu dans une clinique de colposcopie universitaire avec un volume de patients adéquat et une expérience éprouvée dans le recrutement de patients pour de tels essais. L'analyse de la spectroscopie au Royaume-Uni de la spectroscopie se fait dans des laboratoires qui ont une expérience significative dans l'évaluation d'échantillons biologiques. La collaboration internationale du projet est importante et rassemble des leaders de classe mondiale dans la prévention du cancer du col de l'utérus qui ont tous une expérience des nouvelles technologies et des essais de dépistage.