Spettroscopia e intelligenza artificiale per interrompere lo status quo nello screening del cancro cervicale

Dopo aver ottenuto il consenso informato, verranno ottenuti campioni cervicali e di urina da tutti i partecipanti iscritti. Le biopsie cervicali nel gruppo della malattia saranno eseguite a discrezione dei fornitori secondo i protocolli di colposcopia di routine. I campioni cervicali saranno raccolti dai ginecologi presenti e i campioni di urina saranno raccolti dai partecipanti. Aliquote di campioni di urina e cervicale saranno testate per il DNA dell'HPV con il test cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics) che funge da gold standard presso il Newfoundland Public Health Laboratory, St. John's, Newfoundland. Il test cobas, tuttavia, identifica solo due (tipi 16 e 18) dei 14 genotipi di HPV ad alto rischio nello specifico. Pertanto, una seconda serie di aliquote sarà testata presso il laboratorio Seegene di Kitchener, Ontario, per ottenere il profilo genotipico completo di tutti i 14 genotipi ad alto rischio, nonché i risultati quantitativi dell'HPV utilizzando il test Anyplex HPV DNA (Seegene Inc), un test HPV di nuova generazione . I campioni di urina saranno anche testati in modo indipendente mediante spettroscopia a infrarossi (IR) e segnali analizzati dal laboratorio del Prof. Rehman, Dipartimento di Ingegneria, Università di Lancaster, Lancaster Regno Unito (Regno Unito) per rilevare l'HPV. I risultati della spettroscopia saranno confrontati con i risultati del test HPV con i genotipi per determinare la concordanza tra i tipi di campioni e tra le tecnologie di test, con particolare riferimento al test delle urine. La biopsia ha confermato che CIN2+ servirà come endpoint clinico per determinare la sensibilità e la specificità del test spettroscopico delle urine rispetto al test HPV delle urine; i risultati dell'HPV cervicale serviranno come metodo di riferimento. Stiamo collaborando con NSV-Tech, una società di biotecnologie con sede negli Stati Uniti e in India che ha esperienza con l'intelligenza artificiale e lo screening del cancro utilizzando la tecnologia basata su tablet. I segnali spettroscopici saranno condivisi con NSV-Tech per sviluppare reti neurali artificiali (ANN). I risultati della spettroscopia collegati alla verità di base (cellule cervicali anormali confermate dalla biopsia (CIN2) + istologia) saranno utilizzati per sviluppare ANN per migliorare l'accuratezza diagnostica di questo endpoint clinicamente rilevante e rimuovere la soggettività. Lo studio si basa sulla capacità della spettroscopia di rilevare l'HPV. Il team di ricerca è fiducioso che ciò sarà fattibile. Come notato, i membri del team di ricerca stanno rivedendo campioni di urina di riferimento precedentemente analizzati utilizzando metodi standard di rilevamento dell'HPV per confermare che la spettroscopia è un metodo di opzione praticabile. La raccolta e l'analisi dei campioni di controllo utilizzano metodi standard. La raccolta dei dati avverrà in una clinica di colposcopia accademica con un adeguato volume di pazienti e una comprovata esperienza nel reclutamento di pazienti per tali studi. L'analisi della spettroscopia nel Regno Unito della spettroscopia, è in laboratori che hanno una significativa esperienza nella valutazione di campioni biologici. La collaborazione internazionale del progetto è significativa e riunisce leader di livello mondiale nella prevenzione del cancro cervicale che hanno tutti esperienza con nuove tecnologie e test di screening.