Espectroscopia e inteligência artificial para interromper o status quo na triagem do câncer cervical

Após a obtenção do consentimento informado, amostras cervicais e de urina serão obtidas de todos os participantes inscritos. As biópsias cervicais no grupo de doenças serão realizadas a critério dos provedores de acordo com os protocolos de colposcopia de rotina. Amostras cervicais serão coletadas pelos ginecologistas assistentes e amostras de urina serão coletadas pelos participantes. Alíquotas de urina e amostras cervicais serão testadas para DNA do HPV com o teste cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics) servindo como padrão-ouro no Newfoundland Public Health Laboratory, St. John's, Newfoundland. O teste cobas, no entanto, identifica apenas dois (tipos 16 e 18) dos 14 genótipos de HPV de alto risco especificamente. Portanto, um segundo conjunto de alíquotas será testado no laboratório Seegene em Kitchener, Ontário, para obter o perfil genótipo completo de todos os 14 genótipos de alto risco, bem como resultados quantitativos de HPV usando o teste Anyplex HPV DNA (Seegene Inc), um teste de HPV de próxima geração . Amostras de urina também serão testadas independentemente por espectroscopia de infravermelho (IR) e sinais analisados ​​pelo laboratório do Prof. Rehman, Departamento de Engenharia, Lancaster University, Lancaster Reino Unido (UK) para detectar o HPV. Os resultados da espectroscopia serão comparados com os resultados do teste de HPV com genótipos para determinar a concordância entre os tipos de amostra e entre as tecnologias de teste, com uma referência especial ao teste de urina. CIN2+ confirmado por biópsia servirá como ponto final clínico para determinar a sensibilidade e especificidade do teste de espectroscopia de urina em comparação com o teste de HPV na urina; os resultados do HPV cervical servirão como método de referência. Estamos fazendo parceria com a NSV-Tech, uma empresa de biotecnologia com sede nos EUA e na Índia, que tem experiência em inteligência artificial e triagem de câncer usando tecnologia baseada em tablet. Os sinais de espectroscopia serão compartilhados com a NSV-Tech para desenvolver redes neurais artificiais (ANN). As saídas de espectroscopia ligadas à verdade (biópsia confirmaram células cervicais anormais (CIN2) + histologia) serão usadas para desenvolver ANN para melhorar a precisão do diagnóstico deste ponto final clinicamente relevante e remover a subjetividade. O estudo baseia-se na capacidade da espectroscopia para detectar o HPV. A equipe de pesquisa está confiante de que isso será viável. Conforme observado, os membros da equipe de pesquisa estão revisando amostras de urina de referência previamente analisadas usando métodos padrão de detecção de HPV para confirmar que a espectroscopia é um método de opção viável. A coleta e análise da amostra de controle usa métodos padrão. A coleta de dados ocorrerá em uma clínica acadêmica de colposcopia com volume adequado de pacientes e um histórico comprovado no recrutamento de pacientes para tais ensaios. A análise da espectroscopia no Reino Unido da espectroscopia, está em laboratórios que têm experiência significativa na avaliação de amostras biológicas. A colaboração internacional do projeto é significativa e reúne líderes mundiais na prevenção do câncer do colo do útero, todos com experiência em novas tecnologias e testes de triagem.