Spektroskopia i sztuczna inteligencja do zakłócenia status quo w badaniach przesiewowych w kierunku raka szyjki macicy

Po uzyskaniu świadomej zgody od wszystkich zapisanych uczestników zostaną pobrane próbki szyjki macicy i moczu. Biopsje szyjki macicy w grupie chorobowej będą wykonywane według uznania świadczeniodawców zgodnie z rutynowymi protokołami kolposkopii. Próbki szyjki macicy będą pobierane przez prowadzących lekarzy ginekologów, a próbki moczu będą pobierane przez uczestniczki. Próbki moczu i szyjki macicy zostaną przebadane pod kątem DNA HPV za pomocą testu cobas 4800 HPV (Roche Diagnostics) służącego jako złoty standard w Laboratorium Zdrowia Publicznego Nowej Fundlandii w St. John's w Nowej Funlandii. Jednak test cobas identyfikuje konkretnie tylko dwa (typy 16 i 18) z 14 genotypów HPV wysokiego ryzyka. W związku z tym drugi zestaw porcji zostanie przetestowany w laboratorium Seegene w Kitchener w Ontario w celu uzyskania pełnego profilu genotypowego wszystkich 14 genotypów wysokiego ryzyka, a także ilościowych wyników HPV przy użyciu testu DNA Anyplex HPV (Seegene Inc), testu HPV nowej generacji . Próbki moczu będą również niezależnie badane za pomocą spektroskopii w podczerwieni (IR), a sygnały analizowane przez laboratorium prof. Rehmana na Wydziale Inżynierii Uniwersytetu Lancaster w Wielkiej Brytanii (Wielka Brytania) w celu wykrycia HPV. Wyniki spektroskopii zostaną porównane z wynikami testów HPV z genotypami w celu określenia zgodności między typami próbek oraz między technologiami testowania, ze szczególnym uwzględnieniem badania moczu. Biopsja potwierdzona CIN2+ posłuży jako kliniczny punkt końcowy do określenia czułości i swoistości badania spektroskopii moczu w porównaniu z badaniem moczu na HPV; wyniki HPV szyjki macicy będą służyć jako metoda referencyjna. Współpracujemy z NSV-Tech, firmą biotechnologiczną z siedzibą w USA i Indiach, która ma doświadczenie w zakresie sztucznej inteligencji i badań przesiewowych w kierunku raka przy użyciu technologii opartej na tabletach. Sygnały spektroskopowe zostaną udostępnione firmie NSV-Tech w celu opracowania sztucznych sieci neuronowych (ANN). Wyniki spektroskopii powiązane z podstawową prawdą (biopsja potwierdzonych nieprawidłowych komórek szyjki macicy (CIN2) + histologia) zostaną wykorzystane do opracowania ANN w celu poprawy dokładności diagnostycznej tego klinicznie istotnego punktu końcowego i usunięcia subiektywności. Badanie opiera się na zdolności spektroskopii do wykrywania HPV. Zespół badawczy jest przekonany, że będzie to wykonalne. Jak zauważono, członkowie zespołu badawczego dokonują przeglądu referencyjnych próbek moczu, które zostały wcześniej przeanalizowane przy użyciu standardowych metod wykrywania HPV, aby potwierdzić, że spektroskopia jest realną metodą opcjonalną. Pobieranie i analiza próbek kontrolnych odbywa się przy użyciu standardowych metod. Gromadzenie danych odbędzie się w akademickiej klinice kolposkopii z odpowiednią liczbą pacjentów i udokumentowanymi osiągnięciami w rekrutacji pacjentów do takich badań. Analiza spektroskopii w Wielkiej Brytanii spektroskopii odbywa się w laboratoriach, które mają duże doświadczenie w ocenie próbek biologicznych. Międzynarodowa współpraca w ramach projektu jest znacząca i łączy światowej klasy liderów w zapobieganiu rakowi szyjki macicy, którzy mają doświadczenie w zakresie nowatorskich technologii i badań przesiewowych.