Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Zkoumání genetických a environmentálních příčin autismu: multicentrická studie (ASD-Omics-TR)

24. října 2024 aktualizováno: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Multicentrický multiomický přístup pro zkoumání genetických a epigenetických mechanismů u poruchy autistického spektra

Cílem této observační studie je prozkoumat genetické a epigenetické mechanismy, které mohou přispívat k rozvoji poruchy autistického spektra (ASD) u jedinců různých věkových skupin. Cílem studie je prozkoumat, jak genetické varianty a faktory prostředí ovlivňují riziko ASD.

Hlavní otázky, na které chce odpovědět, jsou:

  • Které genetické varianty jsou nejsilněji spojeny s rozvojem ASD?
  • Jak ovlivňují tato genetická rizika environmentální faktory, jako je prenatální expozice?
  • Může kombinace genetických a epigenetických dat zlepšit včasnou detekci nebo intervenční strategie pro ASD?

Účastníci budou:

  • Poskytněte biologické vzorky pro genetickou a epigenetickou analýzu.
  • Vyplňte podrobné dotazníky týkající se expozice životního prostředí a rodinné anamnézy.
  • Zúčastněte se klinických hodnocení, abyste vyhodnotili závažnost symptomů ASD.

Výzkumníci budou porovnávat genetická a environmentální data mezi jednotlivci s ASD a těmi, kteří tuto poruchu nemají, aby pochopili, jak mohou tyto faktory přispívat k riziku ASD. Tato multicentrická studie bude probíhat na několika univerzitách a nemocnicích v Türkiye a zaměří se na potenciální souhru mezi dědičnými genetickými faktory a vlivy prostředí.

Přehled studie

Postavení

Zatím nenabíráme

Podmínky

Detailní popis

Úvod do projektu Projekt představuje inovativní, multicentrickou studii zaměřenou na zkoumání genetických, epigenetických a environmentálních podkladů poruchy autistického spektra (ASD). ASD je komplexní neurovývojový stav, který se obvykle projevuje v raném dětství a ovlivňuje jedince různými způsoby, zejména v sociální komunikaci a chování. Porucha se vyznačuje významnou variabilitou závažnosti symptomů a projevů mezi jednotlivci. Navzdory letům výzkumu zůstávají molekulární mechanismy, které řídí nástup a progresi ASD, nepolapitelné, což činí diagnostiku a léčbu náročnými.

Cílem tohoto výzkumu je zaplnit tuto mezeru pomocí multi-omického přístupu k lepšímu pochopení biologických, genetických a environmentálních faktorů přispívajících k ASD. Prostřednictvím integrace genomických, epigenomických a transkriptomických dat se projekt snaží odhalit molekulární podpisy a interakce, které by mohly vysvětlit variabilitu prezentace a závažnosti ASD. Kromě toho je cílem studie identifikovat potenciální biomarkery, které by mohly vést k dřívější diagnóze, lepší prognóze a personalizovanějším možnostem léčby.

Studie bude provedena napříč několika výzkumnými středisky se strukturovaným a dobře koordinovaným přístupem ke sběru dat, zpracování vzorků a analýze. Tento multidisciplinární projekt spojuje řadu odborných znalostí, včetně genetiky, bioinformatiky, klinické psychiatrie a datové vědy, a zajišťuje, že ke všem aspektům výzkumu se přistupuje s vědeckou přísností a přesností. Analýzou vzorků od jedinců s PAS projekt poskytne nové poznatky o genetických a epigenetických faktorech podílejících se na PAS a zároveň bude zkoumat potenciální vliv faktorů životního prostředí.

Struktura více oddělení a integrita projektu Projekt je organizován do několika specializovaných oddělení, z nichž každé má specifickou roli při udržování integrity studie a zajišťování toho, že všechny výzkumné činnosti jsou prováděny podle nejvyšších standardů. Tato struktura umožňuje bezproblémovou spolupráci mezi odděleními a zajišťuje, že všechna data jsou shromažďována, zpracovávána a analyzována s maximální přesností.

Celková koordinace a dohled Na nejvyšší úrovni je projekt řízen celkovým koordinátorem, který dohlíží na všechny aspekty výzkumu. Tento koordinátor zajišťuje, aby každé oddělení dodržovalo cíle a časovou osu projektu, podporuje komunikaci mezi týmy a usnadňuje integraci klinických, genetických a epigenetických dat. Koordinace zajišťuje, že jakékoli problémy, které se vyskytnou v průběhu studie, budou okamžitě řešeny a že projekt zůstane na cestě ke splnění svých cílů.

Role celkového koordinátora je zásadní pro zajištění integrace multi-omických dat z různých výzkumných center. Koordinátor také hraje klíčovou roli při interpretaci dat, úzce spolupracuje s týmy pro analýzu dat, aby zajistil, že zjištění budou soudržná a smysluplná. Pravidelné aktualizace jsou sdíleny napříč odděleními, aby byl zachován soulad s celkovými výzkumnými cíli projektu.

Klinický provoz: oddělení pro dospělé a děti Klinické provozy projektu jsou rozděleny do dvou hlavních sektorů: oddělení pro dospělé a pediatrie. Každý sektor je řízen specializovaným týmem, který dohlíží na klinická centra zodpovědná za sběr dat. Tato klinická centra se nacházejí v různých regionech, což umožňuje projektu shromažďovat širokou a různorodou škálu klinických dat od jedinců s diagnostikovanou ASD.

Každé klinické centrum se řídí standardizovanými protokoly pro sběr dat, které zajišťují, že všechna data pacientů jsou shromažďována jednotným a konzistentním způsobem. Proces sběru dat zahrnuje použití mezinárodně uznávaných diagnostických nástrojů, včetně Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) a Social Communication Questionnaire (SCQ). Tyto nástroje jsou nezbytné pro diagnostiku ASD a pro hodnocení závažnosti symptomů.

Součástí klinického provozu je také sběr sociodemografických dat, vývojové historie a informací o komorbidních stavech. Tato data jsou shromažďována prostřednictvím dotazníků a klinických rozhovorů vedených vyškolenými zdravotnickými profesionály. Sběr tohoto komplexního souboru dat je zásadní pro pochopení klinické heterogenity ASD a pro korelaci klinických příznaků s genetickými a environmentálními daty.

Genetická a omická divize Genetická a omická divize tvoří jádro projektu, poskytující molekulární data, která budou použita k odhalení genetických a epigenetických mechanismů pohánějících ASD. Divize dohlíží na odběr, zpracování a analýzu biologických vzorků, které zahrnují žilní krev a nosní výtěry získané od účastníků studie.

Odběr a zpracování vzorků Biologické vzorky odebrané od účastníků procházejí přísným a standardizovaným procesem extrakce nukleových kyselin. Tento proces, který řídí týmy pro extrakci a purifikaci nukleových kyselin, zahrnuje izolaci vysoce kvalitní DNA a RNA ze vzorků krve a nosních výtěrů. Tyto vzorky jsou nezbytné pro následné sekvenování a analýzy. Kvalita extrahované DNA a RNA je kritická, protože jakékoli nečistoty nebo degradace by mohly ovlivnit přesnost genetických a epigenetických analýz.

Po extrakci jsou vzorky DNA a RNA podrobeny několika kontrolám kvality. Na tyto kontroly dohlížejí týmy pro kontrolu kvality a skladování, které zajišťují, že nukleové kyseliny splňují požadované standardy pro sekvenování. Vzorky, které projdou kontrolami kvality, jsou skladovány za optimálních podmínek, přičemž je zachována jejich integrita, dokud nejsou připraveny k sekvenování.

Genomická analýza Genomická analýza vzorků DNA začíná sekvenováním celého genomu (WGS), což je komplexní technika, která umožňuje výzkumníkům prozkoumat celý genetický kód každého účastníka. WGS umožňuje identifikaci široké škály genetických variant, včetně jednonukleotidových polymorfismů (SNP), variací počtu kopií (CNV), inzercí a delecí (InDels) a strukturálních variant. Tyto varianty jsou hodnoceny, aby se určil jejich potenciální příspěvek k ASD.

Jednou z primárních analýz prováděných v rámci genomového dělení je celogenomová asociační studie (GWAS). GWAS se používá k identifikaci genetických variant, které jsou významně spojeny s ASD, porovnáním frekvence variant mezi jedinci s ASD a těmi bez poruchy. Tato analýza je zvláště užitečná pro identifikaci běžných genetických variant, které mohou přispívat k riziku ASD.

Kromě GWAS projekt také provádí kvantitativní analýzu lokusu vlastností (QTL). QTL analýza zkoumá, jak genetické varianty ovlivňují kvantitativní rysy související s ASD, jako je závažnost symptomů, kognitivní funkce nebo vývojové milníky. Tento typ analýzy pomáhá objasnit genetický základ pro fenotypovou variabilitu u ASD a identifikuje specifické varianty, které mohou přispívat k rozdílům v prezentaci symptomů.

Epigenetická analýza Epigenetická složka projektu se zaměřuje na to, jak environmentální faktory ovlivňují genovou expresi a přispívají k riziku ASD. Metylace DNA je jedním z klíčových epigenetických mechanismů studovaných v tomto projektu. Pomocí bisulfitového sekvenování celého genomu (WGBS) vědci analyzují vzorce metylace DNA v celém genomu. WGBS je považován za zlatý standard pro analýzu metylace DNA s vysokým rozlišením, která umožňuje identifikaci metylačních změn, které jsou spojeny s ASD.

Diferenciálně methylované oblasti (DMR) jsou genomové oblasti, kde se úrovně methylace liší mezi jednotlivci s ASD a nepostiženými kontrolami. Identifikací těchto DMR mohou vědci určit specifické genomové oblasti, kde mohou environmentální faktory ovlivňovat genovou expresi u jedinců s ASD.

Kromě toho je v této studii zkoumána alelově specifická methylace (ASM). Analýza ASM zkoumá, jak se liší methylační vzorce mezi dvěma kopiemi genu zděděného od každého rodiče. Tato analýza pomáhá výzkumníkům pochopit, jak genetické a epigenetické faktory ovlivňují genovou expresi a přispívají k riziku ASD.

Jako součást epigenetické analýzy bude provedena analýza m-QTL (methylation quantitative trait loci) za účelem prozkoumání vztahu mezi genetickými variantami a vzory metylace DNA v genomu. m-QTL jsou genomové lokusy, kde jsou variace v sekvenci DNA spojeny s rozdíly v úrovních methylace DNA. Identifikací těchto lokusů si projekt klade za cíl odhalit, jak genetická variace ovlivňuje epigenetickou regulaci a následně, jak mohou tyto interakce přispívat k riziku rozvoje ASD. Tato analýza poskytne cenné poznatky o souhře mezi genetickými a epigenetickými faktory a pomůže objasnit molekulární mechanismy, které jsou základem ASD. Kromě toho mohou m-QTL sloužit jako potenciální biomarkery pro pochopení environmentální modulace genetické náchylnosti u jedinců s ASD.

Epigenetická data jsou také integrována s genetickými daty za účelem provádění epigenomových asociačních studií (EWAS). EWAS zkoumá, jak vzory metylace DNA korelují s ASD, s cílem identifikovat methylační značky, které by mohly sloužit jako biomarkery pro poruchu. Tyto analýzy jsou nezbytné pro pochopení toho, jak může expozice životního prostředí, jako je prenatální stres, toxiny nebo zdraví matek, ovlivnit riziko ASD prostřednictvím epigenetických mechanismů.

Transkriptomická analýza Transkriptomická analýza se zaměřuje na pochopení toho, jak se liší genová exprese mezi jednotlivci s ASD a osobami bez poruchy. Sekvenování RNA (RNA-seq) se používá k měření hladin genové exprese ve vzorcích krve i nosních výtěrů. RNA-seq poskytuje komplexní pohled na transkriptom, který představuje kompletní sadu RNA transkriptů přítomných v buňce nebo tkáni v daném čase.

Data RNA-seq se používají k provedení analýzy diferenciální genové exprese (DGE), která identifikuje geny, které jsou buď upregulované, nebo downregulované u jedinců s ASD. Tato analýza pomáhá odhalit molekulární dráhy, které jsou u ASD narušeny, a zdůrazňuje potenciální biomarkery, které by mohly být použity pro včasnou diagnostiku nebo léčbu.

Kromě identifikace odlišně exprimovaných genů se transkriptomická data používají k provedení analýzy dráhy. Analýza dráhy zkoumá, jak změny v genové expresi ovlivňují biologické procesy a buněčné funkce. Tato analýza může identifikovat klíčové cesty, které mohou být u ASD narušeny, a poskytuje pohled na biologické mechanismy, které jsou základem této poruchy.

Porovnáním profilů genové exprese ze vzorků krve a nosních výtěrů mohou vědci identifikovat tkáňově specifické vzorce exprese. Toto srovnání poskytuje podrobnější pochopení molekulárních rozdílů mezi tkáněmi a může odhalit tkáňově specifické biomarkery pro ASD.

eQTL (Expression Quantitative Trait Loci) analýza

Kromě analýzy m-QTL umožní integrace analýzy eQTL (expression quantitative trait loci) projektu identifikovat genetické varianty, které ovlivňují úrovně genové exprese. eQTL jsou lokusy, kde genetické variace korelují se změnami v genové expresi. Pomocí analýzy eQTL může studie zkoumat, jak specifické genetické varianty ovlivňují transkripci genů souvisejících s ASD. Tento přístup pomáhá odhalit regulační dráhy a genové sítě, které přispívají k variabilitě symptomů ASD. Integrace analýzy eQTL s transkriptomickými daty (jako je RNA-Seq) poskytuje jemné pochopení toho, jak genetické rizikové faktory mění genovou expresi, což v konečném důsledku ovlivňuje fenotypovou manifestaci ASD.

Epitranskriptomická analýza

Kromě studia DNA a RNA prostřednictvím genomiky a transkriptomiky zkoumá epitranskriptomika post-transkripční modifikace RNA, jako je N6-methyladenosin (m6A). Tyto modifikace RNA mohou ovlivnit stabilitu mRNA, sestřih, transport a translaci, a tak ovlivnit produkci proteinů a buněčnou funkci. Zahrnutí epitranskriptomické analýzy jako součásti pracovního postupu RNA-Seq nabídne pohled na to, jak se liší modifikace RNA u pacientů s ASD, a poskytne další vrstvu genové regulace, která přispívá ke složitosti ASD. Toto zkoumání by mohlo odhalit nové epitranskriptomické biomarkery pro ASD, čímž by se prohloubilo zkoumání genové regulace na úrovni RNA.

Integrace dat a bioinformatika Integrace genomických, epigenomických a transkriptomických dat je klíčovou součástí projektu. Týmy bioinformatiky a analýzy dat jsou odpovědné za zpracování a analýzu obrovského množství dat generovaných divizemi omics. To zahrnuje použití pokročilých bioinformatických nástrojů a statistických modelů k integraci dat a odhalení smysluplných vzorců.

Integrovaný soubor dat je podroben mnohorozměrným regresním modelům, které zkoumají interakce mezi genetickými variantami, epigenetickými modifikacemi a úrovněmi genové exprese. Tyto modely se používají k identifikaci toho, jak tyto faktory společně přispívají k riziku ASD a závažnosti symptomů. Začleněním genetických a environmentálních dat mohou modely také prozkoumat interakce mezi geny a prostředím, které mohou hrát roli ve vývoji ASD.

Síťová analýza je dalším klíčovým nástrojem používaným týmem bioinformatiky. Tato technika vizualizuje interakce mezi geny, proteiny a regulačními prvky, což umožňuje výzkumníkům identifikovat klíčové geny a cesty, které se mohou podílet na ASD. Síťová analýza také pomáhá odhalit genové regulační sítě, které mohou být narušeny u jedinců s ASD, a poskytuje pohled na molekulární mechanismy, které tuto poruchu řídí.

Projekt také využívá k analýze dat algoritmy strojového učení (ML) a umělé inteligence (AI). Tyto prediktivní modely jsou navrženy tak, aby pomáhaly lékařům při rozhodování o léčbě na základě molekulárního profilu každého pacienta. Modely AI lze například použít k předpovědi závažnosti symptomů ASD na základě genetických, epigenetických a klinických údajů, což umožňuje cílenější intervence.

Hi-C a In-Silico analýza:

Zatímco tradiční Hi-C analýza často používá síťovací činidla k zachycení chromatinových interakcí s dlouhým dosahem, tento projekt zaujme odlišný přístup tím, že upustí od použití síťovacích činidel k propojení specifických fragmentů DNA. Místo toho budou data o interakci chromatinu odvozena a revidována in-silico po integraci dat. Výpočetní analýzou architektury 3D chromatinu se projekt zaměří na identifikaci prostorových chromatinových interakcí, které přispívají k regulaci genů spojených s ASD.

Tento postintegrační přístup umožňuje identifikaci regulačních prvků, jako jsou zesilovače a promotory, které interagují se vzdálenými genomickými oblastmi v kontextu ASD. Data generovaná z genomických, epigenomických a transkriptomických analýz budou integrována za účelem odhalení vzorců interakcí chromatinu, které ovlivňují genovou expresi, zejména ty spojené s patologií ASD. Tato strategie umožní flexibilnější a propracovanější pochopení organizace 3D genomu bez omezení vyplývajících z metod založených na crosslinkeru.

ChIP-Seq a In-Silico epigenetická analýza patogeneze:

Kromě mapování interakcí chromatinu budou data ChIP-Seq využita pro analýzu epigenetické patogeneze. Provedením in-silico analýzy výsledků ChIP-Seq projekt identifikuje modifikace histonů a vazebná místa transkripčního faktoru, která se podílejí na regulaci genové exprese u ASD. Tato technika pomůže objasnit roli specifických epigenetických značek, jako je acetylace a metylace histonů, při dysregulaci genů spojených s ASD.

Integrace dat ChIP-Seq s dalšími daty omics, včetně methylace DNA (WGBS) a expresních profilů RNA-Seq, poskytne komplexní pohled na regulační sítě řídící ASD. To umožní výzkumníkům určit specifické regulační mechanismy, jako je změněná aktivita transkripčních faktorů nebo změny v dostupnosti chromatinu, které mohou přispět k nástupu nebo závažnosti symptomů ASD. In-silico analýza výsledků ChIP-Seq tak poslouží jako účinný nástroj pro pochopení epigenetické krajiny spojené s patogenezí ASD.

Projekt může dále zlepšit svou analýzu výpočtem skóre polygenního rizika (PRS), které kvantifikuje kumulativní účinek mnoha genetických variant s malým účinkem na riziko rozvoje ASD. Agregací dat z tisíců genetických variant může PRS předpovědět celkovou genetickou predispozici jedince k ASD. Tato skóre pak mohou být korelována s klinickými a fenotypovými údaji, aby bylo možné lépe pochopit, jak se genetické riziko promítá do pozorovatelných symptomů. PRS lze také integrovat s environmentálními a epigenetickými daty za účelem prozkoumání interakcí mezi geny a prostředím, což nabízí komplexní model náchylnosti k ASD.

Kontrola kvality a dodržování předpisů Udržování integrity projektu je prvořadé, čehož je dosaženo prostřednictvím přísných opatření kontroly kvality a komplexního rámce dodržování předpisů. Projekt zahrnuje několik oddělení, která se věnují zajištění toho, aby všechny výzkumné aktivity byly v souladu s etickými směrnicemi a regulačními standardy.

Oddělení řízení rizik hraje klíčovou roli při identifikaci a zmírňování potenciálních rizik, která by mohla ohrozit integritu studie. Toto oddělení úzce spolupracuje s týmy interního auditu a dodržování etiky, aby bylo zajištěno, že všechny výzkumné aktivity budou v souladu s etickými standardy, jako je Helsinská deklarace a národní předpisy na ochranu osobních údajů.

Týmy kontroly kvality jsou odpovědné za sledování kvality biologických vzorků a za zajištění přesnosti a spolehlivosti všech údajů. Tyto týmy provádějí pravidelné audity a v případě potřeby zavádějí nápravná a preventivní opatření (CAPA) k řešení jakýchkoli problémů, které se vyskytnou v průběhu studie.

Oddělení dokumentace a archivace je odpovědné za správu všech projektových záznamů, včetně auditních zpráv, protokolů přenosu dat a záznamů o shodě. Toto oddělení zajišťuje, že veškerá dokumentace související s projektem je bezpečně uložena a snadno dostupná pro kontrolu, což usnadňuje transparentnost a odpovědnost.

Součástí projektu je také tým pro řízení zásobování a dodavatelského řetězce, který je zodpovědný za včasné obstarání všech potřebných materiálů, vybavení a činidel. Tento tým řídí logistiku přesunů materiálu a zajišťuje, aby všechny dodávky splňovaly požadované standardy kvality.

Etická hlediska a bezpečnost účastníků Bezpečnost a soukromí účastníků jsou při provádění studie prvořadé. Všechna data účastníků jsou anonymizována a bezpečně uložena, aby byla chráněna jejich důvěrnost. Projekt dodržuje národní i mezinárodní předpisy týkající se ochrany osobních údajů a zajišťuje, že práva účastníků jsou vždy respektována.

Před zařazením do studie je od všech účastníků získán informovaný souhlas. Účastníkům jsou poskytnuty podrobné informace o cílech, postupech a potenciálních rizicích studie. Jsou také informováni o svém právu kdykoli bez sankcí odstoupit ze studie.

Studie získala etické schválení od příslušných národních etických komisí, což zajišťuje, že všechny výzkumné aktivity jsou v souladu se zavedenými etickými pokyny. Pravidelné audity jsou prováděny, aby bylo zajištěno, že všechny postupy jsou správně dodržovány a že jakékoli etické problémy jsou okamžitě řešeny.

Integrace a vizualizace dat Po dokončení studie budou všechna data z genomických, epigenomických a transkriptomických analýz integrována a vizualizována pomocí nejmodernějších bioinformatických nástrojů. Integrovaný soubor dat poskytne komplexní pohled na molekulární mechanismy, které jsou základem ASD, a umožní výzkumníkům identifikovat klíčové biomarkery a potenciální terapeutické cíle.

Integrovaná data budou prezentována prostřednictvím různých vizualizačních technik, jako jsou teplotní mapy, síťové mapy a schémata cest. Tyto vizualizace pomohou výzkumníkům interpretovat data a vyvodit smysluplné závěry o biologických procesech zapojených do ASD.

Závěr Tento projekt je přelomovou studií v oblasti výzkumu ASD, využívající multi-omický přístup k odhalení genetických, epigenetických a environmentálních faktorů přispívajících k této poruše. Multidisciplinární struktura projektu se specializovanými týmy pro klinické operace, analýzu dat, kontrolu kvality a dodržování předpisů zajišťuje, že výzkum je veden s nejvyšší úrovní vědecké přísnosti.

Integrací genomických, epigenomických a transkriptomických dat si projekt klade za cíl poskytnout nový pohled na molekulární mechanismy, které jsou základem ASD, a identifikovat potenciální biomarkery pro diagnostiku a léčbu. Zjištění z této studie by mohla připravit cestu pro personalizované lékařské přístupy k ASD a zlepšit kvalitu života jedinců postižených touto poruchou.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

3000

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

Studijní místa

  • Krocan
      • Afyonkarahisar, Krocan
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Krocan
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Krocan
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
          • Telefonní číslo: 00905428917627
          • E-mail: ysmn.ts@gmail.com
        • Kontakt:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Krocan
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Krocan
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Krocan
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Krocan
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Krocan
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Krocan
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Krocan
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
      • Istanbul, Krocan
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Krocan
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Aynur Görmez, MD.
      • Istanbul, Krocan
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Krocan
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Gonca Özyurt, MD.
      • Konya, Krocan
        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Krocan
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
        • Kontakt:
          • Ali TORABI, MD.,Ph.D.
        • Kontakt:
          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
      • Trabzon, Krocan
        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
      • Şanlıurfa, Krocan
        • Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
    • Selçuklu
      • Konya, Selçuklu, Krocan, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Krocan, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Studijní populace se bude skládat z jedinců s diagnostikovanou poruchou autistického spektra (ASD) nebo vykazujících rysy podobné autismu, vybraných z klinických center specializovaných na neurovývojové poruchy. Populace bude také zahrnovat zdravou kontrolní skupinu, odpovídající věkem, pohlavím a sociodemografickými proměnnými, rekrutovanou z obecné komunity. Kohorta ASD bude zahrnovat účastníky na různých funkčních úrovních, od vysoce funkčního po nízkofunkční autismus, stejně jako osoby s vývojovými profily a komorbidními stavy. Kontroly budou bez psychiatrických či neurologických diagnóz a chronických stavů.

Popis

- Kritéria zahrnutí: Porucha autistického spektra (ASD) nebo rysy podobné autismu: Jedinci s diagnózou ASD na základě diagnostických kritérií DSM-5 nebo ti, kteří vykazují významné rysy autismu bez formální diagnózy.

Zdravá kontrolní skupina: Věkově, genderově a sociodemograficky odpovídající jedinci bez jakékoli psychiatrické nebo neurologické poruchy.

Jedinci s PAS s různou funkční úrovní: Účastníci s PAS s širokou škálou funkčních schopností, od vysoce funkčního po nízkofunkční autismus.

Komorbidní stavy: Začlenění dobrovolníků s vývojovým profilem a komorbidními stavy, jako je ADHD a poruchy učení.

Informovaný souhlas: Písemný informovaný souhlas od účastníků starších 18 let. U účastníků mladších 18 let souhlas rodičů nebo zákonných zástupců.

- Kritéria vyloučení: Těžké psychotické poruchy: Jedinci s diagnózou onemocnění, jako je schizofrenie nebo schizoafektivní porucha.

Známé genetické syndromy nebo chromozomální anomálie: Jedinci s genetickými stavy, jako je Downův syndrom nebo syndrom křehkého X.

Historie genetických nebo experimentálních terapií: Účastníci s předchozí genovou nebo buněčnou terapií, častými krevními transfuzemi nebo transplantacemi kostní dřeně.

Těžké komunikační nebo kognitivní poruchy: Účastníci s poruchami komunikace nebo kognitivními poruchami, které by bránily jejich schopnosti účastnit se sběru dat, nebo osoby s agresivními poruchami chování.

Nedodržení nebo lékařská omezení: Jednotlivci, kteří nejsou schopni dodržovat studijní postupy nebo zdravotní stav, který brání odběru biologického vzorku.

- Kontrolní skupina: Zdraví jedinci: Účastníci bez ASD nebo jakýchkoli psychiatrických či neurologických poruch.

Age and Gender Matching: Shoda se skupinou ASD z hlediska věku, pohlaví a sociodemografického stavu.

Bez anamnézy genetických nebo neurovývojových poruch: Jedinci bez genetických syndromů, chromozomálních anomálií nebo neurovývojových poruch.

Bez historie chronického onemocnění: Účastníci bez anamnézy chronických onemocnění, jako je rakovina, autoimunitní onemocnění nebo metabolické stavy.

Informovaný souhlas: Písemný informovaný souhlas od osob starších 18 let nebo od rodičů/zákonných zástupců pro účastníky mladší 18 let.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Případová skupina ASD
Představuje jedince s diagnózou poruchy autistického spektra (ASD), kteří podstoupí genetickou, epigenetickou a transkriptomickou analýzu.
Kontrolní skupina
Představuje nepostižené jedince a slouží jako srovnávací skupina pro genetické a molekulární analýzy.
Skupina biomarkerů HOT Cluster
Představuje účastníky vybrané po sekundárních výsledcích na základě analýzy HOT clusteru, kteří podstoupí ELISA za účelem studia potenciálních biomarkerů odvozených z analýzy RNA transkriptomové dráhy.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Dokončení náboru klinických dat
Časové okno: Dokončení se očekává do 24 měsíců od zahájení studie.
Primárním výsledkem bude nábor jedinců s diagnostikovanou poruchou autistického spektra (ASD) a nepostižených kontrol. Budou shromažďována komplexní klinická, sociodemografická a fenotypová data, včetně diagnostických hodnocení pomocí standardizovaných nástrojů (např. ADOS, SCQ).
Dokončení se očekává do 24 měsíců od zahájení studie.

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Shromažďování a doplňování nezpracovaných genetických dat (WGS a WGBS)
Časové okno: Dokončení se očekává do 30 měsíců od zahájení studie
sekundární výstup se zaměřuje na získávání nezpracovaných genetických dat ze sekvenování celého genomu (WGS) a bisulfitového sekvenování celého genomu (WGBS) ze vzorků krve a nosních výtěrů. Sekvenační data budou použita pro následné genetické a epigenetické analýzy k identifikaci variant, metylačních změn a jejich asociací s ASD.
Dokončení se očekává do 30 měsíců od zahájení studie
Integrace genetických dat
Časové okno: Dokončení se očekává do 60 měsíců od zahájení studie.
Tento výsledek měří integraci sekvenování celého genomu (WGS), bisulfitového sekvenování celého genomu (WGBS) a dat RNA-seq do kombinovaného souboru dat pro komplexní multi-omickou analýzu. Cílem je odhalit genetické a epigenetické interakce související s ASD.
Dokončení se očekává do 60 měsíců od zahájení studie.

Další výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Kompletní (konečné) měření výsledku: Asociace mezi klinickými a genetickými daty
Časové okno: Očekává se do 66 měsíců po dokončení všech fází sběru dat a analýzy.
Konečný výsledek posoudí korelaci mezi genetickými, epigenetickými a transkriptomickými daty s klinickými fenotypy. Tento výsledek si klade za cíl identifikovat významné souvislosti, které mohou vysvětlit genetické základy poruchy autistického spektra, přispívající k potenciálním biomarkerům nebo terapeutickým cílům.
Očekává se do 66 měsíců po dokončení všech fází sběru dat a analýzy.

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Spolupracovníci

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Vyšetřovatelé

  • Studijní židle: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Ředitel studie: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Ředitel studie: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Ředitel studie: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Ředitel studie: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Ředitel studie: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Odhadovaný)

27. prosince 2025

Primární dokončení (Odhadovaný)

27. prosince 2027

Dokončení studie (Odhadovaný)

27. května 2028

Termíny zápisu do studia

První předloženo

24. října 2024

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

24. října 2024

První zveřejněno (Aktuální)

29. října 2024

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

29. října 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

24. října 2024

Naposledy ověřeno

1. října 2024

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Jiný identifikátor: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Jiný identifikátor: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NEROZHODNÝ

Popis plánu IPD

V současné době není rozhodnutí o sdílení dat jednotlivých účastníků (IPD) dokončeno. Po dokončení studie bude rozhodnutí přezkoumáno a dokončeno v souladu s platnými regulačními a etickými pokyny. Konečné rozhodnutí bude podmíněno získáním povolení od turecké agentury pro léčiva a zdravotnické prostředky (TİTCK), etické komise a tureckého ministerstva zdravotnictví. Plán sdílení zajistí, že budou přísně dodržována všechna nařízení o ochraně údajů a soukromí a budou přijata vhodná opatření k ochraně důvěrnosti účastníků.

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

produkt vyrobený a vyvážený z USA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Předplatit