Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Исследование генетических и экологических причин аутизма: многоцентровое исследование (ASD-Omics-TR)

24 октября 2024 г. обновлено: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Многоцентровый мультиомикальный подход к исследованию генетических и эпигенетических механизмов при расстройствах аутистического спектра

Цель этого наблюдательного исследования — изучить генетические и эпигенетические механизмы, которые могут способствовать развитию расстройств аутистического спектра (РАС) у людей разных возрастных групп. Целью исследования является изучение того, как генетические варианты и факторы окружающей среды взаимодействуют, влияя на риск развития РАС.

Основные вопросы, на которые он призван ответить:

  • Какие генетические варианты наиболее тесно связаны с развитием РАС?
  • Как факторы окружающей среды, такие как пренатальное воздействие, влияют на эти генетические риски?
  • Может ли сочетание генетических и эпигенетических данных улучшить стратегии раннего выявления или вмешательства при РАС?

Участники:

  • Предоставьте биологические образцы для генетического и эпигенетического анализа.
  • Заполните подробные анкеты, касающиеся воздействия окружающей среды и семейного анамнеза.
  • Участвуйте в клинических обследованиях для оценки тяжести симптомов РАС.

Исследователи будут сравнивать генетические данные и данные окружающей среды между людьми с РАС и людьми без этого расстройства, чтобы понять, как эти факторы могут способствовать риску РАС. Это многоцентровое исследование будет проводиться в нескольких университетах и ​​больницах Турции, сосредоточив внимание на потенциальном взаимодействии между наследственными генетическими факторами и влиянием окружающей среды.

Обзор исследования

Статус

Еще не набирают

Условия

Подробное описание

Введение в проект Проект представляет собой инновационное многоцентровое исследование, направленное на изучение генетических, эпигенетических и экологических основ расстройства аутистического спектра (РАС). РАС — это сложное заболевание нервной системы, которое обычно проявляется в раннем детстве и по-разному влияет на людей, особенно на социальное общение и поведение. Расстройство характеризуется значительной вариабельностью тяжести симптомов и их проявлений у разных людей. Несмотря на годы исследований, молекулярные механизмы, вызывающие возникновение и прогрессирование РАС, остаются неуловимыми, что затрудняет диагностику и лечение.

Цель данного исследования – заполнить этот пробел, используя мультиомикальный подход, чтобы лучше понять биологические, генетические и экологические факторы, способствующие развитию РАС. Посредством интеграции геномных, эпигеномных и транскриптомных данных проект стремится раскрыть молекулярные сигнатуры и взаимодействия, которые могли бы объяснить изменчивость проявлений и тяжести РАС. Кроме того, исследование направлено на выявление потенциальных биомаркеров, которые могут привести к более ранней диагностике, улучшению прогноза и более персонализированным вариантам лечения.

Исследование будет проводиться в нескольких исследовательских центрах с использованием структурированного и хорошо скоординированного подхода к сбору данных, обработке и анализу образцов. Этот междисциплинарный проект объединяет широкий спектр знаний, включая генетику, биоинформатику, клиническую психиатрию и науку о данных, гарантируя, что ко всем аспектам исследований подходят с научной строгостью и точностью. Анализируя образцы людей с РАС, проект предоставит новое понимание генетических и эпигенетических факторов, участвующих в РАС, а также исследует потенциальное влияние факторов окружающей среды.

Многоведомственная структура и целостность проекта Проект состоит из нескольких специализированных отделов, каждый из которых играет определенную роль в поддержании целостности исследования и обеспечении того, чтобы вся исследовательская деятельность проводилась в соответствии с самыми высокими стандартами. Такая структура обеспечивает беспрепятственное сотрудничество между отделами и гарантирует сбор, обработку и анализ всех данных с максимальной точностью.

Общая координация и надзор На самом высоком уровне проектом управляет общий координатор, который контролирует все аспекты исследования. Этот координатор гарантирует, что каждое отделение придерживается целей и сроков проекта, способствуя общению между командами и способствуя интеграции клинических, генетических и эпигенетических данных. Координация гарантирует, что любые проблемы, возникающие в ходе исследования, будут оперативно решены и что проект будет идти по пути достижения своих целей.

Роль общего координатора имеет решающее значение для обеспечения интеграции данных мультиомики из различных исследовательских центров. Координатор также играет ключевую роль в интерпретации данных, тесно сотрудничая с группами анализа данных, чтобы обеспечить связность и значимость результатов. Регулярные обновления распространяются между отделами, чтобы поддерживать соответствие общим исследовательским целям проекта.

Клинические операции: взрослые и детские отделения Клинические операции проекта разделены на два основных сектора: взрослый и детский. Каждым сектором управляет специальная группа, которая курирует клинические центры, ответственные за сбор данных. Эти клинические центры расположены в разных регионах, что позволяет проекту собирать широкий и разнообразный спектр клинических данных от людей с диагнозом РАС.

Каждый клинический центр следует стандартизированным протоколам сбора данных, гарантируя, что все данные о пациентах собираются единообразным и последовательным образом. Процесс сбора данных включает использование международно признанных диагностических инструментов, в том числе Графика диагностического наблюдения за аутизмом (ADOS) и Анкеты социальных коммуникаций (SCQ). Эти инструменты необходимы для диагностики РАС и оценки тяжести симптомов.

Клинические операции также включают сбор социально-демографических данных, историй развития и информации о сопутствующих заболеваниях. Эти данные собираются с помощью анкет и клинических интервью, проводимых обученными медицинскими работниками. Сбор этого всеобъемлющего набора данных имеет решающее значение для понимания клинической гетерогенности РАС и корреляции клинических симптомов с генетическими данными и данными окружающей среды.

Отделы генетики и омики Подразделения генетики и омики составляют ядро ​​проекта, предоставляя молекулярные данные, которые будут использоваться для раскрытия генетических и эпигенетических механизмов, вызывающих РАС. Подразделение курирует сбор, обработку и анализ биологических образцов, в том числе венозной крови и мазков из носа, полученных от участников исследования.

Сбор и обработка образцов Биологические образцы, собранные у участников, проходят строгий и стандартизированный процесс экстракции нуклеиновых кислот. Этот процесс, которым управляют команды по выделению и очистке нуклеиновых кислот, включает в себя выделение высококачественной ДНК и РНК из образцов крови и мазков из носа. Эти образцы необходимы для последующего секвенирования и анализа. Качество извлеченной ДНК и РНК имеет решающее значение, поскольку любые примеси или деградация могут повлиять на точность генетического и эпигенетического анализа.

После извлечения образцы ДНК и РНК подвергаются множественным проверкам контроля качества. Эти проверки контролируются группами контроля качества и хранения, которые следят за тем, чтобы нуклеиновые кислоты соответствовали требуемым стандартам секвенирования. Образцы, прошедшие проверку контроля качества, хранятся в оптимальных условиях, сохраняя свою целостность до тех пор, пока они не будут готовы к секвенированию.

Геномный анализ Геномный анализ образцов ДНК начинается с полногеномного секвенирования (WGS), комплексного метода, который позволяет исследователям изучить весь генетический код каждого участника. WGS позволяет идентифицировать широкий спектр генетических вариантов, включая однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), вариации числа копий (CNV), инсерции и делеции (InDels) и структурные варианты. Эти варианты оцениваются, чтобы определить их потенциальный вклад в развитие РАС.

Одним из основных анализов, проводимых в рамках геномного отдела, является полногеномное исследование ассоциаций (GWAS). GWAS используется для выявления генетических вариантов, которые в значительной степени связаны с РАС, путем сравнения частоты вариантов между людьми с РАС и людьми без этого расстройства. Этот анализ особенно полезен для выявления общих генетических вариантов, которые могут способствовать риску РАС.

Помимо GWAS, проект также проводит анализ локуса количественных признаков (QTL). Анализ QTL изучает, как генетические варианты влияют на количественные характеристики, связанные с РАС, такие как тяжесть симптомов, когнитивные функции или этапы развития. Этот тип анализа помогает выяснить генетическую основу фенотипической изменчивости при РАС и выявить конкретные варианты, которые могут способствовать различиям в проявлении симптомов.

Эпигенетический анализ Эпигенетический компонент проекта фокусируется на том, как факторы окружающей среды влияют на экспрессию генов и способствуют риску развития РАС. Метилирование ДНК — один из ключевых эпигенетических механизмов, изучаемых в этом проекте. Используя полногеномное бисульфитное секвенирование (WGBS), исследователи анализируют закономерности метилирования ДНК по всему геному. WGBS считается золотым стандартом анализа метилирования ДНК с высоким разрешением, позволяющим выявлять изменения метилирования, связанные с РАС.

Дифференциально метилированные области (DMR) — это области генома, в которых уровни метилирования различаются у людей с РАС и здоровых людей из контрольной группы. Идентифицируя эти DMR, исследователи могут точно определить конкретные области генома, где факторы окружающей среды могут влиять на экспрессию генов у людей с РАС.

Кроме того, в этом исследовании изучается аллель-специфическое метилирование (ASM). Анализ ASM исследует, как паттерны метилирования различаются между двумя копиями гена, унаследованного от каждого родителя. Этот анализ помогает исследователям понять, как генетические и эпигенетические факторы взаимодействуют, влияя на экспрессию генов и повышая риск РАС.

В рамках эпигенетического анализа будет проведен анализ m-QTL (локусы количественных признаков метилирования) для изучения взаимосвязи между генетическими вариантами и закономерностями метилирования ДНК по всему геному. m-QTL представляют собой геномные локусы, в которых вариации последовательности ДНК связаны с различиями в уровнях метилирования ДНК. Идентифицируя эти локусы, проект стремится выяснить, как генетические вариации влияют на эпигенетическую регуляцию и, как следствие, как эти взаимодействия могут способствовать риску развития РАС. Этот анализ предоставит ценную информацию о взаимодействии генетических и эпигенетических факторов, помогая выяснить молекулярные механизмы, лежащие в основе РАС. Кроме того, m-QTL могут служить потенциальными биомаркерами для понимания влияния окружающей среды на модуляцию генетической предрасположенности у людей с РАС.

Эпигенетические данные также объединяются с генетическими данными для проведения общеэпигеномных ассоциативных исследований (EWAS). EWAS исследует, как закономерности метилирования ДНК коррелируют с РАС, с целью выявления меток метилирования, которые могут служить биомаркерами этого расстройства. Этот анализ необходим для понимания того, как воздействия окружающей среды, такие как пренатальный стресс, токсины или здоровье матери, могут влиять на риск РАС посредством эпигенетических механизмов.

Транскриптомный анализ Транскриптомный анализ направлен на понимание того, как экспрессия генов различается у людей с РАС и у людей без этого расстройства. Секвенирование РНК (RNA-seq) используется для измерения уровней экспрессии генов как в образцах крови, так и в мазках из носа. RNA-seq дает полное представление о транскриптоме, который представляет собой полный набор транскриптов РНК, присутствующих в клетке или ткани в данный момент времени.

Данные РНК-секвенирования используются для проведения анализа дифференциальной экспрессии генов (DGE), который идентифицирует гены, активность которых либо повышена, либо понижена у людей с РАС. Этот анализ помогает раскрыть молекулярные пути, которые нарушаются при РАС, и выявляет потенциальные биомаркеры, которые можно использовать для ранней диагностики или лечения.

Помимо идентификации дифференциально экспрессируемых генов, транскриптомные данные используются для анализа путей. Анализ путей изучает, как изменения в экспрессии генов влияют на биологические процессы и клеточные функции. Этот анализ может выявить ключевые пути, которые могут быть нарушены при РАС, и дать представление о биологических механизмах, лежащих в основе этого расстройства.

Сравнивая профили экспрессии генов в образцах крови и мазков из носа, исследователи могут выявить тканеспецифичные закономерности экспрессии. Это сравнение обеспечивает более детальное понимание молекулярных различий между тканями и может выявить тканеспецифичные биомаркеры РАС.

Анализ eQTL (локусы количественных признаков экспрессии)

В дополнение к анализу m-QTL, интеграция анализа eQTL (локусов количественных признаков экспрессии) позволит проекту идентифицировать генетические варианты, которые влияют на уровень экспрессии генов. eQTL — это локусы, в которых генетические вариации коррелируют с изменениями в экспрессии генов. Анализируя eQTL, исследование может выяснить, как определенные генетические варианты влияют на транскрипцию генов, связанных с РАС. Этот подход помогает раскрыть регуляторные пути и генные сети, которые способствуют изменчивости симптомов РАС. Интеграция анализа eQTL с транскриптомными данными (такими как RNA-Seq) обеспечивает детальное понимание того, как генетические факторы риска изменяют экспрессию генов, в конечном итоге влияя на фенотипические проявления РАС.

Эпитранскриптомный анализ

Помимо изучения ДНК и РНК посредством геномики и транскриптомики, эпитранскриптомика исследует посттранскрипционные модификации РНК, такие как N6-метиладенозин (m6A). Эти модификации РНК могут влиять на стабильность мРНК, сплайсинг, транспорт и трансляцию, тем самым влияя на выработку белка и функцию клеток. Включение эпитранскриптомного анализа в рабочий процесс RNA-Seq позволит понять, как различаются модификации РНК у пациентов с РАС, обеспечивая дополнительный уровень регуляции генов, который усугубляет сложность РАС. Это исследование может раскрыть новые эпитранскриптомные биомаркеры РАС, добавив глубины изучению регуляции генов на уровне РНК.

Интеграция данных и биоинформатика Интеграция геномных, эпигеномных и транскриптомных данных является ключевым компонентом проекта. Группы биоинформатики и анализа данных отвечают за обработку и анализ огромных объемов данных, генерируемых подразделениями омики. Это предполагает использование передовых инструментов биоинформатики и статистических моделей для интеграции данных и выявления значимых закономерностей.

Интегрированный набор данных подвергается модели многомерной регрессии, которая исследует взаимодействие между генетическими вариантами, эпигенетическими модификациями и уровнями экспрессии генов. Эти модели используются для определения того, как эти факторы в совокупности способствуют риску РАС и тяжести симптомов. Объединив как генетические данные, так и данные окружающей среды, модели могут также исследовать взаимодействия генов и окружающей среды, которые могут играть роль в развитии РАС.

Сетевой анализ — еще один ключевой инструмент, используемый командой биоинформатики. Этот метод визуализирует взаимодействие между генами, белками и регуляторными элементами, позволяя исследователям идентифицировать ключевые гены и пути, которые могут быть вовлечены в развитие РАС. Сетевой анализ также помогает выявить сети регуляции генов, которые могут быть нарушены у людей с РАС, что дает представление о молекулярных механизмах, которые приводят к этому расстройству.

Проект также использует алгоритмы машинного обучения (ML) и искусственного интеллекта (AI) для анализа данных. Эти прогностические модели призваны помочь врачам принимать персонализированные решения о лечении на основе молекулярного профиля каждого пациента. Например, модели искусственного интеллекта могут использоваться для прогнозирования тяжести симптомов РАС на основе генетических, эпигенетических и клинических данных, что позволяет проводить более целенаправленные вмешательства.

Hi-C и анализ in-silico:

В то время как традиционный анализ Hi-C часто использует сшивающие агенты для фиксации дальнодействующих взаимодействий хроматина, в этом проекте будет использован особый подход, отказавшись от использования сшивающих агентов для связывания конкретных фрагментов ДНК. Вместо этого данные о взаимодействии хроматина будут получены и повторно проверены in silico после интеграции данных. Путем компьютерного анализа трехмерной архитектуры хроматина проект будет направлен на выявление пространственных взаимодействий хроматина, которые способствуют регуляции генов, связанных с РАС.

Этот пост-интеграционный подход позволяет идентифицировать регуляторные элементы, такие как энхансеры и промоторы, которые взаимодействуют с отдаленными геномными областями в контексте РАС. Данные, полученные в результате геномного, эпигеномного и транскриптомного анализа, будут интегрированы для выявления закономерностей взаимодействия хроматина, которые влияют на экспрессию генов, особенно тех, которые связаны с патологией РАС. Эта стратегия позволит получить более гибкое и четкое понимание организации трехмерного генома без ограничений, налагаемых методами сшивки.

ChIP-Seq и анализ эпигенетического патогенеза in-silico:

Помимо картирования взаимодействия хроматина, данные ChIP-Seq будут использоваться для анализа эпигенетического патогенеза. Выполняя in-silico анализ результатов ChIP-Seq, проект определит модификации гистонов и сайты связывания факторов транскрипции, которые участвуют в регуляции экспрессии генов при РАС. Этот метод поможет выяснить роль специфических эпигенетических меток, таких как ацетилирование и метилирование гистонов, в нарушении регуляции генов, связанных с РАС.

Интеграция данных ChIP-Seq с другими данными omics, включая профили метилирования ДНК (WGBS) и экспрессии RNA-Seq, обеспечит комплексное представление о регуляторных сетях, управляющих РАС. Это позволит исследователям точно определить конкретные регуляторные механизмы, такие как изменение активности транскрипционных факторов или изменения доступности хроматина, которые могут способствовать возникновению или тяжести симптомов РАС. Таким образом, in-silico анализ результатов ChIP-Seq послужит мощным инструментом для понимания эпигенетического ландшафта, связанного с патогенезом РАС.

Проект может еще больше улучшить анализ за счет расчета полигенных показателей риска (PRS), которые количественно определяют кумулятивный эффект многочисленных генетических вариантов с малым эффектом на риск развития РАС. Объединив данные тысяч генетических вариантов, PRS может предсказать общую генетическую предрасположенность человека к РАС. Эти оценки затем можно сопоставить с клиническими и фенотипическими данными, чтобы лучше понять, как генетический риск трансформируется в наблюдаемые симптомы. PRS также можно интегрировать с экологическими и эпигенетическими данными для изучения взаимодействий генов и окружающей среды, предлагая комплексную модель восприимчивости к РАС.

Контроль качества и соответствие требованиям Поддержание целостности проекта имеет первостепенное значение, и это достигается за счет строгих мер контроля качества и комплексной системы обеспечения соответствия. В состав проекта входят несколько отделов, которые следят за тем, чтобы вся исследовательская деятельность соответствовала этическим принципам и нормативным стандартам.

Отдел управления рисками играет решающую роль в выявлении и снижении потенциальных рисков, которые могут поставить под угрозу целостность исследования. Этот отдел тесно сотрудничает с группами внутреннего аудита и соблюдения этических норм, чтобы гарантировать, что вся исследовательская деятельность соответствует этическим стандартам, таким как Хельсинкская декларация и национальные правила защиты персональных данных.

Группы контроля качества несут ответственность за контроль качества биологических образцов и обеспечение точности и надежности всех данных. Эти группы проводят регулярные проверки и реализуют корректирующие и предупреждающие действия (CAPA), когда это необходимо для решения любых проблем, возникающих в ходе исследования.

Отдел документации и архивирования отвечает за управление всеми записями проекта, включая отчеты об аудите, журналы передачи данных и записи о соответствии. Этот отдел гарантирует, что вся документация, связанная с проектом, надежно хранится и легко доступна для просмотра, что способствует прозрачности и подотчетности.

В состав проекта также входит группа управления закупками и цепочками поставок, которая отвечает за обеспечение своевременной закупки всех необходимых материалов, оборудования и реагентов. Эта команда управляет логистикой транспортировки материалов и обеспечивает соответствие всех поставок требуемым стандартам качества.

Этические соображения и безопасность участников. Безопасность и конфиденциальность участников имеют первостепенное значение при проведении исследования. Все данные участников анонимизируются и надежно хранятся для защиты их конфиденциальности. Проект придерживается как национальных, так и международных правил защиты персональных данных, гарантируя постоянное соблюдение прав участников.

Информированное согласие получено от всех участников до их включения в исследование. Участникам предоставляется подробная информация о целях, процедурах и потенциальных рисках исследования. Им также сообщают об их праве выйти из исследования в любое время без штрафных санкций.

Исследование получило этическое одобрение от соответствующих национальных комитетов по этике, гарантируя, что вся исследовательская деятельность соответствует установленным этическим принципам. Регулярные проверки проводятся для обеспечения правильного соблюдения всех процедур и оперативного решения любых этических проблем.

Интеграция и визуализация данных. По завершении исследования все данные геномного, эпигеномного и транскриптомного анализа будут интегрированы и визуализированы с использованием самых современных инструментов биоинформатики. Интегрированный набор данных предоставит комплексное представление о молекулярных механизмах, лежащих в основе РАС, что позволит исследователям идентифицировать ключевые биомаркеры и потенциальные терапевтические цели.

Интегрированные данные будут представлены с помощью различных методов визуализации, таких как тепловые карты, сетевые карты и диаграммы путей. Эти визуализации помогут исследователям интерпретировать данные и сделать значимые выводы о биологических процессах, связанных с РАС.

Заключение Этот проект является знаковым исследованием в области исследований РАС, в котором используется мультиомикальный подход для выявления генетических, эпигенетических и экологических факторов, способствующих развитию расстройства. Многопрофильная структура проекта со специальными группами для клинических операций, анализа данных, контроля качества и соблюдения требований гарантирует, что исследования проводятся с высочайшим уровнем научной строгости.

Путем интеграции геномных, эпигеномных и транскриптомных данных проект стремится предоставить новое понимание молекулярных механизмов, лежащих в основе РАС, и выявить потенциальные биомаркеры для диагностики и лечения. Результаты этого исследования могут проложить путь к персонализированным медицинским подходам к РАС, улучшая качество жизни людей, страдающих этим расстройством.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

3000

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Rukiye Tekdemir, MD.
  • Номер телефона: +90 530 326 49 95
  • Электронная почта: dr.rtekdemir@gmail.com

Учебное резервное копирование контактов

  • Имя: Hasan Ali Güler, MD.
  • Номер телефона: +90 505 347 29 66
  • Электронная почта: dr.hasanaliguler@gmail.com

Места учебы

  • Турция
      • Afyonkarahisar, Турция
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Aziz Kara, MD.
          • Номер телефона: 00905331705112
          • Электронная почта: aziz.kara@afsu.edu.tr
        • Контакт:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Турция
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Контакт:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
          • Номер телефона: +90 542 725 90 66
          • Электронная почта: ysmnhosgoren@gmail.com
        • Контакт:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Турция
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
          • Номер телефона: 00905428917627
          • Электронная почта: ysmn.ts@gmail.com
        • Контакт:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Турция
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
          • Номер телефона: +90 532 665 62 20
          • Электронная почта: ayhancongologlu@gmail.com
        • Контакт:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Турция
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Caner Mutlu, MD.
          • Номер телефона: 00905058343797
          • Электронная почта: canermutlu@uludag.edu.tr
        • Контакт:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Турция
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
          • Номер телефона: 00905325401413
          • Электронная почта: burgekabukcu@yahoo.com
        • Контакт:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Турция
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
          • Номер телефона: 05535525062
          • Электронная почта: esenyildirim08@hotmail.com
        • Контакт:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Турция
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
        • Контакт:
          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Турция
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
          • Номер телефона: 00905544250628
          • Электронная почта: onalbediasultan@gmail.com
        • Контакт:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Турция
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD
          • Номер телефона: +90 505 672 49 30
          • Электронная почта: mtarakcioglu@hotmail.com
        • Контакт:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
      • Istanbul, Турция
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Alperen Bıkmazer, MD
          • Номер телефона: +90 555 301 91 03
          • Электронная почта: alperenbikmazer@yahoo.com
        • Контакт:
          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Турция
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
        • Контакт:
          • Aynur Görmez, MD.
          • Номер телефона: 00905321691143
          • Электронная почта: draynurgormez@gmail.com
        • Контакт:
          • Aynur Görmez, MD.
      • Istanbul, Турция
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Yasin Çalışkan, MD.
          • Номер телефона: 0090507 346 33 66
          • Электронная почта: yascaliskan@gmail.com
        • Контакт:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Турция
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
        • Контакт:
          • Gonca Özyurt, MD.
      • Konya, Турция
        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
          • Номер телефона: +90 530 697 21 02
          • Электронная почта: ofakca@erbakan.edu.tr
        • Контакт:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Турция
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
        • Контакт:
          • Nadir Koçak, MD.
          • Номер телефона: +90 553 258 78 70
          • Электронная почта: nadirkocak@yahoo.com
        • Контакт:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
          • Номер телефона: +90 537 950 50 27
          • Электронная почта: ozkan.bagci@selcuk.edu.tr
        • Контакт:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
        • Контакт:
          • Ali TORABI, MD.,Ph.D.
        • Контакт:
          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
      • Trabzon, Турция
        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
          • Номер телефона: 0090546 561 5281
          • Электронная почта: dr.esrahosoglu@gmail.com
        • Контакт:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
      • Şanlıurfa, Турция
        • Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
          • Номер телефона: 00905071916536
          • Электронная почта: fethiyeklcaslan@gmail.com
        • Контакт:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
    • Selçuklu
      • Konya, Selçuklu, Турция, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Контакт:
          • Hasan Ali Güler, MD.
          • Номер телефона: +90 505 347 29 66
          • Электронная почта: dr.hasanaliguler@gmail.com
        • Контакт:
          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Турция, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Контакт:
          • ALİ KANDEĞER, MD.
          • Номер телефона: +90 537 464 22 12
          • Электронная почта: dralikandeger@gmail.com
        • Контакт:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Ребенок
  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Да

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Исследуемая популяция будет состоять из людей с диагнозом расстройства аутистического спектра (РАС) или с аутистическими чертами, отобранных из клинических центров, специализирующихся на нарушениях нервного развития. Популяция также будет включать здоровую контрольную группу, подобранную по возрасту, полу и социально-демографическим переменным, набранную из населения в целом. В когорту с РАС войдут участники с разными функциональными уровнями, от высокофункционального до низкофункционального аутизма, а также люди с профилями развития и сопутствующими заболеваниями. В контрольной группе не будет психиатрических или неврологических диагнозов и хронических заболеваний.

Описание

- Критерии включения: Расстройство аутистического спектра (РАС) или аутизмоподобные черты: лица, у которых диагностирован РАС на основании диагностических критериев DSM-5, или лица, демонстрирующие существенные черты аутизма без официального диагноза.

Здоровая контрольная группа: лица, соответствующие по возрасту, полу и социально-демографическим характеристикам, без каких-либо психических или неврологических расстройств.

Лица с РАС различных функциональных уровней: участники с РАС с широким спектром функциональных способностей, от высокофункционального до низкофункционального аутизма.

Коморбидные состояния: включение добровольцев с особенностями развития и сопутствующими заболеваниями, такими как СДВГ и неспособность к обучению.

Информированное согласие: Письменное информированное согласие от участников старше 18 лет. Для участников младше 18 лет — согласие родителей или законных опекунов.

- Критерии исключения: Тяжелые психотические расстройства: лица с диагнозом шизофрения или шизоаффективное расстройство.

Известные генетические синдромы или хромосомные аномалии: люди с генетическими заболеваниями, такими как синдром Дауна или синдром ломкой Х-хромосомы.

История генетической или экспериментальной терапии: участники, ранее проходившие генную или клеточную терапию, частые переливания крови или трансплантации костного мозга.

Тяжелые коммуникативные или когнитивные нарушения: участники с коммуникативными или когнитивными расстройствами, которые могут помешать им участвовать в сборе данных, или лица с агрессивными поведенческими расстройствами.

Несоблюдение требований или медицинские ограничения: лица, неспособные соблюдать процедуры исследования или медицинские условия, препятствующие сбору биологических образцов.

- Контрольная группа: Здоровые люди: участники без РАС или каких-либо психических или неврологических расстройств.

Соответствие возрасту и полу: соответствует группе с РАС по возрасту, полу и социально-демографическому статусу.

Отсутствие в анамнезе генетических нарушений или нарушений развития нервной системы: лица без генетических синдромов, хромосомных аномалий или нарушений развития нервной системы.

Отсутствие истории хронических заболеваний: участники без истории хронических заболеваний, таких как рак, аутоиммунные заболевания или нарушения обмена веществ.

Информированное согласие: письменное информированное согласие от лиц старше 18 лет или от родителей/законных опекунов для участников младше 18 лет.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Группа случаев РАС
Представляет людей с диагнозом расстройства аутистического спектра (РАС), которым предстоит пройти генетический, эпигенетический и транскриптомный анализ.
Контрольная группа
Представляет незатронутых людей, служащих группой сравнения для генетического и молекулярного анализа.
Группа биомаркеров кластера HOT
Представляет участников, выбранных после получения вторичных результатов на основе кластерного анализа HOT, которые пройдут ELISA для изучения потенциальных биомаркеров, полученных в результате анализа путей транскриптома РНК.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Завершение набора клинических данных
Временное ограничение: Ожидается, что оно будет завершено в течение 24 месяцев с момента начала исследования.
Первичным результатом будет набор людей с диагнозом расстройство аутистического спектра (РАС) и незатронутых контрольных групп. Будут собраны комплексные клинические, социально-демографические и фенотипические данные, включая диагностические оценки с использованием стандартизированных инструментов (например, ADOS, SCQ).
Ожидается, что оно будет завершено в течение 24 месяцев с момента начала исследования.

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Сбор и пополнение необработанных генетических данных (WGS и WGBS)
Временное ограничение: Ожидается, что оно будет завершено в течение 30 месяцев с момента начала исследования.
Вторичный результат направлен на получение необработанных генетических данных в результате полногеномного секвенирования (WGS) и полногеномного бисульфитного секвенирования (WGBS) из образцов крови и мазков из носа. Данные секвенирования будут использоваться для последующего генетического и эпигенетического анализа для выявления вариантов, изменений метилирования и их связи с РАС.
Ожидается, что оно будет завершено в течение 30 месяцев с момента начала исследования.
Интеграция генетических данных
Временное ограничение: Ожидается, что оно будет завершено в течение 60 месяцев с момента начала исследования.
Этот результат измеряет интеграцию данных полногеномного секвенирования (WGS), полногеномного бисульфитного секвенирования (WGBS) и данных секвенирования РНК в объединенный набор данных для комплексного мультиомного анализа. Цель состоит в том, чтобы раскрыть генетические и эпигенетические взаимодействия, связанные с РАС.
Ожидается, что оно будет завершено в течение 60 месяцев с момента начала исследования.

Другие показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Полный (окончательный) показатель результата: связь между клиническими и генетическими данными
Временное ограничение: Ожидается в течение 66 месяцев после завершения всех этапов сбора и анализа данных.
Окончательный результат позволит оценить корреляцию между генетическими, эпигенетическими и транскриптомными данными с клиническими фенотипами. Этот результат направлен на выявление значимых связей, которые могут объяснить генетическую основу расстройства аутистического спектра, способствуя созданию потенциальных биомаркеров или терапевтических целей.
Ожидается в течение 66 месяцев после завершения всех этапов сбора и анализа данных.

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Соавторы

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Следователи

  • Учебный стул: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Директор по исследованиям: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Директор по исследованиям: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Директор по исследованиям: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Директор по исследованиям: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Директор по исследованиям: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Оцененный)

27 декабря 2025 г.

Первичное завершение (Оцененный)

27 декабря 2027 г.

Завершение исследования (Оцененный)

27 мая 2028 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

24 октября 2024 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

24 октября 2024 г.

Первый опубликованный (Действительный)

29 октября 2024 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

29 октября 2024 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

24 октября 2024 г.

Последняя проверка

1 октября 2024 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Другой идентификатор: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Другой идентификатор: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕ РЕШЕНО

Описание плана IPD

В настоящее время решение о предоставлении индивидуальных данных участников (IPD) еще не принято. По завершении исследования решение будет рассмотрено и окончательно утверждено в соответствии с применимыми нормативными и этическими принципами. Окончательное решение будет зависеть от получения разрешения Турецкого агентства по лекарствам и медицинскому оборудованию (TİTCK), Комитета по этике и Министерства здравоохранения Турции. План обмена обеспечит строгое соблюдение всех правил защиты данных и конфиденциальности, а также будут приняты соответствующие меры для защиты конфиденциальности участников.

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

продукт, произведенный в США и экспортированный из США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться