Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Undersøkelse av genetiske og miljømessige årsaker til autisme: en multisenterstudie (ASD-Omics-TR)

24. oktober 2024 oppdatert av: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

En multi-senter multi-omics-tilnærming for å undersøke genetiske og epigenetiske mekanismer ved autismespektrumforstyrrelse

Målet med denne observasjonsstudien er å undersøke de genetiske og epigenetiske mekanismene som kan bidra til utviklingen av autismespektrumforstyrrelse (ASD) hos individer i ulike aldersgrupper. Studien tar sikte på å utforske hvordan genetiske varianter og miljøfaktorer samhandler for å påvirke risikoen for ASD.

Hovedspørsmålene den tar sikte på å besvare er:

  • Hvilke genetiske varianter er sterkest assosiert med utvikling av ASD?
  • Hvordan påvirker miljøfaktorer, som prenatal eksponering, disse genetiske risikoene?
  • Kan kombinasjonen av genetiske og epigenetiske data forbedre tidlig oppdagelse eller intervensjonsstrategier for ASD?

Deltakerne vil:

  • Gi biologiske prøver for genetisk og epigenetisk analyse.
  • Fyll ut detaljerte spørreskjemaer angående miljøeksponering og familiehistorie.
  • Delta i kliniske vurderinger for å evaluere alvorlighetsgraden av ASD-symptomer.

Forskere vil sammenligne genetiske og miljømessige data mellom individer med ASD og de uten lidelsen for å forstå hvordan disse faktorene kan bidra til risikoen for ASD. Denne multisenterstudien vil finne sted på tvers av flere universiteter og sykehus i Türkiye, med fokus på det potensielle samspillet mellom arvelige genetiske faktorer og miljøpåvirkninger.

Studieoversikt

Status

Har ikke rekruttert ennå

Forhold

Detaljert beskrivelse

Introduksjon til prosjektet Prosjektet representerer en nyskapende multisenterstudie som tar sikte på å undersøke de genetiske, epigenetiske og miljømessige grunnlagene for autismespektrumforstyrrelse (ASD). ASD er en kompleks nevroutviklingstilstand som vanligvis opptrer i tidlig barndom og påvirker individer på forskjellige måter, spesielt i sosial kommunikasjon og atferd. Lidelsen er preget av betydelig variasjon i symptomets alvorlighetsgrad og presentasjon på tvers av individer. Til tross for mange års forskning, er de molekylære mekanismene som driver utbruddet og progresjonen av ASD fortsatt unnvikende, noe som gjør diagnose og behandling utfordrende.

Denne forskningen tar sikte på å fylle dette gapet ved å bruke en multi-omics-tilnærming for å bedre forstå de biologiske, genetiske og miljømessige faktorene som bidrar til ASD. Gjennom integrering av genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data, søker prosjektet å avdekke molekylære signaturer og interaksjoner som kan forklare variasjonen i ASD-presentasjon og alvorlighetsgrad. I tillegg har studien som mål å identifisere potensielle biomarkører som kan føre til tidligere diagnose, bedre prognose og mer personlige behandlingsalternativer.

Studien vil bli utført på tvers av flere forskningssentre, med en strukturert og godt koordinert tilnærming til datainnsamling, prøvebehandling og analyse. Dette tverrfaglige prosjektet samler en rekke ekspertise, inkludert genetikk, bioinformatikk, klinisk psykiatri og datavitenskap, og sikrer at alle aspekter av forskningen tilnærmes med vitenskapelig strenghet og presisjon. Ved å analysere prøver fra individer med ASD, vil prosjektet gi ny innsikt i de genetiske og epigenetiske faktorene som er involvert i ASD, samtidig som det undersøker potensiell påvirkning av miljøfaktorer.

Fleravdelingsstruktur og prosjektintegritet Prosjektet er organisert i flere spesialiserte avdelinger, hver med en spesifikk rolle i å opprettholde integriteten til studien og sikre at alle forskningsaktiviteter utføres til de høyeste standardene. Denne strukturen tillater sømløst samarbeid mellom avdelinger og sikrer at all data samles inn, behandles og analyseres med den største nøyaktighet.

Overordnet koordinering og tilsyn På høyeste nivå ledes prosjektet av en overordnet koordinator som fører tilsyn med alle aspekter av forskningen. Denne koordinatoren sikrer at hver avdeling overholder prosjektets mål og tidslinje, fremmer kommunikasjon mellom team og letter integreringen av kliniske, genetiske og epigenetiske data. Koordinering sikrer at eventuelle utfordringer som oppstår i løpet av studiet blir løst raskt, og at prosjektet fortsetter å nå sine mål.

Rollen til den overordnede koordinatoren er kritisk for å sikre integreringen av multiomics-dataene fra de ulike forskningssentrene. Koordinatoren spiller også en nøkkelrolle i tolkningen av data, og jobber tett med dataanalyseteamene for å sikre at funnene er sammenhengende og meningsfulle. Regelmessige oppdateringer deles på tvers av avdelinger for å opprettholde samsvar med prosjektets overordnede forskningsmål.

Kliniske operasjoner: Voksen- og pediatriske enheter Den kliniske driften av prosjektet er delt inn i to hovedsektorer: voksen og pediatrisk. Hver sektor ledes av et dedikert team som fører tilsyn med kliniske sentre som er ansvarlige for datainnsamling. Disse kliniske sentrene er lokalisert på tvers av ulike regioner, noe som gjør det mulig for prosjektet å samle et bredt og mangfoldig spekter av kliniske data fra individer diagnostisert med ASD.

Hvert klinisk senter følger standardiserte protokoller for datainnsamling, og sikrer at alle pasientdata samles inn på en enhetlig og konsistent måte. Datainnsamlingsprosessen involverer bruk av internasjonalt anerkjente diagnoseverktøy, inkludert Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) og Social Communication Questionnaire (SCQ). Disse verktøyene er avgjørende for å diagnostisere ASD og for å evaluere alvorlighetsgraden av symptomene.

De kliniske operasjonene innebærer også innsamling av sosiodemografiske data, utviklingshistorier og informasjon om komorbide tilstander. Disse dataene er samlet inn gjennom spørreskjemaer og kliniske intervjuer utført av utdannet helsepersonell. Innsamlingen av dette omfattende datasettet er avgjørende for å forstå den kliniske heterogeniteten til ASD og for å korrelere kliniske symptomer med genetiske og miljømessige data.

Genetiske og omics-avdelinger De genetiske og omics-divisjonene utgjør kjernen i prosjektet, og gir de molekylære dataene som vil bli brukt til å avdekke de genetiske og epigenetiske mekanismene som driver ASD. Divisjonen fører tilsyn med innsamling, prosessering og analyse av biologiske prøver, som inkluderer venøst ​​blod og neseprøver hentet fra studiedeltakere.

Prøveinnsamling og prosessering De biologiske prøvene samlet inn fra deltakerne gjennomgår en streng og standardisert prosess med nukleinsyreekstraksjon. Denne prosessen, administrert av nukleinsyreekstraksjons- og renseteamene, involverer isolering av høykvalitets DNA og RNA fra blod- og neseprøvene. Disse prøvene er avgjørende for nedstrøms sekvensering og analyser. Kvaliteten på det ekstraherte DNA og RNA er kritisk, siden eventuelle urenheter eller nedbrytning kan påvirke nøyaktigheten til de genetiske og epigenetiske analysene.

Når de er ekstrahert, blir DNA- og RNA-prøvene utsatt for flere kvalitetskontroller. Disse kontrollene overvåkes av kvalitetskontroll- og lagringsteamene, som sikrer at nukleinsyrene oppfyller de nødvendige standardene for sekvensering. Prøver som består kvalitetskontrollkontrollene lagres under optimale forhold, og bevarer integriteten til de er klare til å bli sekvensert.

Genomisk analyse Den genomiske analysen av DNA-prøver begynner med helgenomsekvensering (WGS), en omfattende teknikk som lar forskere undersøke hele den genetiske koden til hver deltaker. WGS muliggjør identifisering av et bredt spekter av genetiske varianter, inkludert enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP), kopiantallvariasjoner (CNV), innsettinger og slettinger (InDels) og strukturelle varianter. Disse variantene blir evaluert for å bestemme deres potensielle bidrag til ASD.

En av de primære analysene utført innenfor den genomiske divisjonen er den genomomfattende assosiasjonsstudien (GWAS). GWAS brukes til å identifisere genetiske varianter som er signifikant assosiert med ASD ved å sammenligne frekvensen av varianter mellom individer med ASD og de uten lidelsen. Denne analysen er spesielt nyttig for å identifisere vanlige genetiske varianter som kan bidra til ASD-risiko.

I tillegg til GWAS, gjennomfører prosjektet også quantitative trait locus (QTL) analyse. QTL-analyse undersøker hvordan genetiske varianter påvirker kvantitative egenskaper relatert til ASD, slik som alvorlighetsgrad av symptomer, kognitiv funksjon eller utviklingsmilepæler. Denne typen analyser bidrar til å belyse det genetiske grunnlaget for fenotypisk variasjon ved ASD og identifiserer spesifikke varianter som kan bidra til forskjeller i symptompresentasjon.

Epigenetisk analyse Den epigenetiske komponenten i prosjektet fokuserer på hvordan miljøfaktorer påvirker genuttrykk og bidrar til risikoen for ASD. DNA-metylering er en av de viktigste epigenetiske mekanismene som er studert i dette prosjektet. Ved å bruke hele genom-bisulfittsekvensering (WGBS), analyserer forskere DNA-metyleringsmønstre over hele genomet. WGBS regnes som gullstandarden for høyoppløselig DNA-metyleringsanalyse, noe som tillater identifisering av metyleringsendringer som er assosiert med ASD.

Differensielt metylerte regioner (DMR) er genomiske regioner der metyleringsnivåene varierer mellom individer med ASD og upåvirkede kontroller. Ved å identifisere disse DMR-ene kan forskere finne spesifikke genomiske regioner der miljøfaktorer kan påvirke genuttrykk hos individer med ASD.

I tillegg er allelspesifikk metylering (ASM) utforsket i denne studien. ASM-analyse undersøker hvordan metyleringsmønstre skiller seg mellom de to kopiene av et gen som er arvet fra hver forelder. Denne analysen hjelper forskere med å forstå hvordan genetiske og epigenetiske faktorer samhandler for å påvirke genuttrykk og bidra til ASD-risiko.

Som en del av den epigenetiske analysen vil m-QTL (methylation quantitative trait loci)-analyse bli utført for å undersøke forholdet mellom genetiske varianter og DNA-metyleringsmønstre på tvers av genomet. m-QTL-er er genomiske loki der variasjoner i DNA-sekvens er assosiert med forskjeller i DNA-metyleringsnivåer. Ved å identifisere disse lociene, har prosjektet som mål å avdekke hvordan genetisk variasjon påvirker epigenetisk regulering og deretter hvordan disse interaksjonene kan bidra til risikoen for å utvikle ASD. Denne analysen vil gi verdifull innsikt i samspillet mellom genetiske og epigenetiske faktorer, og bidra til å belyse de molekylære mekanismene som underbygger ASD. I tillegg kan m-QTL-er tjene som potensielle biomarkører for å forstå den miljømessige moduleringen av genetisk følsomhet hos individer med ASD.

De epigenetiske dataene er også integrert med genetiske data for å utføre epigenom-wide assosiasjonsstudier (EWAS). EWAS undersøker hvordan DNA-metyleringsmønstre korrelerer med ASD, med mål om å identifisere metyleringsmerker som kan tjene som biomarkører for lidelsen. Disse analysene er avgjørende for å forstå hvordan miljøeksponeringer, som prenatalt stress, giftstoffer eller mødrehelse, kan påvirke ASD-risiko gjennom epigenetiske mekanismer.

Transkriptomisk analyse Den transkriptomiske analysen fokuserer på å forstå hvordan genuttrykk er forskjellig mellom individer med ASD og de uten lidelsen. RNA-sekvensering (RNA-seq) brukes til å måle nivåene av genuttrykk i både blod- og neseprøver. RNA-seq gir en omfattende oversikt over transkriptomet, som representerer det komplette settet med RNA-transkripsjoner som er tilstede i en celle eller vev på et gitt tidspunkt.

RNA-seq-dataene brukes til å utføre differensiell genuttrykk (DGE) analyse, som identifiserer gener som enten er oppregulert eller nedregulert hos individer med ASD. Denne analysen hjelper til med å avdekke de molekylære banene som er forstyrret i ASD og fremhever potensielle biomarkører som kan brukes til tidlig diagnose eller behandling.

I tillegg til å identifisere differensielt uttrykte gener, brukes de transkriptomiske dataene til å utføre baneanalyse. Pathway-analyse undersøker hvordan endringer i genuttrykk påvirker biologiske prosesser og cellulære funksjoner. Denne analysen kan identifisere nøkkelveier som kan bli forstyrret i ASD, og ​​gir innsikt i de biologiske mekanismene som ligger til grunn for lidelsen.

Ved å sammenligne genekspresjonsprofilene fra både blod- og neseprøver, kan forskere identifisere vevsspesifikke uttrykksmønstre. Denne sammenligningen gir en mer nyansert forståelse av de molekylære forskjellene mellom vev og kan avsløre vevsspesifikke biomarkører for ASD.

eQTL (Expression Quantitative Trait Loci) Analyse

I tillegg til m-QTL-analyse, vil integrering av eQTL (expression quantitative trait loci)-analyse tillate prosjektet å identifisere genetiske varianter som påvirker genekspresjonsnivåer. eQTL-er er loki der genetiske variasjoner er korrelert med endringer i genuttrykk. Ved å analysere eQTL-er kan studien undersøke hvordan spesifikke genetiske varianter påvirker transkripsjonen av gener relatert til ASD. Denne tilnærmingen hjelper til med å avdekke regulatoriske veier og gennettverk som bidrar til variasjonen i ASD-symptomer. Integreringen av eQTL-analyse med transkriptomiske data (som RNA-Seq) gir en nyansert forståelse av hvordan genetiske risikofaktorer endrer genuttrykk, og til slutt påvirker den fenotypiske manifestasjonen av ASD.

Epitranskriptomisk analyse

Utover studiet av DNA og RNA gjennom genomikk og transkriptomikk, utforsker epitranskriptomikk post-transkripsjonelle modifikasjoner av RNA, slik som N6-metyladenosin (m6A). Disse RNA-modifikasjonene kan påvirke mRNA-stabilitet, spleising, transport og translasjon, og dermed påvirke proteinproduksjon og cellefunksjon. Inkludering av epitranskriptomisk analyse som en del av RNA-Seq-arbeidsflyten vil gi innsikt i hvordan RNA-modifikasjoner er forskjellige hos ASD-pasienter, og gir et ekstra lag med genregulering som bidrar til kompleksiteten til ASD. Denne undersøkelsen kan avdekke nye epitranskriptomiske biomarkører for ASD, noe som gir dybde til studiens utforskning av genregulering på RNA-nivå.

Dataintegrasjon og bioinformatikk Integreringen av genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data er en nøkkelkomponent i prosjektet. Bioinformatikk- og dataanalyseteamene er ansvarlige for å behandle og analysere de enorme datamengdene som genereres av omics-divisjonene. Dette innebærer bruk av avanserte bioinformatikkverktøy og statistiske modeller for å integrere dataene og avdekke meningsfulle mønstre.

Det integrerte datasettet er utsatt for multivariate regresjonsmodeller, som undersøker interaksjonene mellom genetiske varianter, epigenetiske modifikasjoner og genuttrykksnivåer. Disse modellene brukes til å identifisere hvordan disse faktorene sammen bidrar til ASD-risiko og symptomalvorlighet. Ved å inkludere både genetiske og miljømessige data, kan modellene også utforske gen-miljø-interaksjoner som kan spille en rolle i utviklingen av ASD.

Nettverksanalyse er et annet nøkkelverktøy som brukes av bioinformatikkteamet. Denne teknikken visualiserer interaksjonene mellom gener, proteiner og regulatoriske elementer, slik at forskere kan identifisere nøkkelgener og veier som kan være involvert i ASD. Nettverksanalyse bidrar også til å avdekke genregulerende nettverk som kan bli forstyrret hos individer med ASD, og ​​gir innsikt i de molekylære mekanismene som driver lidelsen.

Prosjektet utnytter også maskinlæring (ML) og kunstig intelligens (AI) algoritmer for å analysere dataene. Disse prediktive modellene er utviklet for å hjelpe klinikere med å ta personlige behandlingsbeslutninger basert på den molekylære profilen til hver pasient. For eksempel kan AI-modeller brukes til å forutsi alvorlighetsgraden av ASD-symptomer basert på genetiske, epigenetiske og kliniske data, noe som muliggjør mer målrettede intervensjoner.

Hi-C og In-Silico-analyse:

Mens tradisjonell Hi-C-analyse ofte bruker tverrbindere for å fange langdistanse kromatininteraksjoner, vil dette prosjektet ta en distinkt tilnærming ved å gi avkall på bruken av tverrbindere for å koble spesifikke DNA-fragmenter. I stedet vil kromatininteraksjonsdataene bli utledet og revisited in-silico post-data integrering. Ved å analysere 3D-kromatinarkitekturen beregningsmessig, vil prosjektet ta sikte på å identifisere romlige kromatininteraksjoner som bidrar til reguleringen av ASD-assosierte gener.

Denne tilnærmingen etter integrering gjør det mulig å identifisere regulatoriske elementer, som forsterkere og promotere, som samhandler med fjerne genomiske regioner i sammenheng med ASD. Dataene generert fra genomiske, epigenomiske og transkriptomiske analyser vil bli integrert for å avsløre kromatininteraksjonsmønstre som påvirker genuttrykk, spesielt de som er assosiert med ASD-patologi. Denne strategien vil gi en mer fleksibel og raffinert forståelse av 3D-genomorganisering uten begrensningene som pålegges av tverrbindingsbaserte metoder.

ChIP-Seq og In-Silico epigenetisk patogeneseanalyse:

I tillegg til kromatininteraksjonskartlegging, vil ChIP-Seq-data bli brukt for epigenetisk patogeneseanalyse. Ved å utføre in-silico-analyse av ChIP-Seq-resultater, vil prosjektet identifisere histonmodifikasjoner og transkripsjonsfaktorbindingssteder som er involvert i reguleringen av genuttrykk i ASD. Denne teknikken vil bidra til å belyse rollene til spesifikke epigenetiske merker, som histonacetylering og metylering, i dysreguleringen av ASD-assosierte gener.

Integrasjonen av ChIP-Seq-data med andre omics-data, inkludert DNA-metylering (WGBS) og RNA-Seq-ekspresjonsprofiler, vil gi et omfattende bilde av regulatoriske nettverk som driver ASD. Dette vil tillate forskere å finne spesifikke reguleringsmekanismer, som endret transkripsjonsfaktoraktivitet eller endringer i kromatintilgjengelighet, som kan bidra til utbruddet eller alvorlighetsgraden av ASD-symptomer. In-silico-analyse av ChIP-Seq-resultatene vil dermed tjene som et kraftig verktøy for å forstå det epigenetiske landskapet assosiert med ASD-patogenese.

Prosjektet kan ytterligere forbedre analysen ved å beregne polygene risikoskårer (PRS), som kvantifiserer den kumulative effekten av mange genetiske varianter med liten effekt på risikoen for å utvikle ASD. Ved å samle data fra tusenvis av genetiske varianter, kan PRS forutsi et individs generelle genetiske disposisjon for ASD. Disse skårene kan deretter korreleres med kliniske og fenotypiske data for å bedre forstå hvordan genetisk risiko oversettes til observerbare symptomer. PRS kan også integreres med miljø- og epigenetiske data for å utforske gen-miljø-interaksjoner, og tilbyr en omfattende modell for ASD-følsomhet.

Kvalitetskontroll og etterlevelse Det er viktig å opprettholde integriteten til prosjektet, og dette oppnås gjennom strenge kvalitetskontrolltiltak og et omfattende samsvarsrammeverk. Prosjektet omfatter flere avdelinger som er dedikert til å sikre at all forskningsaktivitet er i samsvar med etiske retningslinjer og regulatoriske standarder.

Risikostyringsavdelingen spiller en avgjørende rolle i å identifisere og redusere potensielle risikoer som kan kompromittere integriteten til studien. Denne avdelingen jobber tett med internrevisjons- og etikkoverholdelsesteamene for å sikre at alle forskningsaktiviteter overholder etiske standarder, slik som Helsinki-erklæringen og nasjonale forskrifter for beskyttelse av personopplysninger.

Kvalitetskontrollteamene er ansvarlige for å overvåke kvaliteten på de biologiske prøvene og sikre at alle data er nøyaktige og pålitelige. Disse teamene utfører regelmessige revisjoner og implementerer korrigerende og forebyggende tiltak (CAPA) når det er nødvendig for å løse eventuelle problemer som oppstår i løpet av studien.

Dokumentasjons- og arkiveringsavdelingen er ansvarlig for å administrere alle prosjektregistreringer, inkludert revisjonsrapporter, dataoverføringslogger og samsvarsposter. Denne avdelingen sikrer at all prosjektrelatert dokumentasjon er trygt lagret og lett tilgjengelig for gjennomgang, noe som letter åpenhet og ansvarlighet.

Prosjektet inkluderer også et innkjøps- og supply chain management team, som er ansvarlig for å sikre at alle nødvendige materialer, utstyr og reagenser anskaffes i tide. Dette teamet styrer logistikken for materialoverføringer og sikrer at alle forsyninger oppfyller de nødvendige kvalitetsstandardene.

Etiske vurderinger og deltakersikkerhet Sikkerheten og personvernet til deltakerne er avgjørende i gjennomføringen av studien. Alle deltakerdata anonymiseres og lagres sikkert for å beskytte deres konfidensialitet. Prosjektet følger både nasjonale og internasjonale forskrifter angående beskyttelse av personopplysninger, og sikrer at deltakernes rettigheter respekteres til enhver tid.

Informert samtykke innhentes fra alle deltakerne før de blir registrert i studien. Deltakerne får detaljert informasjon om studiens mål, prosedyrer og potensielle risikoer. De er også informert om deres rett til å trekke seg fra studien når som helst uten straff.

Studien har fått etisk godkjenning fra relevante nasjonale etiske komiteer, som sikrer at all forskningsaktivitet følger etablerte etiske retningslinjer. Det gjennomføres regelmessige revisjoner for å sikre at alle prosedyrer følges riktig og at eventuelle etiske bekymringer blir løst umiddelbart.

Dataintegrasjon og visualisering Etter fullføring av studien vil alle data fra de genomiske, epigenomiske og transkriptomiske analysene bli integrert og visualisert ved hjelp av toppmoderne bioinformatikkverktøy. Det integrerte datasettet vil gi et omfattende bilde av de molekylære mekanismene som ligger til grunn for ASD, slik at forskere kan identifisere viktige biomarkører og potensielle terapeutiske mål.

De integrerte dataene vil bli presentert gjennom ulike visualiseringsteknikker, for eksempel varmekart, nettverkskart og rutediagrammer. Disse visualiseringene vil hjelpe forskere med å tolke dataene og trekke meningsfulle konklusjoner om de biologiske prosessene involvert i ASD.

Konklusjon Dette prosjektet er en landemerkestudie innen ASD-forskning, som bruker en multi-omics-tilnærming for å avdekke de genetiske, epigenetiske og miljømessige faktorene som bidrar til lidelsen. Prosjektets tverrfaglige struktur, med dedikerte team for kliniske operasjoner, dataanalyse, kvalitetskontroll og etterlevelse, sikrer at forskningen utføres med det høyeste nivået av vitenskapelig strenghet.

Ved å integrere genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data, har prosjektet som mål å gi ny innsikt i de molekylære mekanismene som ligger til grunn for ASD og å identifisere potensielle biomarkører for diagnose og behandling. Funnene fra denne studien kan bane vei for personlig tilpassede medisintilnærminger til ASD, og ​​forbedre livskvaliteten for individer som er berørt av lidelsen.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

3000

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

Studiesteder

  • Tyrkia
      • Afyonkarahisar, Tyrkia
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Tyrkia
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Tyrkia
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Tyrkia
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Tyrkia
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Tyrkia
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Tyrkia
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Tyrkia
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Tyrkia
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Tyrkia
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
      • Istanbul, Tyrkia
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Tyrkia
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Aynur Görmez, MD.
      • Istanbul, Tyrkia
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Tyrkia
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Gonca Özyurt, MD.
      • Konya, Tyrkia
        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Tyrkia
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
        • Ta kontakt med:
          • Ali TORABI, MD.,Ph.D.
        • Ta kontakt med:
          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
      • Trabzon, Tyrkia
        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
      • Şanlıurfa, Tyrkia
        • Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
    • Selçuklu
      • Konya, Selçuklu, Tyrkia, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Tyrkia, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Ja

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Studiepopulasjonen vil bestå av individer diagnostisert med autismespektrumforstyrrelse (ASD) eller som viser autismelignende egenskaper, valgt fra kliniske sentre som spesialiserer seg på nevroutviklingsforstyrrelser. Befolkningen vil også inkludere en sunn kontrollgruppe, matchet etter alder, kjønn og sosiodemografiske variabler, rekruttert fra det generelle samfunnet. ASD-kohorten vil inkludere deltakere på tvers av en rekke funksjonsnivåer, fra høytfungerende til lavtfungerende autisme, så vel som de med utviklingsprofiler og komorbide tilstander. Kontroller vil være fri for psykiatriske eller nevrologiske diagnoser og kroniske tilstander.

Beskrivelse

- Inklusjonskriterier: Autismespektrumforstyrrelse (ASD) eller autismelignende egenskaper: Individer som er diagnostisert med ASD basert på DSM-5 diagnostiske kriterier, eller de som viser betydelige autismetrekk uten en formell diagnose.

Sunn kontrollgruppe: Alders-, kjønns- og sosiodemografisk matchede individer uten noen psykiatrisk eller nevrologisk lidelse.

ASD-individer med varierende funksjonsnivå: Deltakere med ASD fra et bredt spekter av funksjonelle evner, fra høytfungerende til lavtfungerende autisme.

Komorbide tilstander: Inkludering av frivillige med utviklingsprofil og komorbide tilstander som ADHD og lærevansker.

Informert samtykke: Skriftlig informert samtykke fra deltakere over 18 år. For deltakere under 18 år, samtykke fra foreldre eller foresatte.

- Eksklusjonskriterier: Alvorlige psykotiske lidelser: Personer diagnostisert med tilstander som schizofreni eller schizoaffektiv lidelse.

Kjente genetiske syndromer eller kromosomale anomalier: Personer med genetiske tilstander som Downs syndrom eller Fragilt X-syndrom.

Historie om genetiske eller eksperimentelle terapier: Deltakere med tidligere gen- eller celleterapi, hyppige blodoverføringer eller benmargstransplantasjoner.

Alvorlige kommunikasjons- eller kognitive svekkelser: Deltakere med kommunikasjons- eller kognitive forstyrrelser som vil hindre deres evne til å delta i datainnsamling, eller de med aggressive atferdsforstyrrelser.

Ikke-overholdelse eller medisinske restriksjoner: Enkeltpersoner som ikke er i stand til å overholde studieprosedyrer eller medisinske tilstander som hindrer biologisk prøveinnsamling.

- Kontrollgruppe: Friske individer: Deltakere uten ASD eller noen psykiatriske eller nevrologiske lidelser.

Alders- og kjønnsmatching: Matchet med ASD-gruppen når det gjelder alder, kjønn og sosiodemografisk status.

Ingen historie med genetiske eller nevroutviklingsforstyrrelser: Personer uten genetiske syndromer, kromosomavvik eller nevroutviklingsforstyrrelser.

Ingen kronisk sykdomshistorie: Deltakere uten historie med kroniske sykdommer som kreft, autoimmune sykdommer eller metabolske tilstander.

Informert samtykke: Skriftlig informert samtykke fra personer over 18 år eller fra foreldre/foresatte for deltakere under 18 år.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
ASD Case Group
Representerer individer diagnostisert med autismespektrumforstyrrelse (ASD), som vil gjennomgå genetisk, epigenetisk og transkriptomisk analyse.
Kontrollgruppe
Representerer upåvirkede individer, og fungerer som sammenligningsgruppen for genetiske og molekylære analyser.
HOT Cluster Biomarker Group
Representerer deltakere valgt ut etter sekundære utfallsresultater basert på HOT-klyngeanalyse, som vil gjennomgå ELISA for å studere potensielle biomarkører avledet fra RNA-transkriptomveianalyse.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Avslutning av rekruttering av kliniske data
Tidsramme: Forventes å fullføre innen 24 måneder etter studiestart.
Det primære resultatet vil være rekruttering av individer diagnostisert med autismespektrumforstyrrelse (ASD) og upåvirkede kontroller. Omfattende kliniske, sosiodemografiske og fenotypiske data vil bli samlet inn, inkludert diagnostiske vurderinger ved bruk av standardiserte verktøy (f.eks. ADOS, SCQ).
Forventes å fullføre innen 24 måneder etter studiestart.

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Innsamling og fullføring av genetiske rådata (WGS og WGBS)
Tidsramme: Forventes å fullføre innen 30 måneder etter studiestart
Det sekundære resultatet fokuserer på innhenting av rå genetiske data fra helgenomsekvensering (WGS) og helgenombisulfittsekvensering (WGBS) fra blod- og neseprøver. Sekvenseringsdataene vil bli brukt til påfølgende genetiske og epigenetiske analyser for å identifisere varianter, metyleringsendringer og deres assosiasjoner til ASD.
Forventes å fullføre innen 30 måneder etter studiestart
Integrasjon av genetiske data
Tidsramme: Forventes å fullføre innen 60 måneder etter studiestart.
Dette resultatet måler integreringen av helgenomsekvensering (WGS), helgenombisulfittsekvensering (WGBS) og RNA-sekvensdata i et kombinert datasett for omfattende multi-omics-analyse. Målet er å avdekke genetiske og epigenetiske interaksjoner relatert til ASD.
Forventes å fullføre innen 60 måneder etter studiestart.

Andre resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Fullstendig (endelig) resultatmål: Assosiasjon mellom kliniske og genetiske data
Tidsramme: Forventes innen 66 måneder, etter at alle datainnsamlings- og analysestadier er fullført.
Det endelige resultatet vil vurdere korrelasjonen mellom genetiske, epigenetiske og transkriptomiske data med kliniske fenotyper. Dette resultatet tar sikte på å identifisere signifikante assosiasjoner som kan forklare den genetiske underbygningen av autismespektrumforstyrrelse, og bidra til potensielle biomarkører eller terapeutiske mål.
Forventes innen 66 måneder, etter at alle datainnsamlings- og analysestadier er fullført.

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Samarbeidspartnere

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Etterforskere

  • Studiestol: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Studieleder: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Studieleder: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Studieleder: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Studieleder: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Studieleder: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Antatt)

27. desember 2025

Primær fullføring (Antatt)

27. desember 2027

Studiet fullført (Antatt)

27. mai 2028

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

24. oktober 2024

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

24. oktober 2024

Først lagt ut (Faktiske)

29. oktober 2024

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

29. oktober 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

24. oktober 2024

Sist bekreftet

1. oktober 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Annen identifikator: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Annen identifikator: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

UBESLUTTE

IPD-planbeskrivelse

Foreløpig er ikke beslutningen om å dele individuelle deltakerdata (IPD) ferdigstilt. Etter fullføring av studien vil avgjørelsen bli gjennomgått og ferdigstilt i samsvar med gjeldende regulatoriske og etiske retningslinjer. Den endelige avgjørelsen vil være avhengig av å innhente tillatelse fra det tyrkiske byrået for legemidler og medisinsk utstyr (TİTCK), Etikkkomiteen og det tyrkiske helsedepartementet. Delingsplanen vil sikre at alle databeskyttelses- og personvernforskrifter følges strengt, og passende skritt vil bli tatt for å ivareta deltakernes konfidensialitet.

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere