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Indagine sulle cause genetiche e ambientali dell'autismo: uno studio multicentrico (ASD-Omics-TR)

24 ottobre 2024 aggiornato da: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Un approccio multicentrico multi-omico per lo studio dei meccanismi genetici ed epigenetici nel disturbo dello spettro autistico

L'obiettivo di questo studio osservazionale è quello di indagare i meccanismi genetici ed epigenetici che possono contribuire allo sviluppo del disturbo dello spettro autistico (ASD) in individui di diverse fasce di età. Lo studio mira a esplorare come le varianti genetiche e i fattori ambientali interagiscono per influenzare il rischio di ASD.

Le principali domande a cui si propone di rispondere sono:

  • Quali varianti genetiche sono più fortemente associate allo sviluppo dell’ASD?
  • In che modo i fattori ambientali, come l’esposizione prenatale, influenzano questi rischi genetici?
  • La combinazione di dati genetici ed epigenetici può migliorare la diagnosi precoce o le strategie di intervento per l’ASD?

I partecipanti:

  • Fornire campioni biologici per analisi genetiche ed epigenetiche.
  • Completare questionari dettagliati riguardanti le esposizioni ambientali e la storia familiare.
  • Partecipare a valutazioni cliniche per valutare la gravità dei sintomi dell’ASD.

I ricercatori confronteranno i dati genetici e ambientali tra gli individui con ASD e quelli senza il disturbo per capire come questi fattori possano contribuire al rischio di ASD. Questo studio multicentrico si svolgerà in diverse università e ospedali della Turchia, concentrandosi sulla potenziale interazione tra fattori genetici ereditari e influenze ambientali.

Panoramica dello studio

Stato

Non ancora reclutamento

Condizioni

Descrizione dettagliata

Introduzione al progetto Il progetto rappresenta uno studio innovativo e multicentrico volto a indagare le basi genetiche, epigenetiche e ambientali del disturbo dello spettro autistico (ASD). L’ASD è una condizione complessa dello sviluppo neurologico che si presenta tipicamente nella prima infanzia e colpisce gli individui in modi diversi, in particolare nella comunicazione e nel comportamento sociale. Il disturbo è caratterizzato da una significativa variabilità nella gravità dei sintomi e nella presentazione tra gli individui. Nonostante anni di ricerca, i meccanismi molecolari che guidano l’insorgenza e la progressione dell’ASD rimangono sfuggenti, rendendo la diagnosi e il trattamento difficili.

Questa ricerca mira a colmare questa lacuna utilizzando un approccio multi-omico per comprendere meglio i fattori biologici, genetici e ambientali che contribuiscono all’ASD. Attraverso l'integrazione di dati genomici, epigenomici e trascrittomici, il progetto cerca di scoprire le firme molecolari e le interazioni che potrebbero spiegare la variabilità nella presentazione e nella gravità dell'ASD. Inoltre, lo studio mira a identificare potenziali biomarcatori che potrebbero portare a una diagnosi più precoce, a una prognosi migliore e a opzioni di trattamento più personalizzate.

Lo studio sarà condotto in più centri di ricerca, con un approccio strutturato e ben coordinato alla raccolta dei dati, all’elaborazione dei campioni e all’analisi. Questo progetto multidisciplinare riunisce una vasta gamma di competenze, tra cui genetica, bioinformatica, psichiatria clinica e scienza dei dati, garantendo che tutti gli aspetti della ricerca siano affrontati con rigore e precisione scientifici. Analizzando campioni di individui affetti da ASD, il progetto fornirà nuove informazioni sui fattori genetici ed epigenetici coinvolti nell'ASD, studiando anche la potenziale influenza dei fattori ambientali.

Struttura multidipartimentale e integrità del progetto Il progetto è organizzato in più dipartimenti specializzati, ciascuno con un ruolo specifico nel mantenere l'integrità dello studio e garantire che tutte le attività di ricerca siano condotte secondo gli standard più elevati. Questa struttura consente una collaborazione continua tra i dipartimenti e garantisce che tutti i dati vengano raccolti, elaborati e analizzati con la massima accuratezza.

Coordinamento e supervisione generali Al livello più alto, il progetto è gestito da un coordinatore generale che supervisiona tutti gli aspetti della ricerca. Questo coordinatore garantisce che ciascun dipartimento rispetti gli obiettivi e la tempistica del progetto, favorendo la comunicazione tra i team e facilitando l'integrazione di dati clinici, genetici ed epigenetici. Il coordinamento garantisce che eventuali sfide emerse nel corso dello studio siano affrontate tempestivamente e che il progetto rimanga sulla buona strada per raggiungere i suoi obiettivi.

Il ruolo del coordinatore generale è fondamentale per garantire l'integrazione dei dati multi-omici provenienti dai vari centri di ricerca. Il coordinatore svolge anche un ruolo chiave nell'interpretazione dei dati, lavorando a stretto contatto con i team di analisi dei dati per garantire che i risultati siano coerenti e significativi. Aggiornamenti regolari vengono condivisi tra i dipartimenti per mantenere l'allineamento con gli obiettivi di ricerca generali del progetto.

Interventi Clinici: Unità Adulti e Pediatriche Gli interventi clinici del progetto sono suddivisi in due settori principali: adulti e pediatrici. Ogni settore è gestito da un team dedicato che supervisiona i centri clinici responsabili della raccolta dati. Questi centri clinici sono situati in varie regioni, consentendo al progetto di raccogliere una gamma ampia e diversificata di dati clinici da individui con diagnosi di ASD.

Ogni centro clinico segue protocolli standardizzati per la raccolta dei dati, garantendo che tutti i dati dei pazienti vengano raccolti in modo uniforme e coerente. Il processo di raccolta dei dati prevede l’uso di strumenti diagnostici riconosciuti a livello internazionale, tra cui l’Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) e il Social Communication Questionnaire (SCQ). Questi strumenti sono essenziali per diagnosticare l’ASD e per valutare la gravità dei sintomi.

Le operazioni cliniche prevedono anche la raccolta di dati sociodemografici, storie di sviluppo e informazioni sulle condizioni di comorbilità. Questi dati vengono raccolti attraverso questionari e interviste cliniche condotte da operatori sanitari qualificati. La raccolta di questo set di dati completo è fondamentale per comprendere l’eterogeneità clinica dell’ASD e per correlare i sintomi clinici con i dati genetici e ambientali.

Divisioni genetica e omica Le divisioni genetica e omica costituiscono il nucleo del progetto e forniscono i dati molecolari che verranno utilizzati per scoprire i meccanismi genetici ed epigenetici che guidano l'ASD. La divisione supervisiona la raccolta, il trattamento e l'analisi dei campioni biologici, che includono sangue venoso e tamponi nasali ottenuti dai partecipanti allo studio.

Raccolta ed elaborazione dei campioni I campioni biologici raccolti dai partecipanti vengono sottoposti a un processo rigoroso e standardizzato di estrazione dell'acido nucleico. Questo processo, gestito dai team di estrazione e purificazione degli acidi nucleici, prevede l’isolamento di DNA e RNA di alta qualità dai campioni di sangue e di tamponi nasali. Questi campioni sono essenziali per il sequenziamento e le analisi a valle. La qualità del DNA e dell'RNA estratti è fondamentale, poiché eventuali impurità o degradazione potrebbero influire sull'accuratezza delle analisi genetiche ed epigenetiche.

Una volta estratti, i campioni di DNA e RNA vengono sottoposti a molteplici controlli di qualità. Questi controlli sono supervisionati dai team di controllo qualità e conservazione, che garantiscono che gli acidi nucleici soddisfino gli standard richiesti per il sequenziamento. I campioni che superano i controlli di qualità vengono conservati in condizioni ottimali, preservandone l'integrità finché non sono pronti per essere sequenziati.

Analisi genomica L'analisi genomica dei campioni di DNA inizia con il sequenziamento dell'intero genoma (WGS), una tecnica completa che consente ai ricercatori di esaminare l'intero codice genetico di ciascun partecipante. WGS consente l'identificazione di un'ampia gamma di varianti genetiche, inclusi polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), variazioni del numero di copie (CNV), inserzioni ed eliminazioni (InDels) e varianti strutturali. Queste varianti vengono valutate per determinare il loro potenziale contributo all'ASD.

Una delle analisi primarie condotte all'interno della divisione genomica è lo studio di associazione sull'intero genoma (GWAS). GWAS viene utilizzato per identificare le varianti genetiche che sono significativamente associate all'ASD confrontando la frequenza delle varianti tra individui con ASD e quelli senza il disturbo. Questa analisi è particolarmente utile per identificare varianti genetiche comuni che possono contribuire al rischio di ASD.

Oltre al GWAS, il progetto conduce anche analisi quantitative dei tratti loci (QTL). L'analisi QTL esamina il modo in cui le varianti genetiche influenzano i tratti quantitativi correlati all'ASD, come la gravità dei sintomi, il funzionamento cognitivo o le tappe fondamentali dello sviluppo. Questo tipo di analisi aiuta a chiarire le basi genetiche della variabilità fenotipica nell’ASD e identifica varianti specifiche che possono contribuire alle differenze nella presentazione dei sintomi.

Analisi epigenetica La componente epigenetica del progetto si concentra sul modo in cui i fattori ambientali influenzano l'espressione genetica e contribuiscono al rischio di ASD. La metilazione del DNA è uno dei meccanismi epigenetici chiave studiati in questo progetto. Utilizzando il sequenziamento dell'intero genoma con bisolfito (WGBS), i ricercatori analizzano i modelli di metilazione del DNA nell'intero genoma. Il WGBS è considerato il gold standard per l'analisi della metilazione del DNA ad alta risoluzione, consentendo l'identificazione dei cambiamenti di metilazione associati all'ASD.

Le regioni differenzialmente metilate (DMR) sono regioni genomiche in cui i livelli di metilazione differiscono tra individui con ASD e controlli non affetti. Identificando questi DMR, i ricercatori possono individuare specifiche regioni genomiche in cui i fattori ambientali potrebbero influenzare l’espressione genetica negli individui con ASD.

Inoltre, in questo studio viene esplorata la metilazione allele specifica (ASM). L'analisi ASM indaga come differiscono i modelli di metilazione tra le due copie di un gene ereditato da ciascun genitore. Questa analisi aiuta i ricercatori a capire come i fattori genetici ed epigenetici interagiscono per influenzare l’espressione genetica e contribuire al rischio di ASD.

Come parte dell'analisi epigenetica, verrà condotta l'analisi m-QTL (methylation quantitative trait loci) per studiare la relazione tra varianti genetiche e modelli di metilazione del DNA nel genoma. Gli m-QTL sono loci genomici in cui le variazioni nella sequenza del DNA sono associate a differenze nei livelli di metilazione del DNA. Identificando questi loci, il progetto mira a scoprire come la variazione genetica influenza la regolazione epigenetica e, successivamente, come queste interazioni possono contribuire al rischio di sviluppare ASD. Questa analisi fornirà preziose informazioni sull’interazione tra fattori genetici ed epigenetici, contribuendo a chiarire i meccanismi molecolari alla base dell’ASD. Inoltre, i m-QTL possono servire come potenziali biomarcatori per comprendere la modulazione ambientale della suscettibilità genetica negli individui con ASD.

I dati epigenetici sono inoltre integrati con dati genetici per condurre studi di associazione su tutto l'epigenoma (EWAS). L'EWAS esamina il modo in cui i modelli di metilazione del DNA sono correlati all'ASD, con l'obiettivo di identificare i segni di metilazione che potrebbero fungere da biomarcatori per il disturbo. Queste analisi sono essenziali per comprendere come le esposizioni ambientali, come lo stress prenatale, le tossine o la salute materna, possano influenzare il rischio di ASD attraverso meccanismi epigenetici.

Analisi trascrittomica L'analisi trascrittomica si concentra sulla comprensione di come l'espressione genica differisce tra gli individui con ASD e quelli senza il disturbo. Il sequenziamento dell'RNA (RNA-seq) viene utilizzato per misurare i livelli di espressione genetica sia nei campioni di sangue che in quelli di tampone nasale. RNA-seq fornisce una visione completa del trascrittoma, che rappresenta l'insieme completo di trascrizioni di RNA presenti in una cellula o tessuto in un dato momento.

I dati RNA-seq vengono utilizzati per eseguire l'analisi dell'espressione genica differenziale (DGE), che identifica i geni che sono sovraregolati o sottoregolati negli individui con ASD. Questa analisi aiuta a scoprire i percorsi molecolari che vengono interrotti nell’ASD e evidenzia potenziali biomarcatori che potrebbero essere utilizzati per la diagnosi o il trattamento precoce.

Oltre a identificare i geni espressi in modo differenziale, i dati trascrittomici vengono utilizzati per eseguire l'analisi del percorso. L'analisi del percorso esamina il modo in cui i cambiamenti nell'espressione genica influenzano i processi biologici e le funzioni cellulari. Questa analisi può identificare i percorsi chiave che potrebbero essere interrotti nell’ASD, fornendo informazioni sui meccanismi biologici alla base del disturbo.

Confrontando i profili di espressione genetica dei campioni di sangue e di tampone nasale, i ricercatori possono identificare modelli di espressione specifici del tessuto. Questo confronto fornisce una comprensione più sfumata delle differenze molecolari tra i tessuti e può rivelare biomarcatori tessuto-specifici per l’ASD.

Analisi eQTL (Expression Quantitative Trait Loci).

Oltre all'analisi m-QTL, l'integrazione dell'analisi eQTL (expression quantitative trait loci) consentirà al progetto di identificare varianti genetiche che influenzano i livelli di espressione genetica. Gli eQTL sono loci in cui le variazioni genetiche sono correlate con i cambiamenti nell'espressione genica. Analizzando gli eQTL, lo studio può indagare su come specifiche varianti genetiche influenzano la trascrizione dei geni legati all’ASD. Questo approccio aiuta a scoprire percorsi regolatori e reti genetiche che contribuiscono alla variabilità dei sintomi dell’ASD. L’integrazione dell’analisi eQTL con i dati trascrittomici (come RNA-Seq) fornisce una comprensione sfumata di come i fattori di rischio genetici alterano l’espressione genica, influenzando in definitiva la manifestazione fenotipica dell’ASD.

Analisi epitrascrittomica

Oltre allo studio del DNA e dell'RNA attraverso la genomica e la trascrittomica, l'epitrascrittomica esplora le modificazioni post-trascrizionali dell'RNA, come la N6-metiladenosina (m6A). Queste modifiche dell’RNA possono avere un impatto sulla stabilità, sullo splicing, sul trasporto e sulla traduzione dell’mRNA, influenzando così la produzione di proteine ​​e la funzione cellulare. L’inclusione dell’analisi epitrascrittomica come parte del flusso di lavoro RNA-Seq offrirà approfondimenti su come le modifiche dell’RNA differiscono nei pazienti con ASD, fornendo un ulteriore livello di regolazione genetica che contribuisce alla complessità dell’ASD. Questa indagine potrebbe scoprire nuovi biomarcatori epitrascrittomici per l'ASD, aggiungendo profondità all'esplorazione dello studio sulla regolazione genetica a livello di RNA.

Integrazione dei dati e bioinformatica L'integrazione dei dati genomici, epigenomici e trascrittomici è una componente chiave del progetto. I team di bioinformatica e analisi dei dati sono responsabili dell'elaborazione e dell'analisi delle grandi quantità di dati generati dalle divisioni omiche. Ciò comporta l’uso di strumenti bioinformatici avanzati e modelli statistici per integrare i dati e scoprire modelli significativi.

Il set di dati integrato è sottoposto a modelli di regressione multivariata, che esaminano le interazioni tra varianti genetiche, modifiche epigenetiche e livelli di espressione genica. Questi modelli vengono utilizzati per identificare come questi fattori contribuiscono congiuntamente al rischio di ASD e alla gravità dei sintomi. Incorporando dati genetici e ambientali, i modelli possono anche esplorare le interazioni gene-ambiente che potrebbero svolgere un ruolo nello sviluppo dell’ASD.

L'analisi di rete è un altro strumento chiave utilizzato dal team di bioinformatica. Questa tecnica visualizza le interazioni tra geni, proteine ​​ed elementi regolatori, consentendo ai ricercatori di identificare i geni e i percorsi chiave che potrebbero essere coinvolti nell’ASD. L’analisi di rete aiuta anche a scoprire le reti di regolazione genetica che potrebbero essere interrotte negli individui con ASD, fornendo informazioni sui meccanismi molecolari che guidano il disturbo.

Il progetto sfrutta anche algoritmi di machine learning (ML) e intelligenza artificiale (AI) per analizzare i dati. Questi modelli predittivi sono progettati per assistere i medici nel prendere decisioni terapeutiche personalizzate in base al profilo molecolare di ciascun paziente. Ad esempio, i modelli di intelligenza artificiale possono essere utilizzati per prevedere la gravità dei sintomi dell’ASD sulla base di dati genetici, epigenetici e clinici, consentendo interventi più mirati.

Analisi Hi-C e in silico:

Mentre l’analisi Hi-C tradizionale utilizza spesso reticolanti per catturare le interazioni della cromatina a lungo raggio, questo progetto adotterà un approccio distinto rinunciando all’uso di reticolanti per collegare specifici frammenti di DNA. Invece, i dati sull'interazione della cromatina verranno derivati ​​e rivisitati in silico dopo l'integrazione dei dati. Analizzando computazionalmente l'architettura della cromatina 3D, il progetto mirerà a identificare le interazioni cromatiniche spaziali che contribuiscono alla regolazione dei geni associati all'ASD.

Questo approccio post-integrazione consente l'identificazione di elementi regolatori, come potenziatori e promotori, che interagiscono con regioni genomiche distanti nel contesto dell'ASD. I dati generati dalle analisi genomiche, epigenomiche e trascrittomiche saranno integrati per rivelare modelli di interazione della cromatina che influenzano l'espressione genica, in particolare quelli associati alla patologia ASD. Questa strategia consentirà una comprensione più flessibile e raffinata dell'organizzazione del genoma 3D senza le limitazioni imposte dai metodi basati sui reticolanti.

Analisi della patogenesi epigenetica ChIP-Seq e in-silico:

Oltre alla mappatura dell'interazione della cromatina, i dati ChIP-Seq verranno utilizzati per l'analisi della patogenesi epigenetica. Eseguendo l'analisi in silico dei risultati ChIP-Seq, il progetto identificherà le modifiche degli istoni e i siti di legame dei fattori di trascrizione coinvolti nella regolazione dell'espressione genica nell'ASD. Questa tecnica aiuterà a chiarire il ruolo di specifici segni epigenetici, come l'acetilazione e la metilazione degli istoni, nella disregolazione dei geni associati all'ASD.

L'integrazione dei dati ChIP-Seq con altri dati omici, inclusi i profili di metilazione del DNA (WGBS) e di espressione RNA-Seq, fornirà una visione completa delle reti regolatorie che guidano l'ASD. Ciò consentirà ai ricercatori di individuare meccanismi regolatori specifici, come l’attività alterata dei fattori di trascrizione o i cambiamenti nell’accessibilità della cromatina, che potrebbero contribuire all’insorgenza o alla gravità dei sintomi dell’ASD. L'analisi in silico dei risultati ChIP-Seq fungerà quindi da potente strumento per comprendere il panorama epigenetico associato alla patogenesi dell'ASD.

Il progetto può migliorare ulteriormente la sua analisi calcolando i punteggi di rischio poligenico (PRS), che quantificano l’effetto cumulativo di numerose varianti genetiche di piccolo effetto sul rischio di sviluppare ASD. Aggregando dati provenienti da migliaia di varianti genetiche, la PRS può prevedere la predisposizione genetica complessiva di un individuo all’ASD. Questi punteggi possono quindi essere correlati con dati clinici e fenotipici per comprendere meglio come il rischio genetico si traduce in sintomi osservabili. La PRS può anche essere integrata con dati ambientali ed epigenetici per esplorare le interazioni gene-ambiente, offrendo un modello completo di suscettibilità all’ASD.

Controllo di qualità e conformità Mantenere l'integrità del progetto è fondamentale e ciò si ottiene attraverso rigorose misure di controllo della qualità e un quadro di conformità completo. Il progetto comprende diversi dipartimenti dedicati a garantire che tutte le attività di ricerca rispettino le linee guida etiche e gli standard normativi.

Il dipartimento di gestione del rischio svolge un ruolo cruciale nell’identificare e mitigare i potenziali rischi che potrebbero compromettere l’integrità dello studio. Questo dipartimento lavora a stretto contatto con i team di audit interno e di conformità etica per garantire che tutte le attività di ricerca rispettino gli standard etici, come la Dichiarazione di Helsinki e le normative nazionali per la protezione dei dati personali.

I team di controllo qualità sono responsabili del monitoraggio della qualità dei campioni biologici e della garanzia che tutti i dati siano accurati e affidabili. Questi team eseguono audit regolari e implementano azioni correttive e preventive (CAPA) quando necessario per affrontare eventuali problemi che emergono durante il corso dello studio.

Il dipartimento di documentazione e archiviazione è responsabile della gestione di tutti i record del progetto, inclusi i rapporti di audit, i registri di trasferimento dei dati e i record di conformità. Questo dipartimento garantisce che tutta la documentazione relativa al progetto sia archiviata in modo sicuro e facilmente accessibile per la revisione, facilitando la trasparenza e la responsabilità.

Il progetto comprende anche un team di gestione degli approvvigionamenti e della catena di fornitura, responsabile di garantire che tutti i materiali, le attrezzature e i reagenti necessari siano approvvigionati in modo tempestivo. Questo team gestisce la logistica dei trasferimenti di materiale e garantisce che tutte le forniture soddisfino gli standard di qualità richiesti.

Considerazioni etiche e sicurezza dei partecipanti La sicurezza e la privacy dei partecipanti sono fondamentali nella conduzione dello studio. Tutti i dati dei partecipanti vengono resi anonimi e archiviati in modo sicuro per proteggerne la riservatezza. Il progetto aderisce alle normative nazionali e internazionali in materia di protezione dei dati personali, garantendo in ogni momento il rispetto dei diritti dei partecipanti.

Il consenso informato viene ottenuto da tutti i partecipanti prima che siano arruolati nello studio. Ai partecipanti vengono fornite informazioni dettagliate sugli obiettivi, sulle procedure e sui potenziali rischi dello studio. Sono inoltre informati del loro diritto di recedere dallo studio in qualsiasi momento senza alcuna penalità.

Lo studio ha ricevuto l'approvazione etica dai competenti comitati etici nazionali, garantendo che tutte le attività di ricerca siano conformi alle linee guida etiche stabilite. Vengono condotti controlli regolari per garantire che tutte le procedure siano seguite correttamente e che eventuali preoccupazioni etiche siano affrontate tempestivamente.

Integrazione e visualizzazione dei dati Al termine dello studio, tutti i dati delle analisi genomiche, epigenomiche e trascrittomiche saranno integrati e visualizzati utilizzando strumenti bioinformatici all'avanguardia. Il set di dati integrato fornirà una visione completa dei meccanismi molecolari alla base dell'ASD, consentendo ai ricercatori di identificare biomarcatori chiave e potenziali bersagli terapeutici.

I dati integrati saranno presentati attraverso varie tecniche di visualizzazione, come mappe di calore, mappe di rete e diagrammi di percorso. Queste visualizzazioni aiuteranno i ricercatori a interpretare i dati e a trarre conclusioni significative sui processi biologici coinvolti nell’ASD.

Conclusione Questo progetto è uno studio fondamentale nel campo della ricerca sull'ASD, che utilizza un approccio multi-omico per scoprire i fattori genetici, epigenetici e ambientali che contribuiscono al disturbo. La struttura multidisciplinare del progetto, con team dedicati alle operazioni cliniche, all'analisi dei dati, al controllo di qualità e alla conformità, garantisce che la ricerca sia condotta con il massimo livello di rigore scientifico.

Integrando dati genomici, epigenomici e trascrittomici, il progetto mira a fornire nuove informazioni sui meccanismi molecolari alla base dell'ASD e a identificare potenziali biomarcatori per la diagnosi e il trattamento. I risultati di questo studio potrebbero aprire la strada ad approcci di medicina personalizzata contro l’ASD, migliorando la qualità della vita delle persone affette da questo disturbo.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

3000

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

  • Tacchino
      • Afyonkarahisar, Tacchino
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Tacchino
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Tacchino
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
          • Numero di telefono: 00905428917627
          • Email: ysmn.ts@gmail.com
        • Contatto:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Tacchino
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Tacchino
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Tacchino
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Tacchino
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Tacchino
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Tacchino
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Tacchino
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
      • Istanbul, Tacchino
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Tacchino
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Aynur Görmez, MD.
      • Istanbul, Tacchino
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Tacchino
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Gonca Özyurt, MD.
      • Konya, Tacchino
        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Tacchino
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
        • Contatto:
        • Contatto:
        • Contatto:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
        • Contatto:
          • Ali TORABI, MD.,Ph.D.
        • Contatto:
          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
      • Trabzon, Tacchino
        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
      • Şanlıurfa, Tacchino
        • Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
    • Selçuklu
      • Konya, Selçuklu, Tacchino, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Tacchino, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Contatto:
        • Contatto:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

Sì

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

La popolazione dello studio sarà composta da individui con diagnosi di disturbo dello spettro autistico (ASD) o che presentano tratti simili all'autismo, selezionati da centri clinici specializzati in disturbi dello sviluppo neurologico. La popolazione includerà anche un gruppo di controllo sano, abbinato per età, sesso e variabili socio-demografiche, reclutato dalla comunità generale. La coorte ASD includerà partecipanti di una vasta gamma di livelli funzionali, dall’autismo ad alto funzionamento a quello a basso funzionamento, nonché quelli con profili di sviluppo e condizioni di comorbidità. I controlli saranno esenti da diagnosi psichiatriche o neurologiche e da condizioni croniche.

Descrizione

- Criteri di inclusione: Disturbo dello spettro autistico (ASD) o tratti simili all'autismo: individui con diagnosi di ASD sulla base dei criteri diagnostici del DSM-5 o coloro che mostrano tratti autistici significativi senza una diagnosi formale.

Gruppo di controllo sano: individui corrispondenti per età, sesso e socio-demografica senza alcun disturbo psichiatrico o neurologico.

Individui con ASD di diversi livelli funzionali: partecipanti con ASD provenienti da un'ampia gamma di abilità funzionali, dall'autismo ad alto funzionamento a quello a basso funzionamento.

Condizioni di comorbilità: inclusione di volontari con profili di sviluppo e condizioni di comorbilità come ADHD e difficoltà di apprendimento.

Consenso informato: consenso informato scritto dei partecipanti di età superiore ai 18 anni. Per i partecipanti sotto i 18 anni, consenso dei genitori o dei tutori legali.

- Criteri di esclusione: Disturbi psicotici gravi: individui con diagnosi di condizioni come la schizofrenia o il disturbo schizoaffettivo.

Sindromi genetiche note o anomalie cromosomiche: individui con condizioni genetiche come la sindrome di Down o la sindrome dell'X fragile.

Storia di terapie genetiche o sperimentali: partecipanti con precedente terapia genica o cellulare, frequenti trasfusioni di sangue o trapianti di midollo osseo.

Gravi disturbi comunicativi o cognitivi: partecipanti con disturbi comunicativi o cognitivi che ostacolerebbero la loro capacità di partecipare alla raccolta dei dati o quelli con disturbi comportamentali aggressivi.

Non conformità o restrizioni mediche: individui incapaci di rispettare le procedure dello studio o con condizioni mediche che impediscono la raccolta di campioni biologici.

- Gruppo di controllo: Individui sani: partecipanti senza ASD o disturbi psichiatrici o neurologici.

Abbinamento per età e genere: abbinato al gruppo ASD in termini di età, sesso e stato socio-demografico.

Nessuna storia di disturbi genetici o dello sviluppo neurologico: individui senza sindromi genetiche, anomalie cromosomiche o disturbi dello sviluppo neurologico.

Nessuna storia di malattie croniche: partecipanti senza storia di malattie croniche come cancro, malattie autoimmuni o condizioni metaboliche.

Consenso informato: consenso informato scritto da parte di individui di età superiore a 18 anni o di genitori/tutori legali per i partecipanti di età inferiore a 18 anni.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Gruppo di casi ASD
Rappresenta gli individui con diagnosi di disturbo dello spettro autistico (ASD), che saranno sottoposti ad analisi genetica, epigenetica e trascrittomica.
Gruppo di controllo
Rappresenta individui non affetti e funge da gruppo di confronto per analisi genetiche e molecolari.
Gruppo di biomarcatori HOT Cluster
Rappresenta i partecipanti selezionati dopo i risultati dei risultati secondari basati sull'analisi dei cluster HOT, che saranno sottoposti a ELISA per studiare potenziali biomarcatori derivati ​​dall'analisi del percorso del trascrittoma dell'RNA.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Finalizzazione del reclutamento dei dati clinici
Lasso di tempo: Il completamento è previsto entro 24 mesi dall'inizio dello studio.
L'esito primario sarà il reclutamento di individui con diagnosi di disturbo dello spettro autistico (ASD) e di controlli non affetti. Verranno raccolti dati clinici, sociodemografici e fenotipici completi, comprese valutazioni diagnostiche utilizzando strumenti standardizzati (ad esempio ADOS, SCQ).
Il completamento è previsto entro 24 mesi dall'inizio dello studio.

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Raccolta e completamento dei dati grezzi genetici (WGS e WGBS)
Lasso di tempo: Il completamento è previsto entro 30 mesi dall'inizio dello studio
L'esito secondario si concentra sull'acquisizione di dati genetici grezzi dal sequenziamento dell'intero genoma (WGS) e dal sequenziamento dell'intero genoma con bisolfito (WGBS) da campioni di sangue e tamponi nasali. I dati di sequenziamento verranno utilizzati per successive analisi genetiche ed epigenetiche per identificare varianti, cambiamenti di metilazione e le loro associazioni con l'ASD.
Il completamento è previsto entro 30 mesi dall'inizio dello studio
Integrazione dei dati genetici
Lasso di tempo: Il completamento è previsto entro 60 mesi dall'inizio dello studio.
Questo risultato misura l'integrazione del sequenziamento dell'intero genoma (WGS), del sequenziamento dell'intero genoma con bisolfito (WGBS) e dei dati RNA-seq in un set di dati combinato per un'analisi multi-omica completa. L’obiettivo è scoprire le interazioni genetiche ed epigenetiche legate all’ASD.
Il completamento è previsto entro 60 mesi dall'inizio dello studio.

Altre misure di risultato

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Misura del risultato completo (finale): associazione tra dati clinici e genetici
Lasso di tempo: Previsto entro 66 mesi, una volta completate tutte le fasi di raccolta e analisi dei dati.
Il risultato finale valuterà la correlazione tra dati genetici, epigenetici e trascrittomici con fenotipi clinici. Questo risultato mira a identificare associazioni significative che potrebbero spiegare le basi genetiche del disturbo dello spettro autistico, contribuendo a potenziali biomarcatori o bersagli terapeutici.
Previsto entro 66 mesi, una volta completate tutte le fasi di raccolta e analisi dei dati.

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Collaboratori

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Investigatori

  • Cattedra di studio: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Direttore dello studio: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Direttore dello studio: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Direttore dello studio: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Direttore dello studio: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Direttore dello studio: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Stimato)

27 dicembre 2025

Completamento primario (Stimato)

27 dicembre 2027

Completamento dello studio (Stimato)

27 maggio 2028

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

24 ottobre 2024

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

24 ottobre 2024

Primo Inserito (Effettivo)

29 ottobre 2024

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

29 ottobre 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

24 ottobre 2024

Ultimo verificato

1 ottobre 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Altro identificatore: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Altro identificatore: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Descrizione del piano IPD

Al momento, la decisione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD) non è stata finalizzata. Al termine dello studio, la decisione sarà rivista e finalizzata in conformità con le linee guida normative ed etiche applicabili. La decisione finale sarà soggetta all'ottenimento dell'autorizzazione da parte dell'Agenzia turca per i medicinali e i dispositivi medici (TİTCK), del Comitato etico e del Ministero della sanità turco. Il piano di condivisione garantirà che tutte le norme sulla protezione dei dati e sulla privacy siano rigorosamente seguite e che verranno adottate misure adeguate per salvaguardare la riservatezza dei partecipanti.

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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