- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT06662591
Untersuchung der genetischen und umweltbedingten Ursachen von Autismus: eine multizentrische Studie (ASD-Omics-TR)
Ein multizentrischer Multi-Omics-Ansatz zur Untersuchung genetischer und epigenetischer Mechanismen bei Autismus-Spektrum-Störungen
Ziel dieser Beobachtungsstudie ist es, die genetischen und epigenetischen Mechanismen zu untersuchen, die zur Entwicklung der Autismus-Spektrum-Störung (ASD) bei Personen verschiedener Altersgruppen beitragen können. Die Studie zielt darauf ab, zu untersuchen, wie genetische Varianten und Umweltfaktoren zusammenwirken, um das ASD-Risiko zu beeinflussen.
Die wichtigsten Fragen, die beantwortet werden sollen, sind:
- Welche genetischen Varianten sind am stärksten mit der Entwicklung von ASD verbunden?
- Wie beeinflussen Umweltfaktoren, wie zum Beispiel pränatale Exposition, diese genetischen Risiken?
- Kann die Kombination genetischer und epigenetischer Daten die Früherkennung oder Interventionsstrategien für ASD verbessern?
Die Teilnehmer werden:
- Bereitstellung biologischer Proben für genetische und epigenetische Analysen.
- Füllen Sie detaillierte Fragebögen zu Umweltbelastungen und Familiengeschichte aus.
- Nehmen Sie an klinischen Untersuchungen teil, um die Schwere der ASD-Symptome zu beurteilen.
Forscher werden genetische und umweltbedingte Daten zwischen Personen mit Autismus-Störung und solchen ohne diese Störung vergleichen, um zu verstehen, wie diese Faktoren zum Risiko einer Autismus-Störung beitragen können. Diese multizentrische Studie wird an mehreren Universitäten und Krankenhäusern in der Türkei durchgeführt und konzentriert sich auf das mögliche Zusammenspiel zwischen vererbten genetischen Faktoren und Umwelteinflüssen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Einführung in das Projekt Das Projekt stellt eine innovative, multizentrische Studie dar, die darauf abzielt, die genetischen, epigenetischen und umweltbedingten Grundlagen der Autismus-Spektrum-Störung (ASD) zu untersuchen. ASD ist eine komplexe neurologische Entwicklungsstörung, die typischerweise in der frühen Kindheit auftritt und den Einzelnen auf unterschiedliche Weise beeinträchtigt, insbesondere in der sozialen Kommunikation und im Verhalten. Die Störung zeichnet sich durch eine erhebliche Variabilität in der Symptomschwere und -präsentation zwischen den einzelnen Personen aus. Trotz jahrelanger Forschung sind die molekularen Mechanismen, die den Beginn und das Fortschreiten von ASD vorantreiben, immer noch unklar, was Diagnose und Behandlung zu einer Herausforderung macht.
Diese Forschung zielt darauf ab, diese Lücke zu schließen, indem ein Multi-Omics-Ansatz verwendet wird, um die biologischen, genetischen und umweltbedingten Faktoren, die zu ASD beitragen, besser zu verstehen. Durch die Integration genomischer, epigenomischer und transkriptomischer Daten versucht das Projekt, molekulare Signaturen und Interaktionen aufzudecken, die die Variabilität in der Präsentation und dem Schweregrad von ASD erklären könnten. Darüber hinaus zielt die Studie darauf ab, potenzielle Biomarker zu identifizieren, die zu einer früheren Diagnose, einer besseren Prognose und personalisierteren Behandlungsoptionen führen könnten.
Die Studie wird in mehreren Forschungszentren durchgeführt, mit einem strukturierten und gut koordinierten Ansatz für die Datenerfassung, Probenverarbeitung und Analyse. Dieses multidisziplinäre Projekt vereint eine Reihe von Fachkenntnissen, darunter Genetik, Bioinformatik, klinische Psychiatrie und Datenwissenschaft, und stellt sicher, dass alle Aspekte der Forschung mit wissenschaftlicher Genauigkeit und Präzision angegangen werden. Durch die Analyse von Proben von Personen mit ASD wird das Projekt neue Einblicke in die genetischen und epigenetischen Faktoren liefern, die bei ASD eine Rolle spielen, und gleichzeitig den möglichen Einfluss von Umweltfaktoren untersuchen.
Abteilungsübergreifende Struktur und Projektintegrität Das Projekt ist in mehrere Fachabteilungen unterteilt, von denen jede eine spezifische Rolle bei der Wahrung der Integrität der Studie und der Sicherstellung, dass alle Forschungsaktivitäten nach höchsten Standards durchgeführt werden, spielt. Diese Struktur ermöglicht eine nahtlose Zusammenarbeit zwischen den Abteilungen und stellt sicher, dass alle Daten mit höchster Genauigkeit erfasst, verarbeitet und analysiert werden.
Gesamtkoordination und Aufsicht Auf höchster Ebene wird das Projekt von einem Gesamtkoordinator geleitet, der alle Aspekte der Forschung überwacht. Dieser Koordinator stellt sicher, dass jede Abteilung die Ziele und den Zeitplan des Projekts einhält, fördert die Kommunikation zwischen den Teams und erleichtert die Integration klinischer, genetischer und epigenetischer Daten. Durch die Koordination wird sichergestellt, dass alle im Verlauf der Studie auftretenden Herausforderungen umgehend angegangen werden und das Projekt auf dem richtigen Weg bleibt, um seine Ziele zu erreichen.
Die Rolle des Gesamtkoordinators ist entscheidend für die Integration der Multi-Omics-Daten der verschiedenen Forschungszentren. Der Koordinator spielt auch eine Schlüsselrolle bei der Interpretation der Daten und arbeitet eng mit den Datenanalyseteams zusammen, um sicherzustellen, dass die Ergebnisse kohärent und aussagekräftig sind. Regelmäßige Aktualisierungen werden abteilungsübergreifend ausgetauscht, um die Übereinstimmung mit den übergeordneten Forschungszielen des Projekts sicherzustellen.
Klinischer Betrieb: Erwachsenen- und Kinderabteilung Der klinische Betrieb des Projekts ist in zwei Hauptbereiche unterteilt: Erwachsenen- und Kinderabteilung. Jeder Sektor wird von einem engagierten Team verwaltet, das die für die Datenerfassung verantwortlichen klinischen Zentren überwacht. Diese klinischen Zentren sind über verschiedene Regionen verteilt und ermöglichen es dem Projekt, ein breites und vielfältiges Spektrum klinischer Daten von Personen zu sammeln, bei denen ASD diagnostiziert wurde.
Jedes klinische Zentrum befolgt standardisierte Protokolle zur Datenerfassung, um sicherzustellen, dass alle Patientendaten auf einheitliche und konsistente Weise erfasst werden. Der Datenerfassungsprozess umfasst den Einsatz international anerkannter Diagnosetools, einschließlich des Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) und des Social Communication Questionnaire (SCQ). Diese Tools sind für die Diagnose von ASD und die Beurteilung der Schwere der Symptome unerlässlich.
Die klinischen Operationen umfassen auch die Erhebung soziodemografischer Daten, Entwicklungsgeschichten und Informationen zu komorbiden Erkrankungen. Diese Daten werden durch Fragebögen und klinische Interviews gesammelt, die von geschulten medizinischen Fachkräften durchgeführt werden. Die Sammlung dieses umfassenden Datensatzes ist entscheidend für das Verständnis der klinischen Heterogenität von ASD und für die Korrelation klinischer Symptome mit genetischen und Umweltdaten.
Die Abteilungen Genetik und Omics Die Abteilungen Genetik und Omics bilden den Kern des Projekts und liefern die molekularen Daten, die zur Aufdeckung der genetischen und epigenetischen Mechanismen verwendet werden, die ASD antreiben. Die Abteilung überwacht die Sammlung, Verarbeitung und Analyse biologischer Proben, darunter venöses Blut und Nasenabstriche von Studienteilnehmern.
Probenentnahme und -verarbeitung Die von den Teilnehmern gesammelten biologischen Proben durchlaufen einen strengen und standardisierten Prozess der Nukleinsäureextraktion. Dieser von den Nukleinsäureextraktions- und -reinigungsteams verwaltete Prozess umfasst die Isolierung hochwertiger DNA und RNA aus den Blut- und Nasenabstrichproben. Diese Proben sind für die nachfolgende Sequenzierung und Analyse unerlässlich. Die Qualität der extrahierten DNA und RNA ist von entscheidender Bedeutung, da jegliche Verunreinigungen oder Abbau die Genauigkeit der genetischen und epigenetischen Analysen beeinträchtigen könnte.
Nach der Extraktion werden die DNA- und RNA-Proben mehreren Qualitätskontrollen unterzogen. Diese Kontrollen werden von den Qualitätskontroll- und Lagerteams überwacht, die sicherstellen, dass die Nukleinsäuren den erforderlichen Standards für die Sequenzierung entsprechen. Proben, die die Qualitätskontrolle bestehen, werden unter optimalen Bedingungen gelagert und bewahren ihre Integrität, bis sie zur Sequenzierung bereit sind.
Genomanalyse Die Genomanalyse von DNA-Proben beginnt mit der Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS), einer umfassenden Technik, die es Forschern ermöglicht, den gesamten genetischen Code jedes Teilnehmers zu untersuchen. WGS ermöglicht die Identifizierung einer Vielzahl genetischer Varianten, einschließlich Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs), Kopienzahlvariationen (CNVs), Insertionen und Deletionen (InDels) sowie Strukturvarianten. Diese Varianten werden bewertet, um ihren potenziellen Beitrag zur ASD zu bestimmen.
Eine der primären Analysen, die innerhalb der Genomabteilung durchgeführt werden, ist die genomweite Assoziationsstudie (GWAS). GWAS wird verwendet, um genetische Varianten zu identifizieren, die signifikant mit ASD assoziiert sind, indem die Häufigkeit von Varianten zwischen Personen mit ASD und solchen ohne diese Störung verglichen wird. Diese Analyse ist besonders nützlich, um häufige genetische Varianten zu identifizieren, die zum ASD-Risiko beitragen können.
Zusätzlich zu GWAS führt das Projekt auch quantitative Trait-Locus-Analysen (QTL) durch. Die QTL-Analyse untersucht, wie genetische Varianten quantitative Merkmale im Zusammenhang mit ASD beeinflussen, wie z. B. die Schwere der Symptome, kognitive Funktionen oder Entwicklungsmeilensteine. Diese Art der Analyse hilft, die genetische Grundlage für die phänotypische Variabilität bei ASD aufzuklären und spezifische Varianten zu identifizieren, die zu Unterschieden in der Symptomdarstellung beitragen können.
Epigenetische Analyse Die epigenetische Komponente des Projekts konzentriert sich darauf, wie Umweltfaktoren die Genexpression beeinflussen und zum ASD-Risiko beitragen. Die DNA-Methylierung ist einer der wichtigsten epigenetischen Mechanismen, die in diesem Projekt untersucht werden. Mithilfe der Bisulfit-Sequenzierung des gesamten Genoms (WGBS) analysieren Forscher DNA-Methylierungsmuster im gesamten Genom. WGBS gilt als Goldstandard für hochauflösende DNA-Methylierungsanalysen und ermöglicht die Identifizierung von Methylierungsänderungen, die mit ASD verbunden sind.
Differenziell methylierte Regionen (DMRs) sind genomische Regionen, in denen sich die Methylierungsniveaus zwischen Personen mit ASD und nicht betroffenen Kontrollpersonen unterscheiden. Durch die Identifizierung dieser DMRs können Forscher spezifische Genomregionen lokalisieren, in denen Umweltfaktoren die Genexpression bei Personen mit ASD beeinflussen könnten.
Darüber hinaus wird in dieser Studie die allelspezifische Methylierung (ASM) untersucht. Die ASM-Analyse untersucht, wie sich die Methylierungsmuster zwischen den beiden Kopien eines von jedem Elternteil geerbten Gens unterscheiden. Diese Analyse hilft Forschern zu verstehen, wie genetische und epigenetische Faktoren zusammenwirken, um die Genexpression zu beeinflussen und zum ASD-Risiko beizutragen.
Im Rahmen der epigenetischen Analyse wird eine m-QTL-Analyse (Methylation Quantitative Trait Loci) durchgeführt, um die Beziehung zwischen genetischen Varianten und DNA-Methylierungsmustern im gesamten Genom zu untersuchen. m-QTLs sind genomische Loci, bei denen Variationen in der DNA-Sequenz mit Unterschieden im DNA-Methylierungsgrad verbunden sind. Durch die Identifizierung dieser Loci möchte das Projekt herausfinden, wie genetische Variation die epigenetische Regulation beeinflusst und wie diese Interaktionen anschließend zum Risiko der Entwicklung von ASD beitragen können. Diese Analyse wird wertvolle Einblicke in das Zusammenspiel genetischer und epigenetischer Faktoren liefern und dabei helfen, die molekularen Mechanismen aufzuklären, die ASD zugrunde liegen. Darüber hinaus könnten m-QTLs als potenzielle Biomarker für das Verständnis der umweltbedingten Modulation der genetischen Anfälligkeit bei Personen mit ASD dienen.
Die epigenetischen Daten werden auch mit genetischen Daten integriert, um epigenomweite Assoziationsstudien (EWAS) durchzuführen. EWAS untersucht, wie DNA-Methylierungsmuster mit ASD korrelieren, mit dem Ziel, Methylierungsmarkierungen zu identifizieren, die als Biomarker für die Störung dienen könnten. Diese Analysen sind unerlässlich, um zu verstehen, wie Umweltbelastungen wie pränataler Stress, Toxine oder die Gesundheit von Müttern das ASD-Risiko durch epigenetische Mechanismen beeinflussen können.
Transkriptomische Analyse Die transkriptomische Analyse konzentriert sich auf das Verständnis, wie sich die Genexpression zwischen Personen mit ASD und solchen ohne diese Störung unterscheidet. Mithilfe der RNA-Sequenzierung (RNA-seq) werden die Genexpressionsniveaus sowohl in Blut- als auch in Nasenabstrichproben gemessen. RNA-seq bietet einen umfassenden Überblick über das Transkriptom, das den vollständigen Satz von RNA-Transkripten darstellt, die zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer Zelle oder einem Gewebe vorhanden sind.
Die RNA-seq-Daten werden zur Durchführung einer differenziellen Genexpressionsanalyse (DGE) verwendet, die Gene identifiziert, die bei Personen mit ASD entweder hoch- oder herunterreguliert sind. Diese Analyse hilft, die molekularen Signalwege aufzudecken, die bei ASD gestört sind, und zeigt potenzielle Biomarker auf, die für eine frühzeitige Diagnose oder Behandlung verwendet werden könnten.
Zusätzlich zur Identifizierung unterschiedlich exprimierter Gene werden die transkriptomischen Daten zur Durchführung einer Signalweganalyse verwendet. Die Pathway-Analyse untersucht, wie sich Veränderungen der Genexpression auf biologische Prozesse und Zellfunktionen auswirken. Diese Analyse kann wichtige Signalwege identifizieren, die bei ASD gestört sein können, und liefert Einblicke in die biologischen Mechanismen, die der Störung zugrunde liegen.
Durch den Vergleich der Genexpressionsprofile von Blut- und Nasenabstrichproben können Forscher gewebespezifische Expressionsmuster identifizieren. Dieser Vergleich liefert ein differenzierteres Verständnis der molekularen Unterschiede zwischen Geweben und kann gewebespezifische Biomarker für ASD aufdecken.
eQTL-Analyse (Expression Quantitative Trait Loci).
Zusätzlich zur m-QTL-Analyse wird die Integration der eQTL-Analyse (Expression Quantitative Trait Loci) es dem Projekt ermöglichen, genetische Varianten zu identifizieren, die die Genexpressionsniveaus beeinflussen. eQTLs sind Orte, an denen genetische Variationen mit Veränderungen der Genexpression korrelieren. Durch die Analyse von eQTLs kann die Studie untersuchen, wie bestimmte genetische Varianten die Transkription von Genen im Zusammenhang mit ASD beeinflussen. Dieser Ansatz hilft dabei, regulatorische Wege und Gennetzwerke aufzudecken, die zur Variabilität der ASD-Symptome beitragen. Die Integration der eQTL-Analyse mit transkriptomischen Daten (wie RNA-Seq) ermöglicht ein differenziertes Verständnis darüber, wie genetische Risikofaktoren die Genexpression verändern und sich letztendlich auf die phänotypische Manifestation von ASD auswirken.
Epitranskriptomische Analyse
Über die Untersuchung von DNA und RNA durch Genomik und Transkriptomik hinaus erforscht die Epitranskriptomik posttranskriptionelle Modifikationen von RNA, wie z. B. N6-Methyladenosin (m6A). Diese RNA-Modifikationen können die mRNA-Stabilität, das Spleißen, den Transport und die Translation beeinflussen und somit die Proteinproduktion und Zellfunktion beeinflussen. Die Einbeziehung der epitranskriptomischen Analyse als Teil des RNA-Seq-Workflows wird Erkenntnisse darüber liefern, wie sich RNA-Modifikationen bei ASD-Patienten unterscheiden, und eine zusätzliche Ebene der Genregulation bereitstellen, die zur Komplexität von ASD beiträgt. Diese Untersuchung könnte neue epitranskriptomische Biomarker für ASD aufdecken und so die Untersuchung der Genregulation auf RNA-Ebene vertiefen.
Datenintegration und Bioinformatik Die Integration der genomischen, epigenomischen und transkriptomischen Daten ist ein zentraler Bestandteil des Projekts. Die Bioinformatik- und Datenanalyseteams sind für die Verarbeitung und Analyse der riesigen Datenmengen verantwortlich, die von den Omics-Abteilungen generiert werden. Dies erfordert den Einsatz fortschrittlicher Bioinformatik-Tools und statistischer Modelle, um die Daten zu integrieren und aussagekräftige Muster aufzudecken.
Der integrierte Datensatz wird multivariaten Regressionsmodellen unterzogen, die die Wechselwirkungen zwischen genetischen Varianten, epigenetischen Modifikationen und Genexpressionsniveaus untersuchen. Mithilfe dieser Modelle wird ermittelt, wie diese Faktoren gemeinsam zum ASD-Risiko und zur Schwere der Symptome beitragen. Durch die Einbeziehung sowohl genetischer als auch Umweltdaten können die Modelle auch Gen-Umwelt-Interaktionen untersuchen, die bei der Entwicklung von ASD eine Rolle spielen könnten.
Die Netzwerkanalyse ist ein weiteres wichtiges Werkzeug des Bioinformatik-Teams. Diese Technik visualisiert die Wechselwirkungen zwischen Genen, Proteinen und regulatorischen Elementen und ermöglicht es Forschern, Schlüsselgene und Signalwege zu identifizieren, die an ASD beteiligt sein könnten. Die Netzwerkanalyse hilft auch dabei, Genregulationsnetzwerke aufzudecken, die bei Personen mit ASD gestört sein können, und liefert Einblicke in die molekularen Mechanismen, die die Störung auslösen.
Das Projekt nutzt außerdem Algorithmen des maschinellen Lernens (ML) und der künstlichen Intelligenz (KI), um die Daten zu analysieren. Diese Vorhersagemodelle sollen Ärzte dabei unterstützen, personalisierte Behandlungsentscheidungen auf der Grundlage des molekularen Profils jedes Patienten zu treffen. Beispielsweise können KI-Modelle verwendet werden, um die Schwere von ASD-Symptomen auf der Grundlage genetischer, epigenetischer und klinischer Daten vorherzusagen, was gezieltere Interventionen ermöglicht.
Hi-C- und In-Silico-Analyse:
Während bei der herkömmlichen Hi-C-Analyse häufig Crosslinker zum Erfassen weiträumiger Chromatin-Wechselwirkungen zum Einsatz kommen, verfolgt dieses Projekt einen besonderen Ansatz und verzichtet auf den Einsatz von Crosslinkern zur Verknüpfung spezifischer DNA-Fragmente. Stattdessen werden die Chromatin-Interaktionsdaten abgeleitet und in-silico nach der Datenintegration erneut überprüft. Durch die rechnerische Analyse der 3D-Chromatinarchitektur wird das Projekt darauf abzielen, räumliche Chromatininteraktionen zu identifizieren, die zur Regulierung von ASD-assoziierten Genen beitragen.
Dieser Post-Integration-Ansatz ermöglicht die Identifizierung regulatorischer Elemente wie Enhancer und Promotoren, die im Zusammenhang mit ASD mit entfernten Genomregionen interagieren. Die aus den genomischen, epigenomischen und transkriptomischen Analysen generierten Daten werden integriert, um Chromatin-Interaktionsmuster aufzudecken, die die Genexpression beeinflussen, insbesondere solche, die mit der ASD-Pathologie verbunden sind. Diese Strategie ermöglicht ein flexibleres und verfeinertes Verständnis der 3D-Genomorganisation ohne die Einschränkungen, die durch Crosslinker-basierte Methoden entstehen.
ChIP-Seq und epigenetische In-Silico-Pathogeneseanalyse:
Zusätzlich zur Kartierung der Chromatin-Interaktion werden ChIP-Seq-Daten für die Analyse der epigenetischen Pathogenese verwendet. Durch die Durchführung einer In-silico-Analyse der ChIP-Seq-Ergebnisse wird das Projekt Histonmodifikationen und Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen identifizieren, die an der Regulierung der Genexpression bei ASD beteiligt sind. Diese Technik wird dazu beitragen, die Rolle spezifischer epigenetischer Markierungen wie Histonacetylierung und -methylierung bei der Fehlregulation von ASD-assoziierten Genen aufzuklären.
Die Integration von ChIP-Seq-Daten mit anderen Omics-Daten, einschließlich DNA-Methylierung (WGBS) und RNA-Seq-Expressionsprofilen, wird einen umfassenden Überblick über die regulatorischen Netzwerke liefern, die ASD vorantreiben. Dies wird es den Forschern ermöglichen, spezifische Regulierungsmechanismen zu lokalisieren, wie z. B. eine veränderte Aktivität des Transkriptionsfaktors oder Veränderungen in der Zugänglichkeit von Chromatin, die zum Auftreten oder der Schwere von ASD-Symptomen beitragen können. Die In-silico-Analyse der ChIP-Seq-Ergebnisse wird daher als leistungsstarkes Instrument zum Verständnis der epigenetischen Landschaft im Zusammenhang mit der ASD-Pathogenese dienen.
Das Projekt kann seine Analyse durch die Berechnung von polygenen Risikoscores (PRS) weiter verbessern, die den kumulativen Effekt zahlreicher genetischer Varianten mit geringer Auswirkung auf das Risiko, an ASD zu erkranken, quantifizieren. Durch die Aggregation von Daten aus Tausenden genetischer Varianten kann PRS die allgemeine genetische Veranlagung eines Individuums für ASD vorhersagen. Diese Ergebnisse können dann mit klinischen und phänotypischen Daten korreliert werden, um besser zu verstehen, wie sich genetisches Risiko auf beobachtbare Symptome auswirkt. PRS kann auch mit Umwelt- und epigenetischen Daten integriert werden, um Gen-Umwelt-Wechselwirkungen zu untersuchen, und bietet so ein umfassendes Modell der ASD-Anfälligkeit.
Qualitätskontrolle und Compliance Die Wahrung der Integrität des Projekts ist von größter Bedeutung und wird durch strenge Qualitätskontrollmaßnahmen und einen umfassenden Compliance-Rahmen erreicht. Das Projekt umfasst mehrere Abteilungen, die dafür sorgen, dass alle Forschungsaktivitäten ethischen Richtlinien und regulatorischen Standards entsprechen.
Die Risikomanagementabteilung spielt eine entscheidende Rolle bei der Identifizierung und Minderung potenzieller Risiken, die die Integrität der Studie gefährden könnten. Diese Abteilung arbeitet eng mit den internen Audit- und Ethik-Compliance-Teams zusammen, um sicherzustellen, dass alle Forschungsaktivitäten ethischen Standards wie der Helsinki-Erklärung und nationalen Vorschriften zum Schutz personenbezogener Daten entsprechen.
Die Qualitätskontrollteams sind dafür verantwortlich, die Qualität der biologischen Proben zu überwachen und sicherzustellen, dass alle Daten korrekt und zuverlässig sind. Diese Teams führen regelmäßige Audits durch und implementieren bei Bedarf Korrektur- und Präventivmaßnahmen (CAPA), um etwaige Probleme zu beheben, die im Verlauf der Studie auftreten.
Die Dokumentations- und Archivierungsabteilung ist für die Verwaltung aller Projektaufzeichnungen verantwortlich, einschließlich Prüfberichten, Datenübertragungsprotokollen und Compliance-Aufzeichnungen. Diese Abteilung stellt sicher, dass die gesamte projektbezogene Dokumentation sicher gespeichert und zur Überprüfung leicht zugänglich ist, was Transparenz und Verantwortlichkeit erleichtert.
Zum Projekt gehört auch ein Beschaffungs- und Supply-Chain-Management-Team, das dafür verantwortlich ist, dass alle notwendigen Materialien, Geräte und Reagenzien zeitnah beschafft werden. Dieses Team verwaltet die Logistik der Materialtransfers und stellt sicher, dass alle Lieferungen den erforderlichen Qualitätsstandards entsprechen.
Ethische Überlegungen und Sicherheit der Teilnehmer Die Sicherheit und Privatsphäre der Teilnehmer haben bei der Durchführung der Studie oberste Priorität. Alle Teilnehmerdaten werden anonymisiert und sicher gespeichert, um ihre Vertraulichkeit zu schützen. Das Projekt beachtet sowohl nationale als auch internationale Vorschriften zum Schutz personenbezogener Daten und stellt so sicher, dass die Rechte der Teilnehmer jederzeit respektiert werden.
Vor der Aufnahme in die Studie wird von allen Teilnehmern eine Einverständniserklärung eingeholt. Die Teilnehmer erhalten detaillierte Informationen über die Ziele, den Ablauf und mögliche Risiken der Studie. Sie werden außerdem über ihr Recht informiert, jederzeit und ohne Strafe aus der Studie auszusteigen.
Die Studie wurde von den zuständigen nationalen Ethikkommissionen ethisch genehmigt, wodurch sichergestellt wird, dass alle Forschungsaktivitäten den festgelegten ethischen Richtlinien entsprechen. Es werden regelmäßige Audits durchgeführt, um sicherzustellen, dass alle Verfahren korrekt befolgt werden und etwaige ethische Bedenken umgehend berücksichtigt werden.
Datenintegration und -visualisierung Nach Abschluss der Studie werden alle Daten aus den genomischen, epigenomischen und transkriptomischen Analysen integriert und mithilfe modernster bioinformatischer Tools visualisiert. Der integrierte Datensatz wird einen umfassenden Überblick über die molekularen Mechanismen bieten, die ASD zugrunde liegen, und es Forschern ermöglichen, wichtige Biomarker und potenzielle therapeutische Ziele zu identifizieren.
Die integrierten Daten werden durch verschiedene Visualisierungstechniken wie Heatmaps, Netzwerkkarten und Pfaddiagramme dargestellt. Diese Visualisierungen werden Forschern helfen, die Daten zu interpretieren und aussagekräftige Schlussfolgerungen über die biologischen Prozesse zu ziehen, die an ASD beteiligt sind.
Schlussfolgerung Dieses Projekt ist eine bahnbrechende Studie auf dem Gebiet der ASD-Forschung, bei der ein Multi-Omics-Ansatz verwendet wird, um die genetischen, epigenetischen und umweltbedingten Faktoren aufzudecken, die zur Störung beitragen. Die multidisziplinäre Struktur des Projekts mit engagierten Teams für klinische Abläufe, Datenanalyse, Qualitätskontrolle und Compliance stellt sicher, dass die Forschung mit höchster wissenschaftlicher Genauigkeit durchgeführt wird.
Durch die Integration genomischer, epigenomischer und transkriptomischer Daten soll das Projekt neue Erkenntnisse über die molekularen Mechanismen liefern, die ASD zugrunde liegen, und potenzielle Biomarker für Diagnose und Behandlung identifizieren. Die Ergebnisse dieser Studie könnten den Weg für personalisierte medizinische Ansätze bei ASD ebnen und die Lebensqualität der von der Störung betroffenen Personen verbessern.
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Rukiye Tekdemir, MD.
- Telefonnummer: +90 530 326 49 95
- E-Mail: dr.rtekdemir@gmail.com
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Hasan Ali Güler, MD.
- Telefonnummer: +90 505 347 29 66
- E-Mail: dr.hasanaliguler@gmail.com
Studienorte
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Afyonkarahisar, Truthahn
- Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Aziz Kara, MD.
- Telefonnummer: 00905331705112
- E-Mail: aziz.kara@afsu.edu.tr
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Kontakt:
- Aziz Kara, MD.
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Ankara, Truthahn
- Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
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Kontakt:
- Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
- Telefonnummer: +90 542 725 90 66
- E-Mail: ysmnhosgoren@gmail.com
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Kontakt:
- Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
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Ankara, Truthahn
- Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Yasemin Taş Torun, MD.
- Telefonnummer: 00905428917627
- E-Mail: ysmn.ts@gmail.com
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Kontakt:
- Yasemin Taş Torun, MD.
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Ankara, Truthahn
- Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
- Telefonnummer: +90 532 665 62 20
- E-Mail: ayhancongologlu@gmail.com
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Kontakt:
- Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
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Bursa, Truthahn
- Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Caner Mutlu, MD.
- Telefonnummer: 00905058343797
- E-Mail: canermutlu@uludag.edu.tr
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Kontakt:
- Caner Mutlu, MD.
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Denizli, Truthahn
- Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Bürge Kabukçu Başay, MD.
- Telefonnummer: 00905325401413
- E-Mail: burgekabukcu@yahoo.com
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Kontakt:
- Bürge Kabukçu Başay, MD.
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Erzurum, Truthahn
- Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
- Telefonnummer: 05535525062
- E-Mail: esenyildirim08@hotmail.com
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Kontakt:
- Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
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Gaziantep, Truthahn
- Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Mehmet Karadağ, MD.
- Telefonnummer: 0090541 895 05 65
- E-Mail: mehmetkaradag1988@gmail.com
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Kontakt:
- Mehmet Karadağ, MD.
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Giresun, Truthahn
- Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Bedia Sultan Önal, MD.
- Telefonnummer: 00905544250628
- E-Mail: onalbediasultan@gmail.com
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Kontakt:
- Bedia Sultan Önal, MD.
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Istanbul, Truthahn
- Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD
- Telefonnummer: +90 505 672 49 30
- E-Mail: mtarakcioglu@hotmail.com
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Kontakt:
- Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
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Istanbul, Truthahn
- Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Alperen Bıkmazer, MD
- Telefonnummer: +90 555 301 91 03
- E-Mail: alperenbikmazer@yahoo.com
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Kontakt:
- Alperen Bıkmazer, MD.
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Istanbul, Truthahn
- Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
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Kontakt:
- Aynur Görmez, MD.
- Telefonnummer: 00905321691143
- E-Mail: draynurgormez@gmail.com
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Kontakt:
- Aynur Görmez, MD.
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Istanbul, Truthahn
- Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Yasin Çalışkan, MD.
- Telefonnummer: 0090507 346 33 66
- E-Mail: yascaliskan@gmail.com
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Kontakt:
- Yasin Çalışkan, MD.
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Izmir, Truthahn
- Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Gonca Özyurt, MD.
- Telefonnummer: 00905056942433
- E-Mail: goncaenginozyurt@gmail.com
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Kontakt:
- Gonca Özyurt, MD.
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Konya, Truthahn
- Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Ömer Faruk Akça, MD.
- Telefonnummer: +90 530 697 21 02
- E-Mail: ofakca@erbakan.edu.tr
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Kontakt:
- Ömer Faruk Akça, MD.
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Konya, Truthahn
- Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
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Kontakt:
- Nadir Koçak, MD.
- Telefonnummer: +90 553 258 78 70
- E-Mail: nadirkocak@yahoo.com
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Kontakt:
- ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
- Telefonnummer: +90 537 950 50 27
- E-Mail: ozkan.bagci@selcuk.edu.tr
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Kontakt:
- ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
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Kontakt:
- Ali TORABI, MD.,Ph.D.
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Kontakt:
- EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
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Trabzon, Truthahn
- Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Esra Hoşoğlu, MD.
- Telefonnummer: 0090546 561 5281
- E-Mail: dr.esrahosoglu@gmail.com
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Kontakt:
- Esra Hoşoğlu, MD.
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Şanlıurfa, Truthahn
- Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Fethiye Kılıçaslan, MD.
- Telefonnummer: 00905071916536
- E-Mail: fethiyeklcaslan@gmail.com
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Kontakt:
- Fethiye Kılıçaslan, MD.
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Selçuklu
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Konya, Selçuklu, Truthahn, 42250
- Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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Kontakt:
- Hasan Ali Güler, MD.
- Telefonnummer: +90 505 347 29 66
- E-Mail: dr.hasanaliguler@gmail.com
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Kontakt:
- Hasan Ali Güler, MD.
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Konya, Selçuklu, Truthahn, 42250
- Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
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Kontakt:
- ALİ KANDEĞER, MD.
- Telefonnummer: +90 537 464 22 12
- E-Mail: dralikandeger@gmail.com
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Kontakt:
- ALİ KANDEĞER, MD.
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
- Einschlusskriterien: Autismus-Spektrum-Störung (ASD) oder autismusähnliche Merkmale: Personen, bei denen ASD auf der Grundlage der DSM-5-Diagnosekriterien diagnostiziert wurde, oder Personen, die signifikante Autismusmerkmale ohne formelle Diagnose aufweisen.
Gesunde Kontrollgruppe: Alters-, geschlechts- und soziodemografisch übereinstimmende Personen ohne psychiatrische oder neurologische Störung.
ASD-Personen mit unterschiedlichen Funktionsniveaus: Teilnehmer mit ASD mit einem breiten Spektrum an funktionellen Fähigkeiten, von hochfunktionellem bis hin zu niedrigfunktionellem Autismus.
Komorbide Erkrankungen: Einbeziehung von Freiwilligen mit Entwicklungsprofilen und komorbiden Erkrankungen wie ADHS und Lernbehinderungen.
Einverständniserklärung: Schriftliche Einverständniserklärung von Teilnehmern über 18 Jahren. Für Teilnehmer unter 18 Jahren ist die Zustimmung der Eltern oder Erziehungsberechtigten erforderlich.
- Ausschlusskriterien: Schwere psychotische Störungen: Personen, bei denen Erkrankungen wie Schizophrenie oder schizoaffektive Störung diagnostiziert wurden.
Bekannte genetische Syndrome oder Chromosomenanomalien: Personen mit genetischen Erkrankungen wie Down-Syndrom oder Fragile-X-Syndrom.
Vorgeschichte genetischer oder experimenteller Therapien: Teilnehmer mit vorheriger Gen- oder Zelltherapie, häufigen Bluttransfusionen oder Knochenmarktransplantationen.
Schwere Kommunikations- oder kognitive Beeinträchtigungen: Teilnehmer mit Kommunikations- oder kognitiven Störungen, die ihre Fähigkeit zur Teilnahme an der Datenerfassung beeinträchtigen würden, oder Teilnehmer mit aggressiven Verhaltensstörungen.
Nichteinhaltung oder medizinische Einschränkungen: Personen, die nicht in der Lage sind, die Studienabläufe einzuhalten oder an medizinischen Bedingungen leiden, die die Entnahme biologischer Proben verhindern.
- Kontrollgruppe: Gesunde Personen: Teilnehmer ohne ASD oder psychiatrische oder neurologische Störungen.
Alters- und Geschlechtszuordnung: Übereinstimmung mit der ASD-Gruppe hinsichtlich Alter, Geschlecht und soziodemografischem Status.
Keine genetischen oder neurologischen Entwicklungsstörungen in der Vorgeschichte: Personen ohne genetische Syndrome, Chromosomenanomalien oder neurologische Entwicklungsstörungen.
Keine Vorgeschichte chronischer Krankheiten: Teilnehmer ohne Vorgeschichte chronischer Krankheiten wie Krebs, Autoimmunerkrankungen oder Stoffwechselstörungen.
Einverständniserklärung: Schriftliche Einverständniserklärung von Personen über 18 Jahren oder von Eltern/Erziehungsberechtigten für Teilnehmer unter 18 Jahren.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
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ASD-Fallgruppe
Stellt Personen dar, bei denen eine Autismus-Spektrum-Störung (ASD) diagnostiziert wurde und die einer genetischen, epigenetischen und transkriptomischen Analyse unterzogen werden.
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Kontrollgruppe
Stellt nicht betroffene Personen dar und dient als Vergleichsgruppe für genetische und molekulare Analysen.
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HOT-Cluster-Biomarker-Gruppe
Stellt Teilnehmer dar, die nach sekundären Ergebnisergebnissen auf der Grundlage einer HOT-Cluster-Analyse ausgewählt wurden und sich einem ELISA unterziehen, um potenzielle Biomarker zu untersuchen, die aus der Analyse des RNA-Transkriptompfads abgeleitet werden.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Abschluss der Rekrutierung klinischer Daten
Zeitfenster: Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 24 Monaten nach Studienbeginn.
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Das primäre Ergebnis wird die Rekrutierung von Personen sein, bei denen eine Autismus-Spektrum-Störung (ASD) diagnostiziert wurde, und von nicht betroffenen Kontrollpersonen.
Es werden umfassende klinische, soziodemografische und phänotypische Daten erhoben, einschließlich diagnostischer Bewertungen mithilfe standardisierter Tools (z. B. ADOS, SCQ).
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Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 24 Monaten nach Studienbeginn.
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Sammlung und Vervollständigung genetischer Rohdaten (WGS und WGBS)
Zeitfenster: Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 30 Monaten nach Studienbeginn
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Das sekundäre Ergebnis konzentriert sich auf die Erfassung genetischer Rohdaten aus der Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS) und der Bisulfitsequenzierung des gesamten Genoms (WGBS) aus Blut- und Nasenabstrichproben.
Die Sequenzierungsdaten werden für nachfolgende genetische und epigenetische Analysen verwendet, um Varianten, Methylierungsänderungen und deren Assoziationen mit ASD zu identifizieren.
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Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 30 Monaten nach Studienbeginn
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Integration genetischer Daten
Zeitfenster: Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 60 Monaten nach Studienbeginn.
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Dieses Ergebnis misst die Integration von Whole-Genome-Sequencing (WGS), Whole-Genome-Bisulfit-Sequencing (WGBS) und RNA-Seq-Daten in einen kombinierten Datensatz für eine umfassende Multi-Omics-Analyse.
Ziel ist es, genetische und epigenetische Interaktionen im Zusammenhang mit ASD aufzudecken.
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Voraussichtlicher Abschluss innerhalb von 60 Monaten nach Studienbeginn.
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Andere Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Vollständiges (endgültiges) Ergebnismaß: Zusammenhang zwischen klinischen und genetischen Daten
Zeitfenster: Voraussichtlich innerhalb von 66 Monaten, nachdem alle Phasen der Datenerfassung und -analyse abgeschlossen sind.
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Das Endergebnis wird die Korrelation zwischen genetischen, epigenetischen und transkriptomischen Daten mit klinischen Phänotypen bewerten.
Dieses Ergebnis zielt darauf ab, signifikante Zusammenhänge zu identifizieren, die die genetischen Grundlagen der Autismus-Spektrum-Störung erklären und zu potenziellen Biomarkern oder therapeutischen Zielen beitragen können.
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Voraussichtlich innerhalb von 66 Monaten, nachdem alle Phasen der Datenerfassung und -analyse abgeschlossen sind.
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Mitarbeiter und Ermittler
Mitarbeiter
Ermittler
- Studienstuhl: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
- Studienleiter: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
- Studienleiter: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
- Studienleiter: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
- Studienleiter: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
- Studienleiter: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
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- Baio J, Wiggins L, Christensen DL, Maenner MJ, Daniels J, Warren Z, Kurzius-Spencer M, Zahorodny W, Robinson Rosenberg C, White T, Durkin MS, Imm P, Nikolaou L, Yeargin-Allsopp M, Lee LC, Harrington R, Lopez M, Fitzgerald RT, Hewitt A, Pettygrove S, Constantino JN, Vehorn A, Shenouda J, Hall-Lande J, Van Naarden Braun K, Dowling NF. Prevalence of Autism Spectrum Disorder Among Children Aged 8 Years - Autism and Developmental Disabilities Monitoring Network, 11 Sites, United States, 2014. MMWR Surveill Summ. 2018 Apr 27;67(6):1-23. doi: 10.15585/mmwr.ss6706a1. Erratum In: MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2018 May 18;67(19):564. doi: 10.15585/mmwr.mm6719a8. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2018 Nov 16;67(45):1280. doi: 10.15585/mmwr.mm6745a8.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Geschätzt)
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
- Biomarker
- Autismus-Spektrum-Störung
- Epigenetik
- DNA-Methylierung
- Transkriptomie
- Sequenzierung des gesamten Genoms
- Polygener Risiko-Score
- Genomweite Assoziationsstudie
- Epitranskriptomik
- Einzelnukleotid-Polymorphismen
- Kopienzahlvariationen
- RNA-Sequenzierung
- Genetische Varianten
- Genexpressionsregulation
- Ausdruck quantitativer Merkmalsorte
- Quantitative Merkmalsorte der Methylierung
- Differenziell methylierte Regionen
- Epigenomweite Assoziationsstudie
- Allelspezifische Methylierung
- Einfügungen und Löschungen
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Andere Kennung: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
- HRU.24/16/37 (Andere Kennung: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)
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Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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