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Investigación de las causas genéticas y ambientales del autismo: un estudio multicéntrico (ASD-Omics-TR)

24 de octubre de 2024 actualizado por: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Un enfoque multicéntrico multiómico para investigar los mecanismos genéticos y epigenéticos en el trastorno del espectro autista

El objetivo de este estudio observacional es investigar los mecanismos genéticos y epigenéticos que pueden contribuir al desarrollo del trastorno del espectro autista (TEA) en individuos de diferentes grupos de edad. El estudio tiene como objetivo explorar cómo las variantes genéticas y los factores ambientales interactúan para influir en el riesgo de TEA.

Las principales preguntas que pretende responder son:

  • ¿Qué variantes genéticas están más fuertemente asociadas con el desarrollo del TEA?
  • ¿Cómo influyen los factores ambientales, como la exposición prenatal, en estos riesgos genéticos?
  • ¿Puede la combinación de datos genéticos y epigenéticos mejorar las estrategias de detección o intervención temprana del TEA?

Los participantes:

  • Proporcionar muestras biológicas para análisis genéticos y epigenéticos.
  • Complete cuestionarios detallados sobre exposiciones ambientales y antecedentes familiares.
  • Participar en evaluaciones clínicas para evaluar la gravedad de los síntomas del TEA.

Los investigadores compararán datos genéticos y ambientales entre personas con TEA y aquellas sin el trastorno para comprender cómo estos factores pueden contribuir al riesgo de TEA. Este estudio multicéntrico se llevará a cabo en varias universidades y hospitales de Türkiye y se centrará en la posible interacción entre los factores genéticos heredados y las influencias ambientales.

Descripción general del estudio

Estado

Aún no reclutando

Condiciones

Descripción detallada

Introducción al proyecto El proyecto representa un estudio multicéntrico innovador destinado a investigar los fundamentos genéticos, epigenéticos y ambientales del trastorno del espectro autista (TEA). El TEA es una condición compleja del desarrollo neurológico que generalmente se presenta en la primera infancia y afecta a los individuos de diversas maneras, particularmente en la comunicación social y el comportamiento. El trastorno se caracteriza por una variabilidad significativa en la gravedad de los síntomas y la presentación entre los individuos. A pesar de años de investigación, los mecanismos moleculares que impulsan la aparición y progresión del TEA siguen siendo difíciles de alcanzar, lo que dificulta el diagnóstico y el tratamiento.

Esta investigación tiene como objetivo llenar este vacío mediante el uso de un enfoque multiómico para comprender mejor los factores biológicos, genéticos y ambientales que contribuyen al TEA. Mediante la integración de datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos, el proyecto busca descubrir firmas e interacciones moleculares que podrían explicar la variabilidad en la presentación y gravedad del TEA. Además, el estudio tiene como objetivo identificar posibles biomarcadores que podrían conducir a un diagnóstico más temprano, un mejor pronóstico y opciones de tratamiento más personalizadas.

El estudio se llevará a cabo en múltiples centros de investigación, con un enfoque estructurado y bien coordinado para la recopilación de datos, el procesamiento y el análisis de muestras. Este proyecto multidisciplinario reúne una variedad de conocimientos, que incluyen genética, bioinformática, psiquiatría clínica y ciencia de datos, lo que garantiza que todos los aspectos de la investigación se aborden con rigor y precisión científicos. Al analizar muestras de personas con TEA, el proyecto proporcionará nuevos conocimientos sobre los factores genéticos y epigenéticos implicados en el TEA, al tiempo que investigará la posible influencia de factores ambientales.

Estructura multidepartamental e integridad del proyecto El proyecto está organizado en múltiples departamentos especializados, cada uno con una función específica para mantener la integridad del estudio y garantizar que todas las actividades de investigación se realicen con los más altos estándares. Esta estructura permite una colaboración perfecta entre departamentos y garantiza que todos los datos se recopilen, procesen y analicen con la máxima precisión.

Coordinación y supervisión generales Al más alto nivel, el proyecto es gestionado por un coordinador general que supervisa todos los aspectos de la investigación. Este coordinador garantiza que cada departamento cumpla con los objetivos y el cronograma del proyecto, fomentando la comunicación entre los equipos y facilitando la integración de datos clínicos, genéticos y epigenéticos. La coordinación garantiza que cualquier desafío que surja en el curso del estudio se aborde con prontitud y que el proyecto siga encaminado para cumplir sus objetivos.

El papel del coordinador general es fundamental para garantizar la integración de los datos multiómicos de los distintos centros de investigación. El coordinador también desempeña un papel clave en la interpretación de los datos, trabajando en estrecha colaboración con los equipos de análisis de datos para garantizar que los hallazgos sean coherentes y significativos. Se comparten actualizaciones periódicas entre departamentos para mantener la alineación con los objetivos generales de investigación del proyecto.

Operaciones Clínicas: Unidades de Adultos y Pediátricas Las operaciones clínicas del proyecto se dividen en dos sectores principales: adultos y pediátricos. Cada sector es administrado por un equipo dedicado que supervisa los centros clínicos responsables de la recopilación de datos. Estos centros clínicos están ubicados en varias regiones, lo que permite que el proyecto recopile una amplia y diversa gama de datos clínicos de personas diagnosticadas con TEA.

Cada centro clínico sigue protocolos estandarizados para la recopilación de datos, lo que garantiza que todos los datos de los pacientes se recopilen de manera uniforme y consistente. El proceso de recopilación de datos implica el uso de herramientas de diagnóstico reconocidas internacionalmente, incluido el Programa de observación de diagnóstico de autismo (ADOS) y el Cuestionario de comunicación social (SCQ). Estas herramientas son esenciales para diagnosticar el TEA y evaluar la gravedad de los síntomas.

Las operaciones clínicas también implican la recopilación de datos sociodemográficos, historiales de desarrollo e información sobre condiciones comórbidas. Estos datos se recopilan a través de cuestionarios y entrevistas clínicas realizadas por profesionales sanitarios capacitados. La recopilación de este conjunto de datos completo es fundamental para comprender la heterogeneidad clínica del TEA y para correlacionar los síntomas clínicos con datos genéticos y ambientales.

Divisiones genética y ómica Las divisiones genética y ómica forman el núcleo del proyecto y proporcionan los datos moleculares que se utilizarán para descubrir los mecanismos genéticos y epigenéticos que impulsan el TEA. La división supervisa la recolección, procesamiento y análisis de muestras biológicas, que incluyen sangre venosa e hisopos nasales obtenidos de los participantes del estudio.

Recolección y procesamiento de muestras Las muestras biológicas recolectadas de los participantes se someten a un proceso riguroso y estandarizado de extracción de ácido nucleico. Este proceso, gestionado por los equipos de extracción y purificación de ácidos nucleicos, implica aislar ADN y ARN de alta calidad a partir de muestras de sangre y hisopos nasales. Estas muestras son esenciales para la secuenciación y los análisis posteriores. La calidad del ADN y ARN extraídos es fundamental, ya que cualquier impureza o degradación podría afectar la precisión de los análisis genéticos y epigenéticos.

Una vez extraídas, las muestras de ADN y ARN se someten a múltiples controles de calidad. Estos controles son supervisados ​​por los equipos de control de calidad y almacenamiento, quienes garantizan que los ácidos nucleicos cumplan con los estándares requeridos para la secuenciación. Las muestras que pasan los controles de calidad se almacenan en condiciones óptimas, preservando su integridad hasta que estén listas para ser secuenciadas.

Análisis genómico El análisis genómico de muestras de ADN comienza con la secuenciación del genoma completo (WGS), una técnica integral que permite a los investigadores examinar el código genético completo de cada participante. WGS permite la identificación de una amplia gama de variantes genéticas, incluidos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), variaciones del número de copias (CNV), inserciones y eliminaciones (InDels) y variantes estructurales. Estas variantes se evalúan para determinar su posible contribución al TEA.

Uno de los principales análisis realizados dentro de la división genómica es el estudio de asociación de todo el genoma (GWAS). GWAS se utiliza para identificar variantes genéticas que están significativamente asociadas con el TEA comparando la frecuencia de variantes entre individuos con TEA y aquellos sin el trastorno. Este análisis es particularmente útil para identificar variantes genéticas comunes que pueden contribuir al riesgo de TEA.

Además de GWAS, el proyecto también realiza análisis de locus de rasgos cuantitativos (QTL). El análisis QTL examina cómo las variantes genéticas influyen en los rasgos cuantitativos relacionados con el TEA, como la gravedad de los síntomas, el funcionamiento cognitivo o los hitos del desarrollo. Este tipo de análisis ayuda a dilucidar la base genética de la variabilidad fenotípica en el TEA e identifica variantes específicas que pueden contribuir a las diferencias en la presentación de los síntomas.

Análisis epigenético El componente epigenético del proyecto se centra en cómo los factores ambientales influyen en la expresión genética y contribuyen al riesgo de TEA. La metilación del ADN es uno de los mecanismos epigenéticos clave estudiados en este proyecto. Utilizando la secuenciación con bisulfito del genoma completo (WGBS), los investigadores analizan los patrones de metilación del ADN en todo el genoma. WGBS se considera el estándar de oro para el análisis de metilación del ADN de alta resolución, lo que permite la identificación de cambios de metilación asociados con el TEA.

Las regiones diferencialmente metiladas (DMR) son regiones genómicas donde los niveles de metilación difieren entre individuos con TEA y controles no afectados. Al identificar estos DMR, los investigadores pueden identificar regiones genómicas específicas donde los factores ambientales pueden estar influyendo en la expresión genética en personas con TEA.

Además, en este estudio se explora la metilación específica de alelo (ASM). El análisis ASM investiga cómo difieren los patrones de metilación entre las dos copias de un gen heredado de cada padre. Este análisis ayuda a los investigadores a comprender cómo interactúan los factores genéticos y epigenéticos para influir en la expresión genética y contribuir al riesgo de TEA.

Como parte del análisis epigenético, se realizará un análisis m-QTL (loci de rasgos cuantitativos de metilación) para investigar la relación entre las variantes genéticas y los patrones de metilación del ADN en todo el genoma. Los QTL m son loci genómicos donde las variaciones en la secuencia del ADN se asocian con diferencias en los niveles de metilación del ADN. Al identificar estos loci, el proyecto pretende descubrir cómo la variación genética influye en la regulación epigenética y, posteriormente, cómo estas interacciones pueden contribuir al riesgo de desarrollar TEA. Este análisis proporcionará información valiosa sobre la interacción entre los factores genéticos y epigenéticos, lo que ayudará a dilucidar los mecanismos moleculares que sustentan el TEA. Además, los QTL m pueden servir como biomarcadores potenciales para comprender la modulación ambiental de la susceptibilidad genética en personas con TEA.

Los datos epigenéticos también se integran con datos genéticos para realizar estudios de asociación de todo el epigenoma (EWAS). EWAS examina cómo los patrones de metilación del ADN se correlacionan con el TEA, con el objetivo de identificar marcas de metilación que podrían servir como biomarcadores del trastorno. Estos análisis son esenciales para comprender cómo las exposiciones ambientales, como el estrés prenatal, las toxinas o la salud materna, pueden afectar el riesgo de TEA a través de mecanismos epigenéticos.

Análisis transcriptómico El análisis transcriptómico se centra en comprender cómo la expresión genética difiere entre individuos con TEA y aquellos sin el trastorno. La secuenciación de ARN (RNA-seq) se utiliza para medir los niveles de expresión genética en muestras de sangre y de hisopos nasales. RNA-seq proporciona una visión integral del transcriptoma, que representa el conjunto completo de transcripciones de ARN presentes en una célula o tejido en un momento dado.

Los datos de RNA-seq se utilizan para realizar un análisis de expresión genética diferencial (DGE), que identifica genes que están regulados hacia arriba o hacia abajo en personas con TEA. Este análisis ayuda a descubrir las vías moleculares que se alteran en el TEA y destaca posibles biomarcadores que podrían usarse para el diagnóstico o tratamiento temprano.

Además de identificar genes expresados ​​diferencialmente, los datos transcriptómicos se utilizan para realizar análisis de vías. El análisis de vías examina cómo los cambios en la expresión genética afectan los procesos biológicos y las funciones celulares. Este análisis puede identificar vías clave que pueden verse alteradas en el TEA, proporcionando información sobre los mecanismos biológicos subyacentes al trastorno.

Al comparar los perfiles de expresión genética de muestras de sangre y de hisopos nasales, los investigadores pueden identificar patrones de expresión específicos de tejido. Esta comparación proporciona una comprensión más matizada de las diferencias moleculares entre los tejidos y puede revelar biomarcadores específicos de tejido para el TEA.

Análisis eQTL (loci de rasgos cuantitativos de expresión)

Además del análisis m-QTL, la integración del análisis eQTL (loci de rasgos cuantitativos de expresión) permitirá al proyecto identificar variantes genéticas que afectan los niveles de expresión génica. Los eQTL son loci donde las variaciones genéticas se correlacionan con cambios en la expresión genética. Al analizar los eQTL, el estudio puede investigar cómo variantes genéticas específicas influyen en la transcripción de genes relacionados con el TEA. Este enfoque ayuda a descubrir vías reguladoras y redes genéticas que contribuyen a la variabilidad de los síntomas del TEA. La integración del análisis eQTL con datos transcriptómicos (como RNA-Seq) proporciona una comprensión matizada de cómo los factores de riesgo genéticos alteran la expresión genética y, en última instancia, afectan la manifestación fenotípica del TEA.

Análisis epitranscriptómico

Más allá del estudio del ADN y el ARN a través de la genómica y la transcriptómica, la epitranscriptómica explora las modificaciones postranscripcionales del ARN, como la N6-metiladenosina (m6A). Estas modificaciones del ARN pueden afectar la estabilidad, el empalme, el transporte y la traducción del ARNm, influyendo así en la producción de proteínas y la función celular. La inclusión del análisis epitranscriptómico como parte del flujo de trabajo RNA-Seq ofrecerá información sobre cómo las modificaciones del ARN difieren en los pacientes con TEA, proporcionando una capa adicional de regulación genética que contribuye a la complejidad del TEA. Esta investigación podría descubrir nuevos biomarcadores epitranscriptómicos para el TEA, lo que agregaría profundidad a la exploración del estudio sobre la regulación genética a nivel de ARN.

Integración de datos y bioinformática La integración de datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos es un componente clave del proyecto. Los equipos de bioinformática y análisis de datos son responsables de procesar y analizar las grandes cantidades de datos generados por las divisiones ómicas. Esto implica el uso de herramientas bioinformáticas avanzadas y modelos estadísticos para integrar los datos y descubrir patrones significativos.

El conjunto de datos integrado está sujeto a modelos de regresión multivariados, que examinan las interacciones entre variantes genéticas, modificaciones epigenéticas y niveles de expresión genética. Estos modelos se utilizan para identificar cómo estos factores contribuyen conjuntamente al riesgo de TEA y a la gravedad de los síntomas. Al incorporar datos genéticos y ambientales, los modelos también pueden explorar las interacciones entre genes y entorno que pueden desempeñar un papel en el desarrollo del TEA.

El análisis de redes es otra herramienta clave utilizada por el equipo de bioinformática. Esta técnica visualiza las interacciones entre genes, proteínas y elementos reguladores, lo que permite a los investigadores identificar genes y vías clave que pueden estar involucrados en el TEA. El análisis de redes también ayuda a descubrir redes reguladoras de genes que pueden verse alteradas en personas con TEA, proporcionando información sobre los mecanismos moleculares que impulsan el trastorno.

El proyecto también aprovecha algoritmos de aprendizaje automático (ML) e inteligencia artificial (IA) para analizar los datos. Estos modelos predictivos están diseñados para ayudar a los médicos a tomar decisiones de tratamiento personalizadas basadas en el perfil molecular de cada paciente. Por ejemplo, los modelos de IA pueden usarse para predecir la gravedad de los síntomas del TEA basándose en datos genéticos, epigenéticos y clínicos, lo que permite intervenciones más específicas.

Análisis Hi-C e In-Silico:

Si bien el análisis tradicional Hi-C a menudo utiliza entrecruzadores para capturar interacciones de cromatina de largo alcance, este proyecto adoptará un enfoque distinto al renunciar al uso de entrecruzadores para unir fragmentos de ADN específicos. En cambio, los datos de interacción de la cromatina se derivarán y revisarán en la integración de datos posteriores in-silico. Mediante el análisis computacional de la arquitectura de la cromatina tridimensional, el proyecto tendrá como objetivo identificar interacciones espaciales de la cromatina que contribuyan a la regulación de genes asociados al TEA.

Este enfoque posterior a la integración permite la identificación de elementos reguladores, como potenciadores y promotores, que interactúan con regiones genómicas distantes en el contexto del TEA. Los datos generados a partir de los análisis genómicos, epigenómicos y transcriptómicos se integrarán para revelar patrones de interacción de la cromatina que influyen en la expresión genética, particularmente aquellos asociados con la patología del TEA. Esta estrategia permitirá una comprensión más flexible y refinada de la organización del genoma 3D sin las limitaciones impuestas por los métodos basados ​​en reticulantes.

ChIP-Seq y análisis de patogénesis epigenética in-silico:

Además del mapeo de la interacción de la cromatina, los datos de ChIP-Seq se utilizarán para el análisis de patogénesis epigenética. Al realizar análisis in silico de los resultados de ChIP-Seq, el proyecto identificará modificaciones de histonas y sitios de unión de factores de transcripción que participan en la regulación de la expresión génica en el TEA. Esta técnica ayudará a dilucidar el papel de marcas epigenéticas específicas, como la acetilación y metilación de histonas, en la desregulación de genes asociados al TEA.

La integración de datos de ChIP-Seq con otros datos ómicos, incluida la metilación del ADN (WGBS) y los perfiles de expresión de RNA-Seq, proporcionará una visión integral de las redes regulatorias que impulsan el TEA. Esto permitirá a los investigadores identificar mecanismos reguladores específicos, como la actividad alterada del factor de transcripción o los cambios en la accesibilidad de la cromatina, que pueden contribuir a la aparición o la gravedad de los síntomas del TEA. Por lo tanto, el análisis in silico de los resultados de ChIP-Seq servirá como una herramienta poderosa para comprender el panorama epigenético asociado con la patogénesis del TEA.

El proyecto puede mejorar aún más su análisis calculando puntuaciones de riesgo poligénico (PRS), que cuantifican el efecto acumulativo de numerosas variantes genéticas de pequeños efectos sobre el riesgo de desarrollar TEA. Al agregar datos de miles de variantes genéticas, PRS puede predecir la predisposición genética general de un individuo al TEA. Luego, estas puntuaciones pueden correlacionarse con datos clínicos y fenotípicos para comprender mejor cómo el riesgo genético se traduce en síntomas observables. PRS también se puede integrar con datos ambientales y epigenéticos para explorar las interacciones gen-ambiente, ofreciendo un modelo integral de susceptibilidad al TEA.

Control de calidad y cumplimiento Mantener la integridad del proyecto es primordial, y esto se logra a través de rigurosas medidas de control de calidad y un marco de cumplimiento integral. El proyecto incluye varios departamentos dedicados a garantizar que todas las actividades de investigación cumplan con directrices éticas y estándares regulatorios.

El departamento de gestión de riesgos desempeña un papel crucial en la identificación y mitigación de riesgos potenciales que podrían comprometer la integridad del estudio. Este departamento trabaja en estrecha colaboración con los equipos de auditoría interna y cumplimiento de ética para garantizar que todas las actividades de investigación cumplan con los estándares éticos, como la Declaración de Helsinki y las regulaciones nacionales para la protección de datos personales.

Los equipos de control de calidad son responsables de monitorear la calidad de las muestras biológicas y garantizar que todos los datos sean precisos y confiables. Estos equipos realizan auditorías periódicas e implementan acciones correctivas y preventivas (CAPA) cuando es necesario para abordar cualquier problema que surja durante el curso del estudio.

El departamento de documentación y archivo es responsable de gestionar todos los registros del proyecto, incluidos informes de auditoría, registros de transferencia de datos y registros de cumplimiento. Este departamento garantiza que toda la documentación relacionada con el proyecto esté almacenada de forma segura y fácilmente accesible para su revisión, lo que facilita la transparencia y la rendición de cuentas.

El proyecto también incluye un equipo de gestión de la cadena de suministro y adquisiciones, que es responsable de garantizar que todos los materiales, equipos y reactivos necesarios se adquieran de manera oportuna. Este equipo gestiona la logística de los traslados de materiales y garantiza que todos los suministros cumplan con los estándares de calidad requeridos.

Consideraciones éticas y seguridad de los participantes La seguridad y privacidad de los participantes son primordiales en la realización del estudio. Todos los datos de los participantes se anonimizan y se almacenan de forma segura para proteger su confidencialidad. El proyecto se ajusta a la normativa tanto nacional como internacional en materia de protección de datos personales, garantizando que se respetan en todo momento los derechos de los participantes.

Se obtiene el consentimiento informado de todos los participantes antes de inscribirlos en el estudio. Los participantes reciben información detallada sobre los objetivos, procedimientos y riesgos potenciales del estudio. También se les informa de su derecho a retirarse del estudio en cualquier momento sin penalización.

El estudio ha recibido la aprobación ética de los comités de ética nacionales pertinentes, lo que garantiza que todas las actividades de investigación cumplan con las pautas éticas establecidas. Se realizan auditorías periódicas para garantizar que todos los procedimientos se sigan correctamente y que cualquier inquietud ética se resuelva con prontitud.

Integración y visualización de datos Una vez finalizado el estudio, todos los datos de los análisis genómicos, epigenómicos y transcriptómicos se integrarán y visualizarán utilizando herramientas bioinformáticas de última generación. El conjunto de datos integrado proporcionará una visión integral de los mecanismos moleculares subyacentes al TEA, lo que permitirá a los investigadores identificar biomarcadores clave y posibles objetivos terapéuticos.

Los datos integrados se presentarán a través de varias técnicas de visualización, como mapas de calor, mapas de red y diagramas de ruta. Estas visualizaciones ayudarán a los investigadores a interpretar los datos y sacar conclusiones significativas sobre los procesos biológicos involucrados en el TEA.

Conclusión Este proyecto es un estudio histórico en el campo de la investigación del TEA, que utiliza un enfoque multiómico para descubrir los factores genéticos, epigenéticos y ambientales que contribuyen al trastorno. La estructura multidisciplinaria del proyecto, con equipos dedicados a operaciones clínicas, análisis de datos, control de calidad y cumplimiento, garantiza que la investigación se lleve a cabo con el más alto nivel de rigor científico.

Al integrar datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos, el proyecto tiene como objetivo proporcionar nuevos conocimientos sobre los mecanismos moleculares subyacentes al TEA e identificar biomarcadores potenciales para el diagnóstico y el tratamiento. Los hallazgos de este estudio podrían allanar el camino para enfoques de medicina personalizada para el TEA, mejorando la calidad de vida de las personas afectadas por el trastorno.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

3000

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

  • Nombre: Rukiye Tekdemir, MD.
  • Número de teléfono: +90 530 326 49 95
  • Correo electrónico: dr.rtekdemir@gmail.com

Copia de seguridad de contactos de estudio

Ubicaciones de estudio

  • Pavo
      • Afyonkarahisar, Pavo
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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        • Contacto:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Pavo
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Contacto:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
          • Número de teléfono: +90 542 725 90 66
          • Correo electrónico: ysmnhosgoren@gmail.com
        • Contacto:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Pavo
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Contacto:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
          • Número de teléfono: 00905428917627
          • Correo electrónico: ysmn.ts@gmail.com
        • Contacto:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Pavo
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Pavo
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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        • Contacto:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Pavo
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
          • Número de teléfono: 00905325401413
          • Correo electrónico: burgekabukcu@yahoo.com
        • Contacto:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Pavo
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Pavo
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Pavo
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Pavo
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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      • Istanbul, Pavo
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Pavo
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
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      • Istanbul, Pavo
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Número de teléfono: 0090507 346 33 66
          • Correo electrónico: yascaliskan@gmail.com
        • Contacto:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Pavo
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Número de teléfono: +90 530 697 21 02
          • Correo electrónico: ofakca@erbakan.edu.tr
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          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Pavo
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
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          • Número de teléfono: +90 553 258 78 70
          • Correo electrónico: nadirkocak@yahoo.com
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          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
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          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
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        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
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      • Konya, Selçuklu, Pavo, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
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          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Pavo, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Contacto:
        • Contacto:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

Sí

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

La población de estudio estará formada por personas diagnosticadas con trastorno del espectro autista (TEA) o que presenten rasgos similares al autismo, seleccionados de centros clínicos especializados en trastornos del neurodesarrollo. La población también incluirá un grupo de control sano, emparejado por edad, sexo y variables sociodemográficas, reclutado de la comunidad general. La cohorte de TEA incluirá participantes en una variedad de niveles funcionales, desde autismo de alto funcionamiento hasta autismo de bajo funcionamiento, así como aquellos con perfiles de desarrollo y condiciones comórbidas. Los controles estarán libres de diagnósticos psiquiátricos o neurológicos y condiciones crónicas.

Descripción

- Criterios de inclusión: Trastorno del espectro autista (TEA) o rasgos similares al autismo: personas diagnosticadas con TEA según los criterios de diagnóstico del DSM-5, o aquellos que muestran rasgos significativos de autismo sin un diagnóstico formal.

Grupo de control saludable: individuos emparejados por edad, género y sociodemografía sin ningún trastorno psiquiátrico o neurológico.

Individuos con TEA de diferentes niveles funcionales: participantes con TEA de una amplia gama de habilidades funcionales, desde autismo de alto funcionamiento hasta autismo de bajo funcionamiento.

Condiciones comórbidas: Inclusión de voluntarios con perfiles de desarrollo y condiciones comórbidas como TDAH y problemas de aprendizaje.

Consentimiento informado: Consentimiento informado por escrito de los participantes mayores de 18 años. Para participantes menores de 18 años, consentimiento de los padres o tutores legales.

- Criterio de exclusión: Trastornos psicóticos graves: personas diagnosticadas con afecciones como esquizofrenia o trastorno esquizoafectivo.

Síndromes genéticos o anomalías cromosómicas conocidas: personas con afecciones genéticas como el síndrome de Down o el síndrome de X frágil.

Historial de terapias genéticas o experimentales: participantes con terapia genética o celular previa, transfusiones de sangre frecuentes o trasplantes de médula ósea.

Deficiencias cognitivas o de comunicación graves: participantes con trastornos cognitivos o de comunicación que obstaculizarían su capacidad para participar en la recopilación de datos, o aquellos con trastornos de conducta agresivos.

Incumplimiento o restricciones médicas: personas que no pueden cumplir con los procedimientos del estudio o con condiciones médicas que impiden la recolección de muestras biológicas.

- Grupo de control: Individuos sanos: Participantes sin TEA ni ningún trastorno psiquiátrico o neurológico.

Coincidencia de edad y género: Emparejado con el grupo de TEA en términos de edad, género y estado sociodemográfico.

Sin antecedentes de trastornos genéticos o del neurodesarrollo: personas sin síndromes genéticos, anomalías cromosómicas o trastornos del neurodesarrollo.

Sin antecedentes de enfermedades crónicas: participantes sin antecedentes de enfermedades crónicas como cáncer, enfermedades autoinmunes o afecciones metabólicas.

Consentimiento informado: Consentimiento informado por escrito de personas mayores de 18 años o de padres/tutores legales para participantes menores de 18 años.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Grupo de casos de TEA
Representa a personas diagnosticadas con Trastorno del Espectro Autista (TEA), a quienes se les realizarán análisis genéticos, epigenéticos y transcriptómicos.
Grupo de control
Representa individuos no afectados y sirve como grupo de comparación para análisis genéticos y moleculares.
Grupo de biomarcadores del grupo HOT
Representa a los participantes seleccionados después de los resultados de los resultados secundarios basados ​​en el análisis de conglomerados HOT, que se someterán a ELISA para estudiar posibles biomarcadores derivados del análisis de la vía del transcriptoma del ARN.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Finalización del reclutamiento de datos clínicos.
Periodo de tiempo: Se espera que se complete dentro de los 24 meses posteriores al inicio del estudio.
El resultado principal será el reclutamiento de personas diagnosticadas con trastorno del espectro autista (TEA) y controles no afectados. Se recopilarán datos clínicos, sociodemográficos y fenotípicos completos, incluidas evaluaciones de diagnóstico utilizando herramientas estandarizadas (p. ej., ADOS, SCQ).
Se espera que se complete dentro de los 24 meses posteriores al inicio del estudio.

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Recopilación y finalización de datos genéticos sin procesar (WGS y WGBS)
Periodo de tiempo: Se espera que se complete dentro de los 30 meses posteriores al inicio del estudio.
El resultado secundario se centra en la adquisición de datos genéticos sin procesar de la secuenciación del genoma completo (WGS) y la secuenciación con bisulfito del genoma completo (WGBS) de muestras de sangre y hisopos nasales. Los datos de secuenciación se utilizarán para análisis genéticos y epigenéticos posteriores para identificar variantes, cambios de metilación y sus asociaciones con el TEA.
Se espera que se complete dentro de los 30 meses posteriores al inicio del estudio.
Integración de datos genéticos
Periodo de tiempo: Se espera que se complete dentro de los 60 meses posteriores al inicio del estudio.
Este resultado mide la integración de la secuenciación del genoma completo (WGS), la secuenciación de bisulfito del genoma completo (WGBS) y los datos de RNA-seq en un conjunto de datos combinado para un análisis multiómico integral. El objetivo es descubrir interacciones genéticas y epigenéticas relacionadas con el TEA.
Se espera que se complete dentro de los 60 meses posteriores al inicio del estudio.

Otras medidas de resultado

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Medida de resultado completa (final): asociación entre datos clínicos y genéticos
Periodo de tiempo: Previsto dentro de 66 meses, después de que se hayan completado todas las etapas de recopilación y análisis de datos.
El resultado final evaluará la correlación entre los datos genéticos, epigenéticos y transcriptómicos con los fenotipos clínicos. Este resultado tiene como objetivo identificar asociaciones significativas que puedan explicar los fundamentos genéticos del trastorno del espectro autista, contribuyendo a posibles biomarcadores u objetivos terapéuticos.
Previsto dentro de 66 meses, después de que se hayan completado todas las etapas de recopilación y análisis de datos.

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Colaboradores

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Investigadores

  • Silla de estudio: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Director de estudio: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Director de estudio: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Director de estudio: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Director de estudio: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Director de estudio: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Publicaciones Generales

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Estimado)

27 de diciembre de 2025

Finalización primaria (Estimado)

27 de diciembre de 2027

Finalización del estudio (Estimado)

27 de mayo de 2028

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

24 de octubre de 2024

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

24 de octubre de 2024

Publicado por primera vez (Actual)

29 de octubre de 2024

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

29 de octubre de 2024

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

24 de octubre de 2024

Última verificación

1 de octubre de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Palabras clave

Términos MeSH relevantes adicionales

Otros números de identificación del estudio

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Otro identificador: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Otro identificador: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

INDECISO

Descripción del plan IPD

En este momento, no se ha tomado la decisión de compartir datos de participantes individuales (IPD). Una vez finalizado el estudio, la decisión será revisada y finalizada de acuerdo con las pautas éticas y regulatorias aplicables. La decisión final estará sujeta a la obtención del permiso de la Agencia Turca de Medicamentos y Dispositivos Médicos (TİTCK), el Comité de Ética y el Ministerio de Salud de Turquía. El plan de intercambio garantizará que se sigan estrictamente todas las normas de privacidad y protección de datos, y se tomarán las medidas adecuadas para salvaguardar la confidencialidad de los participantes.

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

producto fabricado y exportado desde los EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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