Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Undersøgelse af de genetiske og miljømæssige årsager til autisme: en multicenterundersøgelse (ASD-Omics-TR)

24. oktober 2024 opdateret af: Research and Treatment Society of Genetic Disorders

En multi-center multi-omics tilgang til undersøgelse af genetiske og epigenetiske mekanismer i autismespektrumforstyrrelser

Målet med dette observationsstudie er at undersøge de genetiske og epigenetiske mekanismer, der kan bidrage til udviklingen af ​​autismespektrumforstyrrelser (ASD) hos individer i forskellige aldersgrupper. Studiet har til formål at undersøge, hvordan genetiske varianter og miljøfaktorer interagerer for at påvirke risikoen for ASD.

De vigtigste spørgsmål, den sigter mod at besvare er:

  • Hvilke genetiske varianter er stærkest forbundet med udviklingen af ​​ASD?
  • Hvordan påvirker miljøfaktorer, såsom prænatal eksponering, disse genetiske risici?
  • Kan kombinationen af ​​genetiske og epigenetiske data forbedre tidlig detektion eller interventionsstrategier for ASD?

Deltagerne vil:

  • Giv biologiske prøver til genetisk og epigenetisk analyse.
  • Udfyld detaljerede spørgeskemaer vedrørende miljøeksponeringer og familiehistorie.
  • Deltage i kliniske vurderinger for at evaluere sværhedsgraden af ​​ASD-symptomer.

Forskere vil sammenligne genetiske og miljømæssige data mellem individer med ASD og dem uden lidelsen for at forstå, hvordan disse faktorer kan bidrage til risikoen for ASD. Denne multi-center undersøgelse vil finde sted på tværs af flere universiteter og hospitaler i Türkiye, med fokus på det potentielle samspil mellem arvelige genetiske faktorer og miljømæssige påvirkninger.

Studieoversigt

Status

Ikke rekrutterer endnu

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

Introduktion til projektet Projektet repræsenterer en innovativ, multi-center undersøgelse, der har til formål at undersøge den genetiske, epigenetiske og miljømæssige underbygning af Autisme Spektrum Disorder (ASD). ASD er en kompleks neuroudviklingstilstand, der typisk viser sig i den tidlige barndom og påvirker individer på forskellige måder, især i social kommunikation og adfærd. Lidelsen er præget af betydelig variation i symptomsværhedsgrad og præsentation på tværs af individer. På trods af mange års forskning forbliver de molekylære mekanismer, der driver start og progression af ASD, uhåndgribelige, hvilket gør diagnose og behandling udfordrende.

Denne forskning har til formål at udfylde dette hul ved at bruge en multi-omics tilgang til bedre at forstå de biologiske, genetiske og miljømæssige faktorer, der bidrager til ASD. Gennem integrationen af ​​genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data søger projektet at afdække molekylære signaturer og interaktioner, der kan forklare variabiliteten i ASD-præsentation og sværhedsgrad. Derudover har undersøgelsen til formål at identificere potentielle biomarkører, der kan føre til tidligere diagnose, bedre prognose og mere personlige behandlingsmuligheder.

Undersøgelsen vil blive udført på tværs af flere forskningscentre med en struktureret og velkoordineret tilgang til dataindsamling, prøvebehandling og analyse. Dette tværfaglige projekt samler en række ekspertise, herunder genetik, bioinformatik, klinisk psykiatri og datavidenskab, hvilket sikrer, at alle aspekter af forskningen behandles med videnskabelig stringens og præcision. Ved at analysere prøver fra individer med ASD vil projektet give ny indsigt i de genetiske og epigenetiske faktorer, der er involveret i ASD, og ​​samtidig undersøge den potentielle indflydelse af miljøfaktorer.

Multi-afdelingsstruktur og projektintegritet Projektet er organiseret i flere specialiserede afdelinger, hver med en specifik rolle i at opretholde undersøgelsens integritet og sikre, at alle forskningsaktiviteter udføres til de højeste standarder. Denne struktur giver mulighed for problemfrit samarbejde mellem afdelinger og sikrer, at alle data indsamles, behandles og analyseres med den største nøjagtighed.

Overordnet koordinering og tilsyn På højeste niveau ledes projektet af en overordnet koordinator, som fører tilsyn med alle aspekter af forskningen. Denne koordinator sikrer, at hver afdeling overholder projektets mål og tidslinje, fremmer kommunikationen mellem teams og letter integrationen af ​​kliniske, genetiske og epigenetiske data. Koordinering sikrer, at eventuelle udfordringer, der opstår i løbet af undersøgelsen, bliver løst omgående, og at projektet forbliver på vej til at nå sine mål.

Rollen som den overordnede koordinator er afgørende for at sikre integrationen af ​​multiomics-data fra de forskellige forskningscentre. Koordinatoren spiller også en central rolle i fortolkningen af ​​data og arbejder tæt sammen med dataanalyseholdene for at sikre, at resultaterne er sammenhængende og meningsfulde. Regelmæssige opdateringer deles på tværs af afdelinger for at opretholde overensstemmelse med projektets overordnede forskningsmål.

Kliniske operationer: Voksne og pædiatriske enheder Projektets kliniske operationer er opdelt i to hovedsektorer: voksen og pædiatrisk. Hver sektor ledes af et dedikeret team, der fører tilsyn med kliniske centre, der er ansvarlige for dataindsamling. Disse kliniske centre er placeret på tværs af forskellige regioner, hvilket gør det muligt for projektet at indsamle en bred og forskelligartet række af kliniske data fra personer diagnosticeret med ASD.

Hvert klinisk center følger standardiserede protokoller for dataindsamling, hvilket sikrer, at alle patientdata indsamles på en ensartet og konsistent måde. Dataindsamlingsprocessen involverer brug af internationalt anerkendte diagnostiske værktøjer, herunder Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) og Social Communication Questionnaire (SCQ). Disse værktøjer er afgørende for diagnosticering af ASD og til evaluering af symptomernes sværhedsgrad.

De kliniske operationer involverer også indsamling af sociodemografiske data, udviklingshistorier og information om komorbide tilstande. Disse data er indsamlet gennem spørgeskemaer og kliniske interviews udført af uddannet sundhedspersonale. Indsamlingen af ​​dette omfattende datasæt er afgørende for at forstå den kliniske heterogenitet af ASD og for at korrelere kliniske symptomer med genetiske og miljømæssige data.

Genetiske og omics divisioner De genetiske og omics divisioner udgør kernen i projektet, og leverer de molekylære data, der vil blive brugt til at afdække de genetiske og epigenetiske mekanismer, der driver ASD. Afdelingen fører tilsyn med indsamling, bearbejdning og analyse af biologiske prøver, som omfatter venøst ​​blod og næsepodninger fra undersøgelsesdeltagere.

Prøveindsamling og -behandling De biologiske prøver indsamlet fra deltagere gennemgår en streng og standardiseret proces med nukleinsyreekstraktion. Denne proces, der styres af nukleinsyreekstraktions- og oprensningsteamene, involverer isolering af højkvalitets DNA og RNA fra blod- og næsepodningsprøverne. Disse prøver er afgørende for nedstrøms sekventering og analyser. Kvaliteten af ​​det ekstraherede DNA og RNA er kritisk, da eventuelle urenheder eller nedbrydning kan påvirke nøjagtigheden af ​​de genetiske og epigenetiske analyser.

Når de er ekstraheret, udsættes DNA- og RNA-prøverne for flere kvalitetskontroltjek. Disse kontroller overvåges af kvalitetskontrol- og lagerholdene, som sikrer, at nukleinsyrerne opfylder de krævede standarder for sekventering. Prøver, der består kvalitetskontrollen, opbevares under optimale forhold og bevarer deres integritet, indtil de er klar til at blive sekventeret.

Genomisk analyse Den genomiske analyse af DNA-prøver begynder med helgenom-sekventering (WGS), en omfattende teknik, der gør det muligt for forskere at undersøge hele den genetiske kode for hver deltager. WGS muliggør identifikation af en lang række genetiske varianter, herunder enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er), kopiantalvariationer (CNV'er), insertioner og deletioner (InDels) og strukturelle varianter. Disse varianter evalueres for at bestemme deres potentielle bidrag til ASD.

En af de primære analyser, der udføres inden for den genomiske division, er den genom-wide association study (GWAS). GWAS bruges til at identificere genetiske varianter, der er signifikant forbundet med ASD ved at sammenligne hyppigheden af ​​varianter mellem individer med ASD og dem uden lidelsen. Denne analyse er især nyttig til at identificere almindelige genetiske varianter, der kan bidrage til ASD-risiko.

Udover GWAS udfører projektet også kvantitative trait locus (QTL) analyse. QTL-analyse undersøger, hvordan genetiske varianter påvirker kvantitative træk relateret til ASD, såsom symptomsværhed, kognitiv funktion eller udviklingsmæssige milepæle. Denne type analyse hjælper med at belyse det genetiske grundlag for fænotypisk variabilitet i ASD og identificerer specifikke varianter, der kan bidrage til forskelle i symptompræsentation.

Epigenetisk analyse Den epigenetiske komponent i projektet fokuserer på, hvordan miljøfaktorer påvirker genekspression og bidrager til risikoen for ASD. DNA-methylering er en af ​​de vigtigste epigenetiske mekanismer, der er undersøgt i dette projekt. Ved hjælp af hele genom-bisulfit-sekventering (WGBS) analyserer forskere DNA-methyleringsmønstre på tværs af hele genomet. WGBS betragtes som guldstandarden for højopløsnings DNA-methyleringsanalyse, hvilket muliggør identifikation af methyleringsændringer, der er forbundet med ASD.

Differentielt methylerede regioner (DMR'er) er genomiske regioner, hvor methyleringsniveauerne er forskellige mellem individer med ASD og upåvirkede kontroller. Ved at identificere disse DMR'er kan forskere udpege specifikke genomiske regioner, hvor miljøfaktorer kan påvirke genekspression hos individer med ASD.

Derudover er allel-specifik methylering (ASM) udforsket i denne undersøgelse. ASM-analyse undersøger, hvordan methyleringsmønstre adskiller sig mellem de to kopier af et gen, der er arvet fra hver forælder. Denne analyse hjælper forskere med at forstå, hvordan genetiske og epigenetiske faktorer interagerer for at påvirke genekspression og bidrage til ASD-risiko.

Som en del af den epigenetiske analyse vil m-QTL (methylation quantitative trait loci) analyse blive udført for at undersøge forholdet mellem genetiske varianter og DNA-methyleringsmønstre på tværs af genomet. m-QTL'er er genomiske loci, hvor variationer i DNA-sekvens er forbundet med forskelle i DNA-methyleringsniveauer. Ved at identificere disse loci har projektet til formål at afdække, hvordan genetisk variation påvirker epigenetisk regulering og efterfølgende, hvordan disse interaktioner kan bidrage til risikoen for at udvikle ASD. Denne analyse vil give værdifuld indsigt i samspillet mellem genetiske og epigenetiske faktorer, der hjælper med at belyse de molekylære mekanismer, der understøtter ASD. Derudover kan m-QTL'er tjene som potentielle biomarkører til at forstå den miljømæssige modulering af genetisk modtagelighed hos individer med ASD.

De epigenetiske data er også integreret med genetiske data for at udføre epigenom-wide association studier (EWAS). EWAS undersøger, hvordan DNA-methyleringsmønstre korrelerer med ASD, med det formål at identificere methyleringsmærker, der kan tjene som biomarkører for lidelsen. Disse analyser er afgørende for at forstå, hvordan miljøeksponeringer, såsom prænatal stress, toksiner eller mødres sundhed, kan påvirke ASD-risiko gennem epigenetiske mekanismer.

Transkriptomisk analyse Den transkriptomiske analyse fokuserer på at forstå, hvordan genekspression adskiller sig mellem individer med ASD og dem uden lidelsen. RNA-sekventering (RNA-seq) bruges til at måle niveauerne af genekspression i både blod- og næsepodningsprøver. RNA-seq giver et omfattende billede af transkriptomet, som repræsenterer det komplette sæt af RNA-transkripter, der er til stede i en celle eller et væv på et givet tidspunkt.

RNA-seq-dataene bruges til at udføre differentiel genekspression (DGE) analyse, som identificerer gener, der enten er opreguleret eller nedreguleret hos individer med ASD. Denne analyse hjælper med at afdække de molekylære veje, der er forstyrret i ASD og fremhæver potentielle biomarkører, der kan bruges til tidlig diagnose eller behandling.

Ud over at identificere differentielt udtrykte gener, bruges de transkriptomiske data til at udføre pathway-analyse. Pathway-analyse undersøger, hvordan ændringer i genekspression påvirker biologiske processer og cellulære funktioner. Denne analyse kan identificere nøgleveje, der kan blive forstyrret i ASD, hvilket giver indsigt i de biologiske mekanismer, der ligger til grund for lidelsen.

Ved at sammenligne genekspressionsprofilerne fra både blod- og næsepodningsprøver kan forskere identificere vævsspecifikke ekspressionsmønstre. Denne sammenligning giver en mere nuanceret forståelse af de molekylære forskelle mellem væv og kan afsløre vævsspecifikke biomarkører for ASD.

eQTL (Expression Quantitative Trait Loci) Analyse

Ud over m-QTL-analyse vil integration af eQTL (expression quantitative trait loci)-analyse gøre det muligt for projektet at identificere genetiske varianter, der påvirker genekspressionsniveauer. eQTL'er er loci, hvor genetiske variationer er korreleret med ændringer i genekspression. Ved at analysere eQTL'er kan undersøgelsen undersøge, hvordan specifikke genetiske varianter påvirker transskriptionen af ​​gener relateret til ASD. Denne tilgang hjælper med at afdække regulatoriske veje og gennetværk, der bidrager til variabiliteten i ASD-symptomer. Integrationen af ​​eQTL-analyse med transkriptomiske data (såsom RNA-Seq) giver en nuanceret forståelse af, hvordan genetiske risikofaktorer ændrer genekspression, hvilket i sidste ende påvirker den fænotypiske manifestation af ASD.

Epitranskriptomisk analyse

Ud over studiet af DNA og RNA gennem genomik og transkriptomik, udforsker epitranscriptomics post-transkriptionelle modifikationer af RNA, såsom N6-methyladenosin (m6A). Disse RNA-modifikationer kan påvirke mRNA-stabilitet, splejsning, transport og translation og dermed påvirke proteinproduktion og cellefunktion. Inkludering af epitranskriptomisk analyse som en del af RNA-Seq-arbejdsgangen vil give indsigt i, hvordan RNA-modifikationer adskiller sig hos ASD-patienter, hvilket giver et ekstra lag af genregulering, der bidrager til kompleksiteten af ​​ASD. Denne undersøgelse kunne afsløre nye epitranskriptomiske biomarkører for ASD, hvilket tilføjer dybde til undersøgelsens udforskning af genregulering på RNA-niveau.

Dataintegration og bioinformatik Integrationen af ​​de genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data er en nøglekomponent i projektet. Bioinformatik- og dataanalyseholdene er ansvarlige for at behandle og analysere de enorme mængder data, der genereres af omics-divisionerne. Dette involverer brug af avancerede bioinformatiske værktøjer og statistiske modeller til at integrere dataene og afdække meningsfulde mønstre.

Det integrerede datasæt udsættes for multivariate regressionsmodeller, som undersøger interaktionerne mellem genetiske varianter, epigenetiske modifikationer og genekspressionsniveauer. Disse modeller bruges til at identificere, hvordan disse faktorer i fællesskab bidrager til ASD-risiko og symptomsværhed. Ved at inkorporere både genetiske og miljømæssige data kan modellerne også udforske gen-miljø-interaktioner, der kan spille en rolle i udviklingen af ​​ASD.

Netværksanalyse er et andet nøgleværktøj, der bruges af bioinformatikteamet. Denne teknik visualiserer interaktionerne mellem gener, proteiner og regulatoriske elementer, hvilket gør det muligt for forskere at identificere nøglegener og veje, der kan være involveret i ASD. Netværksanalyse hjælper også med at afdække genregulatoriske netværk, der kan blive forstyrret hos personer med ASD, hvilket giver indsigt i de molekylære mekanismer, der driver lidelsen.

Projektet udnytter også maskinlæring (ML) og kunstig intelligens (AI) algoritmer til at analysere dataene. Disse prædiktive modeller er designet til at hjælpe klinikere med at træffe personlige behandlingsbeslutninger baseret på hver patients molekylære profil. For eksempel kan AI-modeller bruges til at forudsige sværhedsgraden af ​​ASD-symptomer baseret på genetiske, epigenetiske og kliniske data, hvilket muliggør mere målrettede indgreb.

Hi-C og In-Silico Analyse:

Mens traditionel Hi-C-analyse ofte bruger tværbindere til at fange langrækkende kromatininteraktioner, vil dette projekt tage en særskilt tilgang ved at give afkald på brugen af ​​tværbindere til at forbinde specifikke DNA-fragmenter. I stedet vil kromatininteraktionsdataene blive udledt og genbesøgt in-silico post-data integration. Ved at analysere 3D-kromatinarkitekturen beregningsmæssigt vil projektet sigte mod at identificere rumlige kromatininteraktioner, der bidrager til reguleringen af ​​ASD-associerede gener.

Denne post-integrationstilgang giver mulighed for identifikation af regulatoriske elementer, såsom forstærkere og promotorer, der interagerer med fjerne genomiske regioner i forbindelse med ASD. Dataene genereret fra de genomiske, epigenomiske og transkriptomiske analyser vil blive integreret for at afsløre kromatininteraktionsmønstre, der påvirker genekspression, især dem, der er forbundet med ASD-patologi. Denne strategi vil give mulighed for en mere fleksibel og raffineret forståelse af 3D-genomorganisation uden de begrænsninger, der pålægges af crosslinker-baserede metoder.

ChIP-Seq og In-Silico epigenetisk patogeneseanalyse:

Ud over kromatininteraktionskortlægning vil ChIP-Seq-data blive brugt til epigenetisk patogeneseanalyse. Ved at udføre in-silico-analyse af ChIP-Seq-resultater vil projektet identificere histonmodifikationer og transkriptionsfaktorbindingssteder, der er involveret i reguleringen af ​​genekspression i ASD. Denne teknik vil hjælpe med at belyse rollerne af specifikke epigenetiske mærker, såsom histonacetylering og methylering, i dysreguleringen af ​​ASD-associerede gener.

Integrationen af ​​ChIP-Seq-data med andre omics-data, herunder DNA-methylering (WGBS) og RNA-Seq-ekspressionsprofiler, vil give et omfattende overblik over de regulatoriske netværk, der driver ASD. Dette vil give forskere mulighed for at udpege specifikke reguleringsmekanismer, såsom ændret transkriptionsfaktoraktivitet eller ændringer i kromatintilgængelighed, der kan bidrage til opståen eller sværhedsgraden af ​​ASD-symptomer. In-silico-analyse af ChIP-Seq-resultaterne vil således tjene som et stærkt værktøj til at forstå det epigenetiske landskab forbundet med ASD-patogenese.

Projektet kan yderligere forbedre sin analyse ved at beregne polygenisk risikoscore (PRS), som kvantificerer den kumulative effekt af adskillige genetiske varianter med lille effekt på risikoen for at udvikle ASD. Ved at aggregere data fra tusindvis af genetiske varianter kan PRS forudsige et individs overordnede genetiske disposition for ASD. Disse scores kan derefter korreleres med kliniske og fænotypiske data for bedre at forstå, hvordan genetisk risiko omsættes til observerbare symptomer. PRS kan også integreres med miljømæssige og epigenetiske data for at udforske gen-miljø-interaktioner, hvilket tilbyder en omfattende model for ASD-følsomhed.

Kvalitetskontrol og overholdelse Opretholdelse af projektets integritet er altafgørende, og dette opnås gennem strenge kvalitetskontrolforanstaltninger og en omfattende overholdelsesramme. Projektet omfatter flere afdelinger dedikeret til at sikre, at alle forskningsaktiviteter overholder etiske retningslinjer og regulatoriske standarder.

Risikostyringsafdelingen spiller en afgørende rolle i at identificere og afbøde potentielle risici, der kan kompromittere undersøgelsens integritet. Denne afdeling arbejder tæt sammen med de interne revisions- og etikoverholdelsesteams for at sikre, at alle forskningsaktiviteter overholder etiske standarder, såsom Helsinki-erklæringen og nationale regler for beskyttelse af personoplysninger.

Kvalitetskontrolholdene er ansvarlige for at overvåge kvaliteten af ​​de biologiske prøver og sikre, at alle data er nøjagtige og pålidelige. Disse teams udfører regelmæssige audits og implementerer korrigerende og forebyggende handlinger (CAPA), når det er nødvendigt for at løse eventuelle problemer, der opstår i løbet af undersøgelsen.

Dokumentations- og arkiveringsafdelingen er ansvarlig for at administrere alle projektregistre, herunder revisionsrapporter, dataoverførselslogfiler og overholdelsesregistre. Denne afdeling sikrer, at al projektrelateret dokumentation er sikkert opbevaret og let tilgængelig til gennemsyn, hvilket letter gennemsigtighed og ansvarlighed.

Projektet omfatter også et indkøbs- og supply chain management team, som er ansvarligt for at sikre, at alle nødvendige materialer, udstyr og reagenser anskaffes rettidigt. Dette team styrer logistikken af ​​materialeoverførsler og sikrer, at alle forsyninger opfylder de krævede kvalitetsstandarder.

Etiske overvejelser og deltagernes sikkerhed Deltagernes sikkerhed og privatliv er altafgørende i udførelsen af ​​undersøgelsen. Alle deltagerdata anonymiseres og opbevares sikkert for at beskytte deres fortrolighed. Projektet overholder både nationale og internationale regler vedrørende beskyttelse af persondata, hvilket sikrer, at deltagernes rettigheder til enhver tid respekteres.

Informeret samtykke indhentes fra alle deltagere, før de tilmeldes undersøgelsen. Deltagerne får detaljeret information om undersøgelsens mål, procedurer og potentielle risici. De er også informeret om deres ret til at trække sig fra undersøgelsen til enhver tid uden straf.

Undersøgelsen har modtaget etisk godkendelse fra de relevante nationale etiske komiteer, hvilket sikrer, at alle forskningsaktiviteter overholder etablerede etiske retningslinjer. Der udføres regelmæssige audits for at sikre, at alle procedurer følges korrekt, og at eventuelle etiske betænkeligheder behandles omgående.

Dataintegration og visualisering Efter afslutningen af ​​undersøgelsen vil alle data fra de genomiske, epigenomiske og transkriptomiske analyser blive integreret og visualiseret ved hjælp af avancerede bioinformatiske værktøjer. Det integrerede datasæt vil give et omfattende overblik over de molekylære mekanismer, der ligger til grund for ASD, hvilket gør det muligt for forskere at identificere vigtige biomarkører og potentielle terapeutiske mål.

De integrerede data vil blive præsenteret gennem forskellige visualiseringsteknikker, såsom heatmaps, netværkskort og rutediagrammer. Disse visualiseringer vil hjælpe forskere med at fortolke dataene og drage meningsfulde konklusioner om de biologiske processer, der er involveret i ASD.

Konklusion Dette projekt er et skelsættende studie inden for ASD-forskning, der anvender en multi-omics tilgang til at afdække de genetiske, epigenetiske og miljømæssige faktorer, der bidrager til lidelsen. Projektets tværfaglige struktur, med dedikerede teams til kliniske operationer, dataanalyse, kvalitetskontrol og compliance, sikrer, at forskningen udføres med det højeste niveau af videnskabelig stringens.

Ved at integrere genomiske, epigenomiske og transkriptomiske data har projektet til formål at give ny indsigt i de molekylære mekanismer, der ligger til grund for ASD, og ​​at identificere potentielle biomarkører til diagnose og behandling. Resultaterne fra denne undersøgelse kan bane vejen for personlige medicinske tilgange til ASD, hvilket forbedrer livskvaliteten for personer, der er berørt af lidelsen.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

3000

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

Studiesteder

  • Kalkun
      • Afyonkarahisar, Kalkun
        • Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Aziz Kara, MD.
      • Ankara, Kalkun
        • Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Yasemin Hoşgören Alıcı, MD.
      • Ankara, Kalkun
        • Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Yasemin Taş Torun, MD.
      • Ankara, Kalkun
        • Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mehmet Ayhan Cöngöloğlu, MD.
      • Bursa, Kalkun
        • Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Caner Mutlu, MD.
      • Denizli, Kalkun
        • Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Bürge Kabukçu Başay, MD.
      • Erzurum, Kalkun
        • Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Esen Yıldırım Demirdöğen, MD.
      • Gaziantep, Kalkun
        • Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mehmet Karadağ, MD.
      • Giresun, Kalkun
        • Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Bedia Sultan Önal, MD.
      • Istanbul, Kalkun
        • Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Mahmut Cem Tarakçıoğlu, MD.
      • Istanbul, Kalkun
        • Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Alperen Bıkmazer, MD.
      • Istanbul, Kalkun
        • Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Aynur Görmez, MD.
      • Istanbul, Kalkun
        • Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Yasin Çalışkan, MD.
      • Izmir, Kalkun
        • Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Gonca Özyurt, MD.
      • Konya, Kalkun
        • Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Ömer Faruk Akça, MD.
      • Konya, Kalkun
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • ÖZKAN BAĞCI, Ph.D.
        • Kontakt:
          • Ali TORABI, MD.,Ph.D.
        • Kontakt:
          • EBRU MARZİOĞLU ÖZDEMİR, MD.
      • Trabzon, Kalkun
        • Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Esra Hoşoğlu, MD.
      • Şanlıurfa, Kalkun
        • Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Fethiye Kılıçaslan, MD.
    • Selçuklu
      • Konya, Selçuklu, Kalkun, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Hasan Ali Güler, MD.
      • Konya, Selçuklu, Kalkun, 42250
        • Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • ALİ KANDEĞER, MD.

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Undersøgelsespopulationen vil bestå af personer, der er diagnosticeret med autismespektrumforstyrrelse (ASD) eller udviser autisme-lignende træk, udvalgt fra kliniske centre med speciale i neuroudviklingsforstyrrelser. Populationen vil også omfatte en sund kontrolgruppe, matchet efter alder, køn og socio-demografiske variabler, rekrutteret fra det generelle samfund. ASD-kohorten vil omfatte deltagere på tværs af en række funktionelle niveauer, fra højtfungerende til lavtfungerende autisme, såvel som dem med udviklingsprofiler og komorbide tilstande. Kontroller vil være fri for psykiatriske eller neurologiske diagnoser og kroniske lidelser.

Beskrivelse

- Inklusionskriterier: Autismespektrumforstyrrelse (ASD) eller autismelignende træk: Personer, der er diagnosticeret med ASD baseret på DSM-5 diagnostiske kriterier, eller personer, der udviser væsentlige autismetræk uden en formel diagnose.

Sund kontrolgruppe: Alders-, køns- og sociodemografisk matchede individer uden nogen psykiatrisk eller neurologisk lidelse.

ASD-individer af varierende funktionsniveau: Deltagere med ASD fra en bred vifte af funktionelle evner, fra højtfungerende til lavtfungerende autisme.

Komorbide tilstande: Inklusion af frivillige med udviklingsprofiler og komorbide tilstande som ADHD og indlæringsvanskeligheder.

Informeret samtykke: Skriftligt informeret samtykke fra deltagere over 18 år. For deltagere under 18 år, samtykke fra forældre eller værger.

- Eksklusionskriterier: Alvorlige psykotiske lidelser: Personer diagnosticeret med tilstande som skizofreni eller skizoaffektiv lidelse.

Kendte genetiske syndromer eller kromosomale anomalier: Personer med genetiske tilstande såsom Downs syndrom eller Fragilt X-syndrom.

Historie om genetiske eller eksperimentelle terapier: Deltagere med tidligere gen- eller celleterapi, hyppige blodtransfusioner eller knoglemarvstransplantationer.

Alvorlige kommunikations- eller kognitive svækkelser: Deltagere med kommunikations- eller kognitive forstyrrelser, der ville hindre deres evne til at deltage i dataindsamling, eller dem med aggressive adfærdsforstyrrelser.

Manglende overholdelse eller medicinske begrænsninger: Individer, der ikke er i stand til at overholde undersøgelsesprocedurer eller med medicinske tilstande, der forhindrer biologisk prøveindsamling.

- Kontrolgruppe: Raske personer: Deltagere uden ASD eller nogen psykiatriske eller neurologiske lidelser.

Alders- og kønsmatching: Matchet med ASD-gruppen med hensyn til alder, køn og sociodemografisk status.

Ingen historie med genetiske eller neuroudviklingsmæssige lidelser: Personer uden genetiske syndromer, kromosomale anomalier eller neuroudviklingslidelser.

Ingen kronisk sygdomshistorie: Deltagere uden historie med kroniske sygdomme som cancer, autoimmune sygdomme eller metaboliske tilstande.

Informeret samtykke: Skriftligt informeret samtykke fra personer over 18 år eller fra forældre/værger for deltagere under 18 år.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
ASD-sagsgruppe
Repræsenterer personer diagnosticeret med autismespektrumforstyrrelse (ASD), som vil gennemgå genetisk, epigenetisk og transkriptomisk analyse.
Kontrolgruppe
Repræsenterer upåvirkede individer, der tjener som sammenligningsgruppe for genetiske og molekylære analyser.
HOT Cluster Biomarker Group
Repræsenterer deltagere udvalgt efter sekundære udfaldsresultater baseret på HOT-klyngeanalyse, som vil gennemgå ELISA for at studere potentielle biomarkører afledt af RNA-transkriptom-pathway-analyse.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Afslutning af rekruttering af kliniske data
Tidsramme: Forventes færdig inden for 24 måneder efter studiestart.
Det primære resultat vil være rekruttering af personer diagnosticeret med autismespektrumforstyrrelse (ASD) og upåvirkede kontroller. Der vil blive indsamlet omfattende kliniske, sociodemografiske og fænotypiske data, herunder diagnostiske vurderinger ved hjælp af standardiserede værktøjer (f.eks. ADOS, SCQ).
Forventes færdig inden for 24 måneder efter studiestart.

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Indsamling og færdiggørelse af genetiske rådata (WGS og WGBS)
Tidsramme: Forventes afsluttet inden for 30 måneder efter studiestart
Det sekundære resultat fokuserer på erhvervelse af rå genetiske data fra helgenom-sekventering (WGS) og helgenom-bisulfit-sekventering (WGBS) fra blod- og næsepodningsprøver. Sekvenseringsdataene vil blive brugt til efterfølgende genetiske og epigenetiske analyser for at identificere varianter, methyleringsændringer og deres associationer med ASD.
Forventes afsluttet inden for 30 måneder efter studiestart
Integration af genetiske data
Tidsramme: Forventes afsluttet inden for 60 måneder efter studiestart.
Dette resultat måler integrationen af ​​helgenom-sekventering (WGS), helgenom-bisulfit-sekventering (WGBS) og RNA-seq-data i et kombineret datasæt til omfattende multi-omics-analyse. Målet er at afdække genetiske og epigenetiske interaktioner relateret til ASD.
Forventes afsluttet inden for 60 måneder efter studiestart.

Andre resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Komplet (endelig) resultatmål: sammenhæng mellem kliniske og genetiske data
Tidsramme: Forventes inden for 66 måneder, efter at alle dataindsamlings- og analysefaser er afsluttet.
Det endelige resultat vil vurdere sammenhængen mellem genetiske, epigenetiske og transkriptomiske data med kliniske fænotyper. Dette resultat har til formål at identificere væsentlige associationer, der kan forklare den genetiske underbygning af autismespektrumforstyrrelser, hvilket bidrager til potentielle biomarkører eller terapeutiske mål.
Forventes inden for 66 måneder, efter at alle dataindsamlings- og analysefaser er afsluttet.

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Research and Treatment Society of Genetic Disorders

Samarbejdspartnere

İnvitrotek A.Ş.
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Psychiatry
Istanbul Cerrahpasa Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara SBÜ Gülhane Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Gazi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Izmir Katip Çelebi Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Şanlıurfa Harran University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Erzurum Atatürk University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Trabzon Karadeniz Technical University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Denizli Pamukkale University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Gaziantep University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Afyonkarahisar University of Health Sciences, Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Bursa Uludağ University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Giresun University, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Ankara Başkent University, Department of Psychiatry
Istanbul Medeniyet University, Department of Psychiatry
Konya Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Istanbul Çam and Sakura City Hospital, Department of Child and Adolescent Psychiatry
Konya Selcuk University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics

Efterforskere

  • Studiestol: Ali Torabi, MD.,Ph.D., Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
  • Studieleder: Ali Kandeğer, MD., RUH SAĞLIĞI VE HASTALIKLARI Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı Anabilim Dalı
  • Studieleder: Ömer Faruk Akça, MD., Çocuk Ve Ergen Ruh Sağlığı Ve Hastalıkları Uzmanı /Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi- Çocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı
  • Studieleder: Nadir Koçak, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Studieleder: Ebru Marzioğlu Özdemir, MD, Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi
  • Studieleder: Özkan Bağcı, Ph.D., Tıbbi Genetik Uzmanı / Konya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi- Tıbbi Genetik Anabilim Dalı ve Genetik Hastaliklar Araştırma ve Tedavi Derneği(RTSGD) Yönetim kurulu üyesi

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Anslået)

27. december 2025

Primær færdiggørelse (Anslået)

27. december 2027

Studieafslutning (Anslået)

27. maj 2028

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

24. oktober 2024

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

24. oktober 2024

Først opslået (Faktiske)

29. oktober 2024

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

29. oktober 2024

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

24. oktober 2024

Sidst verificeret

1. oktober 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • ERC2025SYG-TR-ASD-MultiOmics (Anden identifikator: Horizon European Research Council Synergy Grants(HORIZON-ERC-SYG))
  • HRU.24/16/37 (Anden identifikator: Turkish Medicines and Medical Devices Agency Ethics Committee-HARRAN ÜNİVERSİTESİ KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU)

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

UBESLUTET

IPD-planbeskrivelse

På nuværende tidspunkt er beslutningen om at dele individuelle deltagerdata (IPD) ikke afsluttet. Efter afslutningen af ​​undersøgelsen vil beslutningen blive gennemgået og afsluttet i overensstemmelse med de gældende lovgivningsmæssige og etiske retningslinjer. Den endelige beslutning vil være betinget af, at der indhentes tilladelse fra det tyrkiske agentur for lægemidler og medicinsk udstyr (TİTCK), den etiske komité og det tyrkiske sundhedsministerium. Delingsplanen vil sikre, at alle databeskyttelses- og privatlivsbestemmelser følges nøje, og der vil blive taget passende skridt for at beskytte deltagernes fortrolighed.

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Abonner