Role změn proteinu RPL8 u vysoce kvalitního serózního karcinomu vaječníků (OVCAR)

Pozadí a zdůvodnění studie:

Z našich předběžných analýz datového souboru o pacientkách se serózním ovariálním karcinomem vysokého stupně (HGSOC), dostupného v online databázi The Cancer Genome Atlas, jsme zjistili, že gen kódující ribozomální protein L8 (RPL8) je amplifikován s vysokou frekvencí (~ 30 %) v HGSOC. Navíc jeho exprese mRNA pozitivně koreluje s jeho genetickou amplifikací - pozorování, které nebylo dříve popsáno ani studováno v literatuře. RPL8 je strukturální složka velké ribozomální podjednotky, která se podílí na syntéze proteinů. Na základě těchto a našich předběžných údajů předpokládáme, že amplifikace RPL8 může hrát roli ve vývoji rakoviny vaječníků. Pochopení dopadu amplifikace RPL8 u rakoviny vaječníků by mohlo poskytnout nový pohled na biologii této špatně pochopené rakoviny.

Studijní cíle:

Hlavním cílem tohoto projektu je zjistit, zda lze RPL8 použít jako biomarker jak pro hodnocení rizik, tak pro stratifikaci pacienta při výběru nejvhodnější terapeutické možnosti. Konkrétně se zaměřujeme na studium:

1. Vztah mezi genetickým stavem RPL8 a klinickými výsledky.
2. Příspěvek amplifikace RPL8 k odpovědi na léčbu.

Typ zkoumané lidské tkáně:

Analýzy budou provedeny na vzorcích nádorové tkáně získaných z resekcí rakoviny vaječníků. Některé vzorky již byly shromážděny a uloženy v IRCCS, zatímco jiné se teprve shromáždí.

Typ vyšetřování:

• Analýza exprese RPL8, C-MYC a příbuzných genů (RT-PCR, ddPCR, WB, IHC).
• Analýza počtu kopií genu a screening mutací (ddPCR a podobné molekulární techniky).
• Analýza možných souvislostí mezi patologickými údaji, údaji ze sledování a výsledky terapeutické odpovědi u pacientů.

Metodika analýzy:

Údaje o genetickém stavu, expresi a subcelulární lokalizaci RPL8 a C-MYC budou korelovány s kategorickými a spojitými proměnnými souvisejícími s anamnézou a klinickým stavem pacientů. Rozdíly mezi kategoriálními proměnnými budou analyzovány pomocí analýzy rozptylu (ANOVA), Mann-Whitneyho testu nebo Kruskal-Wallisova testu v závislosti na tom, zda je distribuce dat normální nebo ne (posuzováno pomocí Kolmogorov-Smirnovova testu). Korelace mezi spojitými proměnnými budou hodnoceny pomocí Pearsonových nebo Spearmanových testů, opět na základě distribuce dat.

Obecná charakteristika studované populace:

Kritéria zařazení:

• Věk ≥ 18 let.
• Diagnóza vysokého stupně (3 nebo 4) serózního ovariálního karcinomu, ať už na počátku nebo při recidivě.
• Podepsaný informovaný souhlas s účastí ve studii.

Kritéria vyloučení:

• Nádory vaječníků histologických typů jiných než serózní.
• Jiné primární typy nádorů.

Návrh studie retrospektiva (na archiváliích) + prospektivní