Роль изменений белка RPL8 при серозной карциноме яичников высокой степени злокачественности (OVCAR)

Предыстория и обоснование исследования:

В результате нашего предварительного анализа набора данных о пациентах с серозной карциномой яичников высокой степени злокачественности (HGSOC), доступного в онлайн-базе данных Атлас генома рака, мы обнаружили, что ген, кодирующий рибосомальный белок L8 (RPL8), амплифицируется с высокой частотой (~ 30%) в HGSOC. Более того, экспрессия его мРНК положительно коррелирует с его генетической амплификацией — наблюдение, о котором ранее не сообщалось и не изучалось в литературе. RPL8 является структурным компонентом большой субъединицы рибосомы, которая участвует в синтезе белка. Основываясь на этом и наших предварительных данных, мы предполагаем, что амплификация RPL8 может играть роль в развитии рака яичников. Понимание влияния амплификации RPL8 на рак яичников может дать новое понимание биологии этого плохо изученного рака.

Цели исследования:

Основная цель этого проекта — определить, можно ли использовать RPL8 в качестве биомаркера как для оценки риска, так и для стратификации пациентов при выборе наиболее подходящего варианта лечения. В частности, мы стремимся изучить:

1. Взаимосвязь между генетическим статусом RPL8 и клиническими исходами.
2. Вклад амплификации RPL8 в ответ на лечение.

Тип исследуемой ткани человека:

Анализы будут проводиться на образцах опухолевой ткани, полученных в результате резекции рака яичников. Некоторые образцы уже собраны и хранятся в IRCCS, а другие еще предстоит собрать.

Тип расследования:

• Анализ экспрессии RPL8, C-MYC и родственных генов (RT-PCR, ddPCR, WB, IHC).
• Анализ числа копий гена и скрининг мутаций (ddPCR и аналогичные молекулярные методы).
• Анализ возможных связей между патологоанатомическими данными, данными последующего наблюдения и результатами терапевтического ответа у пациентов.

Методика анализа:

Данные о генетическом статусе, экспрессии и субклеточной локализации RPL8 и C-MYC будут коррелировать с категориальными и непрерывными переменными, связанными с историей болезни и клиническим статусом пациентов. Различия между категориальными переменными будут анализироваться с использованием дисперсионного анализа (ANOVA), критерия Манна-Уитни или критерия Крускала-Уоллиса, в зависимости от того, является ли распределение данных нормальным или нет (оценивается с помощью критерия Колмогорова-Смирнова). Корреляции между непрерывными переменными будут оцениваться с использованием тестов Пирсона или Спирмена, опять же на основе распределения данных.

Общая характеристика исследуемой популяции:

Критерии включения:

• Возраст ≥ 18 лет.
• Диагноз серозной карциномы яичников высокой степени (3 или 4) в начале заболевания или при рецидиве.
• Подписанное информированное согласие на участие в исследовании.

Критерии исключения:

• Опухоли яичников гистологических типов, отличных от серозных.
• Другие типы первичных опухолей.

Ретроспектива дизайна исследования (на архивном материале) + перспектива