Rol van RPL8-eiwitveranderingen bij hooggradig sereus ovariumcarcinoom (OVCAR)

Achtergrond en grondgedachte van het onderzoek:

Uit onze voorlopige analyses van een dataset van patiënten met hooggradig sereus ovariumcarcinoom (HGSOC), beschikbaar in de online database The Cancer Genome Atlas, hebben we ontdekt dat het gen dat codeert voor ribosomaal eiwit L8 (RPL8) met een hoge frequentie (~ 30%) in HGSOC. Bovendien is de mRNA-expressie positief gecorreleerd met de genetische amplificatie ervan - een waarneming die niet eerder in de literatuur is gerapporteerd of bestudeerd. RPL8 is een structurele component van de grote ribosomale subeenheid, die betrokken is bij de eiwitsynthese. Op basis hiervan en onze voorlopige gegevens veronderstellen we dat RPL8-amplificatie een rol kan spelen bij de ontwikkeling van eierstokkanker. Het begrijpen van de impact van RPL8-amplificatie bij eierstokkanker zou nieuwe inzichten kunnen opleveren in de biologie van deze slecht begrepen kanker.

Studiedoelstellingen:

Het hoofddoel van dit project is om te bepalen of RPL8 kan worden gebruikt als biomarker, zowel voor risicobeoordeling als voor patiëntstratificatie bij het kiezen van de meest geschikte therapeutische optie. Concreet willen we het volgende bestuderen:

1. De relatie tussen de genetische status van RPL8 en klinische resultaten.
2. De bijdrage van RPL8-amplificatie aan de behandelingsrespons.

Type menselijk weefsel dat wordt bestudeerd:

De analyses zullen worden uitgevoerd op tumorweefselmonsters verkregen uit resecties van eierstokkanker. Sommige monsters zijn al verzameld en opgeslagen bij het IRCCS, terwijl andere nog moeten worden verzameld.

Soort onderzoek:

• Expressieanalyse van RPL8, C-MYC en gerelateerde genen (RT-PCR, ddPCR, WB, IHC).
• Analyse van het aantal genkopieën en mutatiescreening (ddPCR en vergelijkbare moleculaire technieken).
• Analyse van mogelijke associaties tussen pathologische gegevens, follow-upgegevens en therapeutische responsresultaten bij patiënten.

Analysemethodologie:

Gegevens over de genetische status, expressie en subcellulaire lokalisatie van RPL8 en C-MYC zullen worden gecorreleerd met categorische en continue variabelen die verband houden met de medische geschiedenis en klinische status van de patiënt. Verschillen tussen categorische variabelen zullen worden geanalyseerd met behulp van variantieanalyse (ANOVA), de Mann-Whitney-test of de Kruskal-Wallis-test, afhankelijk van of de gegevensverdeling normaal is of niet (beoordeeld via de Kolmogorov-Smirnov-test). Correlaties tussen continue variabelen zullen worden geëvalueerd met behulp van Pearson- of Spearman-tests, opnieuw gebaseerd op gegevensdistributie.

Algemene kenmerken van de onderzoekspopulatie:

Inclusiecriteria:

• Leeftijd ≥ 18 jaar.
• Diagnose van hooggradig (3 of 4) sereus ovariumcarcinoom, zowel bij aanvang als bij recidief.
• Ondertekende geïnformeerde toestemming voor deelname aan het onderzoek.

Uitsluitingscriteria:

• Ovariumtumoren van andere histologische typen dan sereus.
• Andere primaire tumortypen.

Studieontwerp retrospectief (over archiefmateriaal) + prospectief