Rolle af RPL8-proteinændringer i højgradigt serøst ovariecarcinom (OVCAR)

Baggrund og begrundelse for undersøgelsen:

Ud fra vores foreløbige analyser af et datasæt om patienter med højgradigt serøst ovariecarcinom (HGSOC), tilgængeligt i onlinedatabasen The Cancer Genome Atlas, fandt vi ud af, at genet, der koder for ribosomalt protein L8 (RPL8), amplificeres ved en høj frekvens (~ 30 %) i HGSOC. Desuden er dets mRNA-ekspression positivt korreleret med dets genetiske amplifikation - en observation, der ikke tidligere er rapporteret eller undersøgt i litteraturen. RPL8 er en strukturel komponent af den store ribosomale underenhed, som er involveret i proteinsyntese. Baseret på dette og vores foreløbige data antager vi, at RPL8-amplifikation kan spille en rolle i udviklingen af ​​kræft i æggestokkene. Forståelse af virkningen af ​​RPL8-amplifikation i æggestokkræft kunne give ny indsigt i biologien af ​​denne dårligt forståede cancer.

Studiemål:

Hovedformålet med dette projekt er at afgøre, om RPL8 kan bruges som en biomarkør både til risikovurdering og til patientstratificering ved valg af den mest passende terapeutiske mulighed. Specifikt sigter vi mod at studere:

1. Forholdet mellem den genetiske status af RPL8 og kliniske resultater.
2. Bidraget fra RPL8-amplifikation til behandlingsrespons.

Type af humant væv under undersøgelse:

Analyserne vil blive udført på tumorvævsprøver opnået fra ovariecancerresektioner. Nogle prøver er allerede blevet indsamlet og opbevaret på IRCCS, mens andre endnu mangler at blive indsamlet.

Type undersøgelse:

• Ekspressionsanalyse af RPL8, C-MYC og relaterede gener (RT-PCR, ddPCR, WB, IHC).
• Genkopinummeranalyse og mutationsscreening (ddPCR og lignende molekylære teknikker).
• Analyse af mulige sammenhænge mellem patologiske data, opfølgningsdata og terapeutiske responsresultater hos patienter.

Analysemetode:

Data om den genetiske status, ekspression og subcellulære lokalisering af RPL8 og C-MYC vil blive korreleret med kategoriske og kontinuerlige variabler relateret til patienternes sygehistorie og kliniske status. Forskelle mellem kategoriske variable vil blive analyseret ved hjælp af variansanalyse (ANOVA), Mann-Whitney-testen eller Kruskal-Wallis-testen, afhængig af om datafordelingen er normal eller ej (vurderet via Kolmogorov-Smirnov-testen). Korrelationer mellem kontinuerte variable vil blive evalueret ved hjælp af Pearson- eller Spearman-tests, igen baseret på datafordeling.

Generelle karakteristika for undersøgelsespopulationen:

Inklusionskriterier:

• Alder ≥ 18 år.
• Diagnose af højgradigt (3 eller 4) serøst ovariecarcinom, enten ved debut eller recidiv.
• Underskrevet informeret samtykke til at deltage i undersøgelsen.

Ekskluderingskriterier:

• Ovarietumorer af andre histologiske typer end serøse.
• Andre primære tumortyper.

Studie Design retrospektiv (på arkivmateriale) + prospektiv