Rollen til RPL8-proteinendringer i høygradig serøs ovariekarsinom (OVCAR)

Bakgrunn og begrunnelse for studien:

Fra våre foreløpige analyser av et datasett på pasienter med høygradig serøst ovariekarsinom (HGSOC), tilgjengelig i den elektroniske databasen The Cancer Genome Atlas, fant vi at genet som koder for ribosomalt protein L8 (RPL8) er amplifisert med høy frekvens (~ 30 %) i HGSOC. Dessuten er dets mRNA-uttrykk positivt korrelert med dets genetiske amplifikasjon - en observasjon som ikke tidligere er rapportert eller studert i litteraturen. RPL8 er en strukturell komponent av den store ribosomale underenheten, som er involvert i proteinsyntese. Basert på dette, og våre foreløpige data, antar vi at RPL8-amplifikasjon kan spille en rolle i utvikling av eggstokkreft. Å forstå virkningen av RPL8-amplifikasjon i eggstokkreft kan gi ny innsikt i biologien til denne dårlig forstått kreften.

Studiemål:

Hovedmålet med dette prosjektet er å finne ut om RPL8 kan brukes som en biomarkør både for risikovurdering og for pasientstratifisering ved valg av det mest hensiktsmessige terapeutiske alternativet. Konkret tar vi sikte på å studere:

1. Forholdet mellom den genetiske statusen til RPL8 og kliniske utfall.
2. Bidraget til RPL8-amplifikasjon til behandlingsrespons.

Type menneskelig vev som studeres:

Analysene vil bli utført på tumorvevsprøver hentet fra eggstokkreftreseksjoner. Noen prøver er allerede samlet inn og lagret ved IRCCS, mens andre ennå ikke er samlet inn.

Type undersøkelse:

• Ekspresjonsanalyse av RPL8, C-MYC og relaterte gener (RT-PCR, ddPCR, WB, IHC).
• Genkopinummeranalyse og mutasjonsscreening (ddPCR og lignende molekylære teknikker).
• Analyse av mulige assosiasjoner mellom patologiske data, oppfølgingsdata og terapeutiske responsresultater hos pasienter.

Analysemetodikk:

Data om genetisk status, uttrykk og subcellulær lokalisering av RPL8 og C-MYC vil være korrelert med kategoriske og kontinuerlige variabler relatert til pasientenes sykehistorie og kliniske status. Forskjeller mellom kategoriske variabler vil bli analysert ved bruk av variansanalyse (ANOVA), Mann-Whitney-testen eller Kruskal-Wallis-testen, avhengig av om datafordelingen er normal eller ikke (vurdert via Kolmogorov-Smirnov-testen). Korrelasjoner mellom kontinuerlige variabler vil bli evaluert ved hjelp av Pearson- eller Spearman-tester, igjen basert på datadistribusjon.

Generelle kjennetegn ved studiepopulasjonen:

Inkluderingskriterier:

• Alder ≥ 18 år.
• Diagnose av høygradig (3 eller 4) serøst ovariekarsinom, enten ved debut eller tilbakefall.
• Signert informert samtykke til å delta i studien.

Ekskluderingskriterier:

• Ovarietumorer av andre histologiske typer enn serøse.
• Andre primære tumortyper.

Studie Design retrospektiv (på arkivmateriale) + prospektiv