Validace proteomického profilování jako diagnostického testu pro extrahepatický cholangiokarcinom (PROFI-CHOL)

Cholangiokarcinom je rakovina s narůstající incidencí a špatnou prognózou (< 5 % všech stadií po 5 letech). Extrahepatální forma je nejčastější a při diagnóze je zřídka resekovatelná (30 % případů). To je způsobeno pozdním nástupem příznaků, které často naznačují, že onemocnění je příliš pokročilé. To lze také vysvětlit diagnostickými obtížemi, se kterými se tato rakovina setkává. Ve skutečnosti je referenční diagnostickou technikou histologické testování endobiliárních cytologických vzorků odebraných biopsií a/nebo kartáčováním během katetrizace žlučovodů nebo intervenční radiologií. Problém je v tom, že senzitivita tohoto testu je řádově 50 %, s další diagnostickou nejistotou řádově 20 až 30 %, v důsledku buněčných atypií, které nejsou dostatečně jasné, aby potvrdily rakovinnou patologii, ačkoli to není možné to vyloučit. To vede k diagnostickým chybám a zpožděním, opakovaným invazivním vyšetřením a někdy velkým operacím stenóz, které jsou nakonec benigní, když bylo chirurgické rozhodnutí přijato bez spolehlivého histologického výsledku. K diagnostice suspektní extrahepatální stenózy cholangiokarcinomu jsou zapotřebí další diagnostické techniky, zejména na molekulární úrovni pomocí proteomiky a především proteomického profilování. Proteomické profilování umožňuje orientaci diagnózy pacienta na profil (benigní nebo maligní) porovnáním proteinů identifikovaných ve formalínu fixované, parafínem zalité tkáni (cytologický vzorek) se sadou proteinů identifikovaných v referenčním diagnostickém podpisu získaném z dříve analyzovaných benigních a maligních vzorků. V rámci Inserm Unit 1312 – Team 3 byl vyvinut důkaz koncepce proteomického profilování jako diagnostický nástroj tváří v tvář podezření na stenózu extrahepatálního cholangiokarcinomu s vyvinutím diagnostického podpisu. Cílem tohoto projektu je ověřit tento důkaz konceptu na velké retrospektivní monocentrické kohortě.