Predikce dysfunkce alograftu po transplantaci plic založená na multi-omických metodách

ALAD se vyskytuje převážně v časném období po transplantaci. Tento projekt si klade za cíl vytvořit systematický rámec pro sledování a předpovídání dysfunkce po transplantaci plic, se specifickým zaměřením na akutní dysfunkci plicního aloštěpu (ALAD) a její progresi do chronické dysfunkce plicního aloštěpu (CLAD). Plánujeme provést prospektivní multicentrickou klinickou kohortovou studii, při které budeme longitudinálně odebírat vzorky periferní krve a bronchoalveolární lavážní tekutiny (BALF) od příjemců transplantace v různých časových bodech. Integrací multi-omics technologií – včetně fragmentomiky cfDNA, sekvenování jednotlivých buněk periferní krve a proteomické hmotnostní spektrometrie – s plicní funkcí (FEV1) a klinickopatologickými daty usilujeme o vymezení dynamické krajiny dysfunkce po transplantaci plic. Ve srovnání s předchozími studiemi, které se spoléhaly na jednotlivé ukazatele nebo jednorázová měření, se tento projekt vyznačuje několika klíčovými rysy: Za prvé, využití fragmentomických charakteristik cfDNA k odvození tkáňového původu, což umožňuje vysoce specifickou detekci poškození štěpu bez nutnosti informací o genotypu dárce. Za druhé, integrace single-cell transkriptomiky pro komplexní analýzu dynamiky subsetů periferních imunitních buněk, což poskytuje základ pro včasné imunologické varování před dysfunkcí. Za třetí, aplikace proteomiky k odhalení expresních hladin, posttranslačních modifikací a protein-proteinových interakcí ve vzorcích plazmy. Za čtvrté, konstrukce vícerozměrného integrovaného modelu zahrnujícího data z krve, BALF a plicních funkcí s cílem vytvořit generalizovatelný systém včasného varování. Prostřednictvím tohoto výzkumu usilujeme nejen o zlepšení včasné identifikace a intervence ALAD, ale také o položení základů pro objasnění molekulárních mechanismů podílejících se na vývoji CLAD a prozkoumání potenciálních terapeutických cílů.